RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000595594.1

FCHO1-210, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 3

Gene FCHO1, Length 898 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-210ENST00000595594 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa26.87■■□□□ 1.89
FCHO1-210ENST00000595594 A0A0G2JS52 829 aa26.86■■□□□ 1.89
FCHO1-210ENST00000595594 MYT1Q01538 1121 aa26.86■■□□□ 1.89
FCHO1-210ENST00000595594 NBPF1Q3BBV0 1214 aa26.85■■□□□ 1.89
FCHO1-210ENST00000595594 CDK19Q9BWU1 502 aa26.85■■□□□ 1.89
FCHO1-210ENST00000595594 CCDC125Q86Z20 511 aa26.84■■□□□ 1.89
FCHO1-210ENST00000595594 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa26.84■■□□□ 1.89
FCHO1-210ENST00000595594 NUTM2GQ5VZR2 741 aa26.83■■□□□ 1.89
FCHO1-210ENST00000595594 DEFB132Q7Z7B7 95 aa26.83■■□□□ 1.89
FCHO1-210ENST00000595594 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa26.83■■□□□ 1.89
FCHO1-210ENST00000595594 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.88
FCHO1-210ENST00000595594 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
FCHO1-210ENST00000595594 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
FCHO1-210ENST00000595594 ZRANB1Q9UGI0 708 aa26.82■■□□□ 1.88
FCHO1-210ENST00000595594 KRT27Q7Z3Y8 459 aa26.8■■□□□ 1.88
FCHO1-210ENST00000595594 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
FCHO1-210ENST00000595594 CHRNA2Q15822 529 aa26.77■■□□□ 1.88
FCHO1-210ENST00000595594 PRDM11Q9NQV5 511 aa26.77■■□□□ 1.88
FCHO1-210ENST00000595594 ACEP12821 1306 aa26.76■■□□□ 1.87
FCHO1-210ENST00000595594 KIAA0232Q92628 1395 aa26.75■■□□□ 1.87
FCHO1-210ENST00000595594 FAM182BQ5T319 152 aa26.75■■□□□ 1.87
FCHO1-210ENST00000595594 QRICH2Q9H0J4 1663 aa26.75■■□□□ 1.87
FCHO1-210ENST00000595594 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
FCHO1-210ENST00000595594 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
FCHO1-210ENST00000595594 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa26.72■■□□□ 1.87
FCHO1-210ENST00000595594 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa26.72■■□□□ 1.87
FCHO1-210ENST00000595594 NBPF8Q3BBV2 869 aa26.72■■□□□ 1.87
FCHO1-210ENST00000595594 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
FCHO1-210ENST00000595594 STRN4Q9NRL3 753 aa26.71■■□□□ 1.87
FCHO1-210ENST00000595594 CCDC61Q9Y6R9 512 aa26.71■■□□□ 1.87
FCHO1-210ENST00000595594 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
FCHO1-210ENST00000595594 CABP2Q9NPB3 220 aa26.7■■□□□ 1.86
FCHO1-210ENST00000595594 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa26.7■■□□□ 1.86
FCHO1-210ENST00000595594 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
FCHO1-210ENST00000595594 NRKQ7Z2Y5 1582 aa26.68■■□□□ 1.86
FCHO1-210ENST00000595594 SIN3AQ96ST3 1273 aa26.68■■□□□ 1.86
FCHO1-210ENST00000595594 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa26.67■■□□□ 1.86
FCHO1-210ENST00000595594 PLEKHG3A1L390 1219 aa26.67■■□□□ 1.86
FCHO1-210ENST00000595594 L3MBTL2Q969R5 705 aa26.67■■□□□ 1.86
FCHO1-210ENST00000595594 ABTB2Q8N961 1025 aa26.66■■□□□ 1.86
FCHO1-210ENST00000595594 RGPD1P0DJD0 1748 aa26.65■■□□□ 1.86
FCHO1-210ENST00000595594 USP35Q9P2H5 1018 aa26.64■■□□□ 1.86
FCHO1-210ENST00000595594 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa26.64■■□□□ 1.85
FCHO1-210ENST00000595594 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa26.64■■□□□ 1.85
FCHO1-210ENST00000595594 NEUROD1Q13562 356 aa26.62■■□□□ 1.85
FCHO1-210ENST00000595594 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
FCHO1-210ENST00000595594 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa26.6■■□□□ 1.85
FCHO1-210ENST00000595594 BAG6P46379 1132 aa26.6■■□□□ 1.85
FCHO1-210ENST00000595594 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
FCHO1-210ENST00000595594 EVA1CP58658 441 aa26.59■■□□□ 1.85
FCHO1-210ENST00000595594 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
FCHO1-210ENST00000595594 LMO7Q8WWI1 1683 aa26.59■■□□□ 1.85
FCHO1-210ENST00000595594 SSH2Q76I76 1423 aa26.58■■□□□ 1.85
FCHO1-210ENST00000595594 ZBTB7CA1YPR0 619 aa26.58■■□□□ 1.85
FCHO1-210ENST00000595594 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
FCHO1-210ENST00000595594 CABP1Q9NZU7 370 aa26.57■■□□□ 1.84
FCHO1-210ENST00000595594 USP19O94966 1318 aa26.57■■□□□ 1.84
FCHO1-210ENST00000595594 NLRP13Q86W25 1043 aa26.54■■□□□ 1.84
FCHO1-210ENST00000595594 GCP02774 474 aa26.53■■□□□ 1.84
FCHO1-210ENST00000595594 PIK3C2AO00443 1686 aa26.52■■□□□ 1.84
FCHO1-210ENST00000595594 CPDO75976 1380 aa26.52■■□□□ 1.84
FCHO1-210ENST00000595594 TRIM37O94972 964 aa26.52■■□□□ 1.84
FCHO1-210ENST00000595594 USP6P35125 1406 aa26.52■■□□□ 1.84
FCHO1-210ENST00000595594 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
FCHO1-210ENST00000595594 AKAP12Q02952 1782 aa26.49■■□□□ 1.83
FCHO1-210ENST00000595594 NLRP6P59044 892 aa26.49■■□□□ 1.83
FCHO1-210ENST00000595594 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
FCHO1-210ENST00000595594 EVC2Q86UK5 1308 aa26.48■■□□□ 1.83
FCHO1-210ENST00000595594 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
FCHO1-210ENST00000595594 RGPD5Q99666 1765 aa26.46■■□□□ 1.83
FCHO1-210ENST00000595594 SLIT3O75094 1523 aa26.46■■□□□ 1.83
FCHO1-210ENST00000595594 BARGINQ6ZT62 677 aa26.46■■□□□ 1.83
FCHO1-210ENST00000595594 TCP11L2Q8N4U5 519 aa26.46■■□□□ 1.83
FCHO1-210ENST00000595594 LRP5O75197 1615 aa26.46■■□□□ 1.83
FCHO1-210ENST00000595594 PDE3BQ13370 1112 aa26.45■■□□□ 1.82
FCHO1-210ENST00000595594 FAM196AQ6ZSG2 479 aa26.45■■□□□ 1.82
FCHO1-210ENST00000595594 COL18A1P39060 1754 aa26.44■■□□□ 1.82
FCHO1-210ENST00000595594 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
FCHO1-210ENST00000595594 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
FCHO1-210ENST00000595594 SOX12O15370 315 aa26.43■■□□□ 1.82
FCHO1-210ENST00000595594 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
FCHO1-210ENST00000595594 DISP2A7MBM2 1401 aa26.42■■□□□ 1.82
FCHO1-210ENST00000595594 APBA3O96018 575 aa26.42■■□□□ 1.82
FCHO1-210ENST00000595594 CAMKK2Q96RR4 588 aa26.4■■□□□ 1.82
FCHO1-210ENST00000595594 WNK3Q9BYP7 1800 aa26.39■■□□□ 1.81
FCHO1-210ENST00000595594 CRB1P82279 1406 aa26.39■■□□□ 1.81
FCHO1-210ENST00000595594 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa26.39■■□□□ 1.81
FCHO1-210ENST00000595594 RREB1Q92766 1687 aa26.38■■□□□ 1.81
FCHO1-210ENST00000595594 NUP188Q5SRE5 1749 aa26.37■■□□□ 1.81
FCHO1-210ENST00000595594 AATKQ6ZMQ8 1374 aa26.37■■□□□ 1.81
FCHO1-210ENST00000595594 LRRC37A3O60309 1634 aa26.37■■□□□ 1.81
FCHO1-210ENST00000595594 AXIN2Q9Y2T1 843 aa26.37■■□□□ 1.81
FCHO1-210ENST00000595594 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
FCHO1-210ENST00000595594 MON2Q7Z3U7 1717 aa26.36■■□□□ 1.81
FCHO1-210ENST00000595594 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa26.35■■□□□ 1.81
FCHO1-210ENST00000595594 SBF2Q86WG5 1849 aa26.35■■□□□ 1.81
FCHO1-210ENST00000595594 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
FCHO1-210ENST00000595594 PEAK1Q9H792 1746 aa26.34■■□□□ 1.81
FCHO1-210ENST00000595594 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.8
FCHO1-210ENST00000595594 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.9 ms