RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592576.5

EFTUD2-223, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, human

TSL 2 BASIC

Gene EFTUD2, Length 3,364 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFTUD2-223	ENST00000592576	KIF1A	Q12756	1690 aa		12.47	□□□□□ -0.41
EFTUD2-223	ENST00000592576	PAK3	O75914	559 aa	Predicted RBP	12.47	□□□□□ -0.41
EFTUD2-223	ENST00000592576	CERK	Q8TCT0	537 aa		12.47	□□□□□ -0.41
EFTUD2-223	ENST00000592576	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		12.46	□□□□□ -0.41
EFTUD2-223	ENST00000592576	NRK	Q7Z2Y5	1582 aa		12.46	□□□□□ -0.41
EFTUD2-223	ENST00000592576	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		12.46	□□□□□ -0.41
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZRANB1	Q9UGI0	708 aa		12.46	□□□□□ -0.41
EFTUD2-223	ENST00000592576	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		12.46	□□□□□ -0.42
EFTUD2-223	ENST00000592576	RALBP1	Q15311	655 aa		12.46	□□□□□ -0.42
EFTUD2-223	ENST00000592576	NSD2	O96028	1365 aa		12.45	□□□□□ -0.42
EFTUD2-223	ENST00000592576	TOM1	O60784	492 aa		12.45	□□□□□ -0.42
EFTUD2-223	ENST00000592576	MORC1	Q86VD1	984 aa		12.45	□□□□□ -0.42
EFTUD2-223	ENST00000592576	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		12.45	□□□□□ -0.42
EFTUD2-223	ENST00000592576	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		12.44	□□□□□ -0.42
EFTUD2-223	ENST00000592576	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	12.44	□□□□□ -0.42
EFTUD2-223	ENST00000592576	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	12.44	□□□□□ -0.42
EFTUD2-223	ENST00000592576	ABTB2	Q8N961	1025 aa		12.43	□□□□□ -0.42
EFTUD2-223	ENST00000592576	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		12.43	□□□□□ -0.42
EFTUD2-223	ENST00000592576	PIP4K2B	P78356	416 aa		12.43	□□□□□ -0.42
EFTUD2-223	ENST00000592576	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		12.43	□□□□□ -0.42
EFTUD2-223	ENST00000592576	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		12.43	□□□□□ -0.42
EFTUD2-223	ENST00000592576	COG3	Q96JB2	828 aa		12.42	□□□□□ -0.42
EFTUD2-223	ENST00000592576	NLRP6	P59044	892 aa		12.42	□□□□□ -0.42
EFTUD2-223	ENST00000592576	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		12.42	□□□□□ -0.42
EFTUD2-223	ENST00000592576	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		12.42	□□□□□ -0.42
EFTUD2-223	ENST00000592576	PXDN	Q92626	1479 aa		12.42	□□□□□ -0.42
EFTUD2-223	ENST00000592576	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	12.41	□□□□□ -0.42
EFTUD2-223	ENST00000592576	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	12.41	□□□□□ -0.42
EFTUD2-223	ENST00000592576	PIK3C2A	O00443	1686 aa		12.41	□□□□□ -0.42
EFTUD2-223	ENST00000592576	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	12.41	□□□□□ -0.42
EFTUD2-223	ENST00000592576	PPP2R1A	P30153	589 aa		12.41	□□□□□ -0.42
EFTUD2-223	ENST00000592576	FBLN1	P23142	703 aa		12.4	□□□□□ -0.42
EFTUD2-223	ENST00000592576	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		12.4	□□□□□ -0.42
EFTUD2-223	ENST00000592576	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		12.4	□□□□□ -0.42
EFTUD2-223	ENST00000592576	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	12.4	□□□□□ -0.42
EFTUD2-223	ENST00000592576	CCDC184	Q52MB2	194 aa		12.4	□□□□□ -0.42
EFTUD2-223	ENST00000592576	SBNO1	A3KN83	1393 aa		12.4	□□□□□ -0.42
EFTUD2-223	ENST00000592576	USP31	Q70CQ4	1352 aa		12.4	□□□□□ -0.42
EFTUD2-223	ENST00000592576	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		12.39	□□□□□ -0.43
EFTUD2-223	ENST00000592576	NLRP13	Q86W25	1043 aa		12.39	□□□□□ -0.43
EFTUD2-223	ENST00000592576	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		12.39	□□□□□ -0.43
EFTUD2-223	ENST00000592576	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		12.38	□□□□□ -0.43
EFTUD2-223	ENST00000592576	CCER2	I3L3R5	266 aa		12.38	□□□□□ -0.43
EFTUD2-223	ENST00000592576	SOX12	O15370	315 aa		12.38	□□□□□ -0.43
EFTUD2-223	ENST00000592576	PLEKHG5	O94827	1062 aa		12.38	□□□□□ -0.43
EFTUD2-223	ENST00000592576	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		12.38	□□□□□ -0.43
EFTUD2-223	ENST00000592576	MRS2	Q9HD23	443 aa		12.37	□□□□□ -0.43
EFTUD2-223	ENST00000592576	ALS2	Q96Q42	1657 aa		12.36	□□□□□ -0.43
EFTUD2-223	ENST00000592576	MTHFS	P49914	203 aa		12.36	□□□□□ -0.43
EFTUD2-223	ENST00000592576	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	12.36	□□□□□ -0.43
EFTUD2-223	ENST00000592576	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	12.35	□□□□□ -0.43
EFTUD2-223	ENST00000592576	MARF1	Q9Y4F3	1742 aa	Known RBP	12.35	□□□□□ -0.43
EFTUD2-223	ENST00000592576	ARHGEF10	O15013	1369 aa		12.35	□□□□□ -0.43
EFTUD2-223	ENST00000592576	POLK	Q9UBT6	870 aa		12.35	□□□□□ -0.43
EFTUD2-223	ENST00000592576	AATK	Q6ZMQ8	1374 aa		12.34	□□□□□ -0.43
EFTUD2-223	ENST00000592576	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	12.34	□□□□□ -0.43
EFTUD2-223	ENST00000592576	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		12.34	□□□□□ -0.43
EFTUD2-223	ENST00000592576	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		12.34	□□□□□ -0.43
EFTUD2-223	ENST00000592576	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	12.34	□□□□□ -0.43
EFTUD2-223	ENST00000592576	USP19	O94966	1318 aa		12.34	□□□□□ -0.43
EFTUD2-223	ENST00000592576	USP54	Q70EL1	1684 aa		12.34	□□□□□ -0.43
EFTUD2-223	ENST00000592576	GC	P02774	474 aa		12.33	□□□□□ -0.43
EFTUD2-223	ENST00000592576	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		12.33	□□□□□ -0.44
EFTUD2-223	ENST00000592576	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	12.32	□□□□□ -0.44
EFTUD2-223	ENST00000592576	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		12.32	□□□□□ -0.44
EFTUD2-223	ENST00000592576	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	12.32	□□□□□ -0.44
EFTUD2-223	ENST00000592576	PHLPP1	O60346	1717 aa		12.32	□□□□□ -0.44
EFTUD2-223	ENST00000592576	SLIT3	O75094	1523 aa		12.31	□□□□□ -0.44
EFTUD2-223	ENST00000592576	NFAT5	O94916	1531 aa		12.31	□□□□□ -0.44
EFTUD2-223	ENST00000592576	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	12.31	□□□□□ -0.44
EFTUD2-223	ENST00000592576	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	12.3	□□□□□ -0.44
EFTUD2-223	ENST00000592576	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	12.3	□□□□□ -0.44
EFTUD2-223	ENST00000592576	CFAP53	Q96M91	514 aa		12.3	□□□□□ -0.44
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	12.29	□□□□□ -0.44
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		12.29	□□□□□ -0.44
EFTUD2-223	ENST00000592576	AMPH	P49418	695 aa		12.29	□□□□□ -0.44
EFTUD2-223	ENST00000592576	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		12.29	□□□□□ -0.44
EFTUD2-223	ENST00000592576	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		12.29	□□□□□ -0.44
EFTUD2-223	ENST00000592576	PELP1	Q8IZL8	1130 aa	Known RBP	12.29	□□□□□ -0.44
EFTUD2-223	ENST00000592576	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		12.28	□□□□□ -0.44
EFTUD2-223	ENST00000592576	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		12.28	□□□□□ -0.44
EFTUD2-223	ENST00000592576	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	12.28	□□□□□ -0.44
EFTUD2-223	ENST00000592576	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	12.28	□□□□□ -0.44
EFTUD2-223	ENST00000592576	PHRF1	Q9P1Y6	1649 aa	Known RBP	12.27	□□□□□ -0.44
EFTUD2-223	ENST00000592576	PEAK1	Q9H792	1746 aa		12.27	□□□□□ -0.44
EFTUD2-223	ENST00000592576	FLT4	P35916	1363 aa		12.27	□□□□□ -0.45
EFTUD2-223	ENST00000592576	HSPA1L	P34931	641 aa		12.27	□□□□□ -0.45
EFTUD2-223	ENST00000592576	CRYBG1	Q9Y4K1	1723 aa		12.27	□□□□□ -0.45
EFTUD2-223	ENST00000592576	INSR	P06213	1382 aa		12.27	□□□□□ -0.45
EFTUD2-223	ENST00000592576	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	12.27	□□□□□ -0.45
EFTUD2-223	ENST00000592576	HOXC9	P31274	260 aa		12.26	□□□□□ -0.45
EFTUD2-223	ENST00000592576	KIAA0232	Q92628	1395 aa		12.26	□□□□□ -0.45
EFTUD2-223	ENST00000592576	LTN1	O94822	1766 aa		12.26	□□□□□ -0.45
EFTUD2-223	ENST00000592576	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	12.26	□□□□□ -0.45
EFTUD2-223	ENST00000592576	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		12.25	□□□□□ -0.45
EFTUD2-223	ENST00000592576	IP6K1	Q92551	441 aa		12.25	□□□□□ -0.45
EFTUD2-223	ENST00000592576	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	12.25	□□□□□ -0.45
EFTUD2-223	ENST00000592576	CHRNA2	Q15822	529 aa		12.25	□□□□□ -0.45
EFTUD2-223	ENST00000592576	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		12.24	□□□□□ -0.45
EFTUD2-223	ENST00000592576	RTL1	A6NKG5	1358 aa		12.24	□□□□□ -0.45

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 112.7 ms