RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584328.1

NF1-223, Transcript of neurofibromin 1, human

TSL 2

Gene NF1, Length 566 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NF1-223	ENST00000584328	WNT7A	O00755	349 aa		10.3	□□□□□ -0.76
NF1-223	ENST00000584328	WNT7B	P56706	349 aa		10.3	□□□□□ -0.76
NF1-223	ENST00000584328	SKOR1	P84550	965 aa		10.3	□□□□□ -0.76
NF1-223	ENST00000584328	AP1G2	O75843	785 aa		10.28	□□□□□ -0.76
NF1-223	ENST00000584328	LINC01559	Q495D7	138 aa		10.28	□□□□□ -0.76
NF1-223	ENST00000584328	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	10.28	□□□□□ -0.76
NF1-223	ENST00000584328	BAP1	Q92560	729 aa		10.28	□□□□□ -0.76
NF1-223	ENST00000584328	RFC5	P40937	340 aa		10.27	□□□□□ -0.77
NF1-223	ENST00000584328	SH3BP2	P78314	561 aa		10.27	□□□□□ -0.77
NF1-223	ENST00000584328	CYP4X1	Q8N118	509 aa		10.27	□□□□□ -0.77
NF1-223	ENST00000584328	MRGPRX2	Q96LB1	330 aa		10.27	□□□□□ -0.77
NF1-223	ENST00000584328	LRRN4	Q8WUT4	740 aa		10.26	□□□□□ -0.77
NF1-223	ENST00000584328	ZNF511	Q8NB15	262 aa		10.25	□□□□□ -0.77
NF1-223	ENST00000584328	TOR4A	Q9NXH8	423 aa		10.25	□□□□□ -0.77
NF1-223	ENST00000584328	TTC24	A2A3L6	582 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
NF1-223	ENST00000584328	FAM187A	A6NFU0	413 aa		10.24	□□□□□ -0.77
NF1-223	ENST00000584328	PKDCC	Q504Y2	493 aa		10.24	□□□□□ -0.77
NF1-223	ENST00000584328	EHBP1	Q8NDI1	1231 aa		10.24	□□□□□ -0.77
NF1-223	ENST00000584328	DGAT1	O75907	488 aa		10.22	□□□□□ -0.77
NF1-223	ENST00000584328	SNIP1	Q8TAD8	396 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
NF1-223	ENST00000584328	USP17L8	P0C7I0	530 aa		10.21	□□□□□ -0.77
NF1-223	ENST00000584328	TMEM259	Q4ZIN3	620 aa		10.21	□□□□□ -0.77
NF1-223	ENST00000584328	ARMC2	Q8NEN0	867 aa		10.21	□□□□□ -0.77
NF1-223	ENST00000584328	TRAF7	Q6Q0C0	670 aa		10.2	□□□□□ -0.78
NF1-223	ENST00000584328	LCE2B	O14633	110 aa		10.19	□□□□□ -0.78
NF1-223	ENST00000584328	NR6A1	Q15406	480 aa		10.19	□□□□□ -0.78
NF1-223	ENST00000584328	FOXJ1	Q92949	421 aa		10.19	□□□□□ -0.78
NF1-223	ENST00000584328	SIAH2	O43255	324 aa		10.18	□□□□□ -0.78
NF1-223	ENST00000584328	AGER	Q15109	404 aa		10.18	□□□□□ -0.78
NF1-223	ENST00000584328	NBPF14	Q5TI25	921 aa		10.18	□□□□□ -0.78
NF1-223	ENST00000584328		J3QL48	77 aa		10.17	□□□□□ -0.78
NF1-223	ENST00000584328	VARS	P26640	1264 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
NF1-223	ENST00000584328	HMX1	Q9NP08	348 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78
NF1-223	ENST00000584328	ALDH1A1	P00352	501 aa		10.16	□□□□□ -0.78
NF1-223	ENST00000584328	SMPD1	P17405	629 aa		10.16	□□□□□ -0.78
NF1-223	ENST00000584328	BPHL	Q86WA6	291 aa	Predicted RBP	10.16	□□□□□ -0.78
NF1-223	ENST00000584328	MYT1	Q01538	1121 aa		10.15	□□□□□ -0.78
NF1-223	ENST00000584328	EPS8L1	Q8TE68	723 aa		10.15	□□□□□ -0.78
NF1-223	ENST00000584328	FKBPL	Q9UIM3	349 aa		10.15	□□□□□ -0.78
NF1-223	ENST00000584328	C4orf48	Q5BLP8	95 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NF1-223	ENST00000584328	FAM174A	Q8TBP5	190 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NF1-223	ENST00000584328	GPKOW	Q92917	476 aa	Predicted RBP eCLIP	10.14	□□□□□ -0.79
NF1-223	ENST00000584328	TLL2	Q9Y6L7	1015 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NF1-223	ENST00000584328	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
NF1-223	ENST00000584328	AVP	P01185	164 aa		10.12	□□□□□ -0.79
NF1-223	ENST00000584328	SH3BP5L	Q7L8J4	393 aa		10.12	□□□□□ -0.79
NF1-223	ENST00000584328	SH3RF1	Q7Z6J0	888 aa		10.12	□□□□□ -0.79
NF1-223	ENST00000584328	MAGEB6P1	A0A0J9YX57	407 aa		10.11	□□□□□ -0.79
NF1-223	ENST00000584328	PDXDC2P	Q6P474	469 aa		10.11	□□□□□ -0.79
NF1-223	ENST00000584328	PNMA1	Q8ND90	353 aa		10.11	□□□□□ -0.79
NF1-223	ENST00000584328	BANK1	Q8NDB2	785 aa		10.11	□□□□□ -0.79
NF1-223	ENST00000584328	WASF2	Q9Y6W5	498 aa		10.11	□□□□□ -0.79
NF1-223	ENST00000584328	ZC3H4	Q9UPT8	1303 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
NF1-223	ENST00000584328	ST8SIA5	O15466	376 aa		10.1	□□□□□ -0.79
NF1-223	ENST00000584328	MPND	Q8N594	471 aa		10.1	□□□□□ -0.79
NF1-223	ENST00000584328	HPS1	Q92902	700 aa		10.1	□□□□□ -0.79
NF1-223	ENST00000584328	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		10.1	□□□□□ -0.79
NF1-223	ENST00000584328	TRIM34	Q9BYJ4	488 aa		10.1	□□□□□ -0.79
NF1-223	ENST00000584328	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		10.1	□□□□□ -0.79
NF1-223	ENST00000584328	ARID5B	Q14865	1188 aa		10.09	□□□□□ -0.79
NF1-223	ENST00000584328	AAAS	Q9NRG9	546 aa		10.09	□□□□□ -0.79
NF1-223	ENST00000584328	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		10.08	□□□□□ -0.8
NF1-223	ENST00000584328	CTC1	Q2NKJ3	1217 aa		10.08	□□□□□ -0.8
NF1-223	ENST00000584328	ARHGAP9	Q9BRR9	750 aa		10.08	□□□□□ -0.8
NF1-223	ENST00000584328	C1QTNF2	Q9BXJ5	285 aa		10.08	□□□□□ -0.8
NF1-223	ENST00000584328	AXIN1	O15169	862 aa		10.07	□□□□□ -0.8
NF1-223	ENST00000584328	CRIPAK	Q8N1N5	446 aa		10.07	□□□□□ -0.8
NF1-223	ENST00000584328	GJD4	Q96KN9	370 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
NF1-223	ENST00000584328	CDK15	Q96Q40	435 aa		10.07	□□□□□ -0.8
NF1-223	ENST00000584328	SNRK	Q9NRH2	765 aa		10.07	□□□□□ -0.8
NF1-223	ENST00000584328	PTK2	Q05397	1052 aa		10.06	□□□□□ -0.8
NF1-223	ENST00000584328	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		10.06	□□□□□ -0.8
NF1-223	ENST00000584328	ADH1C	P00326	375 aa		10.05	□□□□□ -0.8
NF1-223	ENST00000584328	SMCP	P49901	116 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
NF1-223	ENST00000584328	ERFE	Q4G0M1	354 aa		10.05	□□□□□ -0.8
NF1-223	ENST00000584328	ZBTB33	Q86T24	672 aa		10.05	□□□□□ -0.8
NF1-223	ENST00000584328	GPSM3	Q9Y4H4	160 aa		10.05	□□□□□ -0.8
NF1-223	ENST00000584328	NNT	Q13423	1086 aa		10.04	□□□□□ -0.8
NF1-223	ENST00000584328	TRMT44	Q8IYL2	757 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
NF1-223	ENST00000584328	SOCS7	O14512	581 aa		10.03	□□□□□ -0.8
NF1-223	ENST00000584328	NACAD	O15069	1562 aa		10.03	□□□□□ -0.8
NF1-223	ENST00000584328	OCSTAMP	Q9BR26	566 aa		10.03	□□□□□ -0.8
NF1-223	ENST00000584328	APBB1	O00213	710 aa		10.02	□□□□□ -0.81
NF1-223	ENST00000584328	GRM5	P41594	1212 aa		10.02	□□□□□ -0.81
NF1-223	ENST00000584328	VASH1	Q7L8A9	365 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
NF1-223	ENST00000584328	ADAM32	Q8TC27	787 aa		10.02	□□□□□ -0.81
NF1-223	ENST00000584328	DACH1	Q9UI36	760 aa		10.02	□□□□□ -0.81
NF1-223	ENST00000584328	MAP4K5	Q9Y4K4	846 aa		10.02	□□□□□ -0.81
NF1-223	ENST00000584328	SLC10A4	Q96EP9	437 aa		10.01	□□□□□ -0.81
NF1-223	ENST00000584328	NR5A1	Q13285	461 aa		10	□□□□□ -0.81
NF1-223	ENST00000584328	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		10	□□□□□ -0.81
NF1-223	ENST00000584328	CAPN5	O15484	640 aa	Predicted RBP	9.99	□□□□□ -0.81
NF1-223	ENST00000584328	NR3C2	P08235	984 aa		9.99	□□□□□ -0.81
NF1-223	ENST00000584328	FSHR	P23945	695 aa		9.99	□□□□□ -0.81
NF1-223	ENST00000584328	ZNF787	Q6DD87	383 aa		9.99	□□□□□ -0.81
NF1-223	ENST00000584328	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		9.99	□□□□□ -0.81
NF1-223	ENST00000584328	TMEM132A	Q24JP5	1023 aa		9.98	□□□□□ -0.81
NF1-223	ENST00000584328	ZBBX	A8MT70	800 aa		9.97	□□□□□ -0.81
NF1-223	ENST00000584328	WDR4	P57081	412 aa	Known RBP	9.97	□□□□□ -0.81
NF1-223	ENST00000584328	CDV3	Q9UKY7	258 aa	Known RBP	9.97	□□□□□ -0.81

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