RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591824.5

POP4-211, Transcript of POP4 homolog, ribonuclease P/MRP subunit, humanhuman

TSL 5

Gene POP4, Length 846 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4-211ENST00000591824 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
POP4-211ENST00000591824 NUTM2GQ5VZR2 741 aa23.07■■□□□ 1.28
POP4-211ENST00000591824 ALS2Q96Q42 1657 aa23.06■■□□□ 1.28
POP4-211ENST00000591824 BCL9LQ86UU0 1499 aa23.06■■□□□ 1.28
POP4-211ENST00000591824 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
POP4-211ENST00000591824 UNC5CLQ8IV45 518 aa23.05■■□□□ 1.28
POP4-211ENST00000591824 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa23.04■■□□□ 1.28
POP4-211ENST00000591824 ABTB2Q8N961 1025 aa23.04■■□□□ 1.28
POP4-211ENST00000591824 ATRNO75882 1429 aa23.04■■□□□ 1.28
POP4-211ENST00000591824 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
POP4-211ENST00000591824 ATAD2Q6PL18 1390 aa23.03■■□□□ 1.28
POP4-211ENST00000591824 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa23.03■■□□□ 1.28
POP4-211ENST00000591824 SLIT2O94813 1529 aa23.03■■□□□ 1.28
POP4-211ENST00000591824 ABCA3Q99758 1704 aa23.02■■□□□ 1.28
POP4-211ENST00000591824 FAM83GA6ND36 823 aa23.02■■□□□ 1.28
POP4-211ENST00000591824 RGS12O14924 1447 aa23.01■■□□□ 1.27
POP4-211ENST00000591824 USP6P35125 1406 aa22.99■■□□□ 1.27
POP4-211ENST00000591824 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa22.99■■□□□ 1.27
POP4-211ENST00000591824 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
POP4-211ENST00000591824 PRDM11Q9NQV5 511 aa22.99■■□□□ 1.27
POP4-211ENST00000591824 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
POP4-211ENST00000591824 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
POP4-211ENST00000591824 TMC1Q8TDI8 760 aa22.97■■□□□ 1.27
POP4-211ENST00000591824 BTG4Q9NY30 223 aa22.97■■□□□ 1.27
POP4-211ENST00000591824 NLRP13Q86W25 1043 aa22.96■■□□□ 1.27
POP4-211ENST00000591824 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
POP4-211ENST00000591824 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
POP4-211ENST00000591824 KIAA0232Q92628 1395 aa22.95■■□□□ 1.26
POP4-211ENST00000591824 USP47Q96K76 1375 aa22.95■■□□□ 1.26
POP4-211ENST00000591824 PLCH1Q4KWH8 1693 aa22.94■■□□□ 1.26
POP4-211ENST00000591824 NLRP6P59044 892 aa22.94■■□□□ 1.26
POP4-211ENST00000591824 VPS72Q15906 364 aa22.94■■□□□ 1.26
POP4-211ENST00000591824 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
POP4-211ENST00000591824 CHRNA2Q15822 529 aa22.93■■□□□ 1.26
POP4-211ENST00000591824 TESK2Q96S53 571 aa22.93■■□□□ 1.26
POP4-211ENST00000591824 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
POP4-211ENST00000591824 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa22.92■■□□□ 1.26
POP4-211ENST00000591824 SLC24A1O60721 1099 aa22.92■■□□□ 1.26
POP4-211ENST00000591824 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
POP4-211ENST00000591824 USP19O94966 1318 aa22.91■■□□□ 1.26
POP4-211ENST00000591824 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
POP4-211ENST00000591824 NWD2Q9ULI1 1742 aa22.91■■□□□ 1.26
POP4-211ENST00000591824 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa22.9■■□□□ 1.26
POP4-211ENST00000591824 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
POP4-211ENST00000591824 SSH2Q76I76 1423 aa22.9■■□□□ 1.26
POP4-211ENST00000591824 GCP02774 474 aa22.89■■□□□ 1.25
POP4-211ENST00000591824 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa22.89■■□□□ 1.25
POP4-211ENST00000591824 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
POP4-211ENST00000591824 ZBTB7CA1YPR0 619 aa22.88■■□□□ 1.25
POP4-211ENST00000591824 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP22.88■■□□□ 1.25
POP4-211ENST00000591824 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
POP4-211ENST00000591824 NRKQ7Z2Y5 1582 aa22.88■■□□□ 1.25
POP4-211ENST00000591824 TTC21AQ8NDW8 1320 aa22.87■■□□□ 1.25
POP4-211ENST00000591824 A0A0G2JS52 829 aa22.87■■□□□ 1.25
POP4-211ENST00000591824 TMF1P82094 1093 aa22.87■■□□□ 1.25
POP4-211ENST00000591824 MYT1Q01538 1121 aa22.87■■□□□ 1.25
POP4-211ENST00000591824 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP22.87■■□□□ 1.25
POP4-211ENST00000591824 STRN4Q9NRL3 753 aa22.87■■□□□ 1.25
POP4-211ENST00000591824 TERF2IPQ9NYB0 399 aa22.87■■□□□ 1.25
POP4-211ENST00000591824 GLI3P10071 1580 aa22.87■■□□□ 1.25
POP4-211ENST00000591824 CPDO75976 1380 aa22.85■■□□□ 1.25
POP4-211ENST00000591824 AKAP12Q02952 1782 aa22.84■■□□□ 1.25
POP4-211ENST00000591824 EVA1CP58658 441 aa22.84■■□□□ 1.25
POP4-211ENST00000591824 NRAPQ86VF7 1730 aa22.84■■□□□ 1.25
POP4-211ENST00000591824 PIK3C2AO00443 1686 aa22.84■■□□□ 1.25
POP4-211ENST00000591824 SOX12O15370 315 aa22.83■■□□□ 1.25
POP4-211ENST00000591824 SEPT12Q8IYM1 358 aa22.83■■□□□ 1.25
POP4-211ENST00000591824 CD163L1Q9NR16 1453 aa22.83■■□□□ 1.25
POP4-211ENST00000591824 NINLQ9Y2I6 1382 aa22.82■■□□□ 1.24
POP4-211ENST00000591824 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
POP4-211ENST00000591824 A0A1W2PP64 1363 aa22.81■■□□□ 1.24
POP4-211ENST00000591824 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa22.81■■□□□ 1.24
POP4-211ENST00000591824 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa22.81■■□□□ 1.24
POP4-211ENST00000591824 CDCA8Q53HL2 280 aa22.8■■□□□ 1.24
POP4-211ENST00000591824 KCNH5Q8NCM2 988 aa22.8■■□□□ 1.24
POP4-211ENST00000591824 SLIT3O75094 1523 aa22.8■■□□□ 1.24
POP4-211ENST00000591824 NME9Q86XW9 330 aa22.79■■□□□ 1.24
POP4-211ENST00000591824 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
POP4-211ENST00000591824 MON2Q7Z3U7 1717 aa22.79■■□□□ 1.24
POP4-211ENST00000591824 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
POP4-211ENST00000591824 USP35Q9P2H5 1018 aa22.78■■□□□ 1.24
POP4-211ENST00000591824 ZRANB1Q9UGI0 708 aa22.78■■□□□ 1.24
POP4-211ENST00000591824 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa22.77■■□□□ 1.24
POP4-211ENST00000591824 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa22.76■■□□□ 1.23
POP4-211ENST00000591824 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
POP4-211ENST00000591824 AATKQ6ZMQ8 1374 aa22.75■■□□□ 1.23
POP4-211ENST00000591824 KRT27Q7Z3Y8 459 aa22.74■■□□□ 1.23
POP4-211ENST00000591824 USP31Q70CQ4 1352 aa22.74■■□□□ 1.23
POP4-211ENST00000591824 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP22.73■■□□□ 1.23
POP4-211ENST00000591824 ARHGEF25Q86VW2 580 aa22.73■■□□□ 1.23
POP4-211ENST00000591824 LMO7Q8WWI1 1683 aa22.73■■□□□ 1.23
POP4-211ENST00000591824 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa22.73■■□□□ 1.23
POP4-211ENST00000591824 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
POP4-211ENST00000591824 POLR3GLQ9BT43 218 aa22.71■■□□□ 1.23
POP4-211ENST00000591824 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
POP4-211ENST00000591824 TCP11L2Q8N4U5 519 aa22.69■■□□□ 1.22
POP4-211ENST00000591824 AXIN2Q9Y2T1 843 aa22.69■■□□□ 1.22
POP4-211ENST00000591824 EP400Q96L91 3159 aa22.69■■□□□ 1.22
POP4-211ENST00000591824 NFAT5O94916 1531 aa22.68■■□□□ 1.22
POP4-211ENST00000591824 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.3 ms