RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578093.1

PTPRM-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, human

TSL 3

Gene PTPRM, Length 464 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRM-206	ENST00000578093	ZNF787	Q6DD87	383 aa		6.34	□□□□□ -1.39
PTPRM-206	ENST00000578093	DDX27	Q96GQ7	796 aa	Known RBP	6.34	□□□□□ -1.39
PTPRM-206	ENST00000578093	CRISPLD2	Q9H0B8	497 aa		6.34	□□□□□ -1.39
PTPRM-206	ENST00000578093	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		6.34	□□□□□ -1.39
PTPRM-206	ENST00000578093	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		6.34	□□□□□ -1.39
PTPRM-206	ENST00000578093	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		6.33	□□□□□ -1.4
PTPRM-206	ENST00000578093	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		6.33	□□□□□ -1.4
PTPRM-206	ENST00000578093	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		6.33	□□□□□ -1.4
PTPRM-206	ENST00000578093	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	6.33	□□□□□ -1.4
PTPRM-206	ENST00000578093	NBR1	Q14596	966 aa		6.33	□□□□□ -1.4
PTPRM-206	ENST00000578093	GPHN	Q9NQX3	736 aa	Predicted RBP	6.33	□□□□□ -1.4
PTPRM-206	ENST00000578093	ABCC5	O15440	1437 aa		6.33	□□□□□ -1.4
PTPRM-206	ENST00000578093	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		6.33	□□□□□ -1.4
PTPRM-206	ENST00000578093	TMEM94	Q12767	1356 aa		6.32	□□□□□ -1.4
PTPRM-206	ENST00000578093	KIF15	Q9NS87	1388 aa		6.32	□□□□□ -1.4
PTPRM-206	ENST00000578093	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	6.32	□□□□□ -1.4
PTPRM-206	ENST00000578093	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		6.32	□□□□□ -1.4
PTPRM-206	ENST00000578093	MFSD10	Q14728	455 aa		6.32	□□□□□ -1.4
PTPRM-206	ENST00000578093	LAPTM4A	Q15012	233 aa		6.32	□□□□□ -1.4
PTPRM-206	ENST00000578093	E2F4	Q16254	413 aa		6.32	□□□□□ -1.4
PTPRM-206	ENST00000578093	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	6.32	□□□□□ -1.4
PTPRM-206	ENST00000578093	POTEA	Q6S8J7	498 aa		6.32	□□□□□ -1.4
PTPRM-206	ENST00000578093	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		6.31	□□□□□ -1.4
PTPRM-206	ENST00000578093	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	6.31	□□□□□ -1.4
PTPRM-206	ENST00000578093	TSPY4	P0CV99	314 aa		6.31	□□□□□ -1.4
PTPRM-206	ENST00000578093	TSPY10	P0CW01	314 aa		6.31	□□□□□ -1.4
PTPRM-206	ENST00000578093	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		6.31	□□□□□ -1.4
PTPRM-206	ENST00000578093	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	6.31	□□□□□ -1.4
PTPRM-206	ENST00000578093	LRP6	O75581	1613 aa		6.31	□□□□□ -1.4
PTPRM-206	ENST00000578093	DAPK1	P53355	1430 aa		6.31	□□□□□ -1.4
PTPRM-206	ENST00000578093	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		6.31	□□□□□ -1.4
PTPRM-206	ENST00000578093	PBX2	P40425	430 aa		6.3	□□□□□ -1.4
PTPRM-206	ENST00000578093	PPP1R15B	Q5SWA1	713 aa		6.3	□□□□□ -1.4
PTPRM-206	ENST00000578093	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		6.3	□□□□□ -1.4
PTPRM-206	ENST00000578093	NOS1	P29475	1434 aa		6.3	□□□□□ -1.4
PTPRM-206	ENST00000578093	SHPRH	Q149N8	1683 aa		6.3	□□□□□ -1.4
PTPRM-206	ENST00000578093	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		6.29	□□□□□ -1.4
PTPRM-206	ENST00000578093	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		6.29	□□□□□ -1.4
PTPRM-206	ENST00000578093	FOXK1	P85037	733 aa		6.29	□□□□□ -1.4
PTPRM-206	ENST00000578093	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	6.29	□□□□□ -1.4
PTPRM-206	ENST00000578093	DIP2A	Q14689	1571 aa		6.28	□□□□□ -1.4
PTPRM-206	ENST00000578093	ZFYVE9	O95405	1425 aa		6.28	□□□□□ -1.4
PTPRM-206	ENST00000578093	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		6.28	□□□□□ -1.4
PTPRM-206	ENST00000578093	C2orf72	A6NCS6	295 aa		6.28	□□□□□ -1.4
PTPRM-206	ENST00000578093	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	6.28	□□□□□ -1.4
PTPRM-206	ENST00000578093	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		6.28	□□□□□ -1.4
PTPRM-206	ENST00000578093		E9PCH4	1651 aa		6.28	□□□□□ -1.4
PTPRM-206	ENST00000578093	UNC13B	O14795	1591 aa		6.27	□□□□□ -1.41
PTPRM-206	ENST00000578093	KIF3C	O14782	793 aa		6.27	□□□□□ -1.41
PTPRM-206	ENST00000578093	LCE2A	Q5TA79	106 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
PTPRM-206	ENST00000578093	KCNV2	Q8TDN2	545 aa		6.27	□□□□□ -1.41
PTPRM-206	ENST00000578093	ARHGEF1	Q92888	912 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
PTPRM-206	ENST00000578093	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		6.27	□□□□□ -1.41
PTPRM-206	ENST00000578093	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
PTPRM-206	ENST00000578093	ADGRL2	O95490	1459 aa		6.27	□□□□□ -1.41
PTPRM-206	ENST00000578093	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PTPRM-206	ENST00000578093	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PTPRM-206	ENST00000578093	IDI1	Q13907	227 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PTPRM-206	ENST00000578093	DSG2	Q14126	1118 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PTPRM-206	ENST00000578093	SUZ12	Q15022	739 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
PTPRM-206	ENST00000578093	ADGRD1	Q6QNK2	874 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PTPRM-206	ENST00000578093	PLPP6	Q8IY26	295 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PTPRM-206	ENST00000578093	EID1	Q9Y6B2	187 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PTPRM-206	ENST00000578093	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
PTPRM-206	ENST00000578093	KCNA6	P17658	529 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PTPRM-206	ENST00000578093	CAMK2B	Q13554	666 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PTPRM-206	ENST00000578093	MSH6	P52701	1360 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PTPRM-206	ENST00000578093	KANK1	Q14678	1352 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PTPRM-206	ENST00000578093	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PTPRM-206	ENST00000578093	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PTPRM-206	ENST00000578093	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PTPRM-206	ENST00000578093	EP400	Q96L91	3159 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PTPRM-206	ENST00000578093	JCAD	Q9P266	1359 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PTPRM-206	ENST00000578093	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PTPRM-206	ENST00000578093	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PTPRM-206	ENST00000578093	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
PTPRM-206	ENST00000578093	KCTD12	Q96CX2	325 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
PTPRM-206	ENST00000578093	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PTPRM-206	ENST00000578093	AXIN2	Q9Y2T1	843 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PTPRM-206	ENST00000578093	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PTPRM-206	ENST00000578093	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
PTPRM-206	ENST00000578093	TULP1	O00294	542 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
PTPRM-206	ENST00000578093	HR	O43593	1189 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PTPRM-206	ENST00000578093	TMEM92	Q6UXU6	159 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PTPRM-206	ENST00000578093	ARIH1	Q9Y4X5	557 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
PTPRM-206	ENST00000578093	PTPRU	Q92729	1446 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PTPRM-206	ENST00000578093	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PTPRM-206	ENST00000578093	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PTPRM-206	ENST00000578093	TRPM2	O94759	1503 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PTPRM-206	ENST00000578093	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PTPRM-206	ENST00000578093	TBC1D12	O60347	775 aa		6.21	□□□□□ -1.42
PTPRM-206	ENST00000578093	MAP3K9	P80192	1104 aa		6.21	□□□□□ -1.42
PTPRM-206	ENST00000578093	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	6.21	□□□□□ -1.42
PTPRM-206	ENST00000578093	TRIM52	Q96A61	297 aa		6.21	□□□□□ -1.42
PTPRM-206	ENST00000578093	SLAIN2	Q9P270	581 aa		6.21	□□□□□ -1.42
PTPRM-206	ENST00000578093	RGS12	O14924	1447 aa		6.21	□□□□□ -1.42
PTPRM-206	ENST00000578093	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		6.21	□□□□□ -1.42
PTPRM-206	ENST00000578093	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		6.2	□□□□□ -1.42
PTPRM-206	ENST00000578093	SPDYE16	A6NNV3	312 aa	Predicted RBP	6.2	□□□□□ -1.42
PTPRM-206	ENST00000578093	ARSI	Q5FYB1	569 aa		6.2	□□□□□ -1.42

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