RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532389.5

SERGEF-220, Transcript of secretion regulating guanine nucleotide exchange factor, humanhuman

TSL 5

Gene SERGEF, Length 833 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERGEF-220ENST00000532389 PLEKHG3A1L390 1219 aa30.1■■■□□ 2.41
SERGEF-220ENST00000532389 ACEP12821 1306 aa30.09■■■□□ 2.41
SERGEF-220ENST00000532389 PLCH1Q4KWH8 1693 aa30.09■■■□□ 2.41
SERGEF-220ENST00000532389 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP30.08■■■□□ 2.41
SERGEF-220ENST00000532389 NBPF8Q3BBV2 869 aa30.08■■■□□ 2.41
SERGEF-220ENST00000532389 GLI3P10071 1580 aa30.07■■■□□ 2.4
SERGEF-220ENST00000532389 BTG4Q9NY30 223 aa30.06■■■□□ 2.4
SERGEF-220ENST00000532389 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP30.05■■■□□ 2.4
SERGEF-220ENST00000532389 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa30.05■■■□□ 2.4
SERGEF-220ENST00000532389 CCDC125Q86Z20 511 aa30.05■■■□□ 2.4
SERGEF-220ENST00000532389 PRDM11Q9NQV5 511 aa30.05■■■□□ 2.4
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SERGEF-220ENST00000532389 QRICH2Q9H0J4 1663 aa30.03■■■□□ 2.4
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SERGEF-220ENST00000532389 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa30.02■■■□□ 2.4
SERGEF-220ENST00000532389 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa30.02■■■□□ 2.4
SERGEF-220ENST00000532389 EVC2Q86UK5 1308 aa30.01■■■□□ 2.4
SERGEF-220ENST00000532389 A0A0G2JS52 829 aa30■■■□□ 2.39
SERGEF-220ENST00000532389 MYT1Q01538 1121 aa30■■■□□ 2.39
SERGEF-220ENST00000532389 ABTB2Q8N961 1025 aa30■■■□□ 2.39
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SERGEF-220ENST00000532389 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP29.97■■■□□ 2.39
SERGEF-220ENST00000532389 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa29.96■■■□□ 2.39
SERGEF-220ENST00000532389 KIAA0232Q92628 1395 aa29.95■■■□□ 2.39
SERGEF-220ENST00000532389 TONSLQ96HA7 1378 aa29.95■■■□□ 2.39
SERGEF-220ENST00000532389 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP29.94■■■□□ 2.38
SERGEF-220ENST00000532389 NLRP13Q86W25 1043 aa29.94■■■□□ 2.38
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SERGEF-220ENST00000532389 NRAPQ86VF7 1730 aa29.93■■■□□ 2.38
SERGEF-220ENST00000532389 KRT27Q7Z3Y8 459 aa29.93■■■□□ 2.38
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SERGEF-220ENST00000532389 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP29.91■■■□□ 2.38
SERGEF-220ENST00000532389 CHRNA2Q15822 529 aa29.9■■■□□ 2.38
SERGEF-220ENST00000532389 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa29.9■■■□□ 2.38
SERGEF-220ENST00000532389 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa29.9■■■□□ 2.38
SERGEF-220ENST00000532389 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP29.88■■■□□ 2.37
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SERGEF-220ENST00000532389 CARD11Q9BXL7 1154 aa29.88■■■□□ 2.37
SERGEF-220ENST00000532389 EVA1CP58658 441 aa29.87■■■□□ 2.37
SERGEF-220ENST00000532389 STRN4Q9NRL3 753 aa29.87■■■□□ 2.37
SERGEF-220ENST00000532389 USP19O94966 1318 aa29.86■■■□□ 2.37
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SERGEF-220ENST00000532389 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP29.84■■■□□ 2.37
SERGEF-220ENST00000532389 CPDO75976 1380 aa29.83■■■□□ 2.37
SERGEF-220ENST00000532389 GCP02774 474 aa29.83■■■□□ 2.37
SERGEF-220ENST00000532389 NLRP6P59044 892 aa29.83■■■□□ 2.37
SERGEF-220ENST00000532389 ZRANB1Q9UGI0 708 aa29.83■■■□□ 2.37
SERGEF-220ENST00000532389 EP400Q96L91 3159 aa29.83■■■□□ 2.37
SERGEF-220ENST00000532389 NRKQ7Z2Y5 1582 aa29.81■■■□□ 2.36
SERGEF-220ENST00000532389 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa29.81■■■□□ 2.36
SERGEF-220ENST00000532389 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa29.78■■■□□ 2.36
SERGEF-220ENST00000532389 SSH2Q76I76 1423 aa29.76■■■□□ 2.35
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SERGEF-220ENST00000532389 USP35Q9P2H5 1018 aa29.75■■■□□ 2.35
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SERGEF-220ENST00000532389 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa29.72■■■□□ 2.35
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SERGEF-220ENST00000532389 DEFB132Q7Z7B7 95 aa29.71■■■□□ 2.35
SERGEF-220ENST00000532389 KCNH5Q8NCM2 988 aa29.71■■■□□ 2.35
SERGEF-220ENST00000532389 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP29.71■■■□□ 2.35
SERGEF-220ENST00000532389 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa29.71■■■□□ 2.35
SERGEF-220ENST00000532389 TCP11L2Q8N4U5 519 aa29.7■■■□□ 2.35
SERGEF-220ENST00000532389 SLIT3O75094 1523 aa29.69■■■□□ 2.34
SERGEF-220ENST00000532389 TMC1Q8TDI8 760 aa29.68■■■□□ 2.34
SERGEF-220ENST00000532389 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP29.68■■■□□ 2.34
SERGEF-220ENST00000532389 LMO7Q8WWI1 1683 aa29.68■■■□□ 2.34
SERGEF-220ENST00000532389 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP29.68■■■□□ 2.34
SERGEF-220ENST00000532389 AKAP12Q02952 1782 aa29.67■■■□□ 2.34
SERGEF-220ENST00000532389 AATKQ6ZMQ8 1374 aa29.67■■■□□ 2.34
SERGEF-220ENST00000532389 SLC24A1O60721 1099 aa29.67■■■□□ 2.34
SERGEF-220ENST00000532389 PDE3BQ13370 1112 aa29.67■■■□□ 2.34
SERGEF-220ENST00000532389 PIK3C2AO00443 1686 aa29.66■■■□□ 2.34
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SERGEF-220ENST00000532389 FAM196AQ6ZSG2 479 aa29.65■■■□□ 2.34
SERGEF-220ENST00000532389 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP29.65■■■□□ 2.34
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SERGEF-220ENST00000532389 TERF2IPQ9NYB0 399 aa29.61■■■□□ 2.33
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SERGEF-220ENST00000532389 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP29.6■■■□□ 2.33
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SERGEF-220ENST00000532389 ARHGEF25Q86VW2 580 aa29.58■■■□□ 2.33
SERGEF-220ENST00000532389 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa29.57■■■□□ 2.32
SERGEF-220ENST00000532389 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa29.57■■■□□ 2.32
SERGEF-220ENST00000532389 MON2Q7Z3U7 1717 aa29.57■■■□□ 2.32
SERGEF-220ENST00000532389 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP29.55■■■□□ 2.32
SERGEF-220ENST00000532389 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa29.55■■■□□ 2.32
SERGEF-220ENST00000532389 WDR17Q8IZU2 1322 aa29.54■■■□□ 2.32
SERGEF-220ENST00000532389 TRIM37O94972 964 aa29.54■■■□□ 2.32
SERGEF-220ENST00000532389 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP29.54■■■□□ 2.32
SERGEF-220ENST00000532389 USP31Q70CQ4 1352 aa29.53■■■□□ 2.32
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