RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509593.1

ABCE1-208, Transcript of ATP binding cassette subfamily E member 1, human

TSL 5

Gene ABCE1, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCE1-208	ENST00000509593	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	7.47	□□□□□ -1.21
ABCE1-208	ENST00000509593	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	7.47	□□□□□ -1.21
ABCE1-208	ENST00000509593	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	7.47	□□□□□ -1.21
ABCE1-208	ENST00000509593	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	7.46	□□□□□ -1.22
ABCE1-208	ENST00000509593	LILRB3	O75022	631 aa		7.46	□□□□□ -1.22
ABCE1-208	ENST00000509593	TSC1	Q92574	1164 aa		7.46	□□□□□ -1.22
ABCE1-208	ENST00000509593	POLR3E	Q9NVU0	708 aa		7.46	□□□□□ -1.22
ABCE1-208	ENST00000509593	MAP10	Q9P2G4	905 aa		7.46	□□□□□ -1.22
ABCE1-208	ENST00000509593	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	7.45	□□□□□ -1.22
ABCE1-208	ENST00000509593	ZNF511	Q8NB15	262 aa		7.45	□□□□□ -1.22
ABCE1-208	ENST00000509593	GPBP1L1	Q9HC44	474 aa	Predicted RBP	7.45	□□□□□ -1.22
ABCE1-208	ENST00000509593	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	7.44	□□□□□ -1.22
ABCE1-208	ENST00000509593	F12	P00748	615 aa	Predicted RBP	7.44	□□□□□ -1.22
ABCE1-208	ENST00000509593	TUSC1	Q2TAM9	212 aa		7.44	□□□□□ -1.22
ABCE1-208	ENST00000509593	ATP13A2	Q9NQ11	1180 aa		7.44	□□□□□ -1.22
ABCE1-208	ENST00000509593	CLK2	P49760	499 aa	Known RBP	7.43	□□□□□ -1.22
ABCE1-208	ENST00000509593	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		7.43	□□□□□ -1.22
ABCE1-208	ENST00000509593	WASF2	Q9Y6W5	498 aa		7.43	□□□□□ -1.22
ABCE1-208	ENST00000509593	FOXJ1	Q92949	421 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ABCE1-208	ENST00000509593	KDM4C	Q9H3R0	1056 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ABCE1-208	ENST00000509593	TLL2	Q9Y6L7	1015 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ABCE1-208	ENST00000509593	VARS	P26640	1264 aa	Known RBP	7.41	□□□□□ -1.22
ABCE1-208	ENST00000509593	FAM117A	Q9C073	453 aa		7.41	□□□□□ -1.22
ABCE1-208	ENST00000509593	SNRPB	P14678	240 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.22
ABCE1-208	ENST00000509593	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
ABCE1-208	ENST00000509593	PROCA1	Q8NCQ7	364 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
ABCE1-208	ENST00000509593	CAPN5	O15484	640 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
ABCE1-208	ENST00000509593	CTDSPL2	Q05D32	466 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ABCE1-208	ENST00000509593	SKIV2L	Q15477	1246 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
ABCE1-208	ENST00000509593	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
ABCE1-208	ENST00000509593	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ABCE1-208	ENST00000509593	ARID5B	Q14865	1188 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ABCE1-208	ENST00000509593	AGER	Q15109	404 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ABCE1-208	ENST00000509593	C4orf48	Q5BLP8	95 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ABCE1-208	ENST00000509593	MPND	Q8N594	471 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ABCE1-208	ENST00000509593	FAM174A	Q8TBP5	190 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ABCE1-208	ENST00000509593	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
ABCE1-208	ENST00000509593	BMP1	P13497	986 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ABCE1-208	ENST00000509593	NNT	Q13423	1086 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ABCE1-208	ENST00000509593	TREML4	Q6UXN2	200 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ABCE1-208	ENST00000509593	TRIM47	Q96LD4	638 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ABCE1-208	ENST00000509593	SENP2	Q9HC62	589 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ABCE1-208	ENST00000509593	SH3D19	Q5HYK7	790 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ABCE1-208	ENST00000509593	TRIM46	Q7Z4K8	759 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ABCE1-208	ENST00000509593	DDRGK1	Q96HY6	314 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ABCE1-208	ENST00000509593	LCE2A	Q5TA79	106 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
ABCE1-208	ENST00000509593	BPHL	Q86WA6	291 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
ABCE1-208	ENST00000509593	ARMC2	Q8NEN0	867 aa		7.34	□□□□□ -1.23
ABCE1-208	ENST00000509593	LRRN4	Q8WUT4	740 aa		7.34	□□□□□ -1.23
ABCE1-208	ENST00000509593	CDK15	Q96Q40	435 aa		7.34	□□□□□ -1.23
ABCE1-208	ENST00000509593	ADH1C	P00326	375 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ABCE1-208	ENST00000509593	GNL3	Q9BVP2	549 aa	Known RBP eCLIP	7.33	□□□□□ -1.24
ABCE1-208	ENST00000509593	GRM5	P41594	1212 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ABCE1-208	ENST00000509593	WDR4	P57081	412 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
ABCE1-208	ENST00000509593	TPRN	Q4KMQ1	711 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ABCE1-208	ENST00000509593	KIFC2	Q96AC6	838 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ABCE1-208	ENST00000509593	KLF16	Q9BXK1	252 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
ABCE1-208	ENST00000509593	MAGEB6P1	A0A0J9YX57	407 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ABCE1-208	ENST00000509593	WFS1	O76024	890 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ABCE1-208	ENST00000509593	NR3C2	P08235	984 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ABCE1-208	ENST00000509593	TIMP2	P16035	220 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ABCE1-208	ENST00000509593	NBPF14	Q5TI25	921 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ABCE1-208	ENST00000509593	PPP2R2D	Q66LE6	453 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ABCE1-208	ENST00000509593	SH3BP5L	Q7L8J4	393 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ABCE1-208	ENST00000509593	SH3RF1	Q7Z6J0	888 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ABCE1-208	ENST00000509593	AP1G2	O75843	785 aa		7.3	□□□□□ -1.24
ABCE1-208	ENST00000509593	NFX1	Q12986	1120 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
ABCE1-208	ENST00000509593	ZFP42	Q96MM3	310 aa		7.3	□□□□□ -1.24
ABCE1-208	ENST00000509593	C1QTNF2	Q9BXJ5	285 aa		7.3	□□□□□ -1.24
ABCE1-208	ENST00000509593	NR5A1	Q13285	461 aa		7.29	□□□□□ -1.24
ABCE1-208	ENST00000509593	NR6A1	Q15406	480 aa		7.29	□□□□□ -1.24
ABCE1-208	ENST00000509593	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		7.29	□□□□□ -1.24
ABCE1-208	ENST00000509593	ZFAND3	Q9H8U3	227 aa		7.29	□□□□□ -1.24
ABCE1-208	ENST00000509593	TERT	O14746	1132 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
ABCE1-208	ENST00000509593	ZIC2	O95409	532 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
ABCE1-208	ENST00000509593	MRPL14	Q6P1L8	145 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
ABCE1-208	ENST00000509593	ITPKC	Q96DU7	683 aa		7.28	□□□□□ -1.24
ABCE1-208	ENST00000509593	NEUROD2	Q15784	382 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ABCE1-208	ENST00000509593	LCE2C	Q5TA81	110 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ABCE1-208	ENST00000509593	VASH1	Q7L8A9	365 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
ABCE1-208	ENST00000509593	TRMT44	Q8IYL2	757 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
ABCE1-208	ENST00000509593	IL27	Q8NEV9	243 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ABCE1-208	ENST00000509593	GPKOW	Q92917	476 aa	Predicted RBP eCLIP	7.27	□□□□□ -1.25
ABCE1-208	ENST00000509593	PURB	Q96QR8	312 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
ABCE1-208	ENST00000509593	FKBPL	Q9UIM3	349 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ABCE1-208	ENST00000509593	FSHR	P23945	695 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ABCE1-208	ENST00000509593	ERFE	Q4G0M1	354 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ABCE1-208	ENST00000509593	PDXDC2P	Q6P474	469 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ABCE1-208	ENST00000509593	EPS8L1	Q8TE68	723 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ABCE1-208	ENST00000509593	ARHGAP9	Q9BRR9	750 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ABCE1-208	ENST00000509593	RFC5	P40937	340 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ABCE1-208	ENST00000509593	SCARF1	Q14162	830 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ABCE1-208	ENST00000509593	HMX1	Q9NP08	348 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
ABCE1-208	ENST00000509593	MAP4K5	Q9Y4K4	846 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ABCE1-208	ENST00000509593	SOBP	A7XYQ1	873 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ABCE1-208	ENST00000509593	USP17L8	P0C7I0	530 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ABCE1-208	ENST00000509593	VEGFB	P49765	207 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ABCE1-208	ENST00000509593	C6orf118	Q5T5N4	469 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ABCE1-208	ENST00000509593	ZBTB33	Q86T24	672 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ABCE1-208	ENST00000509593	PCMTD1	Q96MG8	357 aa	Predicted RBP	7.23	□□□□□ -1.25

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