RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503051.1

USP46-AS1-201, USP46 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene USP46-AS1, Length 1,048 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46-AS1-201ENST00000503051 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP27.4■■□□□ 1.98
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USP46-AS1-201ENST00000503051 SLIT2O94813 1529 aa27.38■■□□□ 1.97
USP46-AS1-201ENST00000503051 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
USP46-AS1-201ENST00000503051 CCDC61Q9Y6R9 512 aa27.37■■□□□ 1.97
USP46-AS1-201ENST00000503051 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
USP46-AS1-201ENST00000503051 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
USP46-AS1-201ENST00000503051 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa27.34■■□□□ 1.97
USP46-AS1-201ENST00000503051 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
USP46-AS1-201ENST00000503051 UNC5CLQ8IV45 518 aa27.33■■□□□ 1.97
USP46-AS1-201ENST00000503051 CABP2Q9NPB3 220 aa27.32■■□□□ 1.96
USP46-AS1-201ENST00000503051 ACEP12821 1306 aa27.32■■□□□ 1.96
USP46-AS1-201ENST00000503051 NRAPQ86VF7 1730 aa27.32■■□□□ 1.96
USP46-AS1-201ENST00000503051 EVC2Q86UK5 1308 aa27.3■■□□□ 1.96
USP46-AS1-201ENST00000503051 GLI3P10071 1580 aa27.3■■□□□ 1.96
USP46-AS1-201ENST00000503051 PLEKHG3A1L390 1219 aa27.28■■□□□ 1.96
USP46-AS1-201ENST00000503051 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
USP46-AS1-201ENST00000503051 CARD11Q9BXL7 1154 aa27.28■■□□□ 1.96
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USP46-AS1-201ENST00000503051 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa27.27■■□□□ 1.96
USP46-AS1-201ENST00000503051 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.95
USP46-AS1-201ENST00000503051 BRWD3Q6RI45 1802 aa27.25■■□□□ 1.95
USP46-AS1-201ENST00000503051 ATAD2Q6PL18 1390 aa27.25■■□□□ 1.95
USP46-AS1-201ENST00000503051 AKAP12Q02952 1782 aa27.25■■□□□ 1.95
USP46-AS1-201ENST00000503051 NRKQ7Z2Y5 1582 aa27.22■■□□□ 1.95
USP46-AS1-201ENST00000503051 FAM83GA6ND36 823 aa27.22■■□□□ 1.95
USP46-AS1-201ENST00000503051 NUTM2GQ5VZR2 741 aa27.22■■□□□ 1.95
USP46-AS1-201ENST00000503051 PRDM11Q9NQV5 511 aa27.21■■□□□ 1.95
USP46-AS1-201ENST00000503051 VPS72Q15906 364 aa27.2■■□□□ 1.94
USP46-AS1-201ENST00000503051 ABTB2Q8N961 1025 aa27.2■■□□□ 1.94
USP46-AS1-201ENST00000503051 BTG4Q9NY30 223 aa27.19■■□□□ 1.94
USP46-AS1-201ENST00000503051 USP6P35125 1406 aa27.18■■□□□ 1.94
USP46-AS1-201ENST00000503051 CABP1Q9NZU7 370 aa27.18■■□□□ 1.94
USP46-AS1-201ENST00000503051 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
USP46-AS1-201ENST00000503051 KIAA0232Q92628 1395 aa27.16■■□□□ 1.94
USP46-AS1-201ENST00000503051 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa27.16■■□□□ 1.94
USP46-AS1-201ENST00000503051 PIK3C2AO00443 1686 aa27.14■■□□□ 1.94
USP46-AS1-201ENST00000503051 MON2Q7Z3U7 1717 aa27.14■■□□□ 1.94
USP46-AS1-201ENST00000503051 A0A0G2JS52 829 aa27.14■■□□□ 1.94
USP46-AS1-201ENST00000503051 MYT1Q01538 1121 aa27.14■■□□□ 1.94
USP46-AS1-201ENST00000503051 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
USP46-AS1-201ENST00000503051 NLRP13Q86W25 1043 aa27.13■■□□□ 1.93
USP46-AS1-201ENST00000503051 USP19O94966 1318 aa27.11■■□□□ 1.93
USP46-AS1-201ENST00000503051 CHRNA2Q15822 529 aa27.1■■□□□ 1.93
USP46-AS1-201ENST00000503051 SEPT12Q8IYM1 358 aa27.09■■□□□ 1.93
USP46-AS1-201ENST00000503051 USP47Q96K76 1375 aa27.09■■□□□ 1.93
USP46-AS1-201ENST00000503051 LMO7Q8WWI1 1683 aa27.07■■□□□ 1.92
USP46-AS1-201ENST00000503051 SLIT3O75094 1523 aa27.06■■□□□ 1.92
USP46-AS1-201ENST00000503051 NLRP6P59044 892 aa27.06■■□□□ 1.92
USP46-AS1-201ENST00000503051 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP27.06■■□□□ 1.92
USP46-AS1-201ENST00000503051 STRN4Q9NRL3 753 aa27.06■■□□□ 1.92
USP46-AS1-201ENST00000503051 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
USP46-AS1-201ENST00000503051 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa27.04■■□□□ 1.92
USP46-AS1-201ENST00000503051 CPDO75976 1380 aa27.04■■□□□ 1.92
USP46-AS1-201ENST00000503051 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
USP46-AS1-201ENST00000503051 SSH2Q76I76 1423 aa27.04■■□□□ 1.92
USP46-AS1-201ENST00000503051 ZBTB7CA1YPR0 619 aa27.03■■□□□ 1.92
USP46-AS1-201ENST00000503051 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa27.03■■□□□ 1.92
USP46-AS1-201ENST00000503051 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa27.03■■□□□ 1.92
USP46-AS1-201ENST00000503051 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa27.03■■□□□ 1.92
USP46-AS1-201ENST00000503051 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
USP46-AS1-201ENST00000503051 GCP02774 474 aa27.02■■□□□ 1.92
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USP46-AS1-201ENST00000503051 KRT27Q7Z3Y8 459 aa27.01■■□□□ 1.91
USP46-AS1-201ENST00000503051 TMC1Q8TDI8 760 aa27.01■■□□□ 1.91
USP46-AS1-201ENST00000503051 TESK2Q96S53 571 aa27.01■■□□□ 1.91
USP46-AS1-201ENST00000503051 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa27.01■■□□□ 1.91
USP46-AS1-201ENST00000503051 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa27■■□□□ 1.91
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USP46-AS1-201ENST00000503051 EP400Q96L91 3159 aa26.99■■□□□ 1.91
USP46-AS1-201ENST00000503051 RGPD5Q99666 1765 aa26.98■■□□□ 1.91
USP46-AS1-201ENST00000503051 CCDC125Q86Z20 511 aa26.97■■□□□ 1.91
USP46-AS1-201ENST00000503051 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa26.96■■□□□ 1.91
USP46-AS1-201ENST00000503051 USP54Q70EL1 1684 aa26.96■■□□□ 1.91
USP46-AS1-201ENST00000503051 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
USP46-AS1-201ENST00000503051 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
USP46-AS1-201ENST00000503051 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.91
USP46-AS1-201ENST00000503051 USP35Q9P2H5 1018 aa26.95■■□□□ 1.9
USP46-AS1-201ENST00000503051 COL18A1P39060 1754 aa26.94■■□□□ 1.9
USP46-AS1-201ENST00000503051 CD163L1Q9NR16 1453 aa26.94■■□□□ 1.9
USP46-AS1-201ENST00000503051 RGPD1P0DJD0 1748 aa26.94■■□□□ 1.9
USP46-AS1-201ENST00000503051 SLC24A1O60721 1099 aa26.94■■□□□ 1.9
USP46-AS1-201ENST00000503051 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
USP46-AS1-201ENST00000503051 LTN1O94822 1766 aa26.94■■□□□ 1.9
USP46-AS1-201ENST00000503051 SOX12O15370 315 aa26.93■■□□□ 1.9
USP46-AS1-201ENST00000503051 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP26.92■■□□□ 1.9
USP46-AS1-201ENST00000503051 KCNH5Q8NCM2 988 aa26.92■■□□□ 1.9
USP46-AS1-201ENST00000503051 NINLQ9Y2I6 1382 aa26.92■■□□□ 1.9
USP46-AS1-201ENST00000503051 WNK3Q9BYP7 1800 aa26.91■■□□□ 1.9
USP46-AS1-201ENST00000503051 TERF2IPQ9NYB0 399 aa26.91■■□□□ 1.9
USP46-AS1-201ENST00000503051 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
USP46-AS1-201ENST00000503051 A0A1W2PP64 1363 aa26.9■■□□□ 1.9
USP46-AS1-201ENST00000503051 AATKQ6ZMQ8 1374 aa26.9■■□□□ 1.9
USP46-AS1-201ENST00000503051 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
USP46-AS1-201ENST00000503051 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
USP46-AS1-201ENST00000503051 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa26.9■■□□□ 1.9
USP46-AS1-201ENST00000503051 NFAT5O94916 1531 aa26.9■■□□□ 1.9
USP46-AS1-201ENST00000503051 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
USP46-AS1-201ENST00000503051 TMF1P82094 1093 aa26.87■■□□□ 1.89
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