RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000536244.5

KCTD20-210, Transcript of potassium channel tetramerization domain containing 20, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene KCTD20, Length 5,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD20-210ENST00000536244 TSPYL1Q9H0U9 437 aa21.68■■□□□ 1.06
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KCTD20-210ENST00000536244 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
KCTD20-210ENST00000536244 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
KCTD20-210ENST00000536244 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
KCTD20-210ENST00000536244 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP21.67■■□□□ 1.06
KCTD20-210ENST00000536244 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
KCTD20-210ENST00000536244 ADAMTS8Q9UP79 889 aa21.67■■□□□ 1.06
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KCTD20-210ENST00000536244 TCP11L2Q8N4U5 519 aa21.66■■□□□ 1.06
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KCTD20-210ENST00000536244 GOLGA6L10A6NI86 522 aa21.66■■□□□ 1.06
KCTD20-210ENST00000536244 CBFA2T2O43439 604 aa21.66■■□□□ 1.06
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KCTD20-210ENST00000536244 CCDC27Q2M243 656 aa21.64■■□□□ 1.06
KCTD20-210ENST00000536244 KRT85P78386 507 aa21.64■■□□□ 1.05
KCTD20-210ENST00000536244 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa21.64■■□□□ 1.05
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KCTD20-210ENST00000536244 GNAI2P04899 355 aa21.64■■□□□ 1.05
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KCTD20-210ENST00000536244 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
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KCTD20-210ENST00000536244 KIAA0754O94854 1291 aa21.63■■□□□ 1.05
KCTD20-210ENST00000536244 USP8P40818 1118 aa21.63■■□□□ 1.05
KCTD20-210ENST00000536244 PPFIBP1Q86W92 1011 aa21.63■■□□□ 1.05
KCTD20-210ENST00000536244 STIM1Q13586 685 aa21.63■■□□□ 1.05
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KCTD20-210ENST00000536244 SYCP1Q15431 976 aa21.62■■□□□ 1.05
KCTD20-210ENST00000536244 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa21.61■■□□□ 1.05
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KCTD20-210ENST00000536244 TNMDQ9H2S6 317 aa21.61■■□□□ 1.05
KCTD20-210ENST00000536244 TTLL5Q6EMB2 1281 aa21.61■■□□□ 1.05
KCTD20-210ENST00000536244 MTHFSP49914 203 aa21.6■■□□□ 1.05
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KCTD20-210ENST00000536244 GGNBP2Q9H3C7 697 aa21.6■■□□□ 1.05
KCTD20-210ENST00000536244 FMNL2Q96PY5 1086 aa21.6■■□□□ 1.05
KCTD20-210ENST00000536244 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
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KCTD20-210ENST00000536244 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa21.59■■□□□ 1.05
KCTD20-210ENST00000536244 FYCO1Q9BQS8 1478 aa21.59■■□□□ 1.05
KCTD20-210ENST00000536244 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
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KCTD20-210ENST00000536244 MSH5O43196 834 aa21.58■■□□□ 1.04
KCTD20-210ENST00000536244 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.04
KCTD20-210ENST00000536244 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP21.58■■□□□ 1.04
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KCTD20-210ENST00000536244 TAF3Q5VWG9 929 aa21.56■■□□□ 1.04
KCTD20-210ENST00000536244 ZNF428Q96B54 188 aa21.56■■□□□ 1.04
KCTD20-210ENST00000536244 CEP57L1Q8IYX8 460 aa21.55■■□□□ 1.04
KCTD20-210ENST00000536244 CFAP45Q9UL16 551 aa21.55■■□□□ 1.04
KCTD20-210ENST00000536244 CCDC158Q5M9N0 1113 aa21.55■■□□□ 1.04
KCTD20-210ENST00000536244 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
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KCTD20-210ENST00000536244 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
KCTD20-210ENST00000536244 LRRCC1Q9C099 1032 aa21.54■■□□□ 1.04
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KCTD20-210ENST00000536244 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
KCTD20-210ENST00000536244 ESPNB1AK53 854 aa21.54■■□□□ 1.04
KCTD20-210ENST00000536244 WIZO95785 1651 aa21.54■■□□□ 1.04
KCTD20-210ENST00000536244 CDKL5O76039 1030 aa21.53■■□□□ 1.04
KCTD20-210ENST00000536244 KRT18P05783 430 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
KCTD20-210ENST00000536244 NACAP1Q9BZK3 213 aa21.53■■□□□ 1.04
KCTD20-210ENST00000536244 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
KCTD20-210ENST00000536244 PPP6R1Q9UPN7 881 aa21.53■■□□□ 1.04
KCTD20-210ENST00000536244 ME1P48163 572 aa21.53■■□□□ 1.04
KCTD20-210ENST00000536244 DEF6Q9H4E7 631 aa21.53■■□□□ 1.04
KCTD20-210ENST00000536244 ATP2B1P20020 1258 aa21.53■■□□□ 1.04
KCTD20-210ENST00000536244 CDCA7LQ96GN5 454 aa21.53■■□□□ 1.04
KCTD20-210ENST00000536244 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
KCTD20-210ENST00000536244 MCM4P33991 863 aa21.52■■□□□ 1.04
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KCTD20-210ENST00000536244 FYB1O15117 783 aa21.52■■□□□ 1.04
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KCTD20-210ENST00000536244 KRT32Q14532 448 aa21.52■■□□□ 1.03
KCTD20-210ENST00000536244 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa21.52■■□□□ 1.03
KCTD20-210ENST00000536244 PKNOX2Q96KN3 472 aa21.52■■□□□ 1.03
KCTD20-210ENST00000536244 HFM1A2PYH4 1435 aa21.52■■□□□ 1.03
KCTD20-210ENST00000536244 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.03
KCTD20-210ENST00000536244 NEFHP12036 1026 aa21.51■■□□□ 1.03
KCTD20-210ENST00000536244 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
KCTD20-210ENST00000536244 NLRP2Q9NX02 1062 aa21.51■■□□□ 1.03
KCTD20-210ENST00000536244 GBP3Q9H0R5 595 aa21.51■■□□□ 1.03
KCTD20-210ENST00000536244 UQCRHLA0A096LP55 91 aa21.51■■□□□ 1.03
KCTD20-210ENST00000536244 UQCRHP07919 91 aa21.51■■□□□ 1.03
KCTD20-210ENST00000536244 RBM10P98175 930 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
KCTD20-210ENST00000536244 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
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