RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570016.5

CDIPT-210, Transcript of CDP-diacylglycerol--inositol 3-phosphatidyltransferase, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CDIPT, Length 1,346 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDIPT-210ENST00000570016 CABP2Q9NPB3 220 aa30.96■■■□□ 2.55
CDIPT-210ENST00000570016 EVC2Q86UK5 1308 aa30.95■■■□□ 2.55
CDIPT-210ENST00000570016 RGS12O14924 1447 aa30.95■■■□□ 2.55
CDIPT-210ENST00000570016 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa30.95■■■□□ 2.55
CDIPT-210ENST00000570016 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP30.93■■■□□ 2.54
CDIPT-210ENST00000570016 CARD11Q9BXL7 1154 aa30.93■■■□□ 2.54
CDIPT-210ENST00000570016 UNC5CLQ8IV45 518 aa30.92■■■□□ 2.54
CDIPT-210ENST00000570016 NWD2Q9ULI1 1742 aa30.91■■■□□ 2.54
CDIPT-210ENST00000570016 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP30.91■■■□□ 2.54
CDIPT-210ENST00000570016 CLSPNQ9HAW4 1339 aa30.91■■■□□ 2.54
CDIPT-210ENST00000570016 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP30.9■■■□□ 2.54
CDIPT-210ENST00000570016 PLCH1Q4KWH8 1693 aa30.88■■■□□ 2.53
CDIPT-210ENST00000570016 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP30.87■■■□□ 2.53
CDIPT-210ENST00000570016 FAM83GA6ND36 823 aa30.86■■■□□ 2.53
CDIPT-210ENST00000570016 CABP1Q9NZU7 370 aa30.86■■■□□ 2.53
CDIPT-210ENST00000570016 USP6P35125 1406 aa30.83■■■□□ 2.53
CDIPT-210ENST00000570016 ATAD2Q6PL18 1390 aa30.83■■■□□ 2.53
CDIPT-210ENST00000570016 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP30.83■■■□□ 2.53
CDIPT-210ENST00000570016 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP30.83■■■□□ 2.53
CDIPT-210ENST00000570016 PLEKHG5O94827 1062 aa30.82■■■□□ 2.52
CDIPT-210ENST00000570016 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa30.82■■■□□ 2.52
CDIPT-210ENST00000570016 GLI3P10071 1580 aa30.82■■■□□ 2.52
CDIPT-210ENST00000570016 SSH2Q76I76 1423 aa30.81■■■□□ 2.52
CDIPT-210ENST00000570016 PCGF6Q9BYE7 350 aa30.81■■■□□ 2.52
CDIPT-210ENST00000570016 VPS72Q15906 364 aa30.8■■■□□ 2.52
CDIPT-210ENST00000570016 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP30.79■■■□□ 2.524e-7■■■■■ 54.3
CDIPT-210ENST00000570016 NRAPQ86VF7 1730 aa30.79■■■□□ 2.52
CDIPT-210ENST00000570016 USP19O94966 1318 aa30.79■■■□□ 2.52
CDIPT-210ENST00000570016 ABTB2Q8N961 1025 aa30.77■■■□□ 2.52
CDIPT-210ENST00000570016 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP30.75■■■□□ 2.51
CDIPT-210ENST00000570016 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP30.75■■■□□ 2.51
CDIPT-210ENST00000570016 NRKQ7Z2Y5 1582 aa30.75■■■□□ 2.51
CDIPT-210ENST00000570016 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP30.74■■■□□ 2.51
CDIPT-210ENST00000570016 AKAP12Q02952 1782 aa30.74■■■□□ 2.51
CDIPT-210ENST00000570016 NLRP13Q86W25 1043 aa30.73■■■□□ 2.51
CDIPT-210ENST00000570016 BTG4Q9NY30 223 aa30.73■■■□□ 2.51
CDIPT-210ENST00000570016 KIAA0232Q92628 1395 aa30.73■■■□□ 2.51
CDIPT-210ENST00000570016 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP30.73■■■□□ 2.51
CDIPT-210ENST00000570016 NUTM2GQ5VZR2 741 aa30.73■■■□□ 2.51
CDIPT-210ENST00000570016 PRDM11Q9NQV5 511 aa30.72■■■□□ 2.51
CDIPT-210ENST00000570016 CPDO75976 1380 aa30.71■■■□□ 2.51
CDIPT-210ENST00000570016 TESK2Q96S53 571 aa30.71■■■□□ 2.51
CDIPT-210ENST00000570016 SLC24A1O60721 1099 aa30.69■■■□□ 2.5
CDIPT-210ENST00000570016 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa30.68■■■□□ 2.5
CDIPT-210ENST00000570016 SLIT3O75094 1523 aa30.68■■■□□ 2.5
CDIPT-210ENST00000570016 PIK3C2AO00443 1686 aa30.68■■■□□ 2.5
CDIPT-210ENST00000570016 GCP02774 474 aa30.67■■■□□ 2.5
CDIPT-210ENST00000570016 CD163L1Q9NR16 1453 aa30.66■■■□□ 2.5
CDIPT-210ENST00000570016 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa30.66■■■□□ 2.5
CDIPT-210ENST00000570016 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP30.66■■■□□ 2.5
CDIPT-210ENST00000570016 TTC21AQ8NDW8 1320 aa30.65■■■□□ 2.5
CDIPT-210ENST00000570016 MON2Q7Z3U7 1717 aa30.65■■■□□ 2.5
CDIPT-210ENST00000570016 LMO7Q8WWI1 1683 aa30.63■■■□□ 2.49
CDIPT-210ENST00000570016 NLRP6P59044 892 aa30.63■■■□□ 2.49
CDIPT-210ENST00000570016 CHRNA2Q15822 529 aa30.63■■■□□ 2.49
CDIPT-210ENST00000570016 EP400Q96L91 3159 aa30.63■■■□□ 2.49
CDIPT-210ENST00000570016 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP30.62■■■□□ 2.49
CDIPT-210ENST00000570016 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa30.62■■■□□ 2.49
CDIPT-210ENST00000570016 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa30.62■■■□□ 2.49
CDIPT-210ENST00000570016 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP30.62■■■□□ 2.49
CDIPT-210ENST00000570016 USP47Q96K76 1375 aa30.61■■■□□ 2.49
CDIPT-210ENST00000570016 SEPT12Q8IYM1 358 aa30.6■■■□□ 2.49
CDIPT-210ENST00000570016 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa30.59■■■□□ 2.49
CDIPT-210ENST00000570016 BRWD3Q6RI45 1802 aa30.58■■■□□ 2.49
CDIPT-210ENST00000570016 NINLQ9Y2I6 1382 aa30.58■■■□□ 2.49
CDIPT-210ENST00000570016 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa30.57■■■□□ 2.48
CDIPT-210ENST00000570016 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa30.55■■■□□ 2.48
CDIPT-210ENST00000570016 USP54Q70EL1 1684 aa30.54■■■□□ 2.48
CDIPT-210ENST00000570016 USP31Q70CQ4 1352 aa30.54■■■□□ 2.48
CDIPT-210ENST00000570016 AATKQ6ZMQ8 1374 aa30.53■■■□□ 2.48
CDIPT-210ENST00000570016 TMC1Q8TDI8 760 aa30.53■■■□□ 2.48
CDIPT-210ENST00000570016 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa30.53■■■□□ 2.48
CDIPT-210ENST00000570016 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP30.52■■■□□ 2.48
CDIPT-210ENST00000570016 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP30.52■■■□□ 2.48
CDIPT-210ENST00000570016 KCNH5Q8NCM2 988 aa30.52■■■□□ 2.48
CDIPT-210ENST00000570016 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP30.52■■■□□ 2.48
CDIPT-210ENST00000570016 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP30.52■■■□□ 2.48
CDIPT-210ENST00000570016 A0A1W2PP64 1363 aa30.52■■■□□ 2.48
CDIPT-210ENST00000570016 CCDC125Q86Z20 511 aa30.51■■■□□ 2.48
CDIPT-210ENST00000570016 TERF2IPQ9NYB0 399 aa30.51■■■□□ 2.48
CDIPT-210ENST00000570016 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP30.5■■■□□ 2.47
CDIPT-210ENST00000570016 COL18A1P39060 1754 aa30.5■■■□□ 2.47
CDIPT-210ENST00000570016 STRN4Q9NRL3 753 aa30.49■■■□□ 2.47
CDIPT-210ENST00000570016 TMF1P82094 1093 aa30.48■■■□□ 2.47
CDIPT-210ENST00000570016 KRT27Q7Z3Y8 459 aa30.48■■■□□ 2.47
CDIPT-210ENST00000570016 NFAT5O94916 1531 aa30.48■■■□□ 2.47
CDIPT-210ENST00000570016 EVA1CP58658 441 aa30.47■■■□□ 2.47
CDIPT-210ENST00000570016 ARHGEF25Q86VW2 580 aa30.47■■■□□ 2.47
CDIPT-210ENST00000570016 BARGINQ6ZT62 677 aa30.46■■■□□ 2.47
CDIPT-210ENST00000570016 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP30.45■■■□□ 2.46
CDIPT-210ENST00000570016 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP30.45■■■□□ 2.46
CDIPT-210ENST00000570016 ABCC6O95255 1503 aa30.43■■■□□ 2.46
CDIPT-210ENST00000570016 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP30.43■■■□□ 2.46
CDIPT-210ENST00000570016 NME9Q86XW9 330 aa30.43■■■□□ 2.46
CDIPT-210ENST00000570016 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa30.42■■■□□ 2.46
CDIPT-210ENST00000570016 ZRANB1Q9UGI0 708 aa30.42■■■□□ 2.46
CDIPT-210ENST00000570016 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP30.42■■■□□ 2.46
CDIPT-210ENST00000570016 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa30.41■■■□□ 2.46
CDIPT-210ENST00000570016 OVOS2Q6IE36 1432 aa30.41■■■□□ 2.46
CDIPT-210ENST00000570016 A0A0G2JS52 829 aa30.41■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.7 ms