RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590720.5

PSME3-210, Transcript of proteasome activator subunit 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PSME3, Length 998 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME3-210ENST00000590720 BRWD3Q6RI45 1802 aa29.34■■■□□ 2.29
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PSME3-210ENST00000590720 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP29.31■■■□□ 2.28
PSME3-210ENST00000590720 L3MBTL2Q969R5 705 aa29.3■■■□□ 2.28
PSME3-210ENST00000590720 QRICH2Q9H0J4 1663 aa29.3■■■□□ 2.28
PSME3-210ENST00000590720 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP29.3■■■□□ 2.28
PSME3-210ENST00000590720 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP29.29■■■□□ 2.28
PSME3-210ENST00000590720 CCDC61Q9Y6R9 512 aa29.29■■■□□ 2.28
PSME3-210ENST00000590720 SEPT12Q8IYM1 358 aa29.28■■■□□ 2.28
PSME3-210ENST00000590720 BTG4Q9NY30 223 aa29.28■■■□□ 2.28
PSME3-210ENST00000590720 ACEP12821 1306 aa29.27■■■□□ 2.28
PSME3-210ENST00000590720 SIN3AQ96ST3 1273 aa29.27■■■□□ 2.28
PSME3-210ENST00000590720 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa29.27■■■□□ 2.28
PSME3-210ENST00000590720 CCDC125Q86Z20 511 aa29.26■■■□□ 2.27
PSME3-210ENST00000590720 PLEKHG3A1L390 1219 aa29.25■■■□□ 2.27
PSME3-210ENST00000590720 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP29.25■■■□□ 2.27
PSME3-210ENST00000590720 NBPF8Q3BBV2 869 aa29.23■■■□□ 2.27
PSME3-210ENST00000590720 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP29.22■■■□□ 2.27
PSME3-210ENST00000590720 PRDM11Q9NQV5 511 aa29.22■■■□□ 2.27
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PSME3-210ENST00000590720 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa29.21■■■□□ 2.27
PSME3-210ENST00000590720 KIAA0232Q92628 1395 aa29.2■■■□□ 2.26
PSME3-210ENST00000590720 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP29.19■■■□□ 2.26
PSME3-210ENST00000590720 NEUROD1Q13562 356 aa29.19■■■□□ 2.26
PSME3-210ENST00000590720 NUTM2GQ5VZR2 741 aa29.19■■■□□ 2.26
PSME3-210ENST00000590720 CABP2Q9NPB3 220 aa29.19■■■□□ 2.26
PSME3-210ENST00000590720 NRKQ7Z2Y5 1582 aa29.18■■■□□ 2.26
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PSME3-210ENST00000590720 MYT1Q01538 1121 aa29.17■■■□□ 2.26
PSME3-210ENST00000590720 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa29.16■■■□□ 2.26
PSME3-210ENST00000590720 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa29.16■■■□□ 2.26
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PSME3-210ENST00000590720 CHRNA2Q15822 529 aa29.14■■■□□ 2.26
PSME3-210ENST00000590720 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa29.13■■■□□ 2.25
PSME3-210ENST00000590720 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP29.13■■■□□ 2.25
PSME3-210ENST00000590720 ABTB2Q8N961 1025 aa29.13■■■□□ 2.25
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PSME3-210ENST00000590720 ZRANB1Q9UGI0 708 aa29.1■■■□□ 2.25
PSME3-210ENST00000590720 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP29.09■■■□□ 2.25
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PSME3-210ENST00000590720 CABP1Q9NZU7 370 aa29.08■■■□□ 2.25
PSME3-210ENST00000590720 EVC2Q86UK5 1308 aa29.08■■■□□ 2.25
PSME3-210ENST00000590720 USP6P35125 1406 aa29.08■■■□□ 2.25
PSME3-210ENST00000590720 LMO7Q8WWI1 1683 aa29.08■■■□□ 2.25
PSME3-210ENST00000590720 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa29.07■■■□□ 2.24
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PSME3-210ENST00000590720 STRN4Q9NRL3 753 aa29.06■■■□□ 2.24
PSME3-210ENST00000590720 NLRP13Q86W25 1043 aa29.05■■■□□ 2.24
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PSME3-210ENST00000590720 FAM182BQ5T319 152 aa28.99■■■□□ 2.23
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PSME3-210ENST00000590720 USP35Q9P2H5 1018 aa28.97■■■□□ 2.23
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PSME3-210ENST00000590720 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP28.95■■■□□ 2.22
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PSME3-210ENST00000590720 TONSLQ96HA7 1378 aa28.94■■■□□ 2.22
PSME3-210ENST00000590720 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa28.94■■■□□ 2.22
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PSME3-210ENST00000590720 CARD11Q9BXL7 1154 aa28.92■■■□□ 2.22
PSME3-210ENST00000590720 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP28.91■■■□□ 2.22
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PSME3-210ENST00000590720 TCP11L2Q8N4U5 519 aa28.9■■■□□ 2.22
PSME3-210ENST00000590720 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa28.9■■■□□ 2.22
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PSME3-210ENST00000590720 MON2Q7Z3U7 1717 aa28.88■■■□□ 2.21
PSME3-210ENST00000590720 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP28.87■■■□□ 2.21
PSME3-210ENST00000590720 COL18A1P39060 1754 aa28.87■■■□□ 2.21
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PSME3-210ENST00000590720 KCNH5Q8NCM2 988 aa28.81■■■□□ 2.2
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PSME3-210ENST00000590720 USP54Q70EL1 1684 aa28.78■■■□□ 2.2
PSME3-210ENST00000590720 ARHGEF25Q86VW2 580 aa28.78■■■□□ 2.2
PSME3-210ENST00000590720 AXIN2Q9Y2T1 843 aa28.78■■■□□ 2.2
PSME3-210ENST00000590720 LRRC37A3O60309 1634 aa28.78■■■□□ 2.2
PSME3-210ENST00000590720 SOX12O15370 315 aa28.77■■■□□ 2.2
PSME3-210ENST00000590720 RGPD5Q99666 1765 aa28.77■■■□□ 2.2
PSME3-210ENST00000590720 WDR17Q8IZU2 1322 aa28.76■■■□□ 2.19
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