RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502974.1

CXCL3-202, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 3, humanhuman

TSL 2

Gene CXCL3, Length 630 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3-202ENST00000502974 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa35.34■■■■□ 3.25
CXCL3-202ENST00000502974 PLEKHG3A1L390 1219 aa35.34■■■■□ 3.25
CXCL3-202ENST00000502974 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP35.34■■■■□ 3.25
CXCL3-202ENST00000502974 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP35.34■■■■□ 3.25
CXCL3-202ENST00000502974 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa35.33■■■■□ 3.25
CXCL3-202ENST00000502974 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP35.33■■■■□ 3.25
CXCL3-202ENST00000502974 BCL9LQ86UU0 1499 aa35.28■■■■□ 3.24
CXCL3-202ENST00000502974 ATRNO75882 1429 aa35.27■■■■□ 3.24
CXCL3-202ENST00000502974 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP35.26■■■■□ 3.24
CXCL3-202ENST00000502974 SLIT2O94813 1529 aa35.25■■■■□ 3.23
CXCL3-202ENST00000502974 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa35.24■■■■□ 3.23
CXCL3-202ENST00000502974 CABP1Q9NZU7 370 aa35.24■■■■□ 3.23
CXCL3-202ENST00000502974 PLCH1Q4KWH8 1693 aa35.23■■■■□ 3.23
CXCL3-202ENST00000502974 USP47Q96K76 1375 aa35.23■■■■□ 3.23
CXCL3-202ENST00000502974 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa35.23■■■■□ 3.23
CXCL3-202ENST00000502974 RGS12O14924 1447 aa35.23■■■■□ 3.23
CXCL3-202ENST00000502974 UNC5CLQ8IV45 518 aa35.21■■■■□ 3.23
CXCL3-202ENST00000502974 NWD2Q9ULI1 1742 aa35.2■■■■□ 3.23
CXCL3-202ENST00000502974 ATAD2Q6PL18 1390 aa35.2■■■■□ 3.23
CXCL3-202ENST00000502974 NUTM2GQ5VZR2 741 aa35.16■■■■□ 3.22
CXCL3-202ENST00000502974 ABTB2Q8N961 1025 aa35.16■■■■□ 3.22
CXCL3-202ENST00000502974 TESK2Q96S53 571 aa35.16■■■■□ 3.22
CXCL3-202ENST00000502974 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP35.16■■■■□ 3.22
CXCL3-202ENST00000502974 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP35.15■■■■□ 3.22
CXCL3-202ENST00000502974 FAM83GA6ND36 823 aa35.15■■■■□ 3.22
CXCL3-202ENST00000502974 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP35.14■■■■□ 3.22
CXCL3-202ENST00000502974 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP35.14■■■■□ 3.22
CXCL3-202ENST00000502974 USP6P35125 1406 aa35.14■■■■□ 3.22
CXCL3-202ENST00000502974 AKAP12Q02952 1782 aa35.1■■■■□ 3.21
CXCL3-202ENST00000502974 PRDM11Q9NQV5 511 aa35.09■■■■□ 3.21
CXCL3-202ENST00000502974 SLC24A1O60721 1099 aa35.08■■■■□ 3.21
CXCL3-202ENST00000502974 VPS72Q15906 364 aa35.07■■■■□ 3.2
CXCL3-202ENST00000502974 BTG4Q9NY30 223 aa35.07■■■■□ 3.2
CXCL3-202ENST00000502974 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP35.07■■■■□ 3.2
CXCL3-202ENST00000502974 NRAPQ86VF7 1730 aa35.06■■■■□ 3.2
CXCL3-202ENST00000502974 GLI3P10071 1580 aa35.06■■■■□ 3.2
CXCL3-202ENST00000502974 NLRP13Q86W25 1043 aa35.06■■■■□ 3.2
CXCL3-202ENST00000502974 TMC1Q8TDI8 760 aa35.06■■■■□ 3.2
CXCL3-202ENST00000502974 KIAA0232Q92628 1395 aa35.05■■■■□ 3.2
CXCL3-202ENST00000502974 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP35.05■■■■□ 3.2
CXCL3-202ENST00000502974 NRKQ7Z2Y5 1582 aa35.04■■■■□ 3.2
CXCL3-202ENST00000502974 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP35.04■■■■□ 3.2
CXCL3-202ENST00000502974 USP19O94966 1318 aa35.03■■■■□ 3.2
CXCL3-202ENST00000502974 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP35.02■■■■□ 3.2
CXCL3-202ENST00000502974 TMF1P82094 1093 aa35.02■■■■□ 3.2
CXCL3-202ENST00000502974 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP35.01■■■■□ 3.2
CXCL3-202ENST00000502974 SSH2Q76I76 1423 aa35.01■■■■□ 3.2
CXCL3-202ENST00000502974 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP35■■■■□ 3.19
CXCL3-202ENST00000502974 MON2Q7Z3U7 1717 aa35■■■■□ 3.19
CXCL3-202ENST00000502974 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP35■■■■□ 3.19
CXCL3-202ENST00000502974 NLRP6P59044 892 aa34.99■■■■□ 3.19
CXCL3-202ENST00000502974 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa34.99■■■■□ 3.19
CXCL3-202ENST00000502974 PIK3C2AO00443 1686 aa34.98■■■■□ 3.19
CXCL3-202ENST00000502974 CHRNA2Q15822 529 aa34.98■■■■□ 3.19
CXCL3-202ENST00000502974 CD163L1Q9NR16 1453 aa34.97■■■■□ 3.19
CXCL3-202ENST00000502974 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa34.96■■■■□ 3.19
CXCL3-202ENST00000502974 GCP02774 474 aa34.94■■■■□ 3.18
CXCL3-202ENST00000502974 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP34.94■■■■□ 3.18
CXCL3-202ENST00000502974 TTC21AQ8NDW8 1320 aa34.94■■■■□ 3.18
CXCL3-202ENST00000502974 CPDO75976 1380 aa34.93■■■■□ 3.18
CXCL3-202ENST00000502974 NINLQ9Y2I6 1382 aa34.92■■■■□ 3.18
CXCL3-202ENST00000502974 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP34.92■■■■□ 3.18
CXCL3-202ENST00000502974 SLIT3O75094 1523 aa34.91■■■■□ 3.18
CXCL3-202ENST00000502974 TERF2IPQ9NYB0 399 aa34.91■■■■□ 3.18
CXCL3-202ENST00000502974 A0A1W2PP64 1363 aa34.89■■■■□ 3.18
CXCL3-202ENST00000502974 CDCA8Q53HL2 280 aa34.89■■■■□ 3.18
CXCL3-202ENST00000502974 SEPT12Q8IYM1 358 aa34.89■■■■□ 3.18
CXCL3-202ENST00000502974 STRN4Q9NRL3 753 aa34.89■■■■□ 3.18
CXCL3-202ENST00000502974 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP34.88■■■■□ 3.17
CXCL3-202ENST00000502974 BRWD3Q6RI45 1802 aa34.88■■■■□ 3.17
CXCL3-202ENST00000502974 A0A0G2JS52 829 aa34.87■■■■□ 3.17
CXCL3-202ENST00000502974 MYT1Q01538 1121 aa34.87■■■■□ 3.17
CXCL3-202ENST00000502974 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa34.86■■■■□ 3.17
CXCL3-202ENST00000502974 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa34.86■■■■□ 3.17
CXCL3-202ENST00000502974 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP34.86■■■■□ 3.17
CXCL3-202ENST00000502974 LMO7Q8WWI1 1683 aa34.86■■■■□ 3.17
CXCL3-202ENST00000502974 ZBTB7CA1YPR0 619 aa34.85■■■■□ 3.17
CXCL3-202ENST00000502974 EVA1CP58658 441 aa34.85■■■■□ 3.17
CXCL3-202ENST00000502974 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP34.84■■■■□ 3.17
CXCL3-202ENST00000502974 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP34.84■■■■□ 3.17
CXCL3-202ENST00000502974 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP34.84■■■■□ 3.17
CXCL3-202ENST00000502974 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa34.83■■■■□ 3.17
CXCL3-202ENST00000502974 KCNH5Q8NCM2 988 aa34.81■■■■□ 3.16
CXCL3-202ENST00000502974 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa34.79■■■■□ 3.16
CXCL3-202ENST00000502974 EP400Q96L91 3159 aa34.79■■■■□ 3.16
CXCL3-202ENST00000502974 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa34.79■■■■□ 3.16
CXCL3-202ENST00000502974 SOX12O15370 315 aa34.78■■■■□ 3.16
CXCL3-202ENST00000502974 NME9Q86XW9 330 aa34.78■■■■□ 3.16
CXCL3-202ENST00000502974 MYOM1P52179 1685 aa34.78■■■■□ 3.16
CXCL3-202ENST00000502974 ZRANB1Q9UGI0 708 aa34.77■■■■□ 3.16
CXCL3-202ENST00000502974 AATKQ6ZMQ8 1374 aa34.76■■■■□ 3.16
CXCL3-202ENST00000502974 KRT27Q7Z3Y8 459 aa34.76■■■■□ 3.16
CXCL3-202ENST00000502974 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP34.75■■■■□ 3.15
CXCL3-202ENST00000502974 USP54Q70EL1 1684 aa34.75■■■■□ 3.15
CXCL3-202ENST00000502974 USP31Q70CQ4 1352 aa34.74■■■■□ 3.15
CXCL3-202ENST00000502974 POLR3GLQ9BT43 218 aa34.74■■■■□ 3.15
CXCL3-202ENST00000502974 USP35Q9P2H5 1018 aa34.74■■■■□ 3.15
CXCL3-202ENST00000502974 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP34.73■■■■□ 3.15
CXCL3-202ENST00000502974 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa34.73■■■■□ 3.15
CXCL3-202ENST00000502974 NFAT5O94916 1531 aa34.72■■■■□ 3.15
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