RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000611394.4

PRR5-216, Transcript of proline rich 5, human

TSL 2 BASIC

Gene PRR5, Length 1,843 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRR5-216	ENST00000611394	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		43.46	■■■■■ 4.55
PRR5-216	ENST00000611394	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	43.45	■■■■■ 4.55
PRR5-216	ENST00000611394	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		43.45	■■■■■ 4.55
PRR5-216	ENST00000611394	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		43.45	■■■■■ 4.55
PRR5-216	ENST00000611394	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		43.44	■■■■■ 4.55
PRR5-216	ENST00000611394	NME9	Q86XW9	330 aa		43.43	■■■■■ 4.54
PRR5-216	ENST00000611394	SSH2	Q76I76	1423 aa		43.43	■■■■■ 4.54
PRR5-216	ENST00000611394	MST1R	Q04912	1400 aa		43.42	■■■■■ 4.54
PRR5-216	ENST00000611394	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	43.4	■■■■■ 4.54
PRR5-216	ENST00000611394	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		43.39	■■■■■ 4.54
PRR5-216	ENST00000611394	KIF1A	Q12756	1690 aa		43.38	■■■■■ 4.53
PRR5-216	ENST00000611394	ORAI2	Q96SN7	254 aa		43.38	■■■■■ 4.53
PRR5-216	ENST00000611394	COG3	Q96JB2	828 aa		43.35	■■■■■ 4.53
PRR5-216	ENST00000611394	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	43.32	■■■■■ 4.53
PRR5-216	ENST00000611394	ZRANB1	Q9UGI0	708 aa		43.32	■■■■■ 4.53
PRR5-216	ENST00000611394	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	43.29	■■■■■ 4.52
PRR5-216	ENST00000611394	PSME1	Q06323	249 aa		43.29	■■■■■ 4.52
PRR5-216	ENST00000611394	MTHFS	P49914	203 aa		43.27	■■■■■ 4.52
PRR5-216	ENST00000611394	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		43.26	■■■■■ 4.52
PRR5-216	ENST00000611394	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		43.26	■■■■■ 4.52
PRR5-216	ENST00000611394	PIK3C2A	O00443	1686 aa		43.26	■■■■■ 4.52
PRR5-216	ENST00000611394	FOXO3	O43524	673 aa		43.24	■■■■■ 4.51
PRR5-216	ENST00000611394	PAK3	O75914	559 aa	Predicted RBP	43.22	■■■■■ 4.51
PRR5-216	ENST00000611394	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		43.21	■■■■■ 4.51
PRR5-216	ENST00000611394	CFAP53	Q96M91	514 aa		43.21	■■■■■ 4.51
PRR5-216	ENST00000611394	USP31	Q70CQ4	1352 aa		43.2	■■■■■ 4.51
PRR5-216	ENST00000611394	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	43.19	■■■■■ 4.5
PRR5-216	ENST00000611394	AATK	Q6ZMQ8	1374 aa		43.18	■■■■■ 4.5
PRR5-216	ENST00000611394	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	43.18	■■■■■ 4.5
PRR5-216	ENST00000611394	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	43.17	■■■■■ 4.5
PRR5-216	ENST00000611394	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	43.16	■■■■■ 4.5
PRR5-216	ENST00000611394	USP54	Q70EL1	1684 aa		43.16	■■■■■ 4.5
PRR5-216	ENST00000611394	ABTB2	Q8N961	1025 aa		43.15	■■■■■ 4.5
PRR5-216	ENST00000611394	SLAIN2	Q9P270	581 aa		43.14	■■■■■ 4.5
PRR5-216	ENST00000611394	NLRP6	P59044	892 aa		43.13	■■■■■ 4.49
PRR5-216	ENST00000611394	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		43.13	■■■■■ 4.49
PRR5-216	ENST00000611394	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	43.12	■■■■■ 4.49
PRR5-216	ENST00000611394	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	43.12	■■■■■ 4.49
PRR5-216	ENST00000611394	POLK	Q9UBT6	870 aa		43.11	■■■■■ 4.49
PRR5-216	ENST00000611394	FBLN1	P23142	703 aa		43.11	■■■■■ 4.49
PRR5-216	ENST00000611394	MARF1	Q9Y4F3	1742 aa	Known RBP	43.09	■■■■■ 4.49
PRR5-216	ENST00000611394	SHPRH	Q149N8	1683 aa		43.09	■■■■■ 4.49
PRR5-216	ENST00000611394	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		43.09	■■■■■ 4.49
PRR5-216	ENST00000611394	INSR	P06213	1382 aa		43.08	■■■■■ 4.49
PRR5-216	ENST00000611394	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	43.08	■■■■■ 4.49
PRR5-216	ENST00000611394	BRINP3	Q76B58	766 aa		43.07	■■■■■ 4.49
PRR5-216	ENST00000611394	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		43.06	■■■■■ 4.48
PRR5-216	ENST00000611394	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		43.06	■■■■■ 4.48
PRR5-216	ENST00000611394	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	43.04	■■■■■ 4.48
PRR5-216	ENST00000611394	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		43.04	■■■■■ 4.48
PRR5-216	ENST00000611394	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	43.03	■■■■■ 4.48
PRR5-216	ENST00000611394	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		43.03	■■■■■ 4.48
PRR5-216	ENST00000611394	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	43.02	■■■■■ 4.48
PRR5-216	ENST00000611394	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	43.01	■■■■■ 4.48
PRR5-216	ENST00000611394	BLM	P54132	1417 aa	Predicted RBP	43.01	■■■■■ 4.48
PRR5-216	ENST00000611394	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	43	■■■■■ 4.47
PRR5-216	ENST00000611394	SOX12	O15370	315 aa		42.99	■■■■■ 4.47
PRR5-216	ENST00000611394	ALS2	Q96Q42	1657 aa		42.97	■■■■■ 4.47
PRR5-216	ENST00000611394	SBNO1	A3KN83	1393 aa		42.96	■■■■■ 4.47
PRR5-216	ENST00000611394	PXDN	Q92626	1479 aa		42.96	■■■■■ 4.47
PRR5-216	ENST00000611394	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		42.95	■■■■■ 4.47
PRR5-216	ENST00000611394	NUDC	Q9Y266	331 aa		42.94	■■■■■ 4.47
PRR5-216	ENST00000611394	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	42.93	■■■■■ 4.46
PRR5-216	ENST00000611394	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		42.89	■■■■■ 4.46
PRR5-216	ENST00000611394	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		42.89	■■■■■ 4.46
PRR5-216	ENST00000611394	PEAK1	Q9H792	1746 aa		42.88	■■■■■ 4.45
PRR5-216	ENST00000611394	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		42.88	■■■■■ 4.45
PRR5-216	ENST00000611394	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		42.86	■■■■■ 4.45
PRR5-216	ENST00000611394	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		42.85	■■■■■ 4.45
PRR5-216	ENST00000611394	SLIT3	O75094	1523 aa		42.85	■■■■■ 4.45
PRR5-216	ENST00000611394	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	42.85	■■■■■ 4.45
PRR5-216	ENST00000611394	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	42.85	■■■■■ 4.45
PRR5-216	ENST00000611394	NFAT5	O94916	1531 aa		42.84	■■■■■ 4.45
PRR5-216	ENST00000611394	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	42.84	■■■■■ 4.45
PRR5-216	ENST00000611394	USP19	O94966	1318 aa		42.84	■■■■■ 4.45
PRR5-216	ENST00000611394	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	42.82	■■■■■ 4.45
PRR5-216	ENST00000611394	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		42.82	■■■■■ 4.45
PRR5-216	ENST00000611394	FLT4	P35916	1363 aa		42.81	■■■■■ 4.44
PRR5-216	ENST00000611394	AMPH	P49418	695 aa		42.81	■■■■■ 4.44
PRR5-216	ENST00000611394	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		42.81	■■■■■ 4.44
PRR5-216	ENST00000611394	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		42.8	■■■■■ 4.44
PRR5-216	ENST00000611394	LTN1	O94822	1766 aa		42.8	■■■■■ 4.44
PRR5-216	ENST00000611394	ARHGEF10	O15013	1369 aa		42.8	■■■■■ 4.44
PRR5-216	ENST00000611394	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		42.79	■■■■■ 4.44
PRR5-216	ENST00000611394	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		42.79	■■■■■ 4.44
PRR5-216	ENST00000611394	IL13	P35225	146 aa		42.77	■■■■■ 4.44
PRR5-216	ENST00000611394	GC	P02774	474 aa		42.76	■■■■■ 4.44
PRR5-216	ENST00000611394	PLEKHG5	O94827	1062 aa		42.75	■■■■■ 4.43
PRR5-216	ENST00000611394	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		42.74	■■■■■ 4.43
PRR5-216	ENST00000611394	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	42.74	■■■■■ 4.43
PRR5-216	ENST00000611394	RTL1	A6NKG5	1358 aa		42.73	■■■■■ 4.43
PRR5-216	ENST00000611394	RUNDC1	Q96C34	613 aa		42.71	■■■■■ 4.43
PRR5-216	ENST00000611394	PHRF1	Q9P1Y6	1649 aa	Known RBP	42.7	■■■■■ 4.43
PRR5-216	ENST00000611394	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	42.7	■■■■■ 4.43
PRR5-216	ENST00000611394	HOXC9	P31274	260 aa		42.69	■■■■■ 4.43
PRR5-216	ENST00000611394	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	42.69	■■■■■ 4.42
PRR5-216	ENST00000611394	TOM1	O60784	492 aa		42.67	■■■■■ 4.42
PRR5-216	ENST00000611394	APAF1	O14727	1248 aa		42.66	■■■■■ 4.42
PRR5-216	ENST00000611394	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	42.66	■■■■■ 4.42
PRR5-216	ENST00000611394	CRYBG1	Q9Y4K1	1723 aa		42.66	■■■■■ 4.42

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 6.6 ms