RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574099.1

CCDC40-211, Transcript of coiled-coil domain containing 40, humanhuman

TSL 4

Gene CCDC40, Length 537 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC40-211ENST00000574099 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa26■■□□□ 1.75
CCDC40-211ENST00000574099 ADGRB1O14514 1584 aa26■■□□□ 1.75
CCDC40-211ENST00000574099 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
CCDC40-211ENST00000574099 TRAK1Q9UPV9 953 aa26■■□□□ 1.75
CCDC40-211ENST00000574099 PRR36Q9H6K5 1346 aa25.99■■□□□ 1.75
CCDC40-211ENST00000574099 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
CCDC40-211ENST00000574099 TULP4Q9NRJ4 1543 aa25.98■■□□□ 1.75
CCDC40-211ENST00000574099 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa25.98■■□□□ 1.75
CCDC40-211ENST00000574099 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa25.98■■□□□ 1.75
CCDC40-211ENST00000574099 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
CCDC40-211ENST00000574099 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.75
CCDC40-211ENST00000574099 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
CCDC40-211ENST00000574099 PRDM11Q9NQV5 511 aa25.94■■□□□ 1.74
CCDC40-211ENST00000574099 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
CCDC40-211ENST00000574099 DISP2A7MBM2 1401 aa25.92■■□□□ 1.74
CCDC40-211ENST00000574099 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
CCDC40-211ENST00000574099 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
CCDC40-211ENST00000574099 ITSN1Q15811 1721 aa25.91■■□□□ 1.74
CCDC40-211ENST00000574099 WASLO00401 505 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
CCDC40-211ENST00000574099 KIAA0232Q92628 1395 aa25.89■■□□□ 1.74
CCDC40-211ENST00000574099 CHRNA2Q15822 529 aa25.88■■□□□ 1.73
CCDC40-211ENST00000574099 STRN4Q9NRL3 753 aa25.88■■□□□ 1.73
CCDC40-211ENST00000574099 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa25.88■■□□□ 1.73
CCDC40-211ENST00000574099 TRIM37O94972 964 aa25.87■■□□□ 1.73
CCDC40-211ENST00000574099 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa25.87■■□□□ 1.73
CCDC40-211ENST00000574099 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
CCDC40-211ENST00000574099 ATP7BP35670 1465 aa25.85■■□□□ 1.73
CCDC40-211ENST00000574099 NUTM2GQ5VZR2 741 aa25.83■■□□□ 1.73
CCDC40-211ENST00000574099 USP35Q9P2H5 1018 aa25.83■■□□□ 1.73
CCDC40-211ENST00000574099 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
CCDC40-211ENST00000574099 DCAF11Q8TEB1 546 aa25.82■■□□□ 1.72
CCDC40-211ENST00000574099 CAMKK2Q96RR4 588 aa25.82■■□□□ 1.72
CCDC40-211ENST00000574099 FAM196AQ6ZSG2 479 aa25.81■■□□□ 1.72
CCDC40-211ENST00000574099 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa25.81■■□□□ 1.72
CCDC40-211ENST00000574099 RREB1Q92766 1687 aa25.8■■□□□ 1.72
CCDC40-211ENST00000574099 APBA3O96018 575 aa25.8■■□□□ 1.72
CCDC40-211ENST00000574099 NUP188Q5SRE5 1749 aa25.8■■□□□ 1.72
CCDC40-211ENST00000574099 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
CCDC40-211ENST00000574099 NRKQ7Z2Y5 1582 aa25.78■■□□□ 1.72
CCDC40-211ENST00000574099 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa25.77■■□□□ 1.72
CCDC40-211ENST00000574099 SSH2Q76I76 1423 aa25.77■■□□□ 1.72
CCDC40-211ENST00000574099 PARD3Q8TEW0 1356 aa25.75■■□□□ 1.71
CCDC40-211ENST00000574099 EVA1CP58658 441 aa25.75■■□□□ 1.71
CCDC40-211ENST00000574099 PDE3BQ13370 1112 aa25.74■■□□□ 1.71
CCDC40-211ENST00000574099 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa25.73■■□□□ 1.71
CCDC40-211ENST00000574099 LMO7Q8WWI1 1683 aa25.71■■□□□ 1.71
CCDC40-211ENST00000574099 ACEP12821 1306 aa25.71■■□□□ 1.71
CCDC40-211ENST00000574099 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
CCDC40-211ENST00000574099 BARGINQ6ZT62 677 aa25.71■■□□□ 1.71
CCDC40-211ENST00000574099 CDK19Q9BWU1 502 aa25.71■■□□□ 1.71
CCDC40-211ENST00000574099 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.71
CCDC40-211ENST00000574099 NBPF8Q3BBV2 869 aa25.68■■□□□ 1.7
CCDC40-211ENST00000574099 TCP11L2Q8N4U5 519 aa25.67■■□□□ 1.7
CCDC40-211ENST00000574099 ABTB2Q8N961 1025 aa25.67■■□□□ 1.7
CCDC40-211ENST00000574099 NBPF14Q5TI25 921 aa25.66■■□□□ 1.7
CCDC40-211ENST00000574099 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
CCDC40-211ENST00000574099 YY1P25490 414 aa25.64■■□□□ 1.7
CCDC40-211ENST00000574099 CCDC61Q9Y6R9 512 aa25.64■■□□□ 1.7
CCDC40-211ENST00000574099 CPDO75976 1380 aa25.64■■□□□ 1.69
CCDC40-211ENST00000574099 STAC3Q96MF2 364 aa25.63■■□□□ 1.69
CCDC40-211ENST00000574099 USP19O94966 1318 aa25.63■■□□□ 1.69
CCDC40-211ENST00000574099 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
CCDC40-211ENST00000574099 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
CCDC40-211ENST00000574099 ZBTB7CA1YPR0 619 aa25.61■■□□□ 1.69
CCDC40-211ENST00000574099 PLEKHG3A1L390 1219 aa25.6■■□□□ 1.69
CCDC40-211ENST00000574099 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
CCDC40-211ENST00000574099 PEAK1Q9H792 1746 aa25.58■■□□□ 1.69
CCDC40-211ENST00000574099 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa25.58■■□□□ 1.69
CCDC40-211ENST00000574099 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa25.58■■□□□ 1.69
CCDC40-211ENST00000574099 SPON1Q9HCB6 807 aa25.58■■□□□ 1.69
CCDC40-211ENST00000574099 LRRC37A3O60309 1634 aa25.58■■□□□ 1.69
CCDC40-211ENST00000574099 GCP02774 474 aa25.57■■□□□ 1.68
CCDC40-211ENST00000574099 NLRP13Q86W25 1043 aa25.57■■□□□ 1.68
CCDC40-211ENST00000574099 SBF2Q86WG5 1849 aa25.56■■□□□ 1.68
CCDC40-211ENST00000574099 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa25.56■■□□□ 1.68
CCDC40-211ENST00000574099 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa25.56■■□□□ 1.68
CCDC40-211ENST00000574099 OVOS2Q6IE36 1432 aa25.56■■□□□ 1.68
CCDC40-211ENST00000574099 CRB1P82279 1406 aa25.55■■□□□ 1.68
CCDC40-211ENST00000574099 KCNQ2O43526 872 aa25.55■■□□□ 1.68
CCDC40-211ENST00000574099 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
CCDC40-211ENST00000574099 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
CCDC40-211ENST00000574099 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa25.54■■□□□ 1.68
CCDC40-211ENST00000574099 WNK3Q9BYP7 1800 aa25.53■■□□□ 1.68
CCDC40-211ENST00000574099 CABP2Q9NPB3 220 aa25.52■■□□□ 1.68
CCDC40-211ENST00000574099 NINLQ9Y2I6 1382 aa25.52■■□□□ 1.68
CCDC40-211ENST00000574099 NBPF1Q3BBV0 1214 aa25.51■■□□□ 1.67
CCDC40-211ENST00000574099 QRICH2Q9H0J4 1663 aa25.51■■□□□ 1.67
CCDC40-211ENST00000574099 CASZ1Q86V15 1759 aa25.5■■□□□ 1.67
CCDC40-211ENST00000574099 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
CCDC40-211ENST00000574099 SLIT3O75094 1523 aa25.49■■□□□ 1.67
CCDC40-211ENST00000574099 DCAF8L1A6NGE4 600 aa25.49■■□□□ 1.67
CCDC40-211ENST00000574099 DDB1Q16531 1140 aa25.48■■□□□ 1.67
CCDC40-211ENST00000574099 PTF1AQ7RTS3 328 aa25.48■■□□□ 1.67
CCDC40-211ENST00000574099 AKAP12Q02952 1782 aa25.48■■□□□ 1.67
CCDC40-211ENST00000574099 USP6P35125 1406 aa25.47■■□□□ 1.67
CCDC40-211ENST00000574099 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
CCDC40-211ENST00000574099 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
CCDC40-211ENST00000574099 NLRP6P59044 892 aa25.47■■□□□ 1.67
CCDC40-211ENST00000574099 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa25.47■■□□□ 1.67
CCDC40-211ENST00000574099 PIK3C2AO00443 1686 aa25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.9 ms