RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566180.5

RNPS1-218, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, humanhuman

TSL 5

Gene RNPS1, Length 814 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPS1-218ENST00000566180 CABP1Q9NZU7 370 aa30.31■■■□□ 2.44
RNPS1-218ENST00000566180 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa30.3■■■□□ 2.44
RNPS1-218ENST00000566180 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa30.3■■■□□ 2.44
RNPS1-218ENST00000566180 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP30.3■■■□□ 2.44
RNPS1-218ENST00000566180 ALS2Q96Q42 1657 aa30.28■■■□□ 2.44
RNPS1-218ENST00000566180 ATRNO75882 1429 aa30.28■■■□□ 2.44
RNPS1-218ENST00000566180 SLIT2O94813 1529 aa30.27■■■□□ 2.44
RNPS1-218ENST00000566180 UNC5CLQ8IV45 518 aa30.25■■■□□ 2.43
RNPS1-218ENST00000566180 FAM83GA6ND36 823 aa30.23■■■□□ 2.43
RNPS1-218ENST00000566180 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP30.23■■■□□ 2.43
RNPS1-218ENST00000566180 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP30.22■■■□□ 2.43
RNPS1-218ENST00000566180 ATAD2Q6PL18 1390 aa30.21■■■□□ 2.43
RNPS1-218ENST00000566180 NUTM2GQ5VZR2 741 aa30.2■■■□□ 2.43
RNPS1-218ENST00000566180 ABTB2Q8N961 1025 aa30.2■■■□□ 2.43
RNPS1-218ENST00000566180 RGS12O14924 1447 aa30.2■■■□□ 2.42
RNPS1-218ENST00000566180 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP30.19■■■□□ 2.42
RNPS1-218ENST00000566180 ABCA3Q99758 1704 aa30.19■■■□□ 2.42
RNPS1-218ENST00000566180 USP6P35125 1406 aa30.18■■■□□ 2.42
RNPS1-218ENST00000566180 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP30.17■■■□□ 2.42
RNPS1-218ENST00000566180 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP30.17■■■□□ 2.42
RNPS1-218ENST00000566180 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa30.16■■■□□ 2.42
RNPS1-218ENST00000566180 TESK2Q96S53 571 aa30.15■■■□□ 2.42
RNPS1-218ENST00000566180 VPS72Q15906 364 aa30.14■■■□□ 2.42
RNPS1-218ENST00000566180 NLRP13Q86W25 1043 aa30.14■■■□□ 2.42
RNPS1-218ENST00000566180 SSH2Q76I76 1423 aa30.13■■■□□ 2.41
RNPS1-218ENST00000566180 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP30.13■■■□□ 2.41
RNPS1-218ENST00000566180 PRDM11Q9NQV5 511 aa30.12■■■□□ 2.41
RNPS1-218ENST00000566180 BTG4Q9NY30 223 aa30.12■■■□□ 2.41
RNPS1-218ENST00000566180 USP19O94966 1318 aa30.12■■■□□ 2.41
RNPS1-218ENST00000566180 SLC24A1O60721 1099 aa30.11■■■□□ 2.41
RNPS1-218ENST00000566180 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP30.11■■■□□ 2.41
RNPS1-218ENST00000566180 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP30.1■■■□□ 2.41
RNPS1-218ENST00000566180 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa30.1■■■□□ 2.41
RNPS1-218ENST00000566180 KIAA0232Q92628 1395 aa30.1■■■□□ 2.41
RNPS1-218ENST00000566180 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP30.08■■■□□ 2.41
RNPS1-218ENST00000566180 USP47Q96K76 1375 aa30.07■■■□□ 2.4
RNPS1-218ENST00000566180 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa30.07■■■□□ 2.4
RNPS1-218ENST00000566180 NLRP6P59044 892 aa30.07■■■□□ 2.4
RNPS1-218ENST00000566180 GCP02774 474 aa30.06■■■□□ 2.4
RNPS1-218ENST00000566180 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP30.06■■■□□ 2.4
RNPS1-218ENST00000566180 NWD2Q9ULI1 1742 aa30.05■■■□□ 2.4
RNPS1-218ENST00000566180 PLCH1Q4KWH8 1693 aa30.05■■■□□ 2.4
RNPS1-218ENST00000566180 TMC1Q8TDI8 760 aa30.05■■■□□ 2.4
RNPS1-218ENST00000566180 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP30.05■■■□□ 2.4
RNPS1-218ENST00000566180 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP30.05■■■□□ 2.4
RNPS1-218ENST00000566180 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP30.04■■■□□ 2.4
RNPS1-218ENST00000566180 CHRNA2Q15822 529 aa30.04■■■□□ 2.4
RNPS1-218ENST00000566180 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa30.04■■■□□ 2.4
RNPS1-218ENST00000566180 CPDO75976 1380 aa30.03■■■□□ 2.4
RNPS1-218ENST00000566180 GLI3P10071 1580 aa30.03■■■□□ 2.4
RNPS1-218ENST00000566180 TTC21AQ8NDW8 1320 aa30.03■■■□□ 2.4
RNPS1-218ENST00000566180 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP30.03■■■□□ 2.4
RNPS1-218ENST00000566180 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP30.01■■■□□ 2.39
RNPS1-218ENST00000566180 CD163L1Q9NR16 1453 aa30■■■□□ 2.39
RNPS1-218ENST00000566180 NRKQ7Z2Y5 1582 aa29.99■■■□□ 2.39
RNPS1-218ENST00000566180 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP29.99■■■□□ 2.39
RNPS1-218ENST00000566180 TMF1P82094 1093 aa29.98■■■□□ 2.39
RNPS1-218ENST00000566180 TERF2IPQ9NYB0 399 aa29.98■■■□□ 2.39
RNPS1-218ENST00000566180 NINLQ9Y2I6 1382 aa29.96■■■□□ 2.39
RNPS1-218ENST00000566180 SEPT12Q8IYM1 358 aa29.96■■■□□ 2.39
RNPS1-218ENST00000566180 NRAPQ86VF7 1730 aa29.96■■■□□ 2.39
RNPS1-218ENST00000566180 SLIT3O75094 1523 aa29.96■■■□□ 2.39
RNPS1-218ENST00000566180 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa29.96■■■□□ 2.39
RNPS1-218ENST00000566180 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa29.96■■■□□ 2.39
RNPS1-218ENST00000566180 AKAP12Q02952 1782 aa29.95■■■□□ 2.38
RNPS1-218ENST00000566180 PIK3C2AO00443 1686 aa29.93■■■□□ 2.38
RNPS1-218ENST00000566180 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP29.93■■■□□ 2.38
RNPS1-218ENST00000566180 STRN4Q9NRL3 753 aa29.93■■■□□ 2.38
RNPS1-218ENST00000566180 A0A1W2PP64 1363 aa29.92■■■□□ 2.38
RNPS1-218ENST00000566180 KCNH5Q8NCM2 988 aa29.92■■■□□ 2.38
RNPS1-218ENST00000566180 EVA1CP58658 441 aa29.91■■■□□ 2.38
RNPS1-218ENST00000566180 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP29.91■■■□□ 2.38
RNPS1-218ENST00000566180 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP29.9■■■□□ 2.38
RNPS1-218ENST00000566180 AATKQ6ZMQ8 1374 aa29.9■■■□□ 2.38
RNPS1-218ENST00000566180 USP31Q70CQ4 1352 aa29.9■■■□□ 2.38
RNPS1-218ENST00000566180 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa29.89■■■□□ 2.38
RNPS1-218ENST00000566180 CDCA8Q53HL2 280 aa29.89■■■□□ 2.38
RNPS1-218ENST00000566180 NME9Q86XW9 330 aa29.89■■■□□ 2.38
RNPS1-218ENST00000566180 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa29.89■■■□□ 2.38
RNPS1-218ENST00000566180 ZRANB1Q9UGI0 708 aa29.88■■■□□ 2.37
RNPS1-218ENST00000566180 MON2Q7Z3U7 1717 aa29.88■■■□□ 2.37
RNPS1-218ENST00000566180 ARHGEF25Q86VW2 580 aa29.87■■■□□ 2.37
RNPS1-218ENST00000566180 ZBTB7CA1YPR0 619 aa29.86■■■□□ 2.37
RNPS1-218ENST00000566180 LMO7Q8WWI1 1683 aa29.85■■■□□ 2.37
RNPS1-218ENST00000566180 A0A0G2JS52 829 aa29.85■■■□□ 2.37
RNPS1-218ENST00000566180 MYT1Q01538 1121 aa29.85■■■□□ 2.37
RNPS1-218ENST00000566180 SOX12O15370 315 aa29.84■■■□□ 2.37
RNPS1-218ENST00000566180 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP29.84■■■□□ 2.37
RNPS1-218ENST00000566180 KRT27Q7Z3Y8 459 aa29.84■■■□□ 2.37
RNPS1-218ENST00000566180 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa29.82■■■□□ 2.36
RNPS1-218ENST00000566180 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP29.81■■■□□ 2.36
RNPS1-218ENST00000566180 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP29.8■■■□□ 2.36
RNPS1-218ENST00000566180 USP35Q9P2H5 1018 aa29.8■■■□□ 2.36
RNPS1-218ENST00000566180 AXIN2Q9Y2T1 843 aa29.8■■■□□ 2.36
RNPS1-218ENST00000566180 BARGINQ6ZT62 677 aa29.79■■■□□ 2.36
RNPS1-218ENST00000566180 CCDC125Q86Z20 511 aa29.79■■■□□ 2.36
RNPS1-218ENST00000566180 NFAT5O94916 1531 aa29.78■■■□□ 2.36
RNPS1-218ENST00000566180 TCP11L2Q8N4U5 519 aa29.77■■■□□ 2.36
RNPS1-218ENST00000566180 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP29.76■■■□□ 2.35
RNPS1-218ENST00000566180 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa29.75■■■□□ 2.35
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