RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498768.1

SLC35F5-212, Transcript of solute carrier family 35 member F5, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SLC35F5, Length 1,711 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35F5-212ENST00000498768 A0A1W2PP64 1363 aa29.91■■■□□ 2.38
SLC35F5-212ENST00000498768 CD163L1Q9NR16 1453 aa29.91■■■□□ 2.38
SLC35F5-212ENST00000498768 RNF123Q5XPI4 1314 aa29.9■■■□□ 2.38
SLC35F5-212ENST00000498768 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa29.89■■■□□ 2.38
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SLC35F5-212ENST00000498768 TERF2IPQ9NYB0 399 aa29.88■■■□□ 2.37
SLC35F5-212ENST00000498768 ESCO1Q5FWF5 840 aa29.86■■■□□ 2.37
SLC35F5-212ENST00000498768 WASLO00401 505 aaPredicted RBP29.82■■■□□ 2.36
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SLC35F5-212ENST00000498768 CABP1Q9NZU7 370 aa29.79■■■□□ 2.36
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SLC35F5-212ENST00000498768 SHPRHQ149N8 1683 aa29.74■■■□□ 2.35
SLC35F5-212ENST00000498768 MTHFSP49914 203 aa29.74■■■□□ 2.35
SLC35F5-212ENST00000498768 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP29.73■■■□□ 2.35
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SLC35F5-212ENST00000498768 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP29.71■■■□□ 2.35
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SLC35F5-212ENST00000498768 GGNBP2Q9H3C7 697 aa29.68■■■□□ 2.34
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SLC35F5-212ENST00000498768 APAF1O14727 1248 aa29.63■■■□□ 2.33
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SLC35F5-212ENST00000498768 MON2Q7Z3U7 1717 aa29.55■■■□□ 2.32
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SLC35F5-212ENST00000498768 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa29.48■■■□□ 2.31
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SLC35F5-212ENST00000498768 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa29.47■■■□□ 2.31
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SLC35F5-212ENST00000498768 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP29.45■■■□□ 2.31
SLC35F5-212ENST00000498768 LRP6O75581 1613 aa29.45■■■□□ 2.3
SLC35F5-212ENST00000498768 NME9Q86XW9 330 aa29.45■■■□□ 2.3
SLC35F5-212ENST00000498768 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP29.45■■■□□ 2.3
SLC35F5-212ENST00000498768 POLKQ9UBT6 870 aa29.45■■■□□ 2.3
SLC35F5-212ENST00000498768 TNS3Q68CZ2 1445 aa29.44■■■□□ 2.3
SLC35F5-212ENST00000498768 SBNO1A3KN83 1393 aa29.43■■■□□ 2.3
SLC35F5-212ENST00000498768 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP29.42■■■□□ 2.3
SLC35F5-212ENST00000498768 PLEKHF1Q96S99 279 aa29.42■■■□□ 2.3
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SLC35F5-212ENST00000498768 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa29.4■■■□□ 2.3
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