RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585084.5

GPS1-225, Transcript of G protein pathway suppressor 1, human

TSL 3

Gene GPS1, Length 997 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPS1-225	ENST00000585084	NEUROD1	Q13562	356 aa		40.99	■■■■■ 4.15
GPS1-225	ENST00000585084	ACE	P12821	1306 aa		40.96	■■■■■ 4.15
GPS1-225	ENST00000585084	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	40.96	■■■■■ 4.15
GPS1-225	ENST00000585084	BTG4	Q9NY30	223 aa		40.95	■■■■■ 4.15
GPS1-225	ENST00000585084	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	40.95	■■■■■ 4.15
GPS1-225	ENST00000585084	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		40.94	■■■■■ 4.14
GPS1-225	ENST00000585084	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		40.94	■■■■■ 4.14
GPS1-225	ENST00000585084	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		40.93	■■■■■ 4.14
GPS1-225	ENST00000585084	SEPT12	Q8IYM1	358 aa		40.93	■■■■■ 4.14
GPS1-225	ENST00000585084	CCDC125	Q86Z20	511 aa		40.92	■■■■■ 4.14
GPS1-225	ENST00000585084	COL14A1	Q05707	1796 aa	Known RBP	40.91	■■■■■ 4.14
GPS1-225	ENST00000585084	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		40.89	■■■■■ 4.14
GPS1-225	ENST00000585084	CRYBG1	Q9Y4K1	1723 aa		40.88	■■■■■ 4.13
GPS1-225	ENST00000585084	ONECUT3	O60422	494 aa	Predicted RBP	40.87	■■■■■ 4.13
GPS1-225	ENST00000585084	CABP2	Q9NPB3	220 aa		40.87	■■■■■ 4.13
GPS1-225	ENST00000585084	QRICH2	Q9H0J4	1663 aa		40.86	■■■■■ 4.13
GPS1-225	ENST00000585084	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		40.86	■■■■■ 4.13
GPS1-225	ENST00000585084	NRAP	Q86VF7	1730 aa		40.85	■■■■■ 4.13
GPS1-225	ENST00000585084	PPIP5K1	Q6PFW1	1433 aa		40.84	■■■■■ 4.13
GPS1-225	ENST00000585084	BRWD3	Q6RI45	1802 aa		40.83	■■■■■ 4.13
GPS1-225	ENST00000585084	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		40.83	■■■■■ 4.13
GPS1-225	ENST00000585084		A0A0G2JS52	829 aa		40.83	■■■■■ 4.13
GPS1-225	ENST00000585084	MYT1	Q01538	1121 aa		40.83	■■■■■ 4.13
GPS1-225	ENST00000585084	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	40.82	■■■■■ 4.12
GPS1-225	ENST00000585084	ABTB2	Q8N961	1025 aa		40.8	■■■■■ 4.12
GPS1-225	ENST00000585084	KIAA0232	Q92628	1395 aa		40.79	■■■■■ 4.12
GPS1-225	ENST00000585084	EP400	Q96L91	3159 aa		40.79	■■■■■ 4.12
GPS1-225	ENST00000585084	FAM98C	Q17RN3	349 aa	Known RBP	40.78	■■■■■ 4.12
GPS1-225	ENST00000585084	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		40.78	■■■■■ 4.12
GPS1-225	ENST00000585084	PHRF1	Q9P1Y6	1649 aa	Known RBP	40.77	■■■■■ 4.12
GPS1-225	ENST00000585084	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	40.76	■■■■■ 4.12
GPS1-225	ENST00000585084	EVC2	Q86UK5	1308 aa		40.75	■■■■■ 4.11
GPS1-225	ENST00000585084	BLM	P54132	1417 aa	Predicted RBP	40.75	■■■■■ 4.11
GPS1-225	ENST00000585084	CHRNA2	Q15822	529 aa		40.74	■■■■■ 4.11
GPS1-225	ENST00000585084	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		40.73	■■■■■ 4.11
GPS1-225	ENST00000585084	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		40.73	■■■■■ 4.11
GPS1-225	ENST00000585084	CABP1	Q9NZU7	370 aa		40.73	■■■■■ 4.11
GPS1-225	ENST00000585084	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	40.7	■■■■■ 4.11
GPS1-225	ENST00000585084	NLRP13	Q86W25	1043 aa		40.7	■■■■■ 4.11
GPS1-225	ENST00000585084	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	40.7	■■■■■ 4.11
GPS1-225	ENST00000585084	STRN4	Q9NRL3	753 aa		40.67	■■■■■ 4.1
GPS1-225	ENST00000585084	ZRANB1	Q9UGI0	708 aa		40.67	■■■■■ 4.1
GPS1-225	ENST00000585084	USP19	O94966	1318 aa		40.66	■■■■■ 4.1
GPS1-225	ENST00000585084	EVA1C	P58658	441 aa		40.63	■■■■■ 4.09
GPS1-225	ENST00000585084	NRK	Q7Z2Y5	1582 aa		40.63	■■■■■ 4.09
GPS1-225	ENST00000585084	USP6	P35125	1406 aa		40.62	■■■■■ 4.09
GPS1-225	ENST00000585084	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		40.62	■■■■■ 4.09
GPS1-225	ENST00000585084	GC	P02774	474 aa		40.6	■■■■■ 4.09
GPS1-225	ENST00000585084	CPD	O75976	1380 aa		40.6	■■■■■ 4.09
GPS1-225	ENST00000585084	TONSL	Q96HA7	1378 aa		40.6	■■■■■ 4.09
GPS1-225	ENST00000585084	NLRP6	P59044	892 aa		40.57	■■■■■ 4.09
GPS1-225	ENST00000585084	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		40.57	■■■■■ 4.09
GPS1-225	ENST00000585084	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		40.56	■■■■■ 4.08
GPS1-225	ENST00000585084	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	40.55	■■■■■ 4.08
GPS1-225	ENST00000585084	ZNF692	Q9BU19	519 aa	Predicted RBP	40.55	■■■■■ 4.08
GPS1-225	ENST00000585084	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		40.53	■■■■■ 4.08
GPS1-225	ENST00000585084	SSH2	Q76I76	1423 aa		40.53	■■■■■ 4.08
GPS1-225	ENST00000585084	USP35	Q9P2H5	1018 aa		40.53	■■■■■ 4.08
GPS1-225	ENST00000585084	CAMTA1	Q9Y6Y1	1673 aa		40.51	■■■■■ 4.08
GPS1-225	ENST00000585084	FAM182B	Q5T319	152 aa		40.49	■■■■■ 4.07
GPS1-225	ENST00000585084	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		40.48	■■■■■ 4.07
GPS1-225	ENST00000585084	LARP1	Q6PKG0	1096 aa	Known RBP	40.48	■■■■■ 4.07
GPS1-225	ENST00000585084	LMO7	Q8WWI1	1683 aa		40.47	■■■■■ 4.07
GPS1-225	ENST00000585084	BAG6	P46379	1132 aa		40.47	■■■■■ 4.07
GPS1-225	ENST00000585084	SBNO2	Q9Y2G9	1366 aa		40.46	■■■■■ 4.07
GPS1-225	ENST00000585084	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		40.45	■■■■■ 4.07
GPS1-225	ENST00000585084	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		40.44	■■■■■ 4.06
GPS1-225	ENST00000585084	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		40.43	■■■■■ 4.06
GPS1-225	ENST00000585084	SLIT3	O75094	1523 aa		40.42	■■■■■ 4.06
GPS1-225	ENST00000585084	PIK3C2A	O00443	1686 aa		40.42	■■■■■ 4.06
GPS1-225	ENST00000585084	AKAP12	Q02952	1782 aa		40.41	■■■■■ 4.06
GPS1-225	ENST00000585084	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		40.4	■■■■■ 4.06
GPS1-225	ENST00000585084	KTN1	Q86UP2	1357 aa	Known RBP	40.39	■■■■■ 4.06
GPS1-225	ENST00000585084	COL5A2	P05997	1499 aa	Predicted RBP	40.39	■■■■■ 4.06
GPS1-225	ENST00000585084	AATK	Q6ZMQ8	1374 aa		40.38	■■■■■ 4.06
GPS1-225	ENST00000585084	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	40.38	■■■■■ 4.05
GPS1-225	ENST00000585084	CPSF1	Q10570	1443 aa	Known RBP	40.38	■■■■■ 4.05
GPS1-225	ENST00000585084	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		40.37	■■■■■ 4.05
GPS1-225	ENST00000585084	PDE3B	Q13370	1112 aa		40.37	■■■■■ 4.05
GPS1-225	ENST00000585084	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		40.37	■■■■■ 4.05
GPS1-225	ENST00000585084	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		40.36	■■■■■ 4.05
GPS1-225	ENST00000585084	CRB1	P82279	1406 aa		40.32	■■■■■ 4.04
GPS1-225	ENST00000585084	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	40.31	■■■■■ 4.04
GPS1-225	ENST00000585084	TMC1	Q8TDI8	760 aa		40.31	■■■■■ 4.04
GPS1-225	ENST00000585084	SOX12	O15370	315 aa		40.29	■■■■■ 4.04
GPS1-225	ENST00000585084	TRIM37	O94972	964 aa		40.27	■■■■■ 4.04
GPS1-225	ENST00000585084	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		40.27	■■■■■ 4.04
GPS1-225	ENST00000585084	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		40.26	■■■■■ 4.04
GPS1-225	ENST00000585084	HDGFL2	Q7Z4V5	671 aa	Predicted RBP	40.26	■■■■■ 4.04
GPS1-225	ENST00000585084	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	40.26	■■■■■ 4.04
GPS1-225	ENST00000585084	MON2	Q7Z3U7	1717 aa		40.25	■■■■■ 4.03
GPS1-225	ENST00000585084	AXIN2	Q9Y2T1	843 aa		40.24	■■■■■ 4.03
GPS1-225	ENST00000585084	DISP2	A7MBM2	1401 aa		40.24	■■■■■ 4.03
GPS1-225	ENST00000585084	COL18A1	P39060	1754 aa		40.23	■■■■■ 4.03
GPS1-225	ENST00000585084	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	40.22	■■■■■ 4.03
GPS1-225	ENST00000585084	SLC12A5	Q9H2X9	1139 aa		40.22	■■■■■ 4.03
GPS1-225	ENST00000585084	PUS7	Q96PZ0	661 aa	Known RBP	40.21	■■■■■ 4.03
GPS1-225	ENST00000585084	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		40.2	■■■■■ 4.03
GPS1-225	ENST00000585084	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		40.19	■■■■■ 4.02
GPS1-225	ENST00000585084	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		40.19	■■■■■ 4.02

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