RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484266.5

CHKB-210, Transcript of choline kinase beta, humanhuman

TSL 2

Gene CHKB, Length 1,401 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKB-210ENST00000484266 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP45.91■■■■■ 4.94
CHKB-210ENST00000484266 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP45.91■■■■■ 4.94
CHKB-210ENST00000484266 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP45.91■■■■■ 4.94
CHKB-210ENST00000484266 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP45.9■■■■■ 4.94
CHKB-210ENST00000484266 NRKQ7Z2Y5 1582 aa45.89■■■■■ 4.94
CHKB-210ENST00000484266 SSH2Q76I76 1423 aa45.89■■■■■ 4.94
CHKB-210ENST00000484266 MYOM1P52179 1685 aa45.88■■■■■ 4.94
CHKB-210ENST00000484266 ABCA3Q99758 1704 aa45.86■■■■■ 4.93
CHKB-210ENST00000484266 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP45.86■■■■■ 4.93
CHKB-210ENST00000484266 A0A1W2PP64 1363 aa45.83■■■■■ 4.93
CHKB-210ENST00000484266 TERF2IPQ9NYB0 399 aa45.82■■■■■ 4.93
CHKB-210ENST00000484266 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa45.82■■■■■ 4.93
CHKB-210ENST00000484266 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP45.81■■■■■ 4.92
CHKB-210ENST00000484266 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP45.78■■■■■ 4.92
CHKB-210ENST00000484266 CABLES1Q8TDN4 633 aa45.78■■■■■ 4.92
CHKB-210ENST00000484266 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP45.77■■■■■ 4.92
CHKB-210ENST00000484266 PIK3C2AO00443 1686 aa45.77■■■■■ 4.92
CHKB-210ENST00000484266 ABTB2Q8N961 1025 aa45.77■■■■■ 4.92
CHKB-210ENST00000484266 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa45.76■■■■■ 4.92
CHKB-210ENST00000484266 PLEKHG5O94827 1062 aa45.76■■■■■ 4.92
CHKB-210ENST00000484266 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP45.76■■■■■ 4.92
CHKB-210ENST00000484266 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP45.76■■■■■ 4.92
CHKB-210ENST00000484266 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa45.76■■■■■ 4.92
CHKB-210ENST00000484266 ADAMTS2O95450 1211 aa45.73■■■■■ 4.91
CHKB-210ENST00000484266 NUTM2GQ5VZR2 741 aa45.73■■■■■ 4.91
CHKB-210ENST00000484266 POLR3GLQ9BT43 218 aa45.73■■■■■ 4.91
CHKB-210ENST00000484266 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP45.72■■■■■ 4.91
CHKB-210ENST00000484266 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP45.72■■■■■ 4.91
CHKB-210ENST00000484266 TTC21AQ8NDW8 1320 aa45.71■■■■■ 4.91
CHKB-210ENST00000484266 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP45.67■■■■■ 4.9
CHKB-210ENST00000484266 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP45.67■■■■■ 4.9
CHKB-210ENST00000484266 NLRP13Q86W25 1043 aa45.64■■■■■ 4.9
CHKB-210ENST00000484266 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP45.64■■■■■ 4.9
CHKB-210ENST00000484266 USP19O94966 1318 aa45.64■■■■■ 4.9
CHKB-210ENST00000484266 KIF7Q2M1P5 1343 aa45.64■■■■■ 4.9
CHKB-210ENST00000484266 C8orf37Q96NL8 207 aa45.63■■■■■ 4.9
CHKB-210ENST00000484266 NLRP6P59044 892 aa45.61■■■■■ 4.89
CHKB-210ENST00000484266 USP54Q70EL1 1684 aa45.59■■■■■ 4.89
CHKB-210ENST00000484266 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP45.59■■■■■ 4.89
CHKB-210ENST00000484266 SLIT3O75094 1523 aa45.57■■■■■ 4.89
CHKB-210ENST00000484266 NME9Q86XW9 330 aa45.57■■■■■ 4.89
CHKB-210ENST00000484266 NGLY1Q96IV0 654 aa45.54■■■■■ 4.88
CHKB-210ENST00000484266 USP31Q70CQ4 1352 aa45.54■■■■■ 4.88
CHKB-210ENST00000484266 AFF2P51816 1311 aa45.54■■■■■ 4.88
CHKB-210ENST00000484266 CARD14Q9BXL6 1004 aa45.52■■■■■ 4.88
CHKB-210ENST00000484266 ZRANB1Q9UGI0 708 aa45.52■■■■■ 4.88
CHKB-210ENST00000484266 CCDC7Q96M83 1385 aa45.51■■■■■ 4.88
CHKB-210ENST00000484266 GCP02774 474 aa45.49■■■■■ 4.87
CHKB-210ENST00000484266 NSD3Q9BZ95 1437 aa45.49■■■■■ 4.87
CHKB-210ENST00000484266 WASHC2AQ641Q2 1341 aa45.49■■■■■ 4.87
CHKB-210ENST00000484266 PLCH1Q4KWH8 1693 aa45.48■■■■■ 4.87
CHKB-210ENST00000484266 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP45.48■■■■■ 4.87
CHKB-210ENST00000484266 KIF20BQ96Q89 1820 aa45.47■■■■■ 4.87
CHKB-210ENST00000484266 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP45.46■■■■■ 4.87
CHKB-210ENST00000484266 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa45.46■■■■■ 4.87
CHKB-210ENST00000484266 OVOS2Q6IE36 1432 aa45.46■■■■■ 4.87
CHKB-210ENST00000484266 SLIT2O94813 1529 aa45.45■■■■■ 4.87
CHKB-210ENST00000484266 KIAA0232Q92628 1395 aa45.45■■■■■ 4.87
CHKB-210ENST00000484266 FAM83GA6ND36 823 aa45.44■■■■■ 4.87
CHKB-210ENST00000484266 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP45.43■■■■■ 4.86
CHKB-210ENST00000484266 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP45.43■■■■■ 4.86
CHKB-210ENST00000484266 PANK3Q9H999 370 aa45.43■■■■■ 4.86
CHKB-210ENST00000484266 NWD2Q9ULI1 1742 aa45.42■■■■■ 4.86
CHKB-210ENST00000484266 PRDM11Q9NQV5 511 aa45.41■■■■■ 4.86
CHKB-210ENST00000484266 CPDO75976 1380 aa45.41■■■■■ 4.86
CHKB-210ENST00000484266 NFAT5O94916 1531 aa45.4■■■■■ 4.86
CHKB-210ENST00000484266 BCL9LQ86UU0 1499 aa45.4■■■■■ 4.86
CHKB-210ENST00000484266 FYB1O15117 783 aa45.39■■■■■ 4.86
CHKB-210ENST00000484266 USP21Q9UK80 565 aa45.39■■■■■ 4.86
CHKB-210ENST00000484266 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP45.39■■■■■ 4.86
CHKB-210ENST00000484266 KCNH5Q8NCM2 988 aa45.38■■■■■ 4.86
CHKB-210ENST00000484266 POTEAQ6S8J7 498 aa45.37■■■■■ 4.85
CHKB-210ENST00000484266 NRAPQ86VF7 1730 aa45.34■■■■■ 4.85
CHKB-210ENST00000484266 SOX12O15370 315 aa45.34■■■■■ 4.85
CHKB-210ENST00000484266 CHRNA2Q15822 529 aa45.34■■■■■ 4.85
CHKB-210ENST00000484266 COG3Q96JB2 828 aa45.33■■■■■ 4.85
CHKB-210ENST00000484266 GGNBP2Q9H3C7 697 aa45.33■■■■■ 4.85
CHKB-210ENST00000484266 LMO7Q8WWI1 1683 aa45.31■■■■■ 4.84
CHKB-210ENST00000484266 CGNL1Q0VF96 1302 aa45.3■■■■■ 4.84
CHKB-210ENST00000484266 UNC5CLQ8IV45 518 aa45.29■■■■■ 4.84
CHKB-210ENST00000484266 BTG4Q9NY30 223 aa45.28■■■■■ 4.84
CHKB-210ENST00000484266 COL18A1P39060 1754 aa45.27■■■■■ 4.84
CHKB-210ENST00000484266 ARHGEF25Q86VW2 580 aa45.26■■■■■ 4.84
CHKB-210ENST00000484266 ATRNO75882 1429 aa45.26■■■■■ 4.84
CHKB-210ENST00000484266 LTN1O94822 1766 aa45.26■■■■■ 4.84
CHKB-210ENST00000484266 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP45.26■■■■■ 4.84
CHKB-210ENST00000484266 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP45.24■■■■■ 4.83
CHKB-210ENST00000484266 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa45.24■■■■■ 4.83
CHKB-210ENST00000484266 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa45.23■■■■■ 4.83
CHKB-210ENST00000484266 ZBTB7CA1YPR0 619 aa45.23■■■■■ 4.83
CHKB-210ENST00000484266 AATKQ6ZMQ8 1374 aa45.22■■■■■ 4.83
CHKB-210ENST00000484266 KNSTRNQ9Y448 316 aa45.18■■■■■ 4.82
CHKB-210ENST00000484266 RGPD5Q99666 1765 aa45.16■■■■■ 4.82
CHKB-210ENST00000484266 ABCC6O95255 1503 aa45.16■■■■■ 4.82
CHKB-210ENST00000484266 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP45.15■■■■■ 4.82
CHKB-210ENST00000484266 ILDR2Q71H61 639 aa45.15■■■■■ 4.82
CHKB-210ENST00000484266 VPS72Q15906 364 aa45.14■■■■■ 4.82
CHKB-210ENST00000484266 NSD2O96028 1365 aa45.13■■■■■ 4.82
CHKB-210ENST00000484266 FBLN1P23142 703 aa45.13■■■■■ 4.82
CHKB-210ENST00000484266 RXRBP28702 533 aa45.12■■■■■ 4.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 74 ms