RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535976.1

CLIP1-AS1-201, CLIP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CLIP1-AS1, Length 1,745 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NAIPQ13075 1403 aa8.18□□□□□ -1.1
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NCOA1Q15788 1441 aa8.18□□□□□ -1.1
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa8.17□□□□□ -1.1
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PLXNC1O60486 1568 aa8.17□□□□□ -1.1
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 AFAP1Q8N556 730 aa8.17□□□□□ -1.1
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa8.17□□□□□ -1.1
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa8.16□□□□□ -1.1
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KIF15Q9NS87 1388 aa8.16□□□□□ -1.1
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa8.16□□□□□ -1.1
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa8.15□□□□□ -1.1
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PRKD2Q9BZL6 878 aa8.15□□□□□ -1.1
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ATP7AQ04656 1500 aa8.15□□□□□ -1.1
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DUOX2Q9NRD8 1548 aa8.15□□□□□ -1.1
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa8.15□□□□□ -1.11
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RICTORQ6R327 1708 aa8.15□□□□□ -1.11
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SOWAHBA6NEL2 793 aa8.15□□□□□ -1.11
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.11
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 HECW2Q9P2P5 1572 aa8.14□□□□□ -1.11
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 POGZQ7Z3K3 1410 aa8.14□□□□□ -1.11
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 BCAMP50895 628 aa8.14□□□□□ -1.11
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SMYD5Q6GMV2 418 aa8.14□□□□□ -1.11
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CLSPNQ9HAW4 1339 aa8.14□□□□□ -1.11
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa8.13□□□□□ -1.11
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 BCL11AQ9H165 835 aa8.13□□□□□ -1.11
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 V9GY48 417 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa8.13□□□□□ -1.11
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KDM5CP41229 1560 aa8.13□□□□□ -1.11
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 COL9A1P20849 921 aa8.12□□□□□ -1.11
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ERBINQ96RT1 1412 aa8.12□□□□□ -1.11
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MLH3Q9UHC1 1453 aa8.12□□□□□ -1.11
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RAPGEF3O95398 923 aa8.12□□□□□ -1.11
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LAPTM4BQ86VI4 370 aa8.12□□□□□ -1.11
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RABGEF1Q9UJ41 708 aa8.12□□□□□ -1.11
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KDM6BO15054 1643 aa8.11□□□□□ -1.11
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CDHR5Q9HBB8 845 aa8.11□□□□□ -1.11
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KANK1Q14678 1352 aa8.11□□□□□ -1.11
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MAGI2Q86UL8 1455 aa8.1□□□□□ -1.11
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NUP155O75694 1391 aa8.09□□□□□ -1.11
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CERKQ8TCT0 537 aa8.09□□□□□ -1.11
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MPHOSPH9Q99550 1183 aa8.09□□□□□ -1.11
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 WBP1LQ9NX94 342 aa8.09□□□□□ -1.11
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PODXL2Q9NZ53 605 aa8.09□□□□□ -1.11
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa8.09□□□□□ -1.11
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa8.09□□□□□ -1.11
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 A2MP01023 1474 aa8.09□□□□□ -1.11
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KIF3BO15066 747 aa8.09□□□□□ -1.11
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PROX2Q3B8N5 592 aa8.08□□□□□ -1.12
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ABCA6Q8N139 1617 aa8.08□□□□□ -1.12
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa8.07□□□□□ -1.12
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa8.07□□□□□ -1.12
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NUTM2FA1L443 756 aa8.06□□□□□ -1.12
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ATP10AO60312 1499 aa8.06□□□□□ -1.12
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KDM5DQ9BY66 1539 aa8.06□□□□□ -1.12
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 BCORL1Q5H9F3 1711 aa8.05□□□□□ -1.12
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DEPDC5O75140 1603 aa8.05□□□□□ -1.12
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LOC100996750A0A140TA64 210 aa8.05□□□□□ -1.12
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa8.05□□□□□ -1.12
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NEUROD1Q13562 356 aa8.05□□□□□ -1.12
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GGT6Q6P531 493 aa8.05□□□□□ -1.12
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TREML4Q6UXN2 200 aa8.05□□□□□ -1.12
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa8.05□□□□□ -1.12
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PTGDRQ13258 359 aa8.04□□□□□ -1.12
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CDCA7LQ96GN5 454 aa8.04□□□□□ -1.12
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FAM135AQ9P2D6 1515 aa8.04□□□□□ -1.12
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 STK17AQ9UEE5 414 aa8.03□□□□□ -1.12
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PZPP20742 1482 aa8.03□□□□□ -1.12
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CEP152O94986 1710 aa8.03□□□□□ -1.12
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 REREQ9P2R6 1566 aa8.03□□□□□ -1.12
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TET3O43151 1660 aa8.03□□□□□ -1.12
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 YEATS2Q9ULM3 1422 aa8.03□□□□□ -1.12
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa8.03□□□□□ -1.12
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FCHSD2O94868 740 aa8.03□□□□□ -1.12
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TSKSQ9UJT2 592 aa8.03□□□□□ -1.12
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa8.02□□□□□ -1.13
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GPIHBP1Q8IV16 184 aa8.02□□□□□ -1.13
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KIAA1468Q9P260 1216 aa8.02□□□□□ -1.13
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TONSLQ96HA7 1378 aa8.02□□□□□ -1.13
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
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