RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 ITSN1Q15811 1721 aa24.53■■□□□ 1.52
HERC3-211ENST00000513325 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa24.53■■□□□ 1.52
HERC3-211ENST00000513325 ZRANB1Q9UGI0 708 aa24.51■■□□□ 1.51
HERC3-211ENST00000513325 NRAPQ86VF7 1730 aa24.51■■□□□ 1.51
HERC3-211ENST00000513325 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
HERC3-211ENST00000513325 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
HERC3-211ENST00000513325 KRT27Q7Z3Y8 459 aa24.5■■□□□ 1.51
HERC3-211ENST00000513325 CCDC61Q9Y6R9 512 aa24.5■■□□□ 1.51
HERC3-211ENST00000513325 A0A0G2JS52 829 aa24.49■■□□□ 1.51
HERC3-211ENST00000513325 MYT1Q01538 1121 aa24.49■■□□□ 1.51
HERC3-211ENST00000513325 PRDM11Q9NQV5 511 aa24.49■■□□□ 1.51
HERC3-211ENST00000513325 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa24.49■■□□□ 1.51
HERC3-211ENST00000513325 ACEP12821 1306 aa24.48■■□□□ 1.51
HERC3-211ENST00000513325 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
HERC3-211ENST00000513325 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
HERC3-211ENST00000513325 NBPF8Q3BBV2 869 aa24.47■■□□□ 1.51
HERC3-211ENST00000513325 NUTM2GQ5VZR2 741 aa24.47■■□□□ 1.51
HERC3-211ENST00000513325 DEFB132Q7Z7B7 95 aa24.46■■□□□ 1.51
HERC3-211ENST00000513325 PLEKHG3A1L390 1219 aa24.45■■□□□ 1.5
HERC3-211ENST00000513325 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
HERC3-211ENST00000513325 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa24.45■■□□□ 1.5
HERC3-211ENST00000513325 KIAA0232Q92628 1395 aa24.44■■□□□ 1.5
HERC3-211ENST00000513325 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa24.43■■□□□ 1.5
HERC3-211ENST00000513325 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa24.43■■□□□ 1.5
HERC3-211ENST00000513325 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
HERC3-211ENST00000513325 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
HERC3-211ENST00000513325 L3MBTL2Q969R5 705 aa24.43■■□□□ 1.5
HERC3-211ENST00000513325 CHRNA2Q15822 529 aa24.42■■□□□ 1.5
HERC3-211ENST00000513325 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
HERC3-211ENST00000513325 SIN3AQ96ST3 1273 aa24.4■■□□□ 1.5
HERC3-211ENST00000513325 CABP2Q9NPB3 220 aa24.4■■□□□ 1.5
HERC3-211ENST00000513325 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.5
HERC3-211ENST00000513325 ABTB2Q8N961 1025 aa24.39■■□□□ 1.49
HERC3-211ENST00000513325 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa24.38■■□□□ 1.49
HERC3-211ENST00000513325 STRN4Q9NRL3 753 aa24.38■■□□□ 1.49
HERC3-211ENST00000513325 FAM182BQ5T319 152 aa24.36■■□□□ 1.49
HERC3-211ENST00000513325 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa24.35■■□□□ 1.49
HERC3-211ENST00000513325 QRICH2Q9H0J4 1663 aa24.34■■□□□ 1.49
HERC3-211ENST00000513325 NEUROD1Q13562 356 aa24.34■■□□□ 1.49
HERC3-211ENST00000513325 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa24.34■■□□□ 1.49
HERC3-211ENST00000513325 BAG6P46379 1132 aa24.32■■□□□ 1.48
HERC3-211ENST00000513325 EVA1CP58658 441 aa24.32■■□□□ 1.48
HERC3-211ENST00000513325 NLRP13Q86W25 1043 aa24.32■■□□□ 1.48
HERC3-211ENST00000513325 CABP1Q9NZU7 370 aa24.32■■□□□ 1.48
HERC3-211ENST00000513325 NRKQ7Z2Y5 1582 aa24.32■■□□□ 1.48
HERC3-211ENST00000513325 USP19O94966 1318 aa24.32■■□□□ 1.48
HERC3-211ENST00000513325 USP35Q9P2H5 1018 aa24.31■■□□□ 1.48
HERC3-211ENST00000513325 CPDO75976 1380 aa24.29■■□□□ 1.48
HERC3-211ENST00000513325 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa24.29■■□□□ 1.48
HERC3-211ENST00000513325 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa24.29■■□□□ 1.48
HERC3-211ENST00000513325 SSH2Q76I76 1423 aa24.28■■□□□ 1.48
HERC3-211ENST00000513325 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa24.28■■□□□ 1.48
HERC3-211ENST00000513325 GCP02774 474 aa24.28■■□□□ 1.48
HERC3-211ENST00000513325 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
HERC3-211ENST00000513325 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
HERC3-211ENST00000513325 EVC2Q86UK5 1308 aa24.27■■□□□ 1.48
HERC3-211ENST00000513325 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
HERC3-211ENST00000513325 USP6P35125 1406 aa24.27■■□□□ 1.48
HERC3-211ENST00000513325 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
HERC3-211ENST00000513325 NLRP6P59044 892 aa24.24■■□□□ 1.47
HERC3-211ENST00000513325 BARGINQ6ZT62 677 aa24.24■■□□□ 1.47
HERC3-211ENST00000513325 LMO7Q8WWI1 1683 aa24.24■■□□□ 1.47
HERC3-211ENST00000513325 RGPD1P0DJD0 1748 aa24.24■■□□□ 1.47
HERC3-211ENST00000513325 ZBTB7CA1YPR0 619 aa24.22■■□□□ 1.47
HERC3-211ENST00000513325 FAM196AQ6ZSG2 479 aa24.22■■□□□ 1.47
HERC3-211ENST00000513325 TCP11L2Q8N4U5 519 aa24.22■■□□□ 1.47
HERC3-211ENST00000513325 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
HERC3-211ENST00000513325 TRIM37O94972 964 aa24.2■■□□□ 1.46
HERC3-211ENST00000513325 PDE3BQ13370 1112 aa24.2■■□□□ 1.46
HERC3-211ENST00000513325 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
HERC3-211ENST00000513325 DISP2A7MBM2 1401 aa24.18■■□□□ 1.46
HERC3-211ENST00000513325 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
HERC3-211ENST00000513325 SLIT3O75094 1523 aa24.17■■□□□ 1.46
HERC3-211ENST00000513325 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
HERC3-211ENST00000513325 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
HERC3-211ENST00000513325 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
HERC3-211ENST00000513325 AATKQ6ZMQ8 1374 aa24.16■■□□□ 1.46
HERC3-211ENST00000513325 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa24.15■■□□□ 1.46
HERC3-211ENST00000513325 PIK3C2AO00443 1686 aa24.15■■□□□ 1.46
HERC3-211ENST00000513325 CRB1P82279 1406 aa24.13■■□□□ 1.45
HERC3-211ENST00000513325 APBA3O96018 575 aa24.13■■□□□ 1.45
HERC3-211ENST00000513325 CAMKK2Q96RR4 588 aa24.13■■□□□ 1.45
HERC3-211ENST00000513325 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
HERC3-211ENST00000513325 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
HERC3-211ENST00000513325 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa24.1■■□□□ 1.45
HERC3-211ENST00000513325 CARD11Q9BXL7 1154 aa24.1■■□□□ 1.45
HERC3-211ENST00000513325 AXIN2Q9Y2T1 843 aa24.1■■□□□ 1.45
HERC3-211ENST00000513325 AKAP12Q02952 1782 aa24.1■■□□□ 1.45
HERC3-211ENST00000513325 TTC21AQ8NDW8 1320 aa24.1■■□□□ 1.45
HERC3-211ENST00000513325 SOX12O15370 315 aa24.09■■□□□ 1.45
HERC3-211ENST00000513325 LRP5O75197 1615 aa24.09■■□□□ 1.45
HERC3-211ENST00000513325 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
HERC3-211ENST00000513325 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
HERC3-211ENST00000513325 ARHGEF25Q86VW2 580 aa24.08■■□□□ 1.45
HERC3-211ENST00000513325 KCNH5Q8NCM2 988 aa24.08■■□□□ 1.45
HERC3-211ENST00000513325 COL18A1P39060 1754 aa24.08■■□□□ 1.44
HERC3-211ENST00000513325 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa24.07■■□□□ 1.44
HERC3-211ENST00000513325 PARD3Q8TEW0 1356 aa24.06■■□□□ 1.44
HERC3-211ENST00000513325 WDR17Q8IZU2 1322 aa24.06■■□□□ 1.44
HERC3-211ENST00000513325 TONSLQ96HA7 1378 aa24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.3 ms