RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616767.1

ARHGAP23-213, Transcript of Rho GTPase activating protein 23, human

TSL 3

Gene ARHGAP23, Length 546 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARHGAP23-213	ENST00000616767	PLCH1	Q4KWH8	1693 aa		42.7	■■■■■ 4.43
ARHGAP23-213	ENST00000616767	PLEKHG5	O94827	1062 aa		42.68	■■■■■ 4.42
ARHGAP23-213	ENST00000616767	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		42.68	■■■■■ 4.42
ARHGAP23-213	ENST00000616767	CABP2	Q9NPB3	220 aa		42.68	■■■■■ 4.42
ARHGAP23-213	ENST00000616767	NWD2	Q9ULI1	1742 aa		42.68	■■■■■ 4.42
ARHGAP23-213	ENST00000616767	PPIP5K1	Q6PFW1	1433 aa		42.67	■■■■■ 4.42
ARHGAP23-213	ENST00000616767	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		42.66	■■■■■ 4.42
ARHGAP23-213	ENST00000616767	PAK3	O75914	559 aa	Predicted RBP	42.65	■■■■■ 4.42
ARHGAP23-213	ENST00000616767	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	42.62	■■■■■ 4.41
ARHGAP23-213	ENST00000616767	GJD4	Q96KN9	370 aa	Predicted RBP	42.62	■■■■■ 4.41
ARHGAP23-213	ENST00000616767	GLI3	P10071	1580 aa		42.61	■■■■■ 4.41
ARHGAP23-213	ENST00000616767	EVC2	Q86UK5	1308 aa		42.6	■■■■■ 4.41
ARHGAP23-213	ENST00000616767	FAM83G	A6ND36	823 aa		42.59	■■■■■ 4.41
ARHGAP23-213	ENST00000616767	PHRF1	Q9P1Y6	1649 aa	Known RBP	42.57	■■■■■ 4.4
ARHGAP23-213	ENST00000616767	COL14A1	Q05707	1796 aa	Known RBP	42.56	■■■■■ 4.4
ARHGAP23-213	ENST00000616767	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		42.55	■■■■■ 4.4
ARHGAP23-213	ENST00000616767	NRAP	Q86VF7	1730 aa		42.54	■■■■■ 4.4
ARHGAP23-213	ENST00000616767	SBNO2	Q9Y2G9	1366 aa		42.54	■■■■■ 4.4
ARHGAP23-213	ENST00000616767	CABP1	Q9NZU7	370 aa		42.52	■■■■■ 4.4
ARHGAP23-213	ENST00000616767	VPS72	Q15906	364 aa		42.51	■■■■■ 4.4
ARHGAP23-213	ENST00000616767	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	42.51	■■■■■ 4.4
ARHGAP23-213	ENST00000616767	USP6	P35125	1406 aa		42.47	■■■■■ 4.39
ARHGAP23-213	ENST00000616767	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		42.45	■■■■■ 4.39
ARHGAP23-213	ENST00000616767	BTG4	Q9NY30	223 aa		42.44	■■■■■ 4.38
ARHGAP23-213	ENST00000616767	NRK	Q7Z2Y5	1582 aa		42.44	■■■■■ 4.38
ARHGAP23-213	ENST00000616767	ATAD2	Q6PL18	1390 aa		42.43	■■■■■ 4.38
ARHGAP23-213	ENST00000616767	ABTB2	Q8N961	1025 aa		42.43	■■■■■ 4.38
ARHGAP23-213	ENST00000616767	USP19	O94966	1318 aa		42.43	■■■■■ 4.38
ARHGAP23-213	ENST00000616767	SSH2	Q76I76	1423 aa		42.42	■■■■■ 4.38
ARHGAP23-213	ENST00000616767	KIAA0232	Q92628	1395 aa		42.4	■■■■■ 4.38
ARHGAP23-213	ENST00000616767	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		42.4	■■■■■ 4.38
ARHGAP23-213	ENST00000616767	AKAP12	Q02952	1782 aa		42.38	■■■■■ 4.37
ARHGAP23-213	ENST00000616767	EP400	Q96L91	3159 aa		42.37	■■■■■ 4.37
ARHGAP23-213	ENST00000616767	ONECUT3	O60422	494 aa	Predicted RBP	42.36	■■■■■ 4.37
ARHGAP23-213	ENST00000616767	NLRP13	Q86W25	1043 aa		42.34	■■■■■ 4.37
ARHGAP23-213	ENST00000616767	CPSF1	Q10570	1443 aa	Known RBP	42.33	■■■■■ 4.37
ARHGAP23-213	ENST00000616767	BRWD3	Q6RI45	1802 aa		42.33	■■■■■ 4.37
ARHGAP23-213	ENST00000616767	CCDC9	Q9Y3X0	531 aa	Known RBP	42.33	■■■■■ 4.37
ARHGAP23-213	ENST00000616767	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	42.32	■■■■■ 4.37
ARHGAP23-213	ENST00000616767	PIK3C2A	O00443	1686 aa		42.31	■■■■■ 4.36
ARHGAP23-213	ENST00000616767	CPD	O75976	1380 aa		42.31	■■■■■ 4.36
ARHGAP23-213	ENST00000616767	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		42.3	■■■■■ 4.36
ARHGAP23-213	ENST00000616767	ZNF692	Q9BU19	519 aa	Predicted RBP	42.3	■■■■■ 4.36
ARHGAP23-213	ENST00000616767	CHRNA2	Q15822	529 aa		42.29	■■■■■ 4.36
ARHGAP23-213	ENST00000616767	SEPT12	Q8IYM1	358 aa		42.29	■■■■■ 4.36
ARHGAP23-213	ENST00000616767	SLIT3	O75094	1523 aa		42.27	■■■■■ 4.36
ARHGAP23-213	ENST00000616767	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		42.26	■■■■■ 4.36
ARHGAP23-213	ENST00000616767	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		42.26	■■■■■ 4.36
ARHGAP23-213	ENST00000616767	LMO7	Q8WWI1	1683 aa		42.26	■■■■■ 4.36
ARHGAP23-213	ENST00000616767	GC	P02774	474 aa		42.26	■■■■■ 4.36
ARHGAP23-213	ENST00000616767	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		42.26	■■■■■ 4.36
ARHGAP23-213	ENST00000616767	MON2	Q7Z3U7	1717 aa		42.24	■■■■■ 4.35
ARHGAP23-213	ENST00000616767	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		42.23	■■■■■ 4.35
ARHGAP23-213	ENST00000616767	TESK2	Q96S53	571 aa		42.23	■■■■■ 4.35
ARHGAP23-213	ENST00000616767	NLRP6	P59044	892 aa		42.22	■■■■■ 4.35
ARHGAP23-213	ENST00000616767	CD163L1	Q9NR16	1453 aa		42.22	■■■■■ 4.35
ARHGAP23-213	ENST00000616767	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		42.21	■■■■■ 4.35
ARHGAP23-213	ENST00000616767	CAMTA1	Q9Y6Y1	1673 aa		42.21	■■■■■ 4.35
ARHGAP23-213	ENST00000616767	PUS7	Q96PZ0	661 aa	Known RBP	42.2	■■■■■ 4.35
ARHGAP23-213	ENST00000616767	KTN1	Q86UP2	1357 aa	Known RBP	42.19	■■■■■ 4.34
ARHGAP23-213	ENST00000616767	ST20-MTHFS	A0A0A6YYL1	179 aa		42.19	■■■■■ 4.34
ARHGAP23-213	ENST00000616767	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		42.19	■■■■■ 4.34
ARHGAP23-213	ENST00000616767	FAM98C	Q17RN3	349 aa	Known RBP	42.18	■■■■■ 4.34
ARHGAP23-213	ENST00000616767	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		42.17	■■■■■ 4.34
ARHGAP23-213	ENST00000616767	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		42.15	■■■■■ 4.34
ARHGAP23-213	ENST00000616767	STRN4	Q9NRL3	753 aa		42.13	■■■■■ 4.33
ARHGAP23-213	ENST00000616767	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		42.12	■■■■■ 4.33
ARHGAP23-213	ENST00000616767	CCDC125	Q86Z20	511 aa		42.12	■■■■■ 4.33
ARHGAP23-213	ENST00000616767	SLC12A5	Q9H2X9	1139 aa		42.09	■■■■■ 4.33
ARHGAP23-213	ENST00000616767	USP47	Q96K76	1375 aa		42.09	■■■■■ 4.33
ARHGAP23-213	ENST00000616767	SLC24A1	O60721	1099 aa		42.08	■■■■■ 4.33
ARHGAP23-213	ENST00000616767	USP54	Q70EL1	1684 aa		42.08	■■■■■ 4.33
ARHGAP23-213	ENST00000616767	COL18A1	P39060	1754 aa		42.07	■■■■■ 4.33
ARHGAP23-213	ENST00000616767	COL5A2	P05997	1499 aa	Predicted RBP	42.07	■■■■■ 4.33
ARHGAP23-213	ENST00000616767	AATK	Q6ZMQ8	1374 aa		42.07	■■■■■ 4.33
ARHGAP23-213	ENST00000616767	TMC1	Q8TDI8	760 aa		42.07	■■■■■ 4.33
ARHGAP23-213	ENST00000616767		A0A0G2JS52	829 aa		42.06	■■■■■ 4.32
ARHGAP23-213	ENST00000616767	MYT1	Q01538	1121 aa		42.06	■■■■■ 4.32
ARHGAP23-213	ENST00000616767	BLM	P54132	1417 aa	Predicted RBP	42.04	■■■■■ 4.32
ARHGAP23-213	ENST00000616767	EVA1C	P58658	441 aa		42.04	■■■■■ 4.32
ARHGAP23-213	ENST00000616767		A0A1W2PP64	1363 aa		42.03	■■■■■ 4.32
ARHGAP23-213	ENST00000616767	USP31	Q70CQ4	1352 aa		42.03	■■■■■ 4.32
ARHGAP23-213	ENST00000616767	LARP1	Q6PKG0	1096 aa	Known RBP	42.03	■■■■■ 4.32
ARHGAP23-213	ENST00000616767	HDGFL2	Q7Z4V5	671 aa	Predicted RBP	42.03	■■■■■ 4.32
ARHGAP23-213	ENST00000616767	NFAT5	O94916	1531 aa		42.03	■■■■■ 4.32
ARHGAP23-213	ENST00000616767	NINL	Q9Y2I6	1382 aa		42.02	■■■■■ 4.32
ARHGAP23-213	ENST00000616767	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		42.02	■■■■■ 4.32
ARHGAP23-213	ENST00000616767	EDC4	Q6P2E9	1401 aa	Known RBP	42.02	■■■■■ 4.32
ARHGAP23-213	ENST00000616767	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		41.99	■■■■■ 4.31
ARHGAP23-213	ENST00000616767	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		41.99	■■■■■ 4.31
ARHGAP23-213	ENST00000616767	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		41.99	■■■■■ 4.31
ARHGAP23-213	ENST00000616767	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	41.98	■■■■■ 4.31
ARHGAP23-213	ENST00000616767	ZRANB1	Q9UGI0	708 aa		41.96	■■■■■ 4.31
ARHGAP23-213	ENST00000616767	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		41.95	■■■■■ 4.31
ARHGAP23-213	ENST00000616767	NME9	Q86XW9	330 aa		41.95	■■■■■ 4.31
ARHGAP23-213	ENST00000616767	USP35	Q9P2H5	1018 aa		41.95	■■■■■ 4.31
ARHGAP23-213	ENST00000616767	CRB1	P82279	1406 aa		41.94	■■■■■ 4.3
ARHGAP23-213	ENST00000616767	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		41.93	■■■■■ 4.3
ARHGAP23-213	ENST00000616767	AXIN2	Q9Y2T1	843 aa		41.92	■■■■■ 4.3
ARHGAP23-213	ENST00000616767	TMF1	P82094	1093 aa		41.91	■■■■■ 4.3

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.7 ms