RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601358.5

TIMM50-216, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 50, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TIMM50, Length 1,481 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM50-216ENST00000601358 SLIT2O94813 1529 aa30.14■■■□□ 2.41
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TIMM50-216ENST00000601358 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP30.11■■■□□ 2.41
TIMM50-216ENST00000601358 EVC2Q86UK5 1308 aa30.11■■■□□ 2.41
TIMM50-216ENST00000601358 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP30.11■■■□□ 2.41
TIMM50-216ENST00000601358 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa30.1■■■□□ 2.41
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TIMM50-216ENST00000601358 EP400Q96L91 3159 aa29.94■■■□□ 2.38
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TIMM50-216ENST00000601358 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP29.93■■■□□ 2.38
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TIMM50-216ENST00000601358 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP29.88■■■□□ 2.37
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TIMM50-216ENST00000601358 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa29.75■■■□□ 2.35
TIMM50-216ENST00000601358 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP29.74■■■□□ 2.35
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TIMM50-216ENST00000601358 SOX12O15370 315 aa29.74■■■□□ 2.35
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TIMM50-216ENST00000601358 TCP11L2Q8N4U5 519 aa29.67■■■□□ 2.34
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TIMM50-216ENST00000601358 MON2Q7Z3U7 1717 aa29.66■■■□□ 2.34
TIMM50-216ENST00000601358 BARGINQ6ZT62 677 aa29.65■■■□□ 2.34
TIMM50-216ENST00000601358 ZRANB1Q9UGI0 708 aa29.65■■■□□ 2.34
TIMM50-216ENST00000601358 CD163L1Q9NR16 1453 aa29.65■■■□□ 2.34
TIMM50-216ENST00000601358 NME9Q86XW9 330 aa29.64■■■□□ 2.34
TIMM50-216ENST00000601358 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP29.63■■■□□ 2.33
TIMM50-216ENST00000601358 TMF1P82094 1093 aa29.63■■■□□ 2.33
TIMM50-216ENST00000601358 ARHGEF25Q86VW2 580 aa29.63■■■□□ 2.33
TIMM50-216ENST00000601358 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa29.63■■■□□ 2.33
TIMM50-216ENST00000601358 DEFB132Q7Z7B7 95 aa29.62■■■□□ 2.33
TIMM50-216ENST00000601358 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP29.62■■■□□ 2.33
TIMM50-216ENST00000601358 PDE3BQ13370 1112 aa29.61■■■□□ 2.33
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TIMM50-216ENST00000601358 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa29.61■■■□□ 2.33
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