RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486840.1

CCZ1B-211, Transcript of CCZ1 homolog B, vacuolar protein trafficking and biogenesis associated, humanhuman

TSL 2

Gene CCZ1B, Length 545 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCZ1B-211ENST00000486840 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP37.83■■■■□ 3.65
CCZ1B-211ENST00000486840 ABTB2Q8N961 1025 aa37.79■■■■□ 3.64
CCZ1B-211ENST00000486840 ATAD2Q6PL18 1390 aa37.79■■■■□ 3.64
CCZ1B-211ENST00000486840 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa37.76■■■■□ 3.64
CCZ1B-211ENST00000486840 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP37.75■■■■□ 3.63
CCZ1B-211ENST00000486840 NUTM2GQ5VZR2 741 aa37.74■■■■□ 3.63
CCZ1B-211ENST00000486840 UNC5CLQ8IV45 518 aa37.74■■■■□ 3.63
CCZ1B-211ENST00000486840 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa37.74■■■■□ 3.63
CCZ1B-211ENST00000486840 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP37.73■■■■□ 3.63
CCZ1B-211ENST00000486840 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP37.73■■■■□ 3.63
CCZ1B-211ENST00000486840 NLRP13Q86W25 1043 aa37.71■■■■□ 3.63
CCZ1B-211ENST00000486840 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP37.71■■■■□ 3.63
CCZ1B-211ENST00000486840 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa37.7■■■■□ 3.63
CCZ1B-211ENST00000486840 TMC1Q8TDI8 760 aa37.7■■■■□ 3.63
CCZ1B-211ENST00000486840 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP37.69■■■■□ 3.62
CCZ1B-211ENST00000486840 PRDM11Q9NQV5 511 aa37.68■■■■□ 3.62
CCZ1B-211ENST00000486840 ALS2Q96Q42 1657 aa37.67■■■■□ 3.62
CCZ1B-211ENST00000486840 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP37.67■■■■□ 3.62
CCZ1B-211ENST00000486840 FAM83GA6ND36 823 aa37.66■■■■□ 3.62
CCZ1B-211ENST00000486840 BCL9LQ86UU0 1499 aa37.65■■■■□ 3.62
CCZ1B-211ENST00000486840 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP37.65■■■■□ 3.62
CCZ1B-211ENST00000486840 ATRNO75882 1429 aa37.64■■■■□ 3.62
CCZ1B-211ENST00000486840 USP6P35125 1406 aa37.62■■■■□ 3.61
CCZ1B-211ENST00000486840 NLRP6P59044 892 aa37.62■■■■□ 3.61
CCZ1B-211ENST00000486840 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP37.62■■■■□ 3.61
CCZ1B-211ENST00000486840 SLIT2O94813 1529 aa37.61■■■■□ 3.61
CCZ1B-211ENST00000486840 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP37.61■■■■□ 3.61
CCZ1B-211ENST00000486840 BTG4Q9NY30 223 aa37.61■■■■□ 3.61
CCZ1B-211ENST00000486840 USP47Q96K76 1375 aa37.6■■■■□ 3.61
CCZ1B-211ENST00000486840 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP37.6■■■■□ 3.61
CCZ1B-211ENST00000486840 TMF1P82094 1093 aa37.59■■■■□ 3.61
CCZ1B-211ENST00000486840 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP37.58■■■■□ 3.61
CCZ1B-211ENST00000486840 TERF2IPQ9NYB0 399 aa37.58■■■■□ 3.61
CCZ1B-211ENST00000486840 VPS72Q15906 364 aa37.57■■■■□ 3.6
CCZ1B-211ENST00000486840 CDCA8Q53HL2 280 aa37.55■■■■□ 3.6
CCZ1B-211ENST00000486840 ABCA3Q99758 1704 aa37.54■■■■□ 3.6
CCZ1B-211ENST00000486840 TTC21AQ8NDW8 1320 aa37.54■■■■□ 3.6
CCZ1B-211ENST00000486840 KIAA0232Q92628 1395 aa37.54■■■■□ 3.6
CCZ1B-211ENST00000486840 TESK2Q96S53 571 aa37.53■■■■□ 3.6
CCZ1B-211ENST00000486840 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa37.53■■■■□ 3.6
CCZ1B-211ENST00000486840 RGS12O14924 1447 aa37.53■■■■□ 3.6
CCZ1B-211ENST00000486840 GCP02774 474 aa37.51■■■■□ 3.6
CCZ1B-211ENST00000486840 EVA1CP58658 441 aa37.51■■■■□ 3.6
CCZ1B-211ENST00000486840 CHRNA2Q15822 529 aa37.51■■■■□ 3.6
CCZ1B-211ENST00000486840 A0A0G2JS52 829 aa37.5■■■■□ 3.59
CCZ1B-211ENST00000486840 ZBTB7CA1YPR0 619 aa37.5■■■■□ 3.59
CCZ1B-211ENST00000486840 MYT1Q01538 1121 aa37.5■■■■□ 3.59
CCZ1B-211ENST00000486840 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa37.5■■■■□ 3.59
CCZ1B-211ENST00000486840 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP37.48■■■■□ 3.59
CCZ1B-211ENST00000486840 USP19O94966 1318 aa37.48■■■■□ 3.59
CCZ1B-211ENST00000486840 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP37.47■■■■□ 3.59
CCZ1B-211ENST00000486840 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP37.47■■■■□ 3.59
CCZ1B-211ENST00000486840 STRN4Q9NRL3 753 aa37.47■■■■□ 3.59
CCZ1B-211ENST00000486840 NWD2Q9ULI1 1742 aa37.47■■■■□ 3.59
CCZ1B-211ENST00000486840 NINLQ9Y2I6 1382 aa37.46■■■■□ 3.59
CCZ1B-211ENST00000486840 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP37.45■■■■□ 3.59
CCZ1B-211ENST00000486840 PLCH1Q4KWH8 1693 aa37.45■■■■□ 3.59
CCZ1B-211ENST00000486840 KCNH5Q8NCM2 988 aa37.45■■■■□ 3.59
CCZ1B-211ENST00000486840 SSH2Q76I76 1423 aa37.42■■■■□ 3.58
CCZ1B-211ENST00000486840 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP37.4■■■■□ 3.58
CCZ1B-211ENST00000486840 CPDO75976 1380 aa37.4■■■■□ 3.58
CCZ1B-211ENST00000486840 SOX12O15370 315 aa37.39■■■■□ 3.58
CCZ1B-211ENST00000486840 SEPT12Q8IYM1 358 aa37.38■■■■□ 3.57
CCZ1B-211ENST00000486840 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP37.38■■■■□ 3.57
CCZ1B-211ENST00000486840 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa37.37■■■■□ 3.57
CCZ1B-211ENST00000486840 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP37.37■■■■□ 3.57
CCZ1B-211ENST00000486840 AKAP12Q02952 1782 aa37.35■■■■□ 3.57
CCZ1B-211ENST00000486840 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP37.35■■■■□ 3.57
CCZ1B-211ENST00000486840 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP37.33■■■■□ 3.57
CCZ1B-211ENST00000486840 NRKQ7Z2Y5 1582 aa37.33■■■■□ 3.57
CCZ1B-211ENST00000486840 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa37.33■■■■□ 3.57
CCZ1B-211ENST00000486840 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa37.33■■■■□ 3.57
CCZ1B-211ENST00000486840 A0A1W2PP64 1363 aa37.32■■■■□ 3.57
CCZ1B-211ENST00000486840 GLI3P10071 1580 aa37.3■■■■□ 3.56
CCZ1B-211ENST00000486840 NME9Q86XW9 330 aa37.3■■■■□ 3.56
CCZ1B-211ENST00000486840 USP35Q9P2H5 1018 aa37.3■■■■□ 3.56
CCZ1B-211ENST00000486840 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP37.29■■■■□ 3.56
CCZ1B-211ENST00000486840 POLR3GLQ9BT43 218 aa37.29■■■■□ 3.56
CCZ1B-211ENST00000486840 PIK3C2AO00443 1686 aa37.28■■■■□ 3.56
CCZ1B-211ENST00000486840 CD163L1Q9NR16 1453 aa37.26■■■■□ 3.56
CCZ1B-211ENST00000486840 KRT27Q7Z3Y8 459 aa37.26■■■■□ 3.56
CCZ1B-211ENST00000486840 AATKQ6ZMQ8 1374 aa37.26■■■■□ 3.55
CCZ1B-211ENST00000486840 SLIT3O75094 1523 aa37.26■■■■□ 3.55
CCZ1B-211ENST00000486840 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa37.25■■■■□ 3.55
CCZ1B-211ENST00000486840 MON2Q7Z3U7 1717 aa37.24■■■■□ 3.55
CCZ1B-211ENST00000486840 NRAPQ86VF7 1730 aa37.24■■■■□ 3.55
CCZ1B-211ENST00000486840 USP31Q70CQ4 1352 aa37.24■■■■□ 3.55
CCZ1B-211ENST00000486840 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa37.24■■■■□ 3.55
CCZ1B-211ENST00000486840 COG3Q96JB2 828 aa37.23■■■■□ 3.55
CCZ1B-211ENST00000486840 ZRANB1Q9UGI0 708 aa37.23■■■■□ 3.55
CCZ1B-211ENST00000486840 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP37.22■■■■□ 3.55
CCZ1B-211ENST00000486840 ARHGEF25Q86VW2 580 aa37.22■■■■□ 3.55
CCZ1B-211ENST00000486840 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa37.21■■■■□ 3.55
CCZ1B-211ENST00000486840 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP37.21■■■■□ 3.55
CCZ1B-211ENST00000486840 CCDC125Q86Z20 511 aa37.21■■■■□ 3.55
CCZ1B-211ENST00000486840 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa37.19■■■■□ 3.54
CCZ1B-211ENST00000486840 TCP11L2Q8N4U5 519 aa37.19■■■■□ 3.54
CCZ1B-211ENST00000486840 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa37.18■■■■□ 3.54
CCZ1B-211ENST00000486840 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP37.18■■■■□ 3.54
CCZ1B-211ENST00000486840 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP37.17■■■■□ 3.54
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