RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492966.5

TMBIM1-222, Transcript of transmembrane BAX inhibitor motif containing 1, human

TSL 4

Gene TMBIM1, Length 400 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMBIM1-222	ENST00000492966	PELP1	Q8IZL8	1130 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.53
TMBIM1-222	ENST00000492966	MAP3K5	Q99683	1374 aa		11.77	□□□□□ -0.53
TMBIM1-222	ENST00000492966	IFT172	Q9UG01	1749 aa		11.77	□□□□□ -0.53
TMBIM1-222	ENST00000492966	DAPK1	P53355	1430 aa		11.77	□□□□□ -0.53
TMBIM1-222	ENST00000492966	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		11.77	□□□□□ -0.53
TMBIM1-222	ENST00000492966	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.53
TMBIM1-222	ENST00000492966	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TMBIM1-222	ENST00000492966	TECPR2	O15040	1411 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TMBIM1-222	ENST00000492966	NAIP	Q13075	1403 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TMBIM1-222	ENST00000492966	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
TMBIM1-222	ENST00000492966	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
TMBIM1-222	ENST00000492966	HFM1	A2PYH4	1435 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TMBIM1-222	ENST00000492966	ALS2	Q96Q42	1657 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TMBIM1-222	ENST00000492966	GPBP1L1	Q9HC44	474 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
TMBIM1-222	ENST00000492966	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TMBIM1-222	ENST00000492966	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TMBIM1-222	ENST00000492966	ARX	Q96QS3	562 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TMBIM1-222	ENST00000492966	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TMBIM1-222	ENST00000492966	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
TMBIM1-222	ENST00000492966	ADCY9	O60503	1353 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TMBIM1-222	ENST00000492966	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TMBIM1-222	ENST00000492966	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TMBIM1-222	ENST00000492966	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TMBIM1-222	ENST00000492966	YBX3	P16989	372 aa	Known RBP eCLIP	11.71	□□□□□ -0.53	1e-12	■□□□□ 8.8
TMBIM1-222	ENST00000492966	APLP1	P51693	650 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TMBIM1-222	ENST00000492966	MTFR1L	Q9H019	292 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TMBIM1-222	ENST00000492966	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TMBIM1-222	ENST00000492966	KLHL34	Q8N239	644 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TMBIM1-222	ENST00000492966	PROM2	Q8N271	834 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TMBIM1-222	ENST00000492966	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
TMBIM1-222	ENST00000492966	TNS2	Q63HR2	1409 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TMBIM1-222	ENST00000492966	HTRA3	P83110	453 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TMBIM1-222	ENST00000492966	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
TMBIM1-222	ENST00000492966	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TMBIM1-222	ENST00000492966	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TMBIM1-222	ENST00000492966	SBNO1	A3KN83	1393 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TMBIM1-222	ENST00000492966	ARHGEF10	O15013	1369 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TMBIM1-222	ENST00000492966	CLTCL1	P53675	1640 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TMBIM1-222	ENST00000492966	PDE3B	Q13370	1112 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TMBIM1-222	ENST00000492966	USP35	Q9P2H5	1018 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TMBIM1-222	ENST00000492966	PAPPA	Q13219	1627 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TMBIM1-222	ENST00000492966	KIF1B	O60333	1816 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TMBIM1-222	ENST00000492966	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TMBIM1-222	ENST00000492966	KIF3C	O14782	793 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TMBIM1-222	ENST00000492966	LRRC37A3	O60309	1634 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TMBIM1-222	ENST00000492966	PHRF1	Q9P1Y6	1649 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
TMBIM1-222	ENST00000492966	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TMBIM1-222	ENST00000492966	JMY	Q8N9B5	988 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TMBIM1-222	ENST00000492966	AKAP12	Q02952	1782 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TMBIM1-222	ENST00000492966	ARHGEF28	Q8N1W1	1705 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
TMBIM1-222	ENST00000492966	PLSCR1	O15162	318 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TMBIM1-222	ENST00000492966	SLC15A2	Q16348	729 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TMBIM1-222	ENST00000492966	STRN4	Q9NRL3	753 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TMBIM1-222	ENST00000492966	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TMBIM1-222	ENST00000492966	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TMBIM1-222	ENST00000492966	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		11.65	□□□□□ -0.55
TMBIM1-222	ENST00000492966	KLRG1	Q96E93	195 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TMBIM1-222	ENST00000492966	STK32B	Q9NY57	414 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TMBIM1-222	ENST00000492966	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TMBIM1-222	ENST00000492966	PPL	O60437	1756 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TMBIM1-222	ENST00000492966	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TMBIM1-222	ENST00000492966	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TMBIM1-222	ENST00000492966	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TMBIM1-222	ENST00000492966	PSME1	Q06323	249 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TMBIM1-222	ENST00000492966	CHRNA2	Q15822	529 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TMBIM1-222	ENST00000492966	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TMBIM1-222	ENST00000492966	PHF8	Q9UPP1	1060 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TMBIM1-222	ENST00000492966	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TMBIM1-222	ENST00000492966	ATP7B	P35670	1465 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TMBIM1-222	ENST00000492966	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
TMBIM1-222	ENST00000492966	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TMBIM1-222	ENST00000492966	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TMBIM1-222	ENST00000492966	PDE4DIP	Q5VU43	2346 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TMBIM1-222	ENST00000492966	SSH2	Q76I76	1423 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TMBIM1-222	ENST00000492966	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TMBIM1-222	ENST00000492966	TNRC18	O15417	2968 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
TMBIM1-222	ENST00000492966	KIAA0232	Q92628	1395 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TMBIM1-222	ENST00000492966	FAM161A	Q3B820	660 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TMBIM1-222	ENST00000492966	TXNRD1	Q16881	649 aa		11.59	□□□□□ -0.55
TMBIM1-222	ENST00000492966	LMO7	Q8WWI1	1683 aa		11.59	□□□□□ -0.55
TMBIM1-222	ENST00000492966	GRIN3B	O60391	1043 aa		11.58	□□□□□ -0.56
TMBIM1-222	ENST00000492966	AATK	Q6ZMQ8	1374 aa		11.57	□□□□□ -0.56
TMBIM1-222	ENST00000492966	HSPA1A	P0DMV8	641 aa	Known RBP	11.56	□□□□□ -0.56
TMBIM1-222	ENST00000492966	HSPA1B	P0DMV9	641 aa	Known RBP	11.56	□□□□□ -0.56
TMBIM1-222	ENST00000492966	LARP1	Q6PKG0	1096 aa	Known RBP	11.56	□□□□□ -0.56
TMBIM1-222	ENST00000492966	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		11.56	□□□□□ -0.56
TMBIM1-222	ENST00000492966	TULP4	Q9NRJ4	1543 aa		11.55	□□□□□ -0.56
TMBIM1-222	ENST00000492966	ZNF827	Q17R98	1081 aa		11.55	□□□□□ -0.56
TMBIM1-222	ENST00000492966	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		11.55	□□□□□ -0.56
TMBIM1-222	ENST00000492966	STK26	Q9P289	416 aa		11.55	□□□□□ -0.56
TMBIM1-222	ENST00000492966	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	11.54	□□□□□ -0.56
TMBIM1-222	ENST00000492966	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		11.54	□□□□□ -0.56
TMBIM1-222	ENST00000492966	BTAF1	O14981	1849 aa		11.53	□□□□□ -0.56
TMBIM1-222	ENST00000492966	NHS	Q6T4R5	1651 aa		11.52	□□□□□ -0.56
TMBIM1-222	ENST00000492966	TOMM70	O94826	608 aa		11.52	□□□□□ -0.57
TMBIM1-222	ENST00000492966	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	11.51	□□□□□ -0.57
TMBIM1-222	ENST00000492966	POLD1	P28340	1107 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TMBIM1-222	ENST00000492966	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	11.48	□□□□□ -0.57
TMBIM1-222	ENST00000492966	EVA1C	P58658	441 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TMBIM1-222	ENST00000492966	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		11.48	□□□□□ -0.57

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