RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561408.1

TMOD3-210, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 493 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-210ENST00000561408 NLRP7Q8WX94 980 aa8.08□□□□□ -1.12
TMOD3-210ENST00000561408 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa8.07□□□□□ -1.12
TMOD3-210ENST00000561408 ZPR1O75312 459 aa8.07□□□□□ -1.12
TMOD3-210ENST00000561408 RSPH4AQ5TD94 716 aa8.07□□□□□ -1.12
TMOD3-210ENST00000561408 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa8.07□□□□□ -1.12
TMOD3-210ENST00000561408 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
TMOD3-210ENST00000561408 PHOX2BQ99453 314 aa8.06□□□□□ -1.12
TMOD3-210ENST00000561408 EFCAB5A4FU69 1503 aa8.06□□□□□ -1.12
TMOD3-210ENST00000561408 HECW1Q76N89 1606 aa8.06□□□□□ -1.12
TMOD3-210ENST00000561408 KIF27Q86VH2 1401 aa8.05□□□□□ -1.12
TMOD3-210ENST00000561408 DDX11L8A8MPP1 907 aa8.05□□□□□ -1.12
TMOD3-210ENST00000561408 RDH13Q8NBN7 331 aa8.05□□□□□ -1.12
TMOD3-210ENST00000561408 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
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TMOD3-210ENST00000561408 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
TMOD3-210ENST00000561408 ATP10BO94823 1461 aa8.05□□□□□ -1.12
TMOD3-210ENST00000561408 FHOD3Q2V2M9 1422 aa8.04□□□□□ -1.12
TMOD3-210ENST00000561408 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa8.04□□□□□ -1.12
TMOD3-210ENST00000561408 TOM1O60784 492 aa8.04□□□□□ -1.12
TMOD3-210ENST00000561408 MAP2K5Q13163 448 aa8.04□□□□□ -1.12
TMOD3-210ENST00000561408 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP8.04□□□□□ -1.12
TMOD3-210ENST00000561408 ALKQ9UM73 1620 aa8.03□□□□□ -1.12
TMOD3-210ENST00000561408 GGCXP38435 758 aa8.03□□□□□ -1.12
TMOD3-210ENST00000561408 TLL1O43897 1013 aa8.02□□□□□ -1.13
TMOD3-210ENST00000561408 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
TMOD3-210ENST00000561408 SULF1Q8IWU6 871 aa8.01□□□□□ -1.13
TMOD3-210ENST00000561408 PRKD2Q9BZL6 878 aa8.01□□□□□ -1.13
TMOD3-210ENST00000561408 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
TMOD3-210ENST00000561408 ATP10AO60312 1499 aa8□□□□□ -1.13
TMOD3-210ENST00000561408 IRF6O14896 467 aa8□□□□□ -1.13
TMOD3-210ENST00000561408 NR1I2O75469 434 aa8□□□□□ -1.13
TMOD3-210ENST00000561408 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa7.99□□□□□ -1.13
TMOD3-210ENST00000561408 LMOD2Q6P5Q4 547 aa7.99□□□□□ -1.13
TMOD3-210ENST00000561408 SCUBE3Q8IX30 993 aa7.99□□□□□ -1.13
TMOD3-210ENST00000561408 TMUB1Q9BVT8 246 aa7.99□□□□□ -1.13
TMOD3-210ENST00000561408 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa7.99□□□□□ -1.13
TMOD3-210ENST00000561408 CFAP74Q9C0B2 1584 aa7.98□□□□□ -1.13
TMOD3-210ENST00000561408 C9orf84Q5VXU9 1444 aa7.98□□□□□ -1.13
TMOD3-210ENST00000561408 MAGI2Q86UL8 1455 aa7.98□□□□□ -1.13
TMOD3-210ENST00000561408 GCGRP47871 477 aa7.97□□□□□ -1.13
TMOD3-210ENST00000561408 FUT2Q10981 343 aa7.97□□□□□ -1.13
TMOD3-210ENST00000561408 CCDC102AQ96A19 550 aa7.97□□□□□ -1.13
TMOD3-210ENST00000561408 RNF223E7ERA6 249 aa7.96□□□□□ -1.14
TMOD3-210ENST00000561408 S1PR4O95977 384 aa7.96□□□□□ -1.14
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TMOD3-210ENST00000561408 ATP6V1AP38606 617 aa7.96□□□□□ -1.14
TMOD3-210ENST00000561408 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
TMOD3-210ENST00000561408 V9GY48 417 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
TMOD3-210ENST00000561408 SCAPERQ9BY12 1400 aa7.95□□□□□ -1.14
TMOD3-210ENST00000561408 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
TMOD3-210ENST00000561408 MORN1Q5T089 497 aa7.95□□□□□ -1.14
TMOD3-210ENST00000561408 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP7.94□□□□□ -1.14
TMOD3-210ENST00000561408 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
TMOD3-210ENST00000561408 SLC6A16Q9GZN6 736 aa7.94□□□□□ -1.14
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TMOD3-210ENST00000561408 GOLGA3Q08378 1498 aa7.94□□□□□ -1.14
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TMOD3-210ENST00000561408 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa7.94□□□□□ -1.14
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TMOD3-210ENST00000561408 PTPRKQ15262 1439 aa7.93□□□□□ -1.14
TMOD3-210ENST00000561408 SHANK2Q9UPX8 1470 aa7.93□□□□□ -1.14
TMOD3-210ENST00000561408 CPS1P31327 1500 aa7.93□□□□□ -1.14
TMOD3-210ENST00000561408 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
TMOD3-210ENST00000561408 STRCP1A6NGW2 1772 aa7.92□□□□□ -1.14
TMOD3-210ENST00000561408 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa7.92□□□□□ -1.14
TMOD3-210ENST00000561408 MYO3AQ8NEV4 1616 aa7.92□□□□□ -1.14
TMOD3-210ENST00000561408 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa7.92□□□□□ -1.14
TMOD3-210ENST00000561408 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
TMOD3-210ENST00000561408 GFRA3O60609 400 aa7.91□□□□□ -1.14
TMOD3-210ENST00000561408 GRIPAP1Q4V328 841 aa7.91□□□□□ -1.14
TMOD3-210ENST00000561408 Q6ZNB5 142 aa7.91□□□□□ -1.14
TMOD3-210ENST00000561408 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
TMOD3-210ENST00000561408 TRIM52Q96A61 297 aa7.91□□□□□ -1.14
TMOD3-210ENST00000561408 GPCPD1Q9NPB8 672 aa7.91□□□□□ -1.14
TMOD3-210ENST00000561408 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa7.91□□□□□ -1.14
TMOD3-210ENST00000561408 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
TMOD3-210ENST00000561408 PLA2R1Q13018 1463 aa7.9□□□□□ -1.14
TMOD3-210ENST00000561408 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
TMOD3-210ENST00000561408 ZMYND10O75800 440 aa7.9□□□□□ -1.14
TMOD3-210ENST00000561408 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
TMOD3-210ENST00000561408 CLCN1P35523 988 aa7.9□□□□□ -1.14
TMOD3-210ENST00000561408 SLC19A1P41440 591 aa7.9□□□□□ -1.14
TMOD3-210ENST00000561408 LAPTM4AQ15012 233 aa7.9□□□□□ -1.14
TMOD3-210ENST00000561408 BARGINQ6ZT62 677 aa7.9□□□□□ -1.14
TMOD3-210ENST00000561408 THAP11Q96EK4 314 aa7.9□□□□□ -1.14
TMOD3-210ENST00000561408 ABCA6Q8N139 1617 aa7.89□□□□□ -1.15
TMOD3-210ENST00000561408 AFAP1Q8N556 730 aa7.89□□□□□ -1.15
TMOD3-210ENST00000561408 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
TMOD3-210ENST00000561408 VWDEQ8N2E2 1590 aa7.88□□□□□ -1.15
TMOD3-210ENST00000561408 NEURL4Q96JN8 1562 aa7.88□□□□□ -1.15
TMOD3-210ENST00000561408 KDM4AO75164 1064 aa7.88□□□□□ -1.15
TMOD3-210ENST00000561408 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
TMOD3-210ENST00000561408 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
TMOD3-210ENST00000561408 MROH2AA6NES4 1674 aa7.87□□□□□ -1.15
TMOD3-210ENST00000561408 PLEKHD1A6NEE1 506 aa7.87□□□□□ -1.15
TMOD3-210ENST00000561408 SPRYD7Q5W111 196 aa7.87□□□□□ -1.15
TMOD3-210ENST00000561408 BRICD5Q6PL45 260 aa7.87□□□□□ -1.15
TMOD3-210ENST00000561408 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa7.87□□□□□ -1.15
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