RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588345.1

CTIF-206, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 584 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-206ENST00000588345 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
CTIF-206ENST00000588345 CCDC125Q86Z20 511 aa26.44■■□□□ 1.82
CTIF-206ENST00000588345 EP400Q96L91 3159 aa26.43■■□□□ 1.82
CTIF-206ENST00000588345 CCDC61Q9Y6R9 512 aa26.43■■□□□ 1.82
CTIF-206ENST00000588345 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
CTIF-206ENST00000588345 PLEKHG3A1L390 1219 aa26.41■■□□□ 1.82
CTIF-206ENST00000588345 L3MBTL2Q969R5 705 aa26.41■■□□□ 1.82
CTIF-206ENST00000588345 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
CTIF-206ENST00000588345 SEPT12Q8IYM1 358 aa26.4■■□□□ 1.82
CTIF-206ENST00000588345 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.82
CTIF-206ENST00000588345 BTG4Q9NY30 223 aa26.39■■□□□ 1.82
CTIF-206ENST00000588345 ACEP12821 1306 aa26.39■■□□□ 1.81
CTIF-206ENST00000588345 NBPF8Q3BBV2 869 aa26.38■■□□□ 1.81
CTIF-206ENST00000588345 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
CTIF-206ENST00000588345 QRICH2Q9H0J4 1663 aa26.38■■□□□ 1.81
CTIF-206ENST00000588345 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa26.36■■□□□ 1.81
CTIF-206ENST00000588345 SIN3AQ96ST3 1273 aa26.36■■□□□ 1.81
CTIF-206ENST00000588345 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
CTIF-206ENST00000588345 PRDM11Q9NQV5 511 aa26.33■■□□□ 1.81
CTIF-206ENST00000588345 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa26.32■■□□□ 1.8
CTIF-206ENST00000588345 KIAA0232Q92628 1395 aa26.32■■□□□ 1.8
CTIF-206ENST00000588345 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
CTIF-206ENST00000588345 KRT27Q7Z3Y8 459 aa26.31■■□□□ 1.8
CTIF-206ENST00000588345 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa26.31■■□□□ 1.8
CTIF-206ENST00000588345 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa26.31■■□□□ 1.8
CTIF-206ENST00000588345 NRKQ7Z2Y5 1582 aa26.29■■□□□ 1.8
CTIF-206ENST00000588345 CABP2Q9NPB3 220 aa26.29■■□□□ 1.8
CTIF-206ENST00000588345 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
CTIF-206ENST00000588345 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
CTIF-206ENST00000588345 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa26.28■■□□□ 1.8
CTIF-206ENST00000588345 NUTM2GQ5VZR2 741 aa26.27■■□□□ 1.8
CTIF-206ENST00000588345 USP19O94966 1318 aa26.27■■□□□ 1.8
CTIF-206ENST00000588345 NEUROD1Q13562 356 aa26.26■■□□□ 1.79
CTIF-206ENST00000588345 ABTB2Q8N961 1025 aa26.26■■□□□ 1.79
CTIF-206ENST00000588345 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
CTIF-206ENST00000588345 CPDO75976 1380 aa26.24■■□□□ 1.79
CTIF-206ENST00000588345 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
CTIF-206ENST00000588345 CHRNA2Q15822 529 aa26.24■■□□□ 1.79
CTIF-206ENST00000588345 ZRANB1Q9UGI0 708 aa26.24■■□□□ 1.79
CTIF-206ENST00000588345 A0A0G2JS52 829 aa26.23■■□□□ 1.79
CTIF-206ENST00000588345 MYT1Q01538 1121 aa26.23■■□□□ 1.79
CTIF-206ENST00000588345 USP6P35125 1406 aa26.22■■□□□ 1.79
CTIF-206ENST00000588345 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa26.22■■□□□ 1.79
CTIF-206ENST00000588345 CABP1Q9NZU7 370 aa26.22■■□□□ 1.79
CTIF-206ENST00000588345 LMO7Q8WWI1 1683 aa26.22■■□□□ 1.79
CTIF-206ENST00000588345 EVC2Q86UK5 1308 aa26.21■■□□□ 1.79
CTIF-206ENST00000588345 NLRP13Q86W25 1043 aa26.21■■□□□ 1.79
CTIF-206ENST00000588345 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.78
CTIF-206ENST00000588345 DEFB132Q7Z7B7 95 aa26.2■■□□□ 1.78
CTIF-206ENST00000588345 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa26.19■■□□□ 1.78
CTIF-206ENST00000588345 SSH2Q76I76 1423 aa26.19■■□□□ 1.78
CTIF-206ENST00000588345 STRN4Q9NRL3 753 aa26.18■■□□□ 1.78
CTIF-206ENST00000588345 GCP02774 474 aa26.16■■□□□ 1.78
CTIF-206ENST00000588345 SLIT3O75094 1523 aa26.15■■□□□ 1.78
CTIF-206ENST00000588345 RGPD1P0DJD0 1748 aa26.14■■□□□ 1.78
CTIF-206ENST00000588345 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa26.14■■□□□ 1.78
CTIF-206ENST00000588345 AKAP12Q02952 1782 aa26.13■■□□□ 1.77
CTIF-206ENST00000588345 PIK3C2AO00443 1686 aa26.13■■□□□ 1.77
CTIF-206ENST00000588345 BARGINQ6ZT62 677 aa26.13■■□□□ 1.77
CTIF-206ENST00000588345 EVA1CP58658 441 aa26.12■■□□□ 1.77
CTIF-206ENST00000588345 NLRP6P59044 892 aa26.11■■□□□ 1.77
CTIF-206ENST00000588345 BAG6P46379 1132 aa26.1■■□□□ 1.77
CTIF-206ENST00000588345 FAM182BQ5T319 152 aa26.1■■□□□ 1.77
CTIF-206ENST00000588345 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
CTIF-206ENST00000588345 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
CTIF-206ENST00000588345 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
CTIF-206ENST00000588345 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
CTIF-206ENST00000588345 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
CTIF-206ENST00000588345 DISP2A7MBM2 1401 aa26.07■■□□□ 1.76
CTIF-206ENST00000588345 USP35Q9P2H5 1018 aa26.07■■□□□ 1.76
CTIF-206ENST00000588345 AATKQ6ZMQ8 1374 aa26.07■■□□□ 1.76
CTIF-206ENST00000588345 TCP11L2Q8N4U5 519 aa26.06■■□□□ 1.76
CTIF-206ENST00000588345 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
CTIF-206ENST00000588345 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa26.06■■□□□ 1.76
CTIF-206ENST00000588345 TONSLQ96HA7 1378 aa26.06■■□□□ 1.76
CTIF-206ENST00000588345 COL18A1P39060 1754 aa26.05■■□□□ 1.76
CTIF-206ENST00000588345 CARD11Q9BXL7 1154 aa26.05■■□□□ 1.76
CTIF-206ENST00000588345 FAM196AQ6ZSG2 479 aa26.04■■□□□ 1.76
CTIF-206ENST00000588345 TTC21AQ8NDW8 1320 aa26.04■■□□□ 1.76
CTIF-206ENST00000588345 MON2Q7Z3U7 1717 aa26.03■■□□□ 1.76
CTIF-206ENST00000588345 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
CTIF-206ENST00000588345 CRB1P82279 1406 aa26.03■■□□□ 1.76
CTIF-206ENST00000588345 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa26.03■■□□□ 1.76
CTIF-206ENST00000588345 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
CTIF-206ENST00000588345 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
CTIF-206ENST00000588345 PDE3BQ13370 1112 aa25.99■■□□□ 1.75
CTIF-206ENST00000588345 KCNH5Q8NCM2 988 aa25.99■■□□□ 1.75
CTIF-206ENST00000588345 ARHGEF25Q86VW2 580 aa25.98■■□□□ 1.75
CTIF-206ENST00000588345 CD163L1Q9NR16 1453 aa25.98■■□□□ 1.75
CTIF-206ENST00000588345 USP54Q70EL1 1684 aa25.97■■□□□ 1.75
CTIF-206ENST00000588345 ZBTB7CA1YPR0 619 aa25.97■■□□□ 1.75
CTIF-206ENST00000588345 TRIM37O94972 964 aa25.96■■□□□ 1.75
CTIF-206ENST00000588345 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
CTIF-206ENST00000588345 NFAT5O94916 1531 aa25.96■■□□□ 1.75
CTIF-206ENST00000588345 AXIN2Q9Y2T1 843 aa25.95■■□□□ 1.74
CTIF-206ENST00000588345 USP31Q70CQ4 1352 aa25.95■■□□□ 1.74
CTIF-206ENST00000588345 LRP5O75197 1615 aa25.94■■□□□ 1.74
CTIF-206ENST00000588345 ABCC6O95255 1503 aa25.93■■□□□ 1.74
CTIF-206ENST00000588345 WNK3Q9BYP7 1800 aa25.93■■□□□ 1.74
CTIF-206ENST00000588345 WDR17Q8IZU2 1322 aa25.93■■□□□ 1.74
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