RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490575.1

PTPRVP-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type V, pseudogene, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRVP, Length 953 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRVP-202ENST00000490575 NUTM2GQ5VZR2 741 aa23.03■■□□□ 1.28
PTPRVP-202ENST00000490575 ARHGEF10O15013 1369 aa23.01■■□□□ 1.27
PTPRVP-202ENST00000490575 SSH2Q76I76 1423 aa23.01■■□□□ 1.27
PTPRVP-202ENST00000490575 CD163L1Q9NR16 1453 aa23.01■■□□□ 1.27
PTPRVP-202ENST00000490575 USP6P35125 1406 aa23■■□□□ 1.27
PTPRVP-202ENST00000490575 NGLY1Q96IV0 654 aa23■■□□□ 1.27
PTPRVP-202ENST00000490575 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
PTPRVP-202ENST00000490575 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
PTPRVP-202ENST00000490575 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
PTPRVP-202ENST00000490575 BCL9LQ86UU0 1499 aa22.98■■□□□ 1.27
PTPRVP-202ENST00000490575 NRKQ7Z2Y5 1582 aa22.97■■□□□ 1.27
PTPRVP-202ENST00000490575 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa22.97■■□□□ 1.27
PTPRVP-202ENST00000490575 ATAD2Q6PL18 1390 aa22.97■■□□□ 1.27
PTPRVP-202ENST00000490575 PIK3C2AO00443 1686 aa22.97■■□□□ 1.27
PTPRVP-202ENST00000490575 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
PTPRVP-202ENST00000490575 MON2Q7Z3U7 1717 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPRVP-202ENST00000490575 SLIT2O94813 1529 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPRVP-202ENST00000490575 PLCH1Q4KWH8 1693 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPRVP-202ENST00000490575 USP21Q9UK80 565 aa22.94■■□□□ 1.26
PTPRVP-202ENST00000490575 FAM83GA6ND36 823 aa22.93■■□□□ 1.26
PTPRVP-202ENST00000490575 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
PTPRVP-202ENST00000490575 ABTB2Q8N961 1025 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPRVP-202ENST00000490575 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa22.91■■□□□ 1.26
PTPRVP-202ENST00000490575 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
PTPRVP-202ENST00000490575 TMC1Q8TDI8 760 aa22.91■■□□□ 1.26
PTPRVP-202ENST00000490575 ZRANB1Q9UGI0 708 aa22.9■■□□□ 1.26
PTPRVP-202ENST00000490575 ATRNO75882 1429 aa22.9■■□□□ 1.26
PTPRVP-202ENST00000490575 USP19O94966 1318 aa22.89■■□□□ 1.26
PTPRVP-202ENST00000490575 NRAPQ86VF7 1730 aa22.89■■□□□ 1.26
PTPRVP-202ENST00000490575 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.26
PTPRVP-202ENST00000490575 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
PTPRVP-202ENST00000490575 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
PTPRVP-202ENST00000490575 A0A1W2PP64 1363 aa22.89■■□□□ 1.25
PTPRVP-202ENST00000490575 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
PTPRVP-202ENST00000490575 MYOM1P52179 1685 aa22.87■■□□□ 1.25
PTPRVP-202ENST00000490575 SOCS7O14512 581 aa22.87■■□□□ 1.25
PTPRVP-202ENST00000490575 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
PTPRVP-202ENST00000490575 NWD2Q9ULI1 1742 aa22.87■■□□□ 1.25
PTPRVP-202ENST00000490575 RXRBP28702 533 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPRVP-202ENST00000490575 TMF1P82094 1093 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPRVP-202ENST00000490575 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
PTPRVP-202ENST00000490575 KIAA0232Q92628 1395 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPRVP-202ENST00000490575 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
PTPRVP-202ENST00000490575 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
PTPRVP-202ENST00000490575 CHRNA2Q15822 529 aa22.85■■□□□ 1.25
PTPRVP-202ENST00000490575 SLIT3O75094 1523 aa22.85■■□□□ 1.25
PTPRVP-202ENST00000490575 GLI3P10071 1580 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRVP-202ENST00000490575 NLRP6P59044 892 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRVP-202ENST00000490575 UNC5CLQ8IV45 518 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRVP-202ENST00000490575 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP22.84■■□□□ 1.25
PTPRVP-202ENST00000490575 RGS12O14924 1447 aa22.83■■□□□ 1.25
PTPRVP-202ENST00000490575 NLRP13Q86W25 1043 aa22.83■■□□□ 1.25
PTPRVP-202ENST00000490575 NME9Q86XW9 330 aa22.83■■□□□ 1.25
PTPRVP-202ENST00000490575 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
PTPRVP-202ENST00000490575 GCP02774 474 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRVP-202ENST00000490575 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
PTPRVP-202ENST00000490575 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP22.82■■□□□ 1.24
PTPRVP-202ENST00000490575 BTG4Q9NY30 223 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRVP-202ENST00000490575 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
PTPRVP-202ENST00000490575 LMO7Q8WWI1 1683 aa22.81■■□□□ 1.24
PTPRVP-202ENST00000490575 PRDM11Q9NQV5 511 aa22.8■■□□□ 1.24
PTPRVP-202ENST00000490575 TTC21AQ8NDW8 1320 aa22.8■■□□□ 1.24
PTPRVP-202ENST00000490575 USP54Q70EL1 1684 aa22.79■■□□□ 1.24
PTPRVP-202ENST00000490575 COL18A1P39060 1754 aa22.78■■□□□ 1.24
PTPRVP-202ENST00000490575 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa22.78■■□□□ 1.24
PTPRVP-202ENST00000490575 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
PTPRVP-202ENST00000490575 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
PTPRVP-202ENST00000490575 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
PTPRVP-202ENST00000490575 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
PTPRVP-202ENST00000490575 SLC24A1O60721 1099 aa22.77■■□□□ 1.24
PTPRVP-202ENST00000490575 TERF2IPQ9NYB0 399 aa22.77■■□□□ 1.24
PTPRVP-202ENST00000490575 NFAT5O94916 1531 aa22.77■■□□□ 1.24
PTPRVP-202ENST00000490575 CPDO75976 1380 aa22.76■■□□□ 1.23
PTPRVP-202ENST00000490575 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa22.76■■□□□ 1.23
PTPRVP-202ENST00000490575 NINLQ9Y2I6 1382 aa22.76■■□□□ 1.23
PTPRVP-202ENST00000490575 VPS72Q15906 364 aa22.76■■□□□ 1.23
PTPRVP-202ENST00000490575 USP31Q70CQ4 1352 aa22.76■■□□□ 1.23
PTPRVP-202ENST00000490575 SOX12O15370 315 aa22.75■■□□□ 1.23
PTPRVP-202ENST00000490575 CARD14Q9BXL6 1004 aa22.75■■□□□ 1.23
PTPRVP-202ENST00000490575 RGPD5Q99666 1765 aa22.74■■□□□ 1.23
PTPRVP-202ENST00000490575 BRWD3Q6RI45 1802 aa22.73■■□□□ 1.23
PTPRVP-202ENST00000490575 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa22.73■■□□□ 1.23
PTPRVP-202ENST00000490575 OVOS2Q6IE36 1432 aa22.73■■□□□ 1.23
PTPRVP-202ENST00000490575 ZBTB7CA1YPR0 619 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRVP-202ENST00000490575 AXIN2Q9Y2T1 843 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRVP-202ENST00000490575 POLR3GLQ9BT43 218 aa22.71■■□□□ 1.23
PTPRVP-202ENST00000490575 FBLN1P23142 703 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPRVP-202ENST00000490575 ARHGEF25Q86VW2 580 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPRVP-202ENST00000490575 STRN4Q9NRL3 753 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPRVP-202ENST00000490575 CDCA8Q53HL2 280 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPRVP-202ENST00000490575 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
PTPRVP-202ENST00000490575 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPRVP-202ENST00000490575 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPRVP-202ENST00000490575 LTN1O94822 1766 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPRVP-202ENST00000490575 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
PTPRVP-202ENST00000490575 FYB1O15117 783 aa22.67■■□□□ 1.22
PTPRVP-202ENST00000490575 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
PTPRVP-202ENST00000490575 KIF20BQ96Q89 1820 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRVP-202ENST00000490575 AATKQ6ZMQ8 1374 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRVP-202ENST00000490575 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.3 ms