RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497037.5

ANKRD28-212, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD28, Length 3,509 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-212ENST00000497037 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
ANKRD28-212ENST00000497037 SSH2Q76I76 1423 aa6.49□□□□□ -1.37
ANKRD28-212ENST00000497037 NSD2O96028 1365 aa6.49□□□□□ -1.37
ANKRD28-212ENST00000497037 LRRC7Q96NW7 1537 aa6.49□□□□□ -1.37
ANKRD28-212ENST00000497037 KCNA6P17658 529 aa6.49□□□□□ -1.37
ANKRD28-212ENST00000497037 NME9Q86XW9 330 aa6.49□□□□□ -1.37
ANKRD28-212ENST00000497037 TBX22Q9Y458 520 aa6.49□□□□□ -1.37
ANKRD28-212ENST00000497037 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
ANKRD28-212ENST00000497037 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP6.48□□□□□ -1.376e-7■■■■□ 23.3
ANKRD28-212ENST00000497037 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
ANKRD28-212ENST00000497037 LTN1O94822 1766 aa6.47□□□□□ -1.37
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ANKRD28-212ENST00000497037 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa6.47□□□□□ -1.37
ANKRD28-212ENST00000497037 OVOS2Q6IE36 1432 aa6.47□□□□□ -1.37
ANKRD28-212ENST00000497037 EID1Q9Y6B2 187 aa6.47□□□□□ -1.37
ANKRD28-212ENST00000497037 USP6P35125 1406 aa6.47□□□□□ -1.37
ANKRD28-212ENST00000497037 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.37
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ANKRD28-212ENST00000497037 HDGFP51858 240 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
ANKRD28-212ENST00000497037 TERF2IPQ9NYB0 399 aa6.46□□□□□ -1.38
ANKRD28-212ENST00000497037 ACEP12821 1306 aa6.46□□□□□ -1.38
ANKRD28-212ENST00000497037 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP6.45□□□□□ -1.38
ANKRD28-212ENST00000497037 DUSP27Q5VZP5 1158 aa6.45□□□□□ -1.38
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ANKRD28-212ENST00000497037 PLEKHF1Q96S99 279 aa6.45□□□□□ -1.38
ANKRD28-212ENST00000497037 POLKQ9UBT6 870 aa6.45□□□□□ -1.38
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ANKRD28-212ENST00000497037 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa6.45□□□□□ -1.38
ANKRD28-212ENST00000497037 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
ANKRD28-212ENST00000497037 CCDC61Q9Y6R9 512 aa6.45□□□□□ -1.38
ANKRD28-212ENST00000497037 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
ANKRD28-212ENST00000497037 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa6.44□□□□□ -1.38
ANKRD28-212ENST00000497037 RGPD5Q99666 1765 aa6.44□□□□□ -1.38
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ANKRD28-212ENST00000497037 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa6.44□□□□□ -1.38
ANKRD28-212ENST00000497037 PLEKHG3A1L390 1219 aa6.44□□□□□ -1.38
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ANKRD28-212ENST00000497037 LMTK3Q96Q04 1460 aa6.43□□□□□ -1.38
ANKRD28-212ENST00000497037 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa6.43□□□□□ -1.38
ANKRD28-212ENST00000497037 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa6.43□□□□□ -1.38
ANKRD28-212ENST00000497037 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
ANKRD28-212ENST00000497037 PLIN1O60240 522 aa6.43□□□□□ -1.38
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ANKRD28-212ENST00000497037 C20orf194Q5TEA3 1177 aa6.43□□□□□ -1.38
ANKRD28-212ENST00000497037 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa6.42□□□□□ -1.38
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ANKRD28-212ENST00000497037 ANKARQ7Z5J8 1434 aa6.42□□□□□ -1.38
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ANKRD28-212ENST00000497037 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
ANKRD28-212ENST00000497037 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP6.4□□□□□ -1.381e-6■■■■□ 24.5
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ANKRD28-212ENST00000497037 GOLGA2Q08379 1002 aa6.39□□□□□ -1.39
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ANKRD28-212ENST00000497037 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
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ANKRD28-212ENST00000497037 KIF1AQ12756 1690 aa6.39□□□□□ -1.39
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ANKRD28-212ENST00000497037 BCAR3O75815 825 aa6.39□□□□□ -1.39
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ANKRD28-212ENST00000497037 TNNQ9UQP3 1299 aa6.39□□□□□ -1.39
ANKRD28-212ENST00000497037 LRRC37A3O60309 1634 aa6.39□□□□□ -1.39
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ANKRD28-212ENST00000497037 TMPOP42166 694 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
ANKRD28-212ENST00000497037 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
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ANKRD28-212ENST00000497037 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
ANKRD28-212ENST00000497037 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa6.38□□□□□ -1.39
ANKRD28-212ENST00000497037 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa6.38□□□□□ -1.39
ANKRD28-212ENST00000497037 SOX12O15370 315 aa6.38□□□□□ -1.39
ANKRD28-212ENST00000497037 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa6.38□□□□□ -1.39
ANKRD28-212ENST00000497037 CFAP53Q96M91 514 aa6.38□□□□□ -1.39
ANKRD28-212ENST00000497037 MAP3K19Q56UN5 1328 aa6.38□□□□□ -1.39
ANKRD28-212ENST00000497037 COL18A1P39060 1754 aa6.38□□□□□ -1.39
ANKRD28-212ENST00000497037 SLIT3O75094 1523 aa6.37□□□□□ -1.39
ANKRD28-212ENST00000497037 ABCA3Q99758 1704 aa6.37□□□□□ -1.39
ANKRD28-212ENST00000497037 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
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