RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616306.1

UBXN8-208, Transcript of UBX domain protein 8, humanhuman

TSL 5

Gene UBXN8, Length 571 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8-208ENST00000616306 CABP2Q9NPB3 220 aa14.89□□□□□ -0.03
UBXN8-208ENST00000616306 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
UBXN8-208ENST00000616306 POTEJP0CG39 1038 aa14.88□□□□□ -0.03
UBXN8-208ENST00000616306 MST1RQ04912 1400 aa14.88□□□□□ -0.03
UBXN8-208ENST00000616306 MYOM2P54296 1465 aa14.88□□□□□ -0.03
UBXN8-208ENST00000616306 BRINP3Q76B58 766 aa14.87□□□□□ -0.03
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UBXN8-208ENST00000616306 STK26Q9P289 416 aa14.81□□□□□ -0.04
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UBXN8-208ENST00000616306 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
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UBXN8-208ENST00000616306 PHF8Q9UPP1 1060 aa14.63□□□□□ -0.07
UBXN8-208ENST00000616306 USP32Q8NFA0 1604 aa14.63□□□□□ -0.07
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UBXN8-208ENST00000616306 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
UBXN8-208ENST00000616306 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
UBXN8-208ENST00000616306 TULP4Q9NRJ4 1543 aa14.6□□□□□ -0.07
UBXN8-208ENST00000616306 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa14.6□□□□□ -0.07
UBXN8-208ENST00000616306 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
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UBXN8-208ENST00000616306 C3orf67Q6ZVT6 689 aa14.59□□□□□ -0.07
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