RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523213.1

ZBED8-202, Transcript of zinc finger BED-type containing 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZBED8, Length 2,484 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED8-202ENST00000523213 EID1Q9Y6B2 187 aa19.24■□□□□ 0.67
ZBED8-202ENST00000523213 CCDC61Q9Y6R9 512 aa19.24■□□□□ 0.67
ZBED8-202ENST00000523213 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP19.23■□□□□ 0.67
ZBED8-202ENST00000523213 FAM135BQ49AJ0 1406 aa19.23■□□□□ 0.67
ZBED8-202ENST00000523213 ATP7BP35670 1465 aa19.23■□□□□ 0.67
ZBED8-202ENST00000523213 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP19.23■□□□□ 0.67
ZBED8-202ENST00000523213 CPS1P31327 1500 aa19.23■□□□□ 0.67
ZBED8-202ENST00000523213 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP19.23■□□□□ 0.67
ZBED8-202ENST00000523213 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa19.22■□□□□ 0.67
ZBED8-202ENST00000523213 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP19.22■□□□□ 0.67
ZBED8-202ENST00000523213 MED14O60244 1454 aa19.21■□□□□ 0.67
ZBED8-202ENST00000523213 KNDC1Q76NI1 1749 aa19.21■□□□□ 0.67
ZBED8-202ENST00000523213 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP19.21■□□□□ 0.67
ZBED8-202ENST00000523213 BCL2L13Q9BXK5 485 aa19.2■□□□□ 0.66
ZBED8-202ENST00000523213 SIRT1Q96EB6 747 aa19.2■□□□□ 0.66
ZBED8-202ENST00000523213 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP19.19■□□□□ 0.66
ZBED8-202ENST00000523213 HMOX1P09601 288 aa19.18■□□□□ 0.66
ZBED8-202ENST00000523213 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP19.18■□□□□ 0.66
ZBED8-202ENST00000523213 TMPOP42166 694 aaKnown RBP19.18■□□□□ 0.66
ZBED8-202ENST00000523213 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP19.18■□□□□ 0.66
ZBED8-202ENST00000523213 NGEFQ8N5V2 710 aa19.18■□□□□ 0.66
ZBED8-202ENST00000523213 PNPLA6Q8IY17 1366 aa19.17■□□□□ 0.66
ZBED8-202ENST00000523213 TRIM35Q9UPQ4 493 aa19.17■□□□□ 0.66
ZBED8-202ENST00000523213 TNNQ9UQP3 1299 aa19.17■□□□□ 0.66
ZBED8-202ENST00000523213 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP19.17■□□□□ 0.66
ZBED8-202ENST00000523213 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa19.16■□□□□ 0.66
ZBED8-202ENST00000523213 WDR63Q8IWG1 891 aa19.16■□□□□ 0.66
ZBED8-202ENST00000523213 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP19.16■□□□□ 0.66
ZBED8-202ENST00000523213 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa19.16■□□□□ 0.66
ZBED8-202ENST00000523213 ACEP12821 1306 aa19.15■□□□□ 0.66
ZBED8-202ENST00000523213 PANK1Q8TE04 598 aa19.15■□□□□ 0.66
ZBED8-202ENST00000523213 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP19.15■□□□□ 0.66
ZBED8-202ENST00000523213 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa19.15■□□□□ 0.66
ZBED8-202ENST00000523213 SOX12O15370 315 aa19.15■□□□□ 0.66
ZBED8-202ENST00000523213 ARHGAP23Q9P227 1491 aa19.15■□□□□ 0.66
ZBED8-202ENST00000523213 CCDC27Q2M243 656 aa19.14■□□□□ 0.66
ZBED8-202ENST00000523213 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP19.14■□□□□ 0.66
ZBED8-202ENST00000523213 COG3Q96JB2 828 aa19.14■□□□□ 0.66
ZBED8-202ENST00000523213 ADGRB2O60241 1585 aa19.14■□□□□ 0.65
ZBED8-202ENST00000523213 SLIT1O75093 1534 aa19.14■□□□□ 0.65
ZBED8-202ENST00000523213 MSH5O43196 834 aa19.14■□□□□ 0.65
ZBED8-202ENST00000523213 PRKAR2BP31323 418 aa19.14■□□□□ 0.65
ZBED8-202ENST00000523213 RIPK4P57078 832 aa19.14■□□□□ 0.65
ZBED8-202ENST00000523213 PHACTR3Q96KR7 559 aa19.14■□□□□ 0.65
ZBED8-202ENST00000523213 RARSP54136 660 aaKnown RBP19.13■□□□□ 0.65
ZBED8-202ENST00000523213 TBX22Q9Y458 520 aa19.12■□□□□ 0.65
ZBED8-202ENST00000523213 MON2Q7Z3U7 1717 aa19.11■□□□□ 0.65
ZBED8-202ENST00000523213 KCNA6P17658 529 aa19.11■□□□□ 0.65
ZBED8-202ENST00000523213 CANXP27824 592 aaKnown RBP19.11■□□□□ 0.65
ZBED8-202ENST00000523213 RSPH6AQ9H0K4 717 aa19.11■□□□□ 0.65
ZBED8-202ENST00000523213 COG6Q9Y2V7 657 aa19.11■□□□□ 0.65
ZBED8-202ENST00000523213 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP19.1■□□□□ 0.65
ZBED8-202ENST00000523213 LRRC7Q96NW7 1537 aa19.1■□□□□ 0.65
ZBED8-202ENST00000523213 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP19.1■□□□□ 0.65
ZBED8-202ENST00000523213 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa19.1■□□□□ 0.65
ZBED8-202ENST00000523213 FANCIQ9NVI1 1328 aa19.1■□□□□ 0.65
ZBED8-202ENST00000523213 ITSN1Q15811 1721 aa19.1■□□□□ 0.65
ZBED8-202ENST00000523213 AKAP12Q02952 1782 aa19.1■□□□□ 0.65
ZBED8-202ENST00000523213 IL13P35225 146 aa19.1■□□□□ 0.65
ZBED8-202ENST00000523213 RLBP1P12271 317 aa19.09■□□□□ 0.65
ZBED8-202ENST00000523213 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP19.09■□□□□ 0.65
ZBED8-202ENST00000523213 CLUAP1Q96AJ1 413 aa19.09■□□□□ 0.65
ZBED8-202ENST00000523213 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP19.09■□□□□ 0.65
ZBED8-202ENST00000523213 MYH16Q9H6N6 1097 aa19.08■□□□□ 0.64
ZBED8-202ENST00000523213 KDM2BQ8NHM5 1336 aa19.08■□□□□ 0.64
ZBED8-202ENST00000523213 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP19.07■□□□□ 0.64
ZBED8-202ENST00000523213 FCHSD2O94868 740 aa19.07■□□□□ 0.64
ZBED8-202ENST00000523213 PLEKHG3A1L390 1219 aa19.06■□□□□ 0.64
ZBED8-202ENST00000523213 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP19.06■□□□□ 0.64
ZBED8-202ENST00000523213 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP19.05■□□□□ 0.64
ZBED8-202ENST00000523213 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa19.04■□□□□ 0.64
ZBED8-202ENST00000523213 USP6P35125 1406 aa19.04■□□□□ 0.64
ZBED8-202ENST00000523213 AEBP1Q8IUX7 1158 aa19.04■□□□□ 0.64
ZBED8-202ENST00000523213 NUTM2GQ5VZR2 741 aa19.03■□□□□ 0.64
ZBED8-202ENST00000523213 AATKQ6ZMQ8 1374 aa19.03■□□□□ 0.64
ZBED8-202ENST00000523213 IGHDP01880 384 aa19.03■□□□□ 0.64
ZBED8-202ENST00000523213 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP19.02■□□□□ 0.64
ZBED8-202ENST00000523213 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa19.02■□□□□ 0.64
ZBED8-202ENST00000523213 DIP2AQ14689 1571 aa19.02■□□□□ 0.63
ZBED8-202ENST00000523213 NRKQ7Z2Y5 1582 aa19.02■□□□□ 0.63
ZBED8-202ENST00000523213 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP19.01■□□□□ 0.63
ZBED8-202ENST00000523213 FAM83GA6ND36 823 aa19.01■□□□□ 0.63
ZBED8-202ENST00000523213 PDE3AQ14432 1141 aa19.01■□□□□ 0.63
ZBED8-202ENST00000523213 PTCH1Q13635 1447 aa19.01■□□□□ 0.63
ZBED8-202ENST00000523213 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP19■□□□□ 0.63
ZBED8-202ENST00000523213 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP19■□□□□ 0.63
ZBED8-202ENST00000523213 DCTN1Q14203 1278 aa19■□□□□ 0.63
ZBED8-202ENST00000523213 SSH1Q8WYL5 1049 aa19■□□□□ 0.63
ZBED8-202ENST00000523213 NFE2L2Q16236 605 aa18.99■□□□□ 0.63
ZBED8-202ENST00000523213 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP18.99■□□□□ 0.63
ZBED8-202ENST00000523213 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP18.99■□□□□ 0.63
ZBED8-202ENST00000523213 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP18.99■□□□□ 0.63
ZBED8-202ENST00000523213 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa18.99■□□□□ 0.63
ZBED8-202ENST00000523213 OVOS2Q6IE36 1432 aa18.99■□□□□ 0.63
ZBED8-202ENST00000523213 PDE4AP27815 886 aa18.98■□□□□ 0.63
ZBED8-202ENST00000523213 SMC4Q9NTJ3 1288 aa18.98■□□□□ 0.63
ZBED8-202ENST00000523213 ANKLE2Q86XL3 938 aa18.98■□□□□ 0.63
ZBED8-202ENST00000523213 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP18.98■□□□□ 0.63
ZBED8-202ENST00000523213 NEFMP07197 916 aa18.97■□□□□ 0.63
ZBED8-202ENST00000523213 SULT6B1Q6IMI4 303 aa18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.2 ms