RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545204.1

MDM2-233, Transcript of MDM2 proto-oncogene, human

TSL 5 BASIC

Gene MDM2, Length 398 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM2-233	ENST00000545204	BAP1	Q92560	729 aa		6.77	□□□□□ -1.33
MDM2-233	ENST00000545204	PDZRN3	Q9UPQ7	1066 aa		6.77	□□□□□ -1.33
MDM2-233	ENST00000545204	SH3BP2	P78314	561 aa		6.76	□□□□□ -1.33
MDM2-233	ENST00000545204	FOXC1	Q12948	553 aa		6.76	□□□□□ -1.33
MDM2-233	ENST00000545204	NR6A1	Q15406	480 aa		6.76	□□□□□ -1.33
MDM2-233	ENST00000545204	LINC01559	Q495D7	138 aa		6.76	□□□□□ -1.33
MDM2-233	ENST00000545204	ZNF511	Q8NB15	262 aa		6.76	□□□□□ -1.33
MDM2-233	ENST00000545204	BANK1	Q8NDB2	785 aa		6.76	□□□□□ -1.33
MDM2-233	ENST00000545204	TNFRSF10A	O00220	468 aa		6.75	□□□□□ -1.33
MDM2-233	ENST00000545204	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	6.75	□□□□□ -1.33
MDM2-233	ENST00000545204	ARMC2	Q8NEN0	867 aa		6.75	□□□□□ -1.33
MDM2-233	ENST00000545204	EPS8L1	Q8TE68	723 aa		6.75	□□□□□ -1.33
MDM2-233	ENST00000545204	NRG2	O14511	850 aa	Predicted RBP	6.74	□□□□□ -1.33
MDM2-233	ENST00000545204	GFRA3	O60609	400 aa		6.74	□□□□□ -1.33
MDM2-233	ENST00000545204	LAPTM4A	Q15012	233 aa		6.74	□□□□□ -1.33
MDM2-233	ENST00000545204	MRGPRX2	Q96LB1	330 aa		6.74	□□□□□ -1.33
MDM2-233	ENST00000545204	TRIM34	Q9BYJ4	488 aa		6.74	□□□□□ -1.33
MDM2-233	ENST00000545204	SOCS7	O14512	581 aa		6.73	□□□□□ -1.33
MDM2-233	ENST00000545204	NBPF14	Q5TI25	921 aa		6.73	□□□□□ -1.33
MDM2-233	ENST00000545204	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		6.73	□□□□□ -1.33
MDM2-233	ENST00000545204	GJD4	Q96KN9	370 aa	Predicted RBP	6.73	□□□□□ -1.33
MDM2-233	ENST00000545204	FKBPL	Q9UIM3	349 aa		6.73	□□□□□ -1.33
MDM2-233	ENST00000545204	EHBP1	Q8NDI1	1231 aa		6.72	□□□□□ -1.33
MDM2-233	ENST00000545204	GPKOW	Q92917	476 aa	Predicted RBP eCLIP	6.72	□□□□□ -1.33
MDM2-233	ENST00000545204	FOXJ1	Q92949	421 aa		6.72	□□□□□ -1.33
MDM2-233	ENST00000545204	SNRK	Q9NRH2	765 aa		6.72	□□□□□ -1.33
MDM2-233	ENST00000545204	TOR4A	Q9NXH8	423 aa		6.72	□□□□□ -1.33
MDM2-233	ENST00000545204	ZC3H4	Q9UPT8	1303 aa	Known RBP	6.72	□□□□□ -1.33
MDM2-233	ENST00000545204	C4orf48	Q5BLP8	95 aa		6.71	□□□□□ -1.34
MDM2-233	ENST00000545204	SH3BP5L	Q7L8J4	393 aa		6.71	□□□□□ -1.34
MDM2-233	ENST00000545204	SIAH2	O43255	324 aa		6.7	□□□□□ -1.34
MDM2-233	ENST00000545204	VARS	P26640	1264 aa	Known RBP	6.7	□□□□□ -1.34
MDM2-233	ENST00000545204	SH3RF1	Q7Z6J0	888 aa		6.7	□□□□□ -1.34
MDM2-233	ENST00000545204	BPHL	Q86WA6	291 aa	Predicted RBP	6.7	□□□□□ -1.34
MDM2-233	ENST00000545204	CYP4X1	Q8N118	509 aa		6.7	□□□□□ -1.34
MDM2-233	ENST00000545204	PNMA1	Q8ND90	353 aa		6.7	□□□□□ -1.34
MDM2-233	ENST00000545204	SNIP1	Q8TAD8	396 aa	Known RBP	6.7	□□□□□ -1.34
MDM2-233	ENST00000545204	AGER	Q15109	404 aa		6.69	□□□□□ -1.34
MDM2-233	ENST00000545204	PDXDC2P	Q6P474	469 aa		6.69	□□□□□ -1.34
MDM2-233	ENST00000545204	TTC24	A2A3L6	582 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
MDM2-233	ENST00000545204	APBB1	O00213	710 aa		6.68	□□□□□ -1.34
MDM2-233	ENST00000545204	GPR37L1	O60883	481 aa		6.68	□□□□□ -1.34
MDM2-233	ENST00000545204	MCM6	Q14566	821 aa		6.68	□□□□□ -1.34
MDM2-233	ENST00000545204	C1QTNF2	Q9BXJ5	285 aa		6.68	□□□□□ -1.34
MDM2-233	ENST00000545204	MAGEB6P1	A0A0J9YX57	407 aa		6.67	□□□□□ -1.34
MDM2-233	ENST00000545204	FAM187A	A6NFU0	413 aa		6.67	□□□□□ -1.34
MDM2-233	ENST00000545204		J3QL48	77 aa		6.67	□□□□□ -1.34
MDM2-233	ENST00000545204	SMPD1	P17405	629 aa		6.67	□□□□□ -1.34
MDM2-233	ENST00000545204	FAM174A	Q8TBP5	190 aa		6.67	□□□□□ -1.34
MDM2-233	ENST00000545204	OCSTAMP	Q9BR26	566 aa		6.67	□□□□□ -1.34
MDM2-233	ENST00000545204	GPSM3	Q9Y4H4	160 aa		6.67	□□□□□ -1.34
MDM2-233	ENST00000545204	TLL2	Q9Y6L7	1015 aa		6.67	□□□□□ -1.34
MDM2-233	ENST00000545204	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		6.67	□□□□□ -1.34
MDM2-233	ENST00000545204	DGAT1	O75907	488 aa		6.66	□□□□□ -1.34
MDM2-233	ENST00000545204	ALDH1A1	P00352	501 aa		6.66	□□□□□ -1.34
MDM2-233	ENST00000545204	PTK2	Q05397	1052 aa		6.66	□□□□□ -1.34
MDM2-233	ENST00000545204	PKDCC	Q504Y2	493 aa		6.66	□□□□□ -1.34
MDM2-233	ENST00000545204		Q6ZNB5	142 aa		6.66	□□□□□ -1.34
MDM2-233	ENST00000545204	MPND	Q8N594	471 aa		6.66	□□□□□ -1.34
MDM2-233	ENST00000545204	ARHGAP9	Q9BRR9	750 aa		6.66	□□□□□ -1.34
MDM2-233	ENST00000545204	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		6.66	□□□□□ -1.34
MDM2-233	ENST00000545204	ERFE	Q4G0M1	354 aa		6.65	□□□□□ -1.34
MDM2-233	ENST00000545204	TRMT44	Q8IYL2	757 aa	Known RBP	6.65	□□□□□ -1.34
MDM2-233	ENST00000545204	CDK15	Q96Q40	435 aa		6.65	□□□□□ -1.34
MDM2-233	ENST00000545204	LCE2B	O14633	110 aa		6.64	□□□□□ -1.35
MDM2-233	ENST00000545204	ADAM32	Q8TC27	787 aa		6.64	□□□□□ -1.35
MDM2-233	ENST00000545204	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		6.64	□□□□□ -1.35
MDM2-233	ENST00000545204	AVP	P01185	164 aa		6.63	□□□□□ -1.35
MDM2-233	ENST00000545204	ZBTB33	Q86T24	672 aa		6.63	□□□□□ -1.35
MDM2-233	ENST00000545204	MAP4K5	Q9Y4K4	846 aa		6.63	□□□□□ -1.35
MDM2-233	ENST00000545204	ZBBX	A8MT70	800 aa		6.62	□□□□□ -1.35
MDM2-233	ENST00000545204	ADH1C	P00326	375 aa		6.62	□□□□□ -1.35
MDM2-233	ENST00000545204	FBXO45	P0C2W1	286 aa		6.62	□□□□□ -1.35
MDM2-233	ENST00000545204	FLII	Q13045	1269 aa		6.62	□□□□□ -1.35
MDM2-233	ENST00000545204	ARID5B	Q14865	1188 aa		6.62	□□□□□ -1.35
MDM2-233	ENST00000545204	HPS1	Q92902	700 aa		6.62	□□□□□ -1.35
MDM2-233	ENST00000545204	PRM3	Q9NNZ6	103 aa		6.62	□□□□□ -1.35
MDM2-233	ENST00000545204	WASF2	Q9Y6W5	498 aa		6.62	□□□□□ -1.35
MDM2-233	ENST00000545204	GRM5	P41594	1212 aa		6.61	□□□□□ -1.35
MDM2-233	ENST00000545204	MYT1	Q01538	1121 aa		6.61	□□□□□ -1.35
MDM2-233	ENST00000545204	TRAF7	Q6Q0C0	670 aa		6.61	□□□□□ -1.35
MDM2-233	ENST00000545204	SLC10A4	Q96EP9	437 aa		6.61	□□□□□ -1.35
MDM2-233	ENST00000545204	GDPD2	Q9HCC8	539 aa		6.61	□□□□□ -1.35
MDM2-233	ENST00000545204	NR1H3	Q13133	447 aa		6.6	□□□□□ -1.35
MDM2-233	ENST00000545204	IRF5	Q13568	498 aa		6.6	□□□□□ -1.35
MDM2-233	ENST00000545204	VASH1	Q7L8A9	365 aa	Predicted RBP	6.6	□□□□□ -1.35
MDM2-233	ENST00000545204	CRIPAK	Q8N1N5	446 aa		6.6	□□□□□ -1.35
MDM2-233	ENST00000545204	FSHR	P23945	695 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MDM2-233	ENST00000545204	SMCP	P49901	116 aa	Predicted RBP	6.59	□□□□□ -1.35
MDM2-233	ENST00000545204	NR5A1	Q13285	461 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MDM2-233	ENST00000545204	NNT	Q13423	1086 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MDM2-233	ENST00000545204	CTC1	Q2NKJ3	1217 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MDM2-233	ENST00000545204	CDV3	Q9UKY7	258 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
MDM2-233	ENST00000545204	COG6	Q9Y2V7	657 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MDM2-233	ENST00000545204	ST8SIA5	O15466	376 aa		6.58	□□□□□ -1.36
MDM2-233	ENST00000545204	NR3C2	P08235	984 aa		6.58	□□□□□ -1.36
MDM2-233	ENST00000545204	ABL2	P42684	1182 aa		6.58	□□□□□ -1.36
MDM2-233	ENST00000545204	AAAS	Q9NRG9	546 aa		6.58	□□□□□ -1.36
MDM2-233	ENST00000545204	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
MDM2-233	ENST00000545204	NBPF20	Q3BBV1	942 aa		6.57	□□□□□ -1.36

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