RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512290.2

MSC-AS1-202, MSC antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene MSC-AS1, Length 832 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSC-AS1-202ENST00000512290 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
MSC-AS1-202ENST00000512290 ABCC1P33527 1531 aa11.94□□□□□ -0.5
MSC-AS1-202ENST00000512290 ITSN2Q9NZM3 1697 aa11.94□□□□□ -0.5
MSC-AS1-202ENST00000512290 WBP1LQ9NX94 342 aa11.93□□□□□ -0.5
MSC-AS1-202ENST00000512290 FAM135AQ9P2D6 1515 aa11.92□□□□□ -0.5
MSC-AS1-202ENST00000512290 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
MSC-AS1-202ENST00000512290 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
MSC-AS1-202ENST00000512290 PRSS12P56730 875 aa11.92□□□□□ -0.5
MSC-AS1-202ENST00000512290 NYAP1Q6ZVC0 841 aa11.92□□□□□ -0.5
MSC-AS1-202ENST00000512290 LRCH3Q96II8 777 aa11.92□□□□□ -0.5
MSC-AS1-202ENST00000512290 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa11.92□□□□□ -0.5
MSC-AS1-202ENST00000512290 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa11.91□□□□□ -0.5
MSC-AS1-202ENST00000512290 EEA1Q15075 1411 aa11.91□□□□□ -0.5
MSC-AS1-202ENST00000512290 LRRC7Q96NW7 1537 aa11.91□□□□□ -0.5
MSC-AS1-202ENST00000512290 OSBPP22059 807 aa11.9□□□□□ -0.5
MSC-AS1-202ENST00000512290 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa11.9□□□□□ -0.5
MSC-AS1-202ENST00000512290 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
MSC-AS1-202ENST00000512290 PREX2Q70Z35 1606 aa11.89□□□□□ -0.51
MSC-AS1-202ENST00000512290 VWDEQ8N2E2 1590 aa11.89□□□□□ -0.51
MSC-AS1-202ENST00000512290 A0A0G2JS52 829 aa11.89□□□□□ -0.51
MSC-AS1-202ENST00000512290 TXNDC2Q86VQ3 553 aa11.89□□□□□ -0.51
MSC-AS1-202ENST00000512290 HPS5Q9UPZ3 1129 aa11.89□□□□□ -0.51
MSC-AS1-202ENST00000512290 ATP7AQ04656 1500 aa11.88□□□□□ -0.51
MSC-AS1-202ENST00000512290 SMAPO00193 183 aa11.88□□□□□ -0.51
MSC-AS1-202ENST00000512290 EID1Q9Y6B2 187 aa11.88□□□□□ -0.51
MSC-AS1-202ENST00000512290 NEURL4Q96JN8 1562 aa11.88□□□□□ -0.51
MSC-AS1-202ENST00000512290 MIA2Q96PC5 1412 aa11.87□□□□□ -0.51
MSC-AS1-202ENST00000512290 SYCP2Q9BX26 1530 aa11.87□□□□□ -0.51
MSC-AS1-202ENST00000512290 RGS20O76081 388 aa11.87□□□□□ -0.51
MSC-AS1-202ENST00000512290 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
MSC-AS1-202ENST00000512290 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
MSC-AS1-202ENST00000512290 BCANQ96GW7 911 aa11.87□□□□□ -0.51
MSC-AS1-202ENST00000512290 UGGT1Q9NYU2 1555 aa11.87□□□□□ -0.51
MSC-AS1-202ENST00000512290 ALKQ9UM73 1620 aa11.86□□□□□ -0.51
MSC-AS1-202ENST00000512290 CDHR5Q9HBB8 845 aa11.86□□□□□ -0.51
MSC-AS1-202ENST00000512290 FAM198AQ9UFP1 575 aa11.86□□□□□ -0.51
MSC-AS1-202ENST00000512290 PNMA3Q9UL41 463 aa11.86□□□□□ -0.51
MSC-AS1-202ENST00000512290 CCNB3Q8WWL7 1395 aa11.86□□□□□ -0.51
MSC-AS1-202ENST00000512290 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa11.85□□□□□ -0.51
MSC-AS1-202ENST00000512290 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
MSC-AS1-202ENST00000512290 RXRBP28702 533 aa11.85□□□□□ -0.51
MSC-AS1-202ENST00000512290 PPP4CP60510 307 aa11.85□□□□□ -0.51
MSC-AS1-202ENST00000512290 TATDN2Q93075 761 aa11.85□□□□□ -0.51
MSC-AS1-202ENST00000512290 FAM135BQ49AJ0 1406 aa11.85□□□□□ -0.51
MSC-AS1-202ENST00000512290 MED14O60244 1454 aa11.84□□□□□ -0.51
MSC-AS1-202ENST00000512290 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
MSC-AS1-202ENST00000512290 NBPF26B4DH59 902 aa11.84□□□□□ -0.51
MSC-AS1-202ENST00000512290 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
MSC-AS1-202ENST00000512290 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa11.84□□□□□ -0.51
MSC-AS1-202ENST00000512290 IQGAP1P46940 1657 aa11.84□□□□□ -0.51
MSC-AS1-202ENST00000512290 NLRP1Q9C000 1473 aa11.83□□□□□ -0.52
MSC-AS1-202ENST00000512290 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa11.83□□□□□ -0.52
MSC-AS1-202ENST00000512290 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa11.83□□□□□ -0.52
MSC-AS1-202ENST00000512290 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
MSC-AS1-202ENST00000512290 KCNC4Q03721 635 aa11.83□□□□□ -0.52
MSC-AS1-202ENST00000512290 SAMD7Q7Z3H4 446 aa11.83□□□□□ -0.52
MSC-AS1-202ENST00000512290 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
MSC-AS1-202ENST00000512290 CCDC18Q5T9S5 1454 aa11.83□□□□□ -0.52
MSC-AS1-202ENST00000512290 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
MSC-AS1-202ENST00000512290 HDGFP51858 240 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
MSC-AS1-202ENST00000512290 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
MSC-AS1-202ENST00000512290 PZPP20742 1482 aa11.82□□□□□ -0.52
MSC-AS1-202ENST00000512290 NUDT18Q6ZVK8 323 aa11.81□□□□□ -0.52
MSC-AS1-202ENST00000512290 SLAIN2Q9P270 581 aa11.81□□□□□ -0.52
MSC-AS1-202ENST00000512290 DEPDC5O75140 1603 aa11.81□□□□□ -0.52
MSC-AS1-202ENST00000512290 STRCP1A6NGW2 1772 aa11.8□□□□□ -0.52
MSC-AS1-202ENST00000512290 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
MSC-AS1-202ENST00000512290 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
MSC-AS1-202ENST00000512290 C3orf80F5H4A9 247 aa11.8□□□□□ -0.52
MSC-AS1-202ENST00000512290 C14orf37Q86TY3 774 aa11.8□□□□□ -0.52
MSC-AS1-202ENST00000512290 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
MSC-AS1-202ENST00000512290 ADGBQ8N7X0 1667 aa11.8□□□□□ -0.52
MSC-AS1-202ENST00000512290 JCADQ9P266 1359 aa11.79□□□□□ -0.52
MSC-AS1-202ENST00000512290 PLXNC1O60486 1568 aa11.79□□□□□ -0.52
MSC-AS1-202ENST00000512290 TSPY4P0CV99 314 aa11.79□□□□□ -0.52
MSC-AS1-202ENST00000512290 TSPY10P0CW01 314 aa11.79□□□□□ -0.52
MSC-AS1-202ENST00000512290 LTKP29376 864 aa11.79□□□□□ -0.52
MSC-AS1-202ENST00000512290 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
MSC-AS1-202ENST00000512290 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
MSC-AS1-202ENST00000512290 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
MSC-AS1-202ENST00000512290 TMEM94Q12767 1356 aa11.79□□□□□ -0.52
MSC-AS1-202ENST00000512290 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa11.78□□□□□ -0.52
MSC-AS1-202ENST00000512290 SYNMO15061 1565 aa11.78□□□□□ -0.52
MSC-AS1-202ENST00000512290 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa11.77□□□□□ -0.52
MSC-AS1-202ENST00000512290 KCNA6P17658 529 aa11.77□□□□□ -0.53
MSC-AS1-202ENST00000512290 KCNV2Q8TDN2 545 aa11.77□□□□□ -0.53
MSC-AS1-202ENST00000512290 SLC26A8Q96RN1 970 aa11.77□□□□□ -0.53
MSC-AS1-202ENST00000512290 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.53
MSC-AS1-202ENST00000512290 MTUS2Q5JR59 1369 aa11.77□□□□□ -0.53
MSC-AS1-202ENST00000512290 KDM5DQ9BY66 1539 aa11.76□□□□□ -0.53
MSC-AS1-202ENST00000512290 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
MSC-AS1-202ENST00000512290 RNF40O75150 1001 aa11.76□□□□□ -0.53
MSC-AS1-202ENST00000512290 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
MSC-AS1-202ENST00000512290 PADI6Q6TGC4 694 aa11.76□□□□□ -0.53
MSC-AS1-202ENST00000512290 RSPH4AQ5TD94 716 aa11.75□□□□□ -0.53
MSC-AS1-202ENST00000512290 MSH6P52701 1360 aa11.75□□□□□ -0.53
MSC-AS1-202ENST00000512290 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
MSC-AS1-202ENST00000512290 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa11.74□□□□□ -0.53
MSC-AS1-202ENST00000512290 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa11.74□□□□□ -0.53
MSC-AS1-202ENST00000512290 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms