RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558555.5

MEIS3-204, Transcript of Meis homeobox 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene MEIS3, Length 1,715 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3-204ENST00000558555 KIF20BQ96Q89 1820 aa32.43■■■□□ 2.78
MEIS3-204ENST00000558555 USP6P35125 1406 aa32.43■■■□□ 2.78
MEIS3-204ENST00000558555 KIF1AQ12756 1690 aa32.43■■■□□ 2.78
MEIS3-204ENST00000558555 CCER2I3L3R5 266 aa32.43■■■□□ 2.78
MEIS3-204ENST00000558555 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP32.41■■■□□ 2.78
MEIS3-204ENST00000558555 ORAI2Q96SN7 254 aa32.4■■■□□ 2.78
MEIS3-204ENST00000558555 NRKQ7Z2Y5 1582 aa32.39■■■□□ 2.78
MEIS3-204ENST00000558555 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP32.38■■■□□ 2.77
MEIS3-204ENST00000558555 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa32.37■■■□□ 2.77
MEIS3-204ENST00000558555 MORC1Q86VD1 984 aa32.37■■■□□ 2.77
MEIS3-204ENST00000558555 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa32.36■■■□□ 2.77
MEIS3-204ENST00000558555 FYB1O15117 783 aa32.36■■■□□ 2.77
MEIS3-204ENST00000558555 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP32.34■■■□□ 2.77
MEIS3-204ENST00000558555 PSME1Q06323 249 aa32.34■■■□□ 2.77
MEIS3-204ENST00000558555 GGNBP2Q9H3C7 697 aa32.34■■■□□ 2.77
MEIS3-204ENST00000558555 TTC21AQ8NDW8 1320 aa32.33■■■□□ 2.77
MEIS3-204ENST00000558555 SSH2Q76I76 1423 aa32.33■■■□□ 2.77
MEIS3-204ENST00000558555 FOXO3O43524 673 aa32.3■■■□□ 2.76
MEIS3-204ENST00000558555 NME9Q86XW9 330 aa32.3■■■□□ 2.76
MEIS3-204ENST00000558555 NLRP13Q86W25 1043 aa32.29■■■□□ 2.76
MEIS3-204ENST00000558555 PHLPP1O60346 1717 aa32.27■■■□□ 2.76
MEIS3-204ENST00000558555 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP32.26■■■□□ 2.76
MEIS3-204ENST00000558555 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP32.26■■■□□ 2.75
MEIS3-204ENST00000558555 PPP2R1AP30153 589 aa32.26■■■□□ 2.75
MEIS3-204ENST00000558555 COG3Q96JB2 828 aa32.26■■■□□ 2.75
MEIS3-204ENST00000558555 MRS2Q9HD23 443 aa32.25■■■□□ 2.75
MEIS3-204ENST00000558555 NPHP3Q7Z494 1330 aa32.24■■■□□ 2.75
MEIS3-204ENST00000558555 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP32.23■■■□□ 2.75
MEIS3-204ENST00000558555 BRINP3Q76B58 766 aa32.23■■■□□ 2.75
MEIS3-204ENST00000558555 KRT28Q7Z3Y7 464 aa32.23■■■□□ 2.75
MEIS3-204ENST00000558555 PIK3C2AO00443 1686 aa32.2■■■□□ 2.75
MEIS3-204ENST00000558555 ZRANB1Q9UGI0 708 aa32.2■■■□□ 2.74
MEIS3-204ENST00000558555 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP32.19■■■□□ 2.74
MEIS3-204ENST00000558555 CCDC184Q52MB2 194 aa32.19■■■□□ 2.74
MEIS3-204ENST00000558555 ABTB2Q8N961 1025 aa32.18■■■□□ 2.74
MEIS3-204ENST00000558555 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP32.18■■■□□ 2.74
MEIS3-204ENST00000558555 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP32.17■■■□□ 2.74
MEIS3-204ENST00000558555 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa32.17■■■□□ 2.74
MEIS3-204ENST00000558555 OVOS2Q6IE36 1432 aa32.17■■■□□ 2.74
MEIS3-204ENST00000558555 USP31Q70CQ4 1352 aa32.17■■■□□ 2.74
MEIS3-204ENST00000558555 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP32.15■■■□□ 2.74
MEIS3-204ENST00000558555 NLRP6P59044 892 aa32.14■■■□□ 2.74
MEIS3-204ENST00000558555 ILDR2Q71H61 639 aa32.14■■■□□ 2.74
MEIS3-204ENST00000558555 USP54Q70EL1 1684 aa32.14■■■□□ 2.74
MEIS3-204ENST00000558555 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP32.13■■■□□ 2.73
MEIS3-204ENST00000558555 PXDNQ92626 1479 aa32.12■■■□□ 2.73
MEIS3-204ENST00000558555 SBNO1A3KN83 1393 aa32.12■■■□□ 2.73
MEIS3-204ENST00000558555 NUTM2GQ5VZR2 741 aa32.1■■■□□ 2.73
MEIS3-204ENST00000558555 LMOD2Q6P5Q4 547 aa32.09■■■□□ 2.73
MEIS3-204ENST00000558555 AATKQ6ZMQ8 1374 aa32.09■■■□□ 2.73
MEIS3-204ENST00000558555 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP32.09■■■□□ 2.73
MEIS3-204ENST00000558555 NHSL1Q5SYE7 1610 aa32.09■■■□□ 2.73
MEIS3-204ENST00000558555 MTHFSP49914 203 aa32.09■■■□□ 2.73
MEIS3-204ENST00000558555 ALS2Q96Q42 1657 aa32.08■■■□□ 2.73
MEIS3-204ENST00000558555 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP32.07■■■□□ 2.72
MEIS3-204ENST00000558555 CFAP53Q96M91 514 aa32.06■■■□□ 2.72
MEIS3-204ENST00000558555 JCADQ9P266 1359 aa32.06■■■□□ 2.72
MEIS3-204ENST00000558555 TNS3Q68CZ2 1445 aa32.05■■■□□ 2.72
MEIS3-204ENST00000558555 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP32.04■■■□□ 2.72
MEIS3-204ENST00000558555 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP32.03■■■□□ 2.72
MEIS3-204ENST00000558555 FAM9BQ8IZU0 186 aa32.02■■■□□ 2.72
MEIS3-204ENST00000558555 POLKQ9UBT6 870 aa32.02■■■□□ 2.72
MEIS3-204ENST00000558555 ARHGEF10O15013 1369 aa32.01■■■□□ 2.72
MEIS3-204ENST00000558555 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa32.01■■■□□ 2.72
MEIS3-204ENST00000558555 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP32.01■■■□□ 2.72
MEIS3-204ENST00000558555 SOX12O15370 315 aa32■■■□□ 2.71
MEIS3-204ENST00000558555 FBLN1P23142 703 aa32■■■□□ 2.71
MEIS3-204ENST00000558555 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP31.98■■■□□ 2.71
MEIS3-204ENST00000558555 KCNH5Q8NCM2 988 aa31.98■■■□□ 2.71
MEIS3-204ENST00000558555 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP31.98■■■□□ 2.71
MEIS3-204ENST00000558555 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP31.97■■■□□ 2.71
MEIS3-204ENST00000558555 SHPRHQ149N8 1683 aa31.97■■■□□ 2.71
MEIS3-204ENST00000558555 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa31.97■■■□□ 2.71
MEIS3-204ENST00000558555 USP19O94966 1318 aa31.96■■■□□ 2.71
MEIS3-204ENST00000558555 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP31.95■■■□□ 2.71
MEIS3-204ENST00000558555 SLIT3O75094 1523 aa31.95■■■□□ 2.7
MEIS3-204ENST00000558555 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP31.95■■■□□ 2.7
MEIS3-204ENST00000558555 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP31.95■■■□□ 2.7
MEIS3-204ENST00000558555 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP31.93■■■□□ 2.7
MEIS3-204ENST00000558555 LRP6O75581 1613 aa31.92■■■□□ 2.7
MEIS3-204ENST00000558555 PNPLA6Q8IY17 1366 aa31.92■■■□□ 2.7
MEIS3-204ENST00000558555 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP31.92■■■□□ 2.7
MEIS3-204ENST00000558555 NFAT5O94916 1531 aa31.91■■■□□ 2.7
MEIS3-204ENST00000558555 INSRP06213 1382 aa31.91■■■□□ 2.7
MEIS3-204ENST00000558555 PLEKHG5O94827 1062 aa31.91■■■□□ 2.7
MEIS3-204ENST00000558555 GCP02774 474 aa31.9■■■□□ 2.7
MEIS3-204ENST00000558555 MAP3K19Q56UN5 1328 aa31.9■■■□□ 2.7
MEIS3-204ENST00000558555 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa31.89■■■□□ 2.7
MEIS3-204ENST00000558555 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP31.89■■■□□ 2.7
MEIS3-204ENST00000558555 LTN1O94822 1766 aa31.88■■■□□ 2.69
MEIS3-204ENST00000558555 AMPHP49418 695 aa31.88■■■□□ 2.69
MEIS3-204ENST00000558555 NUDCQ9Y266 331 aa31.88■■■□□ 2.69
MEIS3-204ENST00000558555 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP31.87■■■□□ 2.69
MEIS3-204ENST00000558555 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP31.87■■■□□ 2.69
MEIS3-204ENST00000558555 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP31.87■■■□□ 2.69
MEIS3-204ENST00000558555 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP31.87■■■□□ 2.69
MEIS3-204ENST00000558555 KIF24Q5T7B8 1368 aa31.87■■■□□ 2.69
MEIS3-204ENST00000558555 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP31.86■■■□□ 2.69
MEIS3-204ENST00000558555 PEAK1Q9H792 1746 aa31.86■■■□□ 2.69
MEIS3-204ENST00000558555 FLT4P35916 1363 aa31.86■■■□□ 2.69
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