RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000581792.1

MIR3648-2-201, Transcript of microRNA 3648-2, humanhuman

BASIC

Gene MIR3648-2, Length 180 nt, Biotype miRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIR3648-2-201ENST00000581792 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP36.91■■■■□ 3.5
MIR3648-2-201ENST00000581792 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa36.9■■■■□ 3.5
MIR3648-2-201ENST00000581792 PLEKHG3A1L390 1219 aa36.9■■■■□ 3.5
MIR3648-2-201ENST00000581792 ACEP12821 1306 aa36.89■■■■□ 3.5
MIR3648-2-201ENST00000581792 EP400Q96L91 3159 aa36.88■■■■□ 3.5
MIR3648-2-201ENST00000581792 NBPF8Q3BBV2 869 aa36.88■■■■□ 3.49
MIR3648-2-201ENST00000581792 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa36.86■■■■□ 3.49
MIR3648-2-201ENST00000581792 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP36.85■■■■□ 3.49
MIR3648-2-201ENST00000581792 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa36.85■■■■□ 3.49
MIR3648-2-201ENST00000581792 QRICH2Q9H0J4 1663 aa36.83■■■■□ 3.49
MIR3648-2-201ENST00000581792 CABP2Q9NPB3 220 aa36.83■■■■□ 3.49
MIR3648-2-201ENST00000581792 BTG4Q9NY30 223 aa36.82■■■■□ 3.48
MIR3648-2-201ENST00000581792 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP36.82■■■■□ 3.48
MIR3648-2-201ENST00000581792 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP36.81■■■■□ 3.48
MIR3648-2-201ENST00000581792 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP36.8■■■■□ 3.48
MIR3648-2-201ENST00000581792 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP36.78■■■■□ 3.48
MIR3648-2-201ENST00000581792 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa36.78■■■■□ 3.48
MIR3648-2-201ENST00000581792 NRAPQ86VF7 1730 aa36.78■■■■□ 3.48
MIR3648-2-201ENST00000581792 SEPT12Q8IYM1 358 aa36.77■■■■□ 3.48
MIR3648-2-201ENST00000581792 NUTM2GQ5VZR2 741 aa36.76■■■■□ 3.48
MIR3648-2-201ENST00000581792 PRDM11Q9NQV5 511 aa36.75■■■■□ 3.47
MIR3648-2-201ENST00000581792 BRWD3Q6RI45 1802 aa36.74■■■■□ 3.47
MIR3648-2-201ENST00000581792 CCDC125Q86Z20 511 aa36.74■■■■□ 3.47
MIR3648-2-201ENST00000581792 ABTB2Q8N961 1025 aa36.72■■■■□ 3.47
MIR3648-2-201ENST00000581792 EVC2Q86UK5 1308 aa36.71■■■■□ 3.47
MIR3648-2-201ENST00000581792 CABP1Q9NZU7 370 aa36.71■■■■□ 3.47
MIR3648-2-201ENST00000581792 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP36.7■■■■□ 3.47
MIR3648-2-201ENST00000581792 KIAA0232Q92628 1395 aa36.7■■■■□ 3.47
MIR3648-2-201ENST00000581792 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP36.7■■■■□ 3.47
MIR3648-2-201ENST00000581792 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP36.67■■■■□ 3.46
MIR3648-2-201ENST00000581792 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP36.66■■■■□ 3.46
MIR3648-2-201ENST00000581792 CHRNA2Q15822 529 aa36.65■■■■□ 3.46
MIR3648-2-201ENST00000581792 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP36.65■■■■□ 3.46
MIR3648-2-201ENST00000581792 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa36.64■■■■□ 3.46
MIR3648-2-201ENST00000581792 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa36.64■■■■□ 3.46
MIR3648-2-201ENST00000581792 KRT27Q7Z3Y8 459 aa36.63■■■■□ 3.45
MIR3648-2-201ENST00000581792 NLRP13Q86W25 1043 aa36.62■■■■□ 3.45
MIR3648-2-201ENST00000581792 USP19O94966 1318 aa36.61■■■■□ 3.45
MIR3648-2-201ENST00000581792 A0A0G2JS52 829 aa36.6■■■■□ 3.45
MIR3648-2-201ENST00000581792 MYT1Q01538 1121 aa36.6■■■■□ 3.45
MIR3648-2-201ENST00000581792 TONSLQ96HA7 1378 aa36.6■■■■□ 3.45
MIR3648-2-201ENST00000581792 USP6P35125 1406 aa36.59■■■■□ 3.45
MIR3648-2-201ENST00000581792 NRKQ7Z2Y5 1582 aa36.58■■■■□ 3.45
MIR3648-2-201ENST00000581792 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP36.58■■■■□ 3.45
MIR3648-2-201ENST00000581792 CPDO75976 1380 aa36.56■■■■□ 3.44
MIR3648-2-201ENST00000581792 GCP02774 474 aa36.56■■■■□ 3.44
MIR3648-2-201ENST00000581792 CARD11Q9BXL7 1154 aa36.56■■■■□ 3.44
MIR3648-2-201ENST00000581792 STRN4Q9NRL3 753 aa36.55■■■■□ 3.44
MIR3648-2-201ENST00000581792 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa36.54■■■■□ 3.44
MIR3648-2-201ENST00000581792 SSH2Q76I76 1423 aa36.53■■■■□ 3.44
MIR3648-2-201ENST00000581792 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP36.52■■■■□ 3.44
MIR3648-2-201ENST00000581792 EVA1CP58658 441 aa36.51■■■■□ 3.44
MIR3648-2-201ENST00000581792 NLRP6P59044 892 aa36.51■■■■□ 3.44
MIR3648-2-201ENST00000581792 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa36.51■■■■□ 3.43
MIR3648-2-201ENST00000581792 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa36.49■■■■□ 3.43
MIR3648-2-201ENST00000581792 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa36.48■■■■□ 3.43
MIR3648-2-201ENST00000581792 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP36.47■■■■□ 3.43
MIR3648-2-201ENST00000581792 LMO7Q8WWI1 1683 aa36.46■■■■□ 3.43
MIR3648-2-201ENST00000581792 ZRANB1Q9UGI0 708 aa36.45■■■■□ 3.43
MIR3648-2-201ENST00000581792 AKAP12Q02952 1782 aa36.45■■■■□ 3.43
MIR3648-2-201ENST00000581792 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa36.44■■■■□ 3.42
MIR3648-2-201ENST00000581792 DEFB132Q7Z7B7 95 aa36.44■■■■□ 3.42
MIR3648-2-201ENST00000581792 PIK3C2AO00443 1686 aa36.43■■■■□ 3.42
MIR3648-2-201ENST00000581792 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP36.43■■■■□ 3.42
MIR3648-2-201ENST00000581792 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP36.42■■■■□ 3.42
MIR3648-2-201ENST00000581792 USP35Q9P2H5 1018 aa36.42■■■■□ 3.42
MIR3648-2-201ENST00000581792 SLIT3O75094 1523 aa36.42■■■■□ 3.42
MIR3648-2-201ENST00000581792 BARGINQ6ZT62 677 aa36.4■■■■□ 3.42
MIR3648-2-201ENST00000581792 FAM182BQ5T319 152 aa36.39■■■■□ 3.42
MIR3648-2-201ENST00000581792 TTC21AQ8NDW8 1320 aa36.38■■■■□ 3.41
MIR3648-2-201ENST00000581792 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa36.38■■■■□ 3.41
MIR3648-2-201ENST00000581792 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP36.37■■■■□ 3.41
MIR3648-2-201ENST00000581792 AATKQ6ZMQ8 1374 aa36.36■■■■□ 3.41
MIR3648-2-201ENST00000581792 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP36.36■■■■□ 3.41
MIR3648-2-201ENST00000581792 ZBTB7CA1YPR0 619 aa36.35■■■■□ 3.41
MIR3648-2-201ENST00000581792 TCP11L2Q8N4U5 519 aa36.35■■■■□ 3.41
MIR3648-2-201ENST00000581792 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP36.33■■■■□ 3.41
MIR3648-2-201ENST00000581792 KCNH5Q8NCM2 988 aa36.32■■■■□ 3.4
MIR3648-2-201ENST00000581792 BAG6P46379 1132 aa36.31■■■■□ 3.4
MIR3648-2-201ENST00000581792 TMC1Q8TDI8 760 aa36.3■■■■□ 3.4
MIR3648-2-201ENST00000581792 MON2Q7Z3U7 1717 aa36.3■■■■□ 3.4
MIR3648-2-201ENST00000581792 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP36.29■■■■□ 3.4
MIR3648-2-201ENST00000581792 COL18A1P39060 1754 aa36.29■■■■□ 3.4
MIR3648-2-201ENST00000581792 FAM196AQ6ZSG2 479 aa36.28■■■■□ 3.4
MIR3648-2-201ENST00000581792 ARHGEF25Q86VW2 580 aa36.28■■■■□ 3.4
MIR3648-2-201ENST00000581792 CD163L1Q9NR16 1453 aa36.28■■■■□ 3.4
MIR3648-2-201ENST00000581792 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa36.27■■■■□ 3.4
MIR3648-2-201ENST00000581792 RGPD1P0DJD0 1748 aa36.27■■■■□ 3.4
MIR3648-2-201ENST00000581792 CRB1P82279 1406 aa36.26■■■■□ 3.4
MIR3648-2-201ENST00000581792 PDE3BQ13370 1112 aa36.26■■■■□ 3.4
MIR3648-2-201ENST00000581792 AXIN2Q9Y2T1 843 aa36.26■■■■□ 3.4
MIR3648-2-201ENST00000581792 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa36.25■■■■□ 3.39
MIR3648-2-201ENST00000581792 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP36.25■■■■□ 3.39
MIR3648-2-201ENST00000581792 TESK2Q96S53 571 aa36.25■■■■□ 3.39
MIR3648-2-201ENST00000581792 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP36.24■■■■□ 3.39
MIR3648-2-201ENST00000581792 SOX12O15370 315 aa36.23■■■■□ 3.39
MIR3648-2-201ENST00000581792 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP36.21■■■■□ 3.39
MIR3648-2-201ENST00000581792 USP31Q70CQ4 1352 aa36.21■■■■□ 3.39
MIR3648-2-201ENST00000581792 SLC24A1O60721 1099 aa36.2■■■■□ 3.39
MIR3648-2-201ENST00000581792 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa36.2■■■■□ 3.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 74 ms