RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528068.5

ROBO3-209, Transcript of roundabout guidance receptor 3, humanhuman

TSL 4

Gene ROBO3, Length 572 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROBO3-209ENST00000528068 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
ROBO3-209ENST00000528068 VPS72Q15906 364 aa22.27■■□□□ 1.16
ROBO3-209ENST00000528068 CCDC61Q9Y6R9 512 aa22.26■■□□□ 1.15
ROBO3-209ENST00000528068 NEUROD1Q13562 356 aa22.25■■□□□ 1.15
ROBO3-209ENST00000528068 ACEP12821 1306 aa22.25■■□□□ 1.15
ROBO3-209ENST00000528068 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa22.24■■□□□ 1.15
ROBO3-209ENST00000528068 QRICH2Q9H0J4 1663 aa22.24■■□□□ 1.15
ROBO3-209ENST00000528068 NRAPQ86VF7 1730 aa22.24■■□□□ 1.15
ROBO3-209ENST00000528068 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
ROBO3-209ENST00000528068 PLEKHG3A1L390 1219 aa22.23■■□□□ 1.15
ROBO3-209ENST00000528068 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
ROBO3-209ENST00000528068 NBPF8Q3BBV2 869 aa22.21■■□□□ 1.15
ROBO3-209ENST00000528068 BTG4Q9NY30 223 aa22.21■■□□□ 1.15
ROBO3-209ENST00000528068 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
ROBO3-209ENST00000528068 SEPT12Q8IYM1 358 aa22.2■■□□□ 1.14
ROBO3-209ENST00000528068 CABP2Q9NPB3 220 aa22.2■■□□□ 1.14
ROBO3-209ENST00000528068 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa22.2■■□□□ 1.14
ROBO3-209ENST00000528068 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
ROBO3-209ENST00000528068 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
ROBO3-209ENST00000528068 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
ROBO3-209ENST00000528068 BRWD3Q6RI45 1802 aa22.17■■□□□ 1.14
ROBO3-209ENST00000528068 NUTM2GQ5VZR2 741 aa22.17■■□□□ 1.14
ROBO3-209ENST00000528068 PRDM11Q9NQV5 511 aa22.17■■□□□ 1.14
ROBO3-209ENST00000528068 KIAA0232Q92628 1395 aa22.16■■□□□ 1.14
ROBO3-209ENST00000528068 NRKQ7Z2Y5 1582 aa22.14■■□□□ 1.13
ROBO3-209ENST00000528068 CCDC125Q86Z20 511 aa22.14■■□□□ 1.13
ROBO3-209ENST00000528068 CHRNA2Q15822 529 aa22.12■■□□□ 1.13
ROBO3-209ENST00000528068 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
ROBO3-209ENST00000528068 ABTB2Q8N961 1025 aa22.12■■□□□ 1.13
ROBO3-209ENST00000528068 USP19O94966 1318 aa22.11■■□□□ 1.13
ROBO3-209ENST00000528068 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa22.11■■□□□ 1.13
ROBO3-209ENST00000528068 EVC2Q86UK5 1308 aa22.11■■□□□ 1.13
ROBO3-209ENST00000528068 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa22.11■■□□□ 1.13
ROBO3-209ENST00000528068 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
ROBO3-209ENST00000528068 CABP1Q9NZU7 370 aa22.11■■□□□ 1.13
ROBO3-209ENST00000528068 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
ROBO3-209ENST00000528068 A0A0G2JS52 829 aa22.1■■□□□ 1.13
ROBO3-209ENST00000528068 USP6P35125 1406 aa22.1■■□□□ 1.13
ROBO3-209ENST00000528068 MYT1Q01538 1121 aa22.1■■□□□ 1.13
ROBO3-209ENST00000528068 KRT27Q7Z3Y8 459 aa22.1■■□□□ 1.13
ROBO3-209ENST00000528068 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
ROBO3-209ENST00000528068 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa22.07■■□□□ 1.12
ROBO3-209ENST00000528068 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa22.07■■□□□ 1.12
ROBO3-209ENST00000528068 CPDO75976 1380 aa22.07■■□□□ 1.12
ROBO3-209ENST00000528068 NLRP13Q86W25 1043 aa22.06■■□□□ 1.12
ROBO3-209ENST00000528068 TONSLQ96HA7 1378 aa22.06■■□□□ 1.12
ROBO3-209ENST00000528068 SSH2Q76I76 1423 aa22.06■■□□□ 1.12
ROBO3-209ENST00000528068 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa22.06■■□□□ 1.12
ROBO3-209ENST00000528068 STRN4Q9NRL3 753 aa22.05■■□□□ 1.12
ROBO3-209ENST00000528068 LMO7Q8WWI1 1683 aa22.04■■□□□ 1.12
ROBO3-209ENST00000528068 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
ROBO3-209ENST00000528068 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa22.04■■□□□ 1.12
ROBO3-209ENST00000528068 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa22.03■■□□□ 1.12
ROBO3-209ENST00000528068 GCP02774 474 aa22.03■■□□□ 1.12
ROBO3-209ENST00000528068 PIK3C2AO00443 1686 aa22.02■■□□□ 1.12
ROBO3-209ENST00000528068 CARD11Q9BXL7 1154 aa22.02■■□□□ 1.12
ROBO3-209ENST00000528068 SLIT3O75094 1523 aa22.01■■□□□ 1.11
ROBO3-209ENST00000528068 DEFB132Q7Z7B7 95 aa22.01■■□□□ 1.11
ROBO3-209ENST00000528068 NLRP6P59044 892 aa22■■□□□ 1.11
ROBO3-209ENST00000528068 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
ROBO3-209ENST00000528068 ZRANB1Q9UGI0 708 aa21.99■■□□□ 1.11
ROBO3-209ENST00000528068 AKAP12Q02952 1782 aa21.99■■□□□ 1.11
ROBO3-209ENST00000528068 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
ROBO3-209ENST00000528068 EVA1CP58658 441 aa21.98■■□□□ 1.11
ROBO3-209ENST00000528068 FAM182BQ5T319 152 aa21.98■■□□□ 1.11
ROBO3-209ENST00000528068 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
ROBO3-209ENST00000528068 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
ROBO3-209ENST00000528068 USP35Q9P2H5 1018 aa21.97■■□□□ 1.11
ROBO3-209ENST00000528068 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa21.97■■□□□ 1.11
ROBO3-209ENST00000528068 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
ROBO3-209ENST00000528068 BARGINQ6ZT62 677 aa21.95■■□□□ 1.1
ROBO3-209ENST00000528068 AATKQ6ZMQ8 1374 aa21.94■■□□□ 1.1
ROBO3-209ENST00000528068 ZBTB7CA1YPR0 619 aa21.93■■□□□ 1.1
ROBO3-209ENST00000528068 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
ROBO3-209ENST00000528068 TCP11L2Q8N4U5 519 aa21.93■■□□□ 1.1
ROBO3-209ENST00000528068 TTC21AQ8NDW8 1320 aa21.93■■□□□ 1.1
ROBO3-209ENST00000528068 RGPD1P0DJD0 1748 aa21.92■■□□□ 1.1
ROBO3-209ENST00000528068 MON2Q7Z3U7 1717 aa21.92■■□□□ 1.1
ROBO3-209ENST00000528068 CD163L1Q9NR16 1453 aa21.91■■□□□ 1.1
ROBO3-209ENST00000528068 BAG6P46379 1132 aa21.91■■□□□ 1.1
ROBO3-209ENST00000528068 CRB1P82279 1406 aa21.9■■□□□ 1.1
ROBO3-209ENST00000528068 COL18A1P39060 1754 aa21.9■■□□□ 1.1
ROBO3-209ENST00000528068 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.1
ROBO3-209ENST00000528068 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
ROBO3-209ENST00000528068 NFAT5O94916 1531 aa21.88■■□□□ 1.09
ROBO3-209ENST00000528068 DISP2A7MBM2 1401 aa21.88■■□□□ 1.09
ROBO3-209ENST00000528068 FAM196AQ6ZSG2 479 aa21.87■■□□□ 1.09
ROBO3-209ENST00000528068 ARHGEF25Q86VW2 580 aa21.87■■□□□ 1.09
ROBO3-209ENST00000528068 KCNH5Q8NCM2 988 aa21.87■■□□□ 1.09
ROBO3-209ENST00000528068 AXIN2Q9Y2T1 843 aa21.87■■□□□ 1.09
ROBO3-209ENST00000528068 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
ROBO3-209ENST00000528068 SOX12O15370 315 aa21.86■■□□□ 1.09
ROBO3-209ENST00000528068 PDE3BQ13370 1112 aa21.86■■□□□ 1.09
ROBO3-209ENST00000528068 TMC1Q8TDI8 760 aa21.86■■□□□ 1.09
ROBO3-209ENST00000528068 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
ROBO3-209ENST00000528068 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP21.85■■□□□ 1.09
ROBO3-209ENST00000528068 TESK2Q96S53 571 aa21.85■■□□□ 1.09
ROBO3-209ENST00000528068 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa21.85■■□□□ 1.09
ROBO3-209ENST00000528068 TRIM37O94972 964 aa21.84■■□□□ 1.09
ROBO3-209ENST00000528068 USP54Q70EL1 1684 aa21.84■■□□□ 1.09
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