RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495702.5

CEP41-215, Transcript of centrosomal protein 41, human

TSL 1 (best)

Gene CEP41, Length 733 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CEP41-215	ENST00000495702	BMP2K	Q9NSY1	1161 aa	Predicted RBP	10.3	□□□□□ -0.76
CEP41-215	ENST00000495702	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	10.3	□□□□□ -0.76
CEP41-215	ENST00000495702	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		10.29	□□□□□ -0.76
CEP41-215	ENST00000495702	ATAD2	Q6PL18	1390 aa		10.29	□□□□□ -0.76
CEP41-215	ENST00000495702	STK25	O00506	426 aa		10.29	□□□□□ -0.76
CEP41-215	ENST00000495702	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		10.29	□□□□□ -0.76
CEP41-215	ENST00000495702	DCBLD2	Q96PD2	775 aa		10.29	□□□□□ -0.76
CEP41-215	ENST00000495702	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	10.29	□□□□□ -0.76
CEP41-215	ENST00000495702	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		10.27	□□□□□ -0.76
CEP41-215	ENST00000495702	ATMIN	O43313	823 aa	Predicted RBP	10.27	□□□□□ -0.77
CEP41-215	ENST00000495702	FOXO3	O43524	673 aa		10.27	□□□□□ -0.77
CEP41-215	ENST00000495702	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	10.27	□□□□□ -0.77
CEP41-215	ENST00000495702	CCDC125	Q86Z20	511 aa		10.27	□□□□□ -0.77
CEP41-215	ENST00000495702	TMEM106C	Q9BVX2	250 aa		10.27	□□□□□ -0.77
CEP41-215	ENST00000495702	NUTM2F	A1L443	756 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CEP41-215	ENST00000495702	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CEP41-215	ENST00000495702	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CEP41-215	ENST00000495702	PTCH1	Q13635	1447 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CEP41-215	ENST00000495702	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CEP41-215	ENST00000495702	GJD4	Q96KN9	370 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
CEP41-215	ENST00000495702	STK26	Q9P289	416 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CEP41-215	ENST00000495702	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CEP41-215	ENST00000495702	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CEP41-215	ENST00000495702	STK24	Q9Y6E0	443 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CEP41-215	ENST00000495702	ATRN	O75882	1429 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CEP41-215	ENST00000495702	CLTCL1	P53675	1640 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CEP41-215	ENST00000495702	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
CEP41-215	ENST00000495702	RGL3	Q3MIN7	710 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CEP41-215	ENST00000495702	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CEP41-215	ENST00000495702	KIF1B	O60333	1816 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CEP41-215	ENST00000495702	SOX12	O15370	315 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CEP41-215	ENST00000495702	IER5L	Q5T953	404 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CEP41-215	ENST00000495702	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
CEP41-215	ENST00000495702	HFM1	A2PYH4	1435 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CEP41-215	ENST00000495702	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CEP41-215	ENST00000495702	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		10.21	□□□□□ -0.77
CEP41-215	ENST00000495702	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
CEP41-215	ENST00000495702	ATN1	P54259	1190 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
CEP41-215	ENST00000495702	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
CEP41-215	ENST00000495702	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		10.2	□□□□□ -0.78
CEP41-215	ENST00000495702	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		10.2	□□□□□ -0.78
CEP41-215	ENST00000495702	LAMC1	P11047	1609 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CEP41-215	ENST00000495702	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CEP41-215	ENST00000495702	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CEP41-215	ENST00000495702	RYDEN	Q9NUL5	291 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
CEP41-215	ENST00000495702	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CEP41-215	ENST00000495702	MYOM2	P54296	1465 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CEP41-215	ENST00000495702	NAIP	Q13075	1403 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CEP41-215	ENST00000495702	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CEP41-215	ENST00000495702	PSME1	Q06323	249 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CEP41-215	ENST00000495702	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CEP41-215	ENST00000495702	SEPT12	Q8IYM1	358 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CEP41-215	ENST00000495702	PELP1	Q8IZL8	1130 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
CEP41-215	ENST00000495702	CABP2	Q9NPB3	220 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CEP41-215	ENST00000495702	CCDC9	Q9Y3X0	531 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
CEP41-215	ENST00000495702	EFCAB3	Q8N7B9	438 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CEP41-215	ENST00000495702	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CEP41-215	ENST00000495702	ZBTB4	Q9P1Z0	1013 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78
CEP41-215	ENST00000495702	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78
CEP41-215	ENST00000495702	PXDN	Q92626	1479 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CEP41-215	ENST00000495702	FBXO22	Q8NEZ5	403 aa		10.16	□□□□□ -0.78
CEP41-215	ENST00000495702	MFRP	Q9BY79	579 aa		10.16	□□□□□ -0.78
CEP41-215	ENST00000495702	BLM	P54132	1417 aa	Predicted RBP	10.16	□□□□□ -0.78
CEP41-215	ENST00000495702	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CEP41-215	ENST00000495702	GTPBP6	O43824	516 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
CEP41-215	ENST00000495702	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CEP41-215	ENST00000495702	PHF8	Q9UPP1	1060 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CEP41-215	ENST00000495702	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CEP41-215	ENST00000495702	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		10.15	□□□□□ -0.79
CEP41-215	ENST00000495702	ABCC11	Q96J66	1382 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CEP41-215	ENST00000495702		A0A0G2JS52	829 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CEP41-215	ENST00000495702	POTEB2	H3BUK9	544 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CEP41-215	ENST00000495702	ONECUT3	O60422	494 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
CEP41-215	ENST00000495702	MYT1	Q01538	1121 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CEP41-215	ENST00000495702	VPS72	Q15906	364 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CEP41-215	ENST00000495702	SIRT1	Q96EB6	747 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CEP41-215	ENST00000495702	SLIT2	O94813	1529 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CEP41-215	ENST00000495702	FAM83G	A6ND36	823 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CEP41-215	ENST00000495702	C7	P10643	843 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CEP41-215	ENST00000495702	IRX5	P78411	483 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
CEP41-215	ENST00000495702	PLCB2	Q00722	1185 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CEP41-215	ENST00000495702	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
CEP41-215	ENST00000495702	SLC39A7	Q92504	469 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CEP41-215	ENST00000495702	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CEP41-215	ENST00000495702	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
CEP41-215	ENST00000495702	PPL	O60437	1756 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CEP41-215	ENST00000495702	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CEP41-215	ENST00000495702	MARF1	Q9Y4F3	1742 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
CEP41-215	ENST00000495702	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CEP41-215	ENST00000495702	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
CEP41-215	ENST00000495702	NLRP6	P59044	892 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CEP41-215	ENST00000495702	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	10.12	□□□□□ -0.79
CEP41-215	ENST00000495702	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CEP41-215	ENST00000495702	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CEP41-215	ENST00000495702	GLI3	P10071	1580 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CEP41-215	ENST00000495702	BAG6	P46379	1132 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CEP41-215	ENST00000495702	GOLGA2	Q08379	1002 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CEP41-215	ENST00000495702	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CEP41-215	ENST00000495702	SPRYD3	Q8NCJ5	442 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CEP41-215	ENST00000495702	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79

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