RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000600201.5

FCHO1-231, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 5

Gene FCHO1, Length 694 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-231ENST00000600201 CDK19Q9BWU1 502 aa21.6■■□□□ 1.05
FCHO1-231ENST00000600201 GPRASP1Q5JY77 1395 aa21.6■■□□□ 1.05
FCHO1-231ENST00000600201 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
FCHO1-231ENST00000600201 VPS72Q15906 364 aa21.58■■□□□ 1.05
FCHO1-231ENST00000600201 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
FCHO1-231ENST00000600201 NUTM2GQ5VZR2 741 aa21.56■■□□□ 1.04
FCHO1-231ENST00000600201 NRKQ7Z2Y5 1582 aa21.56■■□□□ 1.04
FCHO1-231ENST00000600201 SEPT12Q8IYM1 358 aa21.55■■□□□ 1.04
FCHO1-231ENST00000600201 L3MBTL2Q969R5 705 aa21.55■■□□□ 1.04
FCHO1-231ENST00000600201 BTG4Q9NY30 223 aa21.55■■□□□ 1.04
FCHO1-231ENST00000600201 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
FCHO1-231ENST00000600201 ACEP12821 1306 aa21.54■■□□□ 1.04
FCHO1-231ENST00000600201 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
FCHO1-231ENST00000600201 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa21.52■■□□□ 1.04
FCHO1-231ENST00000600201 CABP2Q9NPB3 220 aa21.51■■□□□ 1.03
FCHO1-231ENST00000600201 KIAA0232Q92628 1395 aa21.5■■□□□ 1.03
FCHO1-231ENST00000600201 CHRNA2Q15822 529 aa21.5■■□□□ 1.03
FCHO1-231ENST00000600201 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa21.49■■□□□ 1.03
FCHO1-231ENST00000600201 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
FCHO1-231ENST00000600201 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
FCHO1-231ENST00000600201 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa21.48■■□□□ 1.03
FCHO1-231ENST00000600201 LMO7Q8WWI1 1683 aa21.48■■□□□ 1.03
FCHO1-231ENST00000600201 NEUROD1Q13562 356 aa21.48■■□□□ 1.03
FCHO1-231ENST00000600201 NBPF8Q3BBV2 869 aa21.48■■□□□ 1.03
FCHO1-231ENST00000600201 DEFB132Q7Z7B7 95 aa21.48■■□□□ 1.03
FCHO1-231ENST00000600201 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
FCHO1-231ENST00000600201 FAM182BQ5T319 152 aa21.47■■□□□ 1.03
FCHO1-231ENST00000600201 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
FCHO1-231ENST00000600201 PLEKHG3A1L390 1219 aa21.46■■□□□ 1.03
FCHO1-231ENST00000600201 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
FCHO1-231ENST00000600201 PRDM11Q9NQV5 511 aa21.46■■□□□ 1.03
FCHO1-231ENST00000600201 CCDC61Q9Y6R9 512 aa21.46■■□□□ 1.03
FCHO1-231ENST00000600201 PIK3C2AO00443 1686 aa21.45■■□□□ 1.02
FCHO1-231ENST00000600201 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
FCHO1-231ENST00000600201 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
FCHO1-231ENST00000600201 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa21.44■■□□□ 1.02
FCHO1-231ENST00000600201 AKAP12Q02952 1782 aa21.44■■□□□ 1.02
FCHO1-231ENST00000600201 A0A0G2JS52 829 aa21.44■■□□□ 1.02
FCHO1-231ENST00000600201 MYT1Q01538 1121 aa21.44■■□□□ 1.02
FCHO1-231ENST00000600201 KRT27Q7Z3Y8 459 aa21.44■■□□□ 1.02
FCHO1-231ENST00000600201 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa21.44■■□□□ 1.02
FCHO1-231ENST00000600201 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa21.44■■□□□ 1.02
FCHO1-231ENST00000600201 RGPD1P0DJD0 1748 aa21.41■■□□□ 1.02
FCHO1-231ENST00000600201 STRN4Q9NRL3 753 aa21.41■■□□□ 1.02
FCHO1-231ENST00000600201 USP19O94966 1318 aa21.4■■□□□ 1.02
FCHO1-231ENST00000600201 RGPD5Q99666 1765 aa21.39■■□□□ 1.01
FCHO1-231ENST00000600201 ABTB2Q8N961 1025 aa21.39■■□□□ 1.01
FCHO1-231ENST00000600201 USP6P35125 1406 aa21.38■■□□□ 1.01
FCHO1-231ENST00000600201 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
FCHO1-231ENST00000600201 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa21.38■■□□□ 1.01
FCHO1-231ENST00000600201 CCDC125Q86Z20 511 aa21.38■■□□□ 1.01
FCHO1-231ENST00000600201 CABP1Q9NZU7 370 aa21.38■■□□□ 1.01
FCHO1-231ENST00000600201 COL18A1P39060 1754 aa21.38■■□□□ 1.01
FCHO1-231ENST00000600201 SSH2Q76I76 1423 aa21.38■■□□□ 1.01
FCHO1-231ENST00000600201 SLIT3O75094 1523 aa21.37■■□□□ 1.01
FCHO1-231ENST00000600201 MON2Q7Z3U7 1717 aa21.35■■□□□ 1.01
FCHO1-231ENST00000600201 USP35Q9P2H5 1018 aa21.34■■□□□ 1.01
FCHO1-231ENST00000600201 ZRANB1Q9UGI0 708 aa21.34■■□□□ 1.01
FCHO1-231ENST00000600201 WNK3Q9BYP7 1800 aa21.34■■□□□ 1.01
FCHO1-231ENST00000600201 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
FCHO1-231ENST00000600201 CPDO75976 1380 aa21.33■■□□□ 1
FCHO1-231ENST00000600201 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
FCHO1-231ENST00000600201 ZBTB7CA1YPR0 619 aa21.31■■□□□ 1
FCHO1-231ENST00000600201 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
FCHO1-231ENST00000600201 GCP02774 474 aa21.3■■□□□ 1
FCHO1-231ENST00000600201 EVC2Q86UK5 1308 aa21.29■■□□□ 1
FCHO1-231ENST00000600201 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
FCHO1-231ENST00000600201 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
FCHO1-231ENST00000600201 NLRP13Q86W25 1043 aa21.28■■□□□ 1
FCHO1-231ENST00000600201 LRRC37A3O60309 1634 aa21.28■■□□□ 1
FCHO1-231ENST00000600201 NLRP6P59044 892 aa21.27■■□□□ 1
FCHO1-231ENST00000600201 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP21.26■□□□□ 0.99
FCHO1-231ENST00000600201 EVA1CP58658 441 aa21.26■□□□□ 0.99
FCHO1-231ENST00000600201 CD163L1Q9NR16 1453 aa21.26■□□□□ 0.99
FCHO1-231ENST00000600201 RREB1Q92766 1687 aa21.25■□□□□ 0.99
FCHO1-231ENST00000600201 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
FCHO1-231ENST00000600201 PEAK1Q9H792 1746 aa21.25■□□□□ 0.99
FCHO1-231ENST00000600201 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa21.25■□□□□ 0.99
FCHO1-231ENST00000600201 SBF2Q86WG5 1849 aa21.25■□□□□ 0.99
FCHO1-231ENST00000600201 NFAT5O94916 1531 aa21.24■□□□□ 0.99
FCHO1-231ENST00000600201 NUP188Q5SRE5 1749 aa21.24■□□□□ 0.99
FCHO1-231ENST00000600201 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP21.23■□□□□ 0.99
FCHO1-231ENST00000600201 SOX12O15370 315 aa21.23■□□□□ 0.99
FCHO1-231ENST00000600201 TRIM37O94972 964 aa21.23■□□□□ 0.99
FCHO1-231ENST00000600201 BAG6P46379 1132 aa21.23■□□□□ 0.99
FCHO1-231ENST00000600201 AXIN2Q9Y2T1 843 aa21.23■□□□□ 0.99
FCHO1-231ENST00000600201 USP54Q70EL1 1684 aa21.23■□□□□ 0.99
FCHO1-231ENST00000600201 LTN1O94822 1766 aa21.23■□□□□ 0.99
FCHO1-231ENST00000600201 BARGINQ6ZT62 677 aa21.22■□□□□ 0.99
FCHO1-231ENST00000600201 LRP5O75197 1615 aa21.22■□□□□ 0.99
FCHO1-231ENST00000600201 DISP2A7MBM2 1401 aa21.21■□□□□ 0.99
FCHO1-231ENST00000600201 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP21.21■□□□□ 0.99
FCHO1-231ENST00000600201 TCP11L2Q8N4U5 519 aa21.21■□□□□ 0.99
FCHO1-231ENST00000600201 CARD11Q9BXL7 1154 aa21.21■□□□□ 0.99
FCHO1-231ENST00000600201 CRB1P82279 1406 aa21.21■□□□□ 0.99
FCHO1-231ENST00000600201 AATKQ6ZMQ8 1374 aa21.2■□□□□ 0.98
FCHO1-231ENST00000600201 TONSLQ96HA7 1378 aa21.2■□□□□ 0.98
FCHO1-231ENST00000600201 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP21.19■□□□□ 0.98
FCHO1-231ENST00000600201 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa21.19■□□□□ 0.98
FCHO1-231ENST00000600201 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms