RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617631.1

5S_rRNA.12-201, humanhuman

BASIC

Gene 5S_rRNA, Length 107 nt, Biotype rRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 CCDC102AQ96A19 550 aa4.23□□□□□ -1.73
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 CFAP53Q96M91 514 aa4.23□□□□□ -1.73
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP4.23□□□□□ -1.73
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP4.23□□□□□ -1.73
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 EFCC1Q9HA90 598 aa4.23□□□□□ -1.73
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 CHPF2Q9P2E5 772 aa4.23□□□□□ -1.73
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 NRBP1Q9UHY1 535 aa4.23□□□□□ -1.73
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP4.22□□□□□ -1.73
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 MSH5O43196 834 aa4.22□□□□□ -1.73
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 ATG7O95352 703 aa4.22□□□□□ -1.73
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 FOSBP53539 338 aa4.22□□□□□ -1.73
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 RASSF7Q02833 373 aa4.22□□□□□ -1.73
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 POU5F1BQ06416 359 aa4.22□□□□□ -1.73
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 DMTNQ08495 405 aa4.22□□□□□ -1.73
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 LMOD3Q0VAK6 560 aa4.22□□□□□ -1.73
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 BIRC2Q13490 618 aa4.22□□□□□ -1.73
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 MCM6Q14566 821 aa4.22□□□□□ -1.73
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP4.22□□□□□ -1.73
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa4.22□□□□□ -1.73
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa4.22□□□□□ -1.73
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa4.22□□□□□ -1.73
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 CREBRFQ8IUR6 639 aa4.22□□□□□ -1.73
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 OGFOD1Q8N543 542 aa4.22□□□□□ -1.73
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 PDILTQ8N807 584 aa4.22□□□□□ -1.73
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 BANK1Q8NDB2 785 aa4.22□□□□□ -1.73
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 ATL2Q8NHH9 583 aa4.22□□□□□ -1.73
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 TTC14Q96N46 770 aa4.22□□□□□ -1.73
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP4.22□□□□□ -1.73
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 EPAS1Q99814 870 aa4.22□□□□□ -1.73
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 PAGR1Q9BTK6 254 aa4.22□□□□□ -1.73
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 RETREG1Q9H6L5 497 aa4.22□□□□□ -1.73
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP4.22□□□□□ -1.73
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 CEP83Q9Y592 693 aa4.22□□□□□ -1.73
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 RGS20O76081 388 aa4.21□□□□□ -1.74
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 PDE4DQ08499 809 aa4.21□□□□□ -1.74
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP4.21□□□□□ -1.74
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP4.21□□□□□ -1.74
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP4.21□□□□□ -1.74
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 NAALADL2Q58DX5 795 aa4.21□□□□□ -1.74
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP4.21□□□□□ -1.74
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 OTUD6AQ7L8S5 288 aa4.21□□□□□ -1.74
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 ZSCAN30Q86W11 494 aa4.21□□□□□ -1.74
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP4.21□□□□□ -1.74
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 MNS1Q8NEH6 495 aa4.21□□□□□ -1.74
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP4.21□□□□□ -1.74
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP4.21□□□□□ -1.74
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP4.21□□□□□ -1.74
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 AKAP2Q9Y2D5 859 aa4.21□□□□□ -1.74
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa4.21□□□□□ -1.74
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 ERBB3P21860 1342 aa4.21□□□□□ -1.74
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP4.2□□□□□ -1.74
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 TIMM44O43615 452 aa4.2□□□□□ -1.74
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP4.2□□□□□ -1.74
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 TDO2P48775 406 aa4.2□□□□□ -1.74
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 EIF5P55010 431 aaKnown RBP4.2□□□□□ -1.74
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP4.2□□□□□ -1.74
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 CTR9Q6PD62 1173 aa4.2□□□□□ -1.74
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 KRT77Q7Z794 578 aa4.2□□□□□ -1.74
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 CCDC146Q8IYE0 955 aa4.2□□□□□ -1.74
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 VPS37AQ8NEZ2 397 aa4.2□□□□□ -1.74
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 RNF217Q8TC41 542 aa4.2□□□□□ -1.74
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 GPATCH3Q96I76 525 aa4.2□□□□□ -1.74
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 FAM13BQ9NYF5 915 aa4.2□□□□□ -1.74
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 ACAD8Q9UKU7 415 aa4.2□□□□□ -1.74
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP4.2□□□□□ -1.74
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 PHF8Q9UPP1 1060 aa4.2□□□□□ -1.74
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 KNSTRNQ9Y448 316 aa4.2□□□□□ -1.74
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 KLHL33A6NCF5 533 aa4.19□□□□□ -1.74
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa4.19□□□□□ -1.74
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP4.19□□□□□ -1.74
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 HOXA2O43364 376 aa4.19□□□□□ -1.74
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 VAMP4O75379 141 aa4.19□□□□□ -1.74
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 CCDC159P0C7I6 412 aa4.19□□□□□ -1.74
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 CCDC172P0C7W6 258 aa4.19□□□□□ -1.74
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP4.19□□□□□ -1.74
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 CD53P19397 219 aa4.19□□□□□ -1.74
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 TRPC1P48995 793 aa4.19□□□□□ -1.74
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 TMED1Q13445 227 aa4.19□□□□□ -1.74
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 COL19A1Q14993 1142 aa4.19□□□□□ -1.74
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 IQCEQ6IPM2 695 aa4.19□□□□□ -1.74
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP4.19□□□□□ -1.74
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa4.19□□□□□ -1.74
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP4.19□□□□□ -1.74
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa4.19□□□□□ -1.74
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP4.19□□□□□ -1.74
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 LMNTD2Q8IXW0 634 aa4.19□□□□□ -1.74
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 SAMD3Q8N6K7 520 aa4.19□□□□□ -1.74
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP4.19□□□□□ -1.74
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 SVIPQ8NHG7 77 aa4.19□□□□□ -1.74
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 PIK3R5Q8WYR1 880 aa4.19□□□□□ -1.74
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 RELTQ969Z4 430 aa4.19□□□□□ -1.74
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 RUNDC1Q96C34 613 aa4.19□□□□□ -1.74
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 AGAP3Q96P47 875 aa4.19□□□□□ -1.74
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 RPS6KC1Q96S38 1066 aa4.19□□□□□ -1.74
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP4.19□□□□□ -1.74
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 TRIM34Q9BYJ4 488 aa4.19□□□□□ -1.74
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 TMX1Q9H3N1 280 aa4.19□□□□□ -1.74
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP4.19□□□□□ -1.74
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 SUN2Q9UH99 717 aa4.19□□□□□ -1.74
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP4.19□□□□□ -1.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.1 ms