RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578600.1

PTPRM-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRM, Length 578 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-208ENST00000578600 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
PTPRM-208ENST00000578600 MRC2Q9UBG0 1479 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRM-208ENST00000578600 SERPINA10Q9UK55 444 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRM-208ENST00000578600 SMARCA4P51532 1647 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRM-208ENST00000578600 F12P00748 615 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
PTPRM-208ENST00000578600 WASHC4Q2M389 1173 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRM-208ENST00000578600 PEG3Q9GZU2 1588 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRM-208ENST00000578600 COPS2P61201 443 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRM-208ENST00000578600 PTPRNQ16849 979 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRM-208ENST00000578600 SPSB2Q99619 263 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRM-208ENST00000578600 DXOO77932 396 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
PTPRM-208ENST00000578600 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRM-208ENST00000578600 GLMNQ92990 594 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRM-208ENST00000578600 ZPR1O75312 459 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRM-208ENST00000578600 MMP16P51512 607 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRM-208ENST00000578600 MTRQ99707 1265 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRM-208ENST00000578600 PODXL2Q9NZ53 605 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRM-208ENST00000578600 VAC14Q08AM6 782 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRM-208ENST00000578600 TJAP1Q5JTD0 557 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRM-208ENST00000578600 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
PTPRM-208ENST00000578600 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
PTPRM-208ENST00000578600 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRM-208ENST00000578600 ALG2Q9H553 416 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRM-208ENST00000578600 PRDM9Q9NQV7 894 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRM-208ENST00000578600 MAP10Q9P2G4 905 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRM-208ENST00000578600 WDR62O43379 1518 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRM-208ENST00000578600 TLL1O43897 1013 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRM-208ENST00000578600 ADH1BP00325 375 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRM-208ENST00000578600 PTPN5P54829 565 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRM-208ENST00000578600 EVA1BQ9NVM1 165 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRM-208ENST00000578600 PNMA1Q8ND90 353 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRM-208ENST00000578600 FKBPLQ9UIM3 349 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRM-208ENST00000578600 CCNYL3P0C7X3 344 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRM-208ENST00000578600 ZNF516Q92618 1163 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRM-208ENST00000578600 IL21Q9HBE4 155 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRM-208ENST00000578600 CEP164Q9UPV0 1460 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRM-208ENST00000578600 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
PTPRM-208ENST00000578600 KCNH2Q12809 1159 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRM-208ENST00000578600 NUDT12Q9BQG2 462 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRM-208ENST00000578600 MYT1LQ9UL68 1186 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRM-208ENST00000578600 SOX11P35716 441 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRM-208ENST00000578600 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
PTPRM-208ENST00000578600 NR1H3Q13133 447 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRM-208ENST00000578600 CTHP32929 405 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRM-208ENST00000578600 ZBBXA8MT70 800 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRM-208ENST00000578600 FBXO45P0C2W1 286 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRM-208ENST00000578600 SLC6A16Q9GZN6 736 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRM-208ENST00000578600 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
PTPRM-208ENST00000578600 ARMC2Q8NEN0 867 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRM-208ENST00000578600 NKX2-3Q8TAU0 364 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRM-208ENST00000578600 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP9.46□□□□□ -0.9
PTPRM-208ENST00000578600 UCN2Q96RP3 112 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRM-208ENST00000578600 FANCD2Q9BXW9 1451 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRM-208ENST00000578600 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRM-208ENST00000578600 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP9.45□□□□□ -0.9
PTPRM-208ENST00000578600 CFAP70Q5T0N1 1121 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRM-208ENST00000578600 PDXDC2PQ6P474 469 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRM-208ENST00000578600 OCSTAMPQ9BR26 566 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRM-208ENST00000578600 GPSM3Q9Y4H4 160 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRM-208ENST00000578600 ZBTB7CA1YPR0 619 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRM-208ENST00000578600 SEMA3FQ13275 785 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRM-208ENST00000578600 CYB5RLQ6IPT4 315 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRM-208ENST00000578600 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRM-208ENST00000578600 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
PTPRM-208ENST00000578600 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
PTPRM-208ENST00000578600 UNC93B1Q9H1C4 597 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRM-208ENST00000578600 S1PR4O95977 384 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRM-208ENST00000578600 PTK2Q05397 1052 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRM-208ENST00000578600 NBPF14Q5TI25 921 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRM-208ENST00000578600 CFTRP13569 1480 aa9.41□□□□□ -0.9
PTPRM-208ENST00000578600 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
PTPRM-208ENST00000578600 CCDC24Q8N4L8 307 aa9.41□□□□□ -0.9
PTPRM-208ENST00000578600 HCSTQ9UBK5 93 aa9.41□□□□□ -0.9
PTPRM-208ENST00000578600 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
PTPRM-208ENST00000578600 PCDH10Q9P2E7 1040 aa9.4□□□□□ -0.9
PTPRM-208ENST00000578600 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
PTPRM-208ENST00000578600 MROH2BQ7Z745 1585 aa9.4□□□□□ -0.9
PTPRM-208ENST00000578600 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRM-208ENST00000578600 SPNS2Q8IVW8 549 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRM-208ENST00000578600 IFT140Q96RY7 1462 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRM-208ENST00000578600 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
PTPRM-208ENST00000578600 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa9.38□□□□□ -0.91
PTPRM-208ENST00000578600 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
PTPRM-208ENST00000578600 PBXIP1Q96AQ6 731 aa9.38□□□□□ -0.91
PTPRM-208ENST00000578600 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
PTPRM-208ENST00000578600 ARHGEF11O15085 1522 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRM-208ENST00000578600 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
PTPRM-208ENST00000578600 KCNC4Q03721 635 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRM-208ENST00000578600 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRM-208ENST00000578600 TRAIPQ9BWF2 469 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRM-208ENST00000578600 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
PTPRM-208ENST00000578600 ABCC8Q09428 1581 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRM-208ENST00000578600 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
PTPRM-208ENST00000578600 ATP9BO43861 1147 aa9.36□□□□□ -0.91
PTPRM-208ENST00000578600 RFX1P22670 979 aa9.36□□□□□ -0.91
PTPRM-208ENST00000578600 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
PTPRM-208ENST00000578600 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa9.36□□□□□ -0.91
PTPRM-208ENST00000578600 ADAM32Q8TC27 787 aa9.36□□□□□ -0.91
PTPRM-208ENST00000578600 BAP1Q92560 729 aa9.36□□□□□ -0.91
PTPRM-208ENST00000578600 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa9.36□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.4 ms