RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520462.5

TSNARE1-206, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene TSNARE1, Length 589 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-206ENST00000520462 GLI3P10071 1580 aa21.87■■□□□ 1.09
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TSNARE1-206ENST00000520462 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
TSNARE1-206ENST00000520462 PRR36Q9H6K5 1346 aa21.85■■□□□ 1.09
TSNARE1-206ENST00000520462 CCDC125Q86Z20 511 aa21.85■■□□□ 1.09
TSNARE1-206ENST00000520462 ZRANB1Q9UGI0 708 aa21.84■■□□□ 1.09
TSNARE1-206ENST00000520462 ATP7BP35670 1465 aa21.83■■□□□ 1.09
TSNARE1-206ENST00000520462 EVC2Q86UK5 1308 aa21.83■■□□□ 1.09
TSNARE1-206ENST00000520462 VPS72Q15906 364 aa21.83■■□□□ 1.09
TSNARE1-206ENST00000520462 PLCH1Q4KWH8 1693 aa21.82■■□□□ 1.08
TSNARE1-206ENST00000520462 SEPT12Q8IYM1 358 aa21.82■■□□□ 1.08
TSNARE1-206ENST00000520462 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
TSNARE1-206ENST00000520462 ABCA3Q99758 1704 aa21.82■■□□□ 1.08
TSNARE1-206ENST00000520462 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa21.8■■□□□ 1.08
TSNARE1-206ENST00000520462 A0A0G2JS52 829 aa21.8■■□□□ 1.08
TSNARE1-206ENST00000520462 FAM83GA6ND36 823 aa21.8■■□□□ 1.08
TSNARE1-206ENST00000520462 MYT1Q01538 1121 aa21.8■■□□□ 1.08
TSNARE1-206ENST00000520462 CABP2Q9NPB3 220 aa21.8■■□□□ 1.08
TSNARE1-206ENST00000520462 CCDC61Q9Y6R9 512 aa21.8■■□□□ 1.08
TSNARE1-206ENST00000520462 NWD2Q9ULI1 1742 aa21.79■■□□□ 1.08
TSNARE1-206ENST00000520462 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
TSNARE1-206ENST00000520462 BRWD3Q6RI45 1802 aa21.78■■□□□ 1.08
TSNARE1-206ENST00000520462 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
TSNARE1-206ENST00000520462 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
TSNARE1-206ENST00000520462 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa21.76■■□□□ 1.07
TSNARE1-206ENST00000520462 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
TSNARE1-206ENST00000520462 BTG4Q9NY30 223 aa21.76■■□□□ 1.07
TSNARE1-206ENST00000520462 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa21.74■■□□□ 1.07
TSNARE1-206ENST00000520462 KRT27Q7Z3Y8 459 aa21.74■■□□□ 1.07
TSNARE1-206ENST00000520462 ALS2Q96Q42 1657 aa21.73■■□□□ 1.07
TSNARE1-206ENST00000520462 PLEKHG3A1L390 1219 aa21.73■■□□□ 1.07
TSNARE1-206ENST00000520462 DEFB132Q7Z7B7 95 aa21.73■■□□□ 1.07
TSNARE1-206ENST00000520462 ACEP12821 1306 aa21.73■■□□□ 1.07
TSNARE1-206ENST00000520462 USP47Q96K76 1375 aa21.73■■□□□ 1.07
TSNARE1-206ENST00000520462 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa21.72■■□□□ 1.07
TSNARE1-206ENST00000520462 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
TSNARE1-206ENST00000520462 SLC24A1O60721 1099 aa21.72■■□□□ 1.07
TSNARE1-206ENST00000520462 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
TSNARE1-206ENST00000520462 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
TSNARE1-206ENST00000520462 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
TSNARE1-206ENST00000520462 NRAPQ86VF7 1730 aa21.69■■□□□ 1.06
TSNARE1-206ENST00000520462 PRDM11Q9NQV5 511 aa21.69■■□□□ 1.06
TSNARE1-206ENST00000520462 CABP1Q9NZU7 370 aa21.69■■□□□ 1.06
TSNARE1-206ENST00000520462 NUTM2GQ5VZR2 741 aa21.65■■□□□ 1.06
TSNARE1-206ENST00000520462 TESK2Q96S53 571 aa21.64■■□□□ 1.05
TSNARE1-206ENST00000520462 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa21.63■■□□□ 1.05
TSNARE1-206ENST00000520462 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa21.63■■□□□ 1.05
TSNARE1-206ENST00000520462 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa21.63■■□□□ 1.05
TSNARE1-206ENST00000520462 TMF1P82094 1093 aa21.63■■□□□ 1.05
TSNARE1-206ENST00000520462 CHRNA2Q15822 529 aa21.63■■□□□ 1.05
TSNARE1-206ENST00000520462 TMC1Q8TDI8 760 aa21.63■■□□□ 1.05
TSNARE1-206ENST00000520462 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
TSNARE1-206ENST00000520462 KIAA0232Q92628 1395 aa21.62■■□□□ 1.05
TSNARE1-206ENST00000520462 AKAP12Q02952 1782 aa21.62■■□□□ 1.05
TSNARE1-206ENST00000520462 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
TSNARE1-206ENST00000520462 FAM182BQ5T319 152 aa21.62■■□□□ 1.05
TSNARE1-206ENST00000520462 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
TSNARE1-206ENST00000520462 BAG6P46379 1132 aa21.61■■□□□ 1.05
TSNARE1-206ENST00000520462 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
TSNARE1-206ENST00000520462 STRN4Q9NRL3 753 aa21.61■■□□□ 1.05
TSNARE1-206ENST00000520462 USP6P35125 1406 aa21.6■■□□□ 1.05
TSNARE1-206ENST00000520462 ABTB2Q8N961 1025 aa21.59■■□□□ 1.05
TSNARE1-206ENST00000520462 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
TSNARE1-206ENST00000520462 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP21.58■■□□□ 1.052e-6■■■■■ 26.9
TSNARE1-206ENST00000520462 CDCA8Q53HL2 280 aa21.58■■□□□ 1.05
TSNARE1-206ENST00000520462 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
TSNARE1-206ENST00000520462 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
TSNARE1-206ENST00000520462 EVA1CP58658 441 aa21.56■■□□□ 1.04
TSNARE1-206ENST00000520462 USP35Q9P2H5 1018 aa21.56■■□□□ 1.04
TSNARE1-206ENST00000520462 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa21.55■■□□□ 1.04
TSNARE1-206ENST00000520462 MON2Q7Z3U7 1717 aa21.55■■□□□ 1.04
TSNARE1-206ENST00000520462 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
TSNARE1-206ENST00000520462 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
TSNARE1-206ENST00000520462 NLRP13Q86W25 1043 aa21.55■■□□□ 1.04
TSNARE1-206ENST00000520462 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa21.55■■□□□ 1.04
TSNARE1-206ENST00000520462 TERF2IPQ9NYB0 399 aa21.55■■□□□ 1.04
TSNARE1-206ENST00000520462 NINLQ9Y2I6 1382 aa21.55■■□□□ 1.04
TSNARE1-206ENST00000520462 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa21.54■■□□□ 1.04
TSNARE1-206ENST00000520462 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
TSNARE1-206ENST00000520462 RGPD1P0DJD0 1748 aa21.52■■□□□ 1.04
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TSNARE1-206ENST00000520462 TTC21AQ8NDW8 1320 aa21.52■■□□□ 1.03
TSNARE1-206ENST00000520462 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
TSNARE1-206ENST00000520462 NLRP6P59044 892 aa21.51■■□□□ 1.03
TSNARE1-206ENST00000520462 NRKQ7Z2Y5 1582 aa21.5■■□□□ 1.03
TSNARE1-206ENST00000520462 SSH2Q76I76 1423 aa21.5■■□□□ 1.03
TSNARE1-206ENST00000520462 ZBTB7CA1YPR0 619 aa21.49■■□□□ 1.03
TSNARE1-206ENST00000520462 PIK3C2AO00443 1686 aa21.49■■□□□ 1.03
TSNARE1-206ENST00000520462 CD163L1Q9NR16 1453 aa21.48■■□□□ 1.03
TSNARE1-206ENST00000520462 TRIM37O94972 964 aa21.48■■□□□ 1.03
TSNARE1-206ENST00000520462 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP21.48■■□□□ 1.032e-6■■■□□ 16.2
TSNARE1-206ENST00000520462 A0A1W2PP64 1363 aa21.48■■□□□ 1.03
TSNARE1-206ENST00000520462 PDE3BQ13370 1112 aa21.47■■□□□ 1.03
TSNARE1-206ENST00000520462 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
TSNARE1-206ENST00000520462 FAM196AQ6ZSG2 479 aa21.47■■□□□ 1.03
TSNARE1-206ENST00000520462 USP19O94966 1318 aa21.47■■□□□ 1.03
TSNARE1-206ENST00000520462 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa21.47■■□□□ 1.03
TSNARE1-206ENST00000520462 GCP02774 474 aa21.46■■□□□ 1.03
TSNARE1-206ENST00000520462 POLR3GLQ9BT43 218 aa21.46■■□□□ 1.03
TSNARE1-206ENST00000520462 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
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