RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584229.1

GPS1-223, Transcript of G protein pathway suppressor 1, human

TSL 3

Gene GPS1, Length 535 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPS1-223	ENST00000584229	HDGFL2	Q7Z4V5	671 aa	Predicted RBP	34.68	■■■■□ 3.14
GPS1-223	ENST00000584229	KTN1	Q86UP2	1357 aa	Known RBP	34.68	■■■■□ 3.14
GPS1-223	ENST00000584229	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	34.68	■■■■□ 3.14
GPS1-223	ENST00000584229	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	34.67	■■■■□ 3.14
GPS1-223	ENST00000584229	ARHGEF10	O15013	1369 aa		34.66	■■■■□ 3.14
GPS1-223	ENST00000584229	ABCA3	Q99758	1704 aa		34.66	■■■■□ 3.14
GPS1-223	ENST00000584229	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		34.65	■■■■□ 3.14
GPS1-223	ENST00000584229	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		34.65	■■■■□ 3.14
GPS1-223	ENST00000584229	CD163L1	Q9NR16	1453 aa		34.65	■■■■□ 3.14
GPS1-223	ENST00000584229	CPSF1	Q10570	1443 aa	Known RBP	34.64	■■■■□ 3.14
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF692	Q9BU19	519 aa	Predicted RBP	34.63	■■■■□ 3.13
GPS1-223	ENST00000584229		A0A1W2PP64	1363 aa		34.62	■■■■□ 3.13
GPS1-223	ENST00000584229	LRP6	O75581	1613 aa		34.6	■■■■□ 3.13
GPS1-223	ENST00000584229	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	34.6	■■■■□ 3.13
GPS1-223	ENST00000584229	MARF1	Q9Y4F3	1742 aa	Known RBP	34.6	■■■■□ 3.13
GPS1-223	ENST00000584229	PIK3C2A	O00443	1686 aa		34.6	■■■■□ 3.13
GPS1-223	ENST00000584229	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	34.59	■■■■□ 3.13
GPS1-223	ENST00000584229	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		34.59	■■■■□ 3.13
GPS1-223	ENST00000584229	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	34.58	■■■■□ 3.13
GPS1-223	ENST00000584229	PHRF1	Q9P1Y6	1649 aa	Known RBP	34.57	■■■■□ 3.12
GPS1-223	ENST00000584229	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	34.57	■■■■□ 3.12
GPS1-223	ENST00000584229	ABTB2	Q8N961	1025 aa		34.57	■■■■□ 3.12
GPS1-223	ENST00000584229	CRYBG1	Q9Y4K1	1723 aa		34.57	■■■■□ 3.12
GPS1-223	ENST00000584229	ANKRD36B	Q8N2N9	1353 aa		34.57	■■■■□ 3.12
GPS1-223	ENST00000584229	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	34.54	■■■■□ 3.12
GPS1-223	ENST00000584229	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		34.54	■■■■□ 3.12
GPS1-223	ENST00000584229	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		34.54	■■■■□ 3.12
GPS1-223	ENST00000584229	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		34.54	■■■■□ 3.12
GPS1-223	ENST00000584229	EDC4	Q6P2E9	1401 aa	Known RBP	34.53	■■■■□ 3.12
GPS1-223	ENST00000584229	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		34.53	■■■■□ 3.12
GPS1-223	ENST00000584229	ADAMTS2	O95450	1211 aa		34.52	■■■■□ 3.12
GPS1-223	ENST00000584229	SSH2	Q76I76	1423 aa		34.51	■■■■□ 3.12
GPS1-223	ENST00000584229	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		34.5	■■■■□ 3.11
GPS1-223	ENST00000584229	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	34.48	■■■■□ 3.11
GPS1-223	ENST00000584229	NLRP6	P59044	892 aa		34.46	■■■■□ 3.11
GPS1-223	ENST00000584229	CCDC7	Q96M83	1385 aa		34.46	■■■■□ 3.11
GPS1-223	ENST00000584229	NLRP13	Q86W25	1043 aa		34.45	■■■■□ 3.11
GPS1-223	ENST00000584229	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		34.44	■■■■□ 3.1
GPS1-223	ENST00000584229	C8orf37	Q96NL8	207 aa		34.43	■■■■□ 3.1
GPS1-223	ENST00000584229	NME9	Q86XW9	330 aa		34.42	■■■■□ 3.1
GPS1-223	ENST00000584229	USP54	Q70EL1	1684 aa		34.41	■■■■□ 3.1
GPS1-223	ENST00000584229	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		34.41	■■■■□ 3.1
GPS1-223	ENST00000584229	PLCH1	Q4KWH8	1693 aa		34.39	■■■■□ 3.1
GPS1-223	ENST00000584229	PANK3	Q9H999	370 aa		34.37	■■■■□ 3.09
GPS1-223	ENST00000584229	ZRANB1	Q9UGI0	708 aa		34.37	■■■■□ 3.09
GPS1-223	ENST00000584229	USP19	O94966	1318 aa		34.36	■■■■□ 3.09
GPS1-223	ENST00000584229	SLIT3	O75094	1523 aa		34.36	■■■■□ 3.09
GPS1-223	ENST00000584229	SOX12	O15370	315 aa		34.36	■■■■□ 3.09
GPS1-223	ENST00000584229	NGLY1	Q96IV0	654 aa		34.35	■■■■□ 3.09
GPS1-223	ENST00000584229	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		34.34	■■■■□ 3.09
GPS1-223	ENST00000584229	COL14A1	Q05707	1796 aa	Known RBP	34.34	■■■■□ 3.09
GPS1-223	ENST00000584229	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		34.33	■■■■□ 3.09
GPS1-223	ENST00000584229	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	34.32	■■■■□ 3.08
GPS1-223	ENST00000584229	LTN1	O94822	1766 aa		34.31	■■■■□ 3.08
GPS1-223	ENST00000584229	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		34.31	■■■■□ 3.08
GPS1-223	ENST00000584229	AFF2	P51816	1311 aa		34.3	■■■■□ 3.08
GPS1-223	ENST00000584229	USP31	Q70CQ4	1352 aa		34.3	■■■■□ 3.08
GPS1-223	ENST00000584229	GC	P02774	474 aa		34.29	■■■■□ 3.08
GPS1-223	ENST00000584229	COG3	Q96JB2	828 aa		34.29	■■■■□ 3.08
GPS1-223	ENST00000584229	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		34.29	■■■■□ 3.08
GPS1-223	ENST00000584229	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		34.29	■■■■□ 3.08
GPS1-223	ENST00000584229	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		34.29	■■■■□ 3.08
GPS1-223	ENST00000584229	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		34.29	■■■■□ 3.08
GPS1-223	ENST00000584229	KIAA0232	Q92628	1395 aa		34.28	■■■■□ 3.08
GPS1-223	ENST00000584229	NWD2	Q9ULI1	1742 aa		34.28	■■■■□ 3.08
GPS1-223	ENST00000584229	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		34.27	■■■■□ 3.08
GPS1-223	ENST00000584229	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		34.26	■■■■□ 3.08
GPS1-223	ENST00000584229	FYB1	O15117	783 aa		34.24	■■■■□ 3.07
GPS1-223	ENST00000584229	NFAT5	O94916	1531 aa		34.24	■■■■□ 3.07
GPS1-223	ENST00000584229	TNKS1BP1	Q9C0C2	1729 aa	Known RBP	34.24	■■■■□ 3.07
GPS1-223	ENST00000584229	CHRNA2	Q15822	529 aa		34.23	■■■■□ 3.07
GPS1-223	ENST00000584229	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		34.23	■■■■□ 3.07
GPS1-223	ENST00000584229	RGPD5	Q99666	1765 aa		34.21	■■■■□ 3.07
GPS1-223	ENST00000584229	FAM83G	A6ND36	823 aa		34.21	■■■■□ 3.07
GPS1-223	ENST00000584229	USP21	Q9UK80	565 aa		34.21	■■■■□ 3.07
GPS1-223	ENST00000584229	NRAP	Q86VF7	1730 aa		34.21	■■■■□ 3.07
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	34.2	■■■■□ 3.07
GPS1-223	ENST00000584229	CPD	O75976	1380 aa		34.18	■■■■□ 3.06
GPS1-223	ENST00000584229	SLIT2	O94813	1529 aa		34.18	■■■■□ 3.06
GPS1-223	ENST00000584229	LMO7	Q8WWI1	1683 aa		34.16	■■■■□ 3.06
GPS1-223	ENST00000584229	BTG4	Q9NY30	223 aa		34.16	■■■■□ 3.06
GPS1-223	ENST00000584229	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	34.16	■■■■□ 3.06
GPS1-223	ENST00000584229	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	34.15	■■■■□ 3.06
GPS1-223	ENST00000584229	COL18A1	P39060	1754 aa		34.13	■■■■□ 3.05
GPS1-223	ENST00000584229	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	34.13	■■■■□ 3.05
GPS1-223	ENST00000584229	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	34.12	■■■■□ 3.05
GPS1-223	ENST00000584229	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		34.12	■■■■□ 3.05
GPS1-223	ENST00000584229	NSD2	O96028	1365 aa		34.11	■■■■□ 3.05
GPS1-223	ENST00000584229	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		34.1	■■■■□ 3.05
GPS1-223	ENST00000584229	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		34.09	■■■■□ 3.05
GPS1-223	ENST00000584229	STRN4	Q9NRL3	753 aa		34.09	■■■■□ 3.05
GPS1-223	ENST00000584229	CAMTA1	Q9Y6Y1	1673 aa		34.09	■■■■□ 3.05
GPS1-223	ENST00000584229	FBLN1	P23142	703 aa		34.08	■■■■□ 3.05
GPS1-223	ENST00000584229	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	34.08	■■■■□ 3.05
GPS1-223	ENST00000584229	POTEA	Q6S8J7	498 aa		34.08	■■■■□ 3.05
GPS1-223	ENST00000584229	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	34.08	■■■■□ 3.05
GPS1-223	ENST00000584229	CCDC9	Q9Y3X0	531 aa	Known RBP	34.08	■■■■□ 3.05
GPS1-223	ENST00000584229	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	34.07	■■■■□ 3.04
GPS1-223	ENST00000584229	AATK	Q6ZMQ8	1374 aa		34.06	■■■■□ 3.04
GPS1-223	ENST00000584229	ABCC6	O95255	1503 aa		34.05	■■■■□ 3.04

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