RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485499.1

PTPRT-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, human

TSL 3

Gene PTPRT, Length 208 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRT-208	ENST00000485499	TOM1	O60784	492 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PTPRT-208	ENST00000485499	CDHR5	Q9HBB8	845 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PTPRT-208	ENST00000485499	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PTPRT-208	ENST00000485499	PTGDR	Q13258	359 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PTPRT-208	ENST00000485499	NPDC1	Q9NQX5	325 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
PTPRT-208	ENST00000485499	RABGEF1	Q9UJ41	708 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PTPRT-208	ENST00000485499	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		10.17	□□□□□ -0.78
PTPRT-208	ENST00000485499	PTPRK	Q15262	1439 aa		10.17	□□□□□ -0.78
PTPRT-208	ENST00000485499	SOWAHB	A6NEL2	793 aa		10.17	□□□□□ -0.78
PTPRT-208	ENST00000485499	FCHSD2	O94868	740 aa		10.17	□□□□□ -0.78
PTPRT-208	ENST00000485499	PRSS12	P56730	875 aa		10.17	□□□□□ -0.78
PTPRT-208	ENST00000485499	TRIM6-TRIM34	B2RNG4	842 aa		10.16	□□□□□ -0.78
PTPRT-208	ENST00000485499	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		10.16	□□□□□ -0.78
PTPRT-208	ENST00000485499	GPIHBP1	Q8IV16	184 aa		10.16	□□□□□ -0.78
PTPRT-208	ENST00000485499	CDCA7L	Q96GN5	454 aa		10.16	□□□□□ -0.78
PTPRT-208	ENST00000485499	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PTPRT-208	ENST00000485499	NRG2	O14511	850 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
PTPRT-208	ENST00000485499	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
PTPRT-208	ENST00000485499	HIC1	Q14526	733 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PTPRT-208	ENST00000485499	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PTPRT-208	ENST00000485499	LAPTM4B	Q86VI4	370 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PTPRT-208	ENST00000485499	AFAP1	Q8N556	730 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PTPRT-208	ENST00000485499	PLXNC1	O60486	1568 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PTPRT-208	ENST00000485499	BCAM	P50895	628 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PTPRT-208	ENST00000485499	DEPDC5	O75140	1603 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PTPRT-208	ENST00000485499	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PTPRT-208	ENST00000485499	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
PTPRT-208	ENST00000485499	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPRT-208	ENST00000485499	PROX2	Q3B8N5	592 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPRT-208	ENST00000485499	PACS2	Q86VP3	889 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPRT-208	ENST00000485499	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
PTPRT-208	ENST00000485499	ZMYM3	Q14202	1370 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPRT-208	ENST00000485499	TTC13	Q8NBP0	860 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PTPRT-208	ENST00000485499	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
PTPRT-208	ENST00000485499	GNPAT	O15228	680 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PTPRT-208	ENST00000485499	GPR37	O15354	613 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PTPRT-208	ENST00000485499	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
PTPRT-208	ENST00000485499	ZNF787	Q6DD87	383 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PTPRT-208	ENST00000485499	WBP1L	Q9NX94	342 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PTPRT-208	ENST00000485499	KIAA1468	Q9P260	1216 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PTPRT-208	ENST00000485499	TSKS	Q9UJT2	592 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PTPRT-208	ENST00000485499	ATP7A	Q04656	1500 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PTPRT-208	ENST00000485499	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PTPRT-208	ENST00000485499	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PTPRT-208	ENST00000485499	PADI6	Q6TGC4	694 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PTPRT-208	ENST00000485499	NBPF26	B4DH59	902 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PTPRT-208	ENST00000485499	ZNF775	Q96BV0	537 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
PTPRT-208	ENST00000485499	CLIP1	P30622	1438 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PTPRT-208	ENST00000485499	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
PTPRT-208	ENST00000485499	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PTPRT-208	ENST00000485499	PHLPP1	O60346	1717 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PTPRT-208	ENST00000485499	ZFR	Q96KR1	1074 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
PTPRT-208	ENST00000485499	POTEA	Q6S8J7	498 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PTPRT-208	ENST00000485499	FAM198A	Q9UFP1	575 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PTPRT-208	ENST00000485499	TATDN2	Q93075	761 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PTPRT-208	ENST00000485499	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PTPRT-208	ENST00000485499	FAM98C	Q17RN3	349 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
PTPRT-208	ENST00000485499	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
PTPRT-208	ENST00000485499	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PTPRT-208	ENST00000485499	ZC3H15	Q8WU90	426 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
PTPRT-208	ENST00000485499	PRKD2	Q9BZL6	878 aa		10.03	□□□□□ -0.8
PTPRT-208	ENST00000485499	PNMA3	Q9UL41	463 aa		10.03	□□□□□ -0.8
PTPRT-208	ENST00000485499		V9GY48	417 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
PTPRT-208	ENST00000485499	MED14	O60244	1454 aa		10.03	□□□□□ -0.8
PTPRT-208	ENST00000485499	A2M	P01023	1474 aa		10.03	□□□□□ -0.8
PTPRT-208	ENST00000485499	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		10.02	□□□□□ -0.8
PTPRT-208	ENST00000485499	OAT	P04181	439 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PTPRT-208	ENST00000485499	RBM46	Q8TBY0	533 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
PTPRT-208	ENST00000485499	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
PTPRT-208	ENST00000485499	ADGRG1	Q9Y653	693 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PTPRT-208	ENST00000485499	MAP2K5	Q13163	448 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PTPRT-208	ENST00000485499	NUDT18	Q6ZVK8	323 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PTPRT-208	ENST00000485499	TSR3	Q9UJK0	312 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
PTPRT-208	ENST00000485499	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PTPRT-208	ENST00000485499	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	10.01	□□□□□ -0.81
PTPRT-208	ENST00000485499	FMN1	Q68DA7	1419 aa		10	□□□□□ -0.81
PTPRT-208	ENST00000485499	ZMYND10	O75800	440 aa		10	□□□□□ -0.81
PTPRT-208	ENST00000485499	SEPT9	Q9UHD8	586 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
PTPRT-208	ENST00000485499	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
PTPRT-208	ENST00000485499	MINK1	Q8N4C8	1332 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
PTPRT-208	ENST00000485499	TNR	Q92752	1358 aa		10	□□□□□ -0.81
PTPRT-208	ENST00000485499	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PTPRT-208	ENST00000485499	FECH	P22830	423 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PTPRT-208	ENST00000485499	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PTPRT-208	ENST00000485499	EYA1	Q99502	592 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PTPRT-208	ENST00000485499	CEP152	O94986	1710 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PTPRT-208	ENST00000485499	PZP	P20742	1482 aa		9.98	□□□□□ -0.81
PTPRT-208	ENST00000485499	C3orf80	F5H4A9	247 aa		9.97	□□□□□ -0.81
PTPRT-208	ENST00000485499	SMAP	O00193	183 aa		9.97	□□□□□ -0.81
PTPRT-208	ENST00000485499	GGT6	Q6P531	493 aa		9.97	□□□□□ -0.81
PTPRT-208	ENST00000485499	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		9.97	□□□□□ -0.81
PTPRT-208	ENST00000485499	NLRP1	Q9C000	1473 aa		9.97	□□□□□ -0.81
PTPRT-208	ENST00000485499	IRF6	O14896	467 aa		9.96	□□□□□ -0.82
PTPRT-208	ENST00000485499	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	9.96	□□□□□ -0.82
PTPRT-208	ENST00000485499	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	9.96	□□□□□ -0.82
PTPRT-208	ENST00000485499	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	9.96	□□□□□ -0.82
PTPRT-208	ENST00000485499	SHPRH	Q149N8	1683 aa		9.96	□□□□□ -0.82
PTPRT-208	ENST00000485499	DNAJB2	P25686	324 aa		9.95	□□□□□ -0.82
PTPRT-208	ENST00000485499	METTL3	Q86U44	580 aa	Known RBP	9.95	□□□□□ -0.82
PTPRT-208	ENST00000485499	PXYLP1	Q8TE99	480 aa		9.95	□□□□□ -0.82

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