RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481518.1

PSME4-208, Transcript of proteasome activator subunit 4, human

TSL 5

Gene PSME4, Length 886 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSME4-208	ENST00000481518	ACE	P12821	1306 aa		32.98	■■■□□ 2.87
PSME4-208	ENST00000481518	PLCH1	Q4KWH8	1693 aa		32.97	■■■□□ 2.87
PSME4-208	ENST00000481518	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		32.97	■■■□□ 2.87
PSME4-208	ENST00000481518	PAK3	O75914	559 aa	Predicted RBP	32.97	■■■□□ 2.87
PSME4-208	ENST00000481518	PPIP5K1	Q6PFW1	1433 aa		32.94	■■■□□ 2.86
PSME4-208	ENST00000481518	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		32.94	■■■□□ 2.86
PSME4-208	ENST00000481518	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	32.92	■■■□□ 2.86
PSME4-208	ENST00000481518	NWD2	Q9ULI1	1742 aa		32.91	■■■□□ 2.86
PSME4-208	ENST00000481518	GJD4	Q96KN9	370 aa	Predicted RBP	32.91	■■■□□ 2.86
PSME4-208	ENST00000481518	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		32.91	■■■□□ 2.86
PSME4-208	ENST00000481518	GLI3	P10071	1580 aa		32.91	■■■□□ 2.86
PSME4-208	ENST00000481518	FAM83G	A6ND36	823 aa		32.9	■■■□□ 2.86
PSME4-208	ENST00000481518	PHRF1	Q9P1Y6	1649 aa	Known RBP	32.87	■■■□□ 2.85
PSME4-208	ENST00000481518	EVC2	Q86UK5	1308 aa		32.86	■■■□□ 2.85
PSME4-208	ENST00000481518	NRAP	Q86VF7	1730 aa		32.85	■■■□□ 2.85
PSME4-208	ENST00000481518	COL14A1	Q05707	1796 aa	Known RBP	32.84	■■■□□ 2.85
PSME4-208	ENST00000481518	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		32.84	■■■□□ 2.85
PSME4-208	ENST00000481518	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		32.84	■■■□□ 2.85
PSME4-208	ENST00000481518	CABP1	Q9NZU7	370 aa		32.83	■■■□□ 2.85
PSME4-208	ENST00000481518	VPS72	Q15906	364 aa		32.82	■■■□□ 2.84
PSME4-208	ENST00000481518	USP6	P35125	1406 aa		32.78	■■■□□ 2.84
PSME4-208	ENST00000481518	BTG4	Q9NY30	223 aa		32.78	■■■□□ 2.84
PSME4-208	ENST00000481518	SBNO2	Q9Y2G9	1366 aa		32.78	■■■□□ 2.84
PSME4-208	ENST00000481518	ABTB2	Q8N961	1025 aa		32.77	■■■□□ 2.84
PSME4-208	ENST00000481518	NRK	Q7Z2Y5	1582 aa		32.77	■■■□□ 2.84
PSME4-208	ENST00000481518	ATAD2	Q6PL18	1390 aa		32.76	■■■□□ 2.83
PSME4-208	ENST00000481518	KIAA0232	Q92628	1395 aa		32.76	■■■□□ 2.83
PSME4-208	ENST00000481518	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		32.75	■■■□□ 2.83
PSME4-208	ENST00000481518	CCDC9	Q9Y3X0	531 aa	Known RBP	32.74	■■■□□ 2.83
PSME4-208	ENST00000481518	USP19	O94966	1318 aa		32.74	■■■□□ 2.83
PSME4-208	ENST00000481518	SSH2	Q76I76	1423 aa		32.73	■■■□□ 2.83
PSME4-208	ENST00000481518	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	32.72	■■■□□ 2.83
PSME4-208	ENST00000481518	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	32.71	■■■□□ 2.83
PSME4-208	ENST00000481518	CHRNA2	Q15822	529 aa		32.71	■■■□□ 2.83
PSME4-208	ENST00000481518	AKAP12	Q02952	1782 aa		32.7	■■■□□ 2.82
PSME4-208	ENST00000481518	BRWD3	Q6RI45	1802 aa		32.69	■■■□□ 2.82
PSME4-208	ENST00000481518	PIK3C2A	O00443	1686 aa		32.68	■■■□□ 2.82
PSME4-208	ENST00000481518	SEPT12	Q8IYM1	358 aa		32.67	■■■□□ 2.82
PSME4-208	ENST00000481518	ONECUT3	O60422	494 aa	Predicted RBP	32.66	■■■□□ 2.82
PSME4-208	ENST00000481518	NLRP13	Q86W25	1043 aa		32.66	■■■□□ 2.82
PSME4-208	ENST00000481518	CPSF1	Q10570	1443 aa	Known RBP	32.66	■■■□□ 2.82
PSME4-208	ENST00000481518	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		32.65	■■■□□ 2.82
PSME4-208	ENST00000481518	CPD	O75976	1380 aa		32.64	■■■□□ 2.82
PSME4-208	ENST00000481518	LMO7	Q8WWI1	1683 aa		32.62	■■■□□ 2.81
PSME4-208	ENST00000481518	SLIT3	O75094	1523 aa		32.62	■■■□□ 2.81
PSME4-208	ENST00000481518	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		32.62	■■■□□ 2.81
PSME4-208	ENST00000481518	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		32.62	■■■□□ 2.81
PSME4-208	ENST00000481518	GC	P02774	474 aa		32.62	■■■□□ 2.81
PSME4-208	ENST00000481518	NLRP6	P59044	892 aa		32.61	■■■□□ 2.81
PSME4-208	ENST00000481518	FAM98C	Q17RN3	349 aa	Known RBP	32.61	■■■□□ 2.81
PSME4-208	ENST00000481518	CAMTA1	Q9Y6Y1	1673 aa		32.6	■■■□□ 2.81
PSME4-208	ENST00000481518	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		32.6	■■■□□ 2.81
PSME4-208	ENST00000481518	ZNF692	Q9BU19	519 aa	Predicted RBP	32.6	■■■□□ 2.81
PSME4-208	ENST00000481518	MON2	Q7Z3U7	1717 aa		32.6	■■■□□ 2.81
PSME4-208	ENST00000481518	CD163L1	Q9NR16	1453 aa		32.59	■■■□□ 2.81
PSME4-208	ENST00000481518	TESK2	Q96S53	571 aa		32.58	■■■□□ 2.81
PSME4-208	ENST00000481518	STRN4	Q9NRL3	753 aa		32.58	■■■□□ 2.81
PSME4-208	ENST00000481518	ST20-MTHFS	A0A0A6YYL1	179 aa		32.57	■■■□□ 2.8
PSME4-208	ENST00000481518	KTN1	Q86UP2	1357 aa	Known RBP	32.57	■■■□□ 2.8
PSME4-208	ENST00000481518	EP400	Q96L91	3159 aa		32.56	■■■□□ 2.8
PSME4-208	ENST00000481518	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		32.55	■■■□□ 2.8
PSME4-208	ENST00000481518	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		32.54	■■■□□ 2.8
PSME4-208	ENST00000481518	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		32.54	■■■□□ 2.8
PSME4-208	ENST00000481518		A0A0G2JS52	829 aa		32.54	■■■□□ 2.8
PSME4-208	ENST00000481518	MYT1	Q01538	1121 aa		32.54	■■■□□ 2.8
PSME4-208	ENST00000481518	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		32.52	■■■□□ 2.8
PSME4-208	ENST00000481518	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		32.52	■■■□□ 2.8
PSME4-208	ENST00000481518	SLC12A5	Q9H2X9	1139 aa		32.52	■■■□□ 2.8
PSME4-208	ENST00000481518	TMC1	Q8TDI8	760 aa		32.51	■■■□□ 2.79
PSME4-208	ENST00000481518	USP47	Q96K76	1375 aa		32.49	■■■□□ 2.79
PSME4-208	ENST00000481518	COL5A2	P05997	1499 aa	Predicted RBP	32.48	■■■□□ 2.79
PSME4-208	ENST00000481518	EVA1C	P58658	441 aa		32.48	■■■□□ 2.79
PSME4-208	ENST00000481518	LARP1	Q6PKG0	1096 aa	Known RBP	32.48	■■■□□ 2.79
PSME4-208	ENST00000481518	PUS7	Q96PZ0	661 aa	Known RBP	32.48	■■■□□ 2.79
PSME4-208	ENST00000481518	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		32.47	■■■□□ 2.79
PSME4-208	ENST00000481518	COL18A1	P39060	1754 aa		32.47	■■■□□ 2.79
PSME4-208	ENST00000481518	AATK	Q6ZMQ8	1374 aa		32.46	■■■□□ 2.79
PSME4-208	ENST00000481518	BLM	P54132	1417 aa	Predicted RBP	32.46	■■■□□ 2.79
PSME4-208	ENST00000481518	CCDC125	Q86Z20	511 aa		32.46	■■■□□ 2.79
PSME4-208	ENST00000481518	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	32.46	■■■□□ 2.79
PSME4-208	ENST00000481518	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		32.46	■■■□□ 2.79
PSME4-208	ENST00000481518	USP35	Q9P2H5	1018 aa		32.45	■■■□□ 2.79
PSME4-208	ENST00000481518	ZRANB1	Q9UGI0	708 aa		32.45	■■■□□ 2.79
PSME4-208	ENST00000481518		A0A1W2PP64	1363 aa		32.45	■■■□□ 2.78
PSME4-208	ENST00000481518	NFAT5	O94916	1531 aa		32.44	■■■□□ 2.78
PSME4-208	ENST00000481518	USP54	Q70EL1	1684 aa		32.43	■■■□□ 2.78
PSME4-208	ENST00000481518	SOX12	O15370	315 aa		32.42	■■■□□ 2.78
PSME4-208	ENST00000481518	HDGFL2	Q7Z4V5	671 aa	Predicted RBP	32.42	■■■□□ 2.78
PSME4-208	ENST00000481518	NME9	Q86XW9	330 aa		32.42	■■■□□ 2.78
PSME4-208	ENST00000481518	USP31	Q70CQ4	1352 aa		32.41	■■■□□ 2.78
PSME4-208	ENST00000481518	EDC4	Q6P2E9	1401 aa	Known RBP	32.41	■■■□□ 2.78
PSME4-208	ENST00000481518	FAM182B	Q5T319	152 aa		32.4	■■■□□ 2.78
PSME4-208	ENST00000481518	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		32.4	■■■□□ 2.78
PSME4-208	ENST00000481518	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		32.4	■■■□□ 2.78
PSME4-208	ENST00000481518	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		32.39	■■■□□ 2.78
PSME4-208	ENST00000481518	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		32.39	■■■□□ 2.78
PSME4-208	ENST00000481518	AXIN2	Q9Y2T1	843 aa		32.38	■■■□□ 2.77
PSME4-208	ENST00000481518	NINL	Q9Y2I6	1382 aa		32.37	■■■□□ 2.77
PSME4-208	ENST00000481518	CRB1	P82279	1406 aa		32.36	■■■□□ 2.77
PSME4-208	ENST00000481518	SLC24A1	O60721	1099 aa		32.36	■■■□□ 2.77

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