RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531298.5

PACS1-211, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 4

Gene PACS1, Length 547 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-211ENST00000531298 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
PACS1-211ENST00000531298 METP08581 1390 aa9.93□□□□□ -0.82
PACS1-211ENST00000531298 RRP1P56182 461 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
PACS1-211ENST00000531298 MLECQ14165 292 aa9.93□□□□□ -0.82
PACS1-211ENST00000531298 WDR63Q8IWG1 891 aa9.93□□□□□ -0.82
PACS1-211ENST00000531298 RUNDC1Q96C34 613 aa9.93□□□□□ -0.82
PACS1-211ENST00000531298 CABP2Q9NPB3 220 aa9.93□□□□□ -0.82
PACS1-211ENST00000531298 CCDC61Q9Y6R9 512 aa9.93□□□□□ -0.82
PACS1-211ENST00000531298 ITSN1Q15811 1721 aa9.93□□□□□ -0.82
PACS1-211ENST00000531298 ADAMTSL3P82987 1691 aa9.93□□□□□ -0.82
PACS1-211ENST00000531298 LRRC7Q96NW7 1537 aa9.92□□□□□ -0.82
PACS1-211ENST00000531298 FYB1O15117 783 aa9.92□□□□□ -0.82
PACS1-211ENST00000531298 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
PACS1-211ENST00000531298 SLFN5Q08AF3 891 aa9.92□□□□□ -0.82
PACS1-211ENST00000531298 AAMPQ13685 434 aa9.92□□□□□ -0.82
PACS1-211ENST00000531298 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
PACS1-211ENST00000531298 DUSP27Q5VZP5 1158 aa9.92□□□□□ -0.82
PACS1-211ENST00000531298 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
PACS1-211ENST00000531298 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
PACS1-211ENST00000531298 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
PACS1-211ENST00000531298 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
PACS1-211ENST00000531298 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa9.91□□□□□ -0.82
PACS1-211ENST00000531298 PLEKHG3A1L390 1219 aa9.91□□□□□ -0.82
PACS1-211ENST00000531298 MTHFSP49914 203 aa9.91□□□□□ -0.82
PACS1-211ENST00000531298 STK26Q9P289 416 aa9.91□□□□□ -0.82
PACS1-211ENST00000531298 ANKARQ7Z5J8 1434 aa9.9□□□□□ -0.82
PACS1-211ENST00000531298 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
PACS1-211ENST00000531298 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.83
PACS1-211ENST00000531298 NRKQ7Z2Y5 1582 aa9.89□□□□□ -0.83
PACS1-211ENST00000531298 IL16Q14005 1332 aa9.89□□□□□ -0.83
PACS1-211ENST00000531298 TXNDC2Q86VQ3 553 aa9.89□□□□□ -0.83
PACS1-211ENST00000531298 USP54Q70EL1 1684 aa9.89□□□□□ -0.83
PACS1-211ENST00000531298 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa9.89□□□□□ -0.83
PACS1-211ENST00000531298 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
PACS1-211ENST00000531298 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
PACS1-211ENST00000531298 CABP1Q9NZU7 370 aa9.88□□□□□ -0.83
PACS1-211ENST00000531298 ROBO2Q9HCK4 1378 aa9.88□□□□□ -0.83
PACS1-211ENST00000531298 APAF1O14727 1248 aa9.87□□□□□ -0.83
PACS1-211ENST00000531298 FCHSD2O94868 740 aa9.87□□□□□ -0.83
PACS1-211ENST00000531298 LTKP29376 864 aa9.87□□□□□ -0.83
PACS1-211ENST00000531298 WWC1Q8IX03 1113 aa9.87□□□□□ -0.83
PACS1-211ENST00000531298 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
PACS1-211ENST00000531298 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
PACS1-211ENST00000531298 NALCNQ8IZF0 1738 aa9.87□□□□□ -0.83
PACS1-211ENST00000531298 KIF24Q5T7B8 1368 aa9.87□□□□□ -0.83
PACS1-211ENST00000531298 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
PACS1-211ENST00000531298 TTC21AQ8NDW8 1320 aa9.86□□□□□ -0.83
PACS1-211ENST00000531298 SSH2Q76I76 1423 aa9.86□□□□□ -0.83
PACS1-211ENST00000531298 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa9.86□□□□□ -0.83
PACS1-211ENST00000531298 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
PACS1-211ENST00000531298 PTPRUQ92729 1446 aa9.85□□□□□ -0.83
PACS1-211ENST00000531298 PDE3AQ14432 1141 aa9.85□□□□□ -0.83
PACS1-211ENST00000531298 WAPLQ7Z5K2 1190 aa9.85□□□□□ -0.83
PACS1-211ENST00000531298 ZNF428Q96B54 188 aa9.85□□□□□ -0.83
PACS1-211ENST00000531298 CDCA7LQ96GN5 454 aa9.85□□□□□ -0.83
PACS1-211ENST00000531298 USP31Q70CQ4 1352 aa9.85□□□□□ -0.83
PACS1-211ENST00000531298 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
PACS1-211ENST00000531298 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP9.84□□□□□ -0.83
PACS1-211ENST00000531298 TCP11L2Q8N4U5 519 aa9.84□□□□□ -0.83
PACS1-211ENST00000531298 PLEKHF1Q96S99 279 aa9.84□□□□□ -0.83
PACS1-211ENST00000531298 MYH16Q9H6N6 1097 aa9.84□□□□□ -0.83
PACS1-211ENST00000531298 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa9.83□□□□□ -0.84
PACS1-211ENST00000531298 USP6P35125 1406 aa9.83□□□□□ -0.84
PACS1-211ENST00000531298 OVOS2Q6IE36 1432 aa9.83□□□□□ -0.84
PACS1-211ENST00000531298 FMN2Q9NZ56 1722 aa9.83□□□□□ -0.84
PACS1-211ENST00000531298 CCDC136Q96JN2 1154 aa9.83□□□□□ -0.84
PACS1-211ENST00000531298 MS4A1P11836 297 aa9.82□□□□□ -0.84
PACS1-211ENST00000531298 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
PACS1-211ENST00000531298 BCANQ96GW7 911 aa9.82□□□□□ -0.84
PACS1-211ENST00000531298 GGNBP2Q9H3C7 697 aa9.82□□□□□ -0.84
PACS1-211ENST00000531298 POLKQ9UBT6 870 aa9.82□□□□□ -0.84
PACS1-211ENST00000531298 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa9.82□□□□□ -0.84
PACS1-211ENST00000531298 PRR36Q9H6K5 1346 aa9.82□□□□□ -0.84
PACS1-211ENST00000531298 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
PACS1-211ENST00000531298 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP9.81□□□□□ -0.84
PACS1-211ENST00000531298 ANKLE2Q86XL3 938 aa9.81□□□□□ -0.84
PACS1-211ENST00000531298 COG3Q96JB2 828 aa9.81□□□□□ -0.84
PACS1-211ENST00000531298 NWD1Q149M9 1564 aa9.8□□□□□ -0.84
PACS1-211ENST00000531298 NEFMP07197 916 aa9.8□□□□□ -0.84
PACS1-211ENST00000531298 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
PACS1-211ENST00000531298 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa9.8□□□□□ -0.84
PACS1-211ENST00000531298 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa9.8□□□□□ -0.84
PACS1-211ENST00000531298 TMPOP42166 694 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
PACS1-211ENST00000531298 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
PACS1-211ENST00000531298 LMOD3Q0VAK6 560 aa9.79□□□□□ -0.84
PACS1-211ENST00000531298 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
PACS1-211ENST00000531298 CCDC146Q8IYE0 955 aa9.79□□□□□ -0.84
PACS1-211ENST00000531298 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa9.79□□□□□ -0.84
PACS1-211ENST00000531298 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
PACS1-211ENST00000531298 IL13P35225 146 aa9.78□□□□□ -0.84
PACS1-211ENST00000531298 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
PACS1-211ENST00000531298 RGPD1P0DJD0 1748 aa9.78□□□□□ -0.84
PACS1-211ENST00000531298 ACEP12821 1306 aa9.78□□□□□ -0.84
PACS1-211ENST00000531298 FANCIQ9NVI1 1328 aa9.78□□□□□ -0.84
PACS1-211ENST00000531298 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa9.77□□□□□ -0.85
PACS1-211ENST00000531298 RSPH6AQ9H0K4 717 aa9.77□□□□□ -0.85
PACS1-211ENST00000531298 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
PACS1-211ENST00000531298 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
PACS1-211ENST00000531298 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
PACS1-211ENST00000531298 MST1RQ04912 1400 aa9.76□□□□□ -0.85
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