RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481121.5

NELFE-208, Transcript of negative elongation factor complex member E, human

TSL 2

Gene NELFE, Length 1,543 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NELFE-208	ENST00000481121	NGLY1	Q96IV0	654 aa		29.36	■■■□□ 2.29
NELFE-208	ENST00000481121	PLEKHG5	O94827	1062 aa		29.35	■■■□□ 2.29
NELFE-208	ENST00000481121	PLCH1	Q4KWH8	1693 aa		29.35	■■■□□ 2.29
NELFE-208	ENST00000481121	CABP1	Q9NZU7	370 aa		29.35	■■■□□ 2.29
NELFE-208	ENST00000481121	ST20-MTHFS	A0A0A6YYL1	179 aa		29.34	■■■□□ 2.29
NELFE-208	ENST00000481121	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		29.34	■■■□□ 2.29
NELFE-208	ENST00000481121	MON2	Q7Z3U7	1717 aa		29.33	■■■□□ 2.29
NELFE-208	ENST00000481121	TNKS1BP1	Q9C0C2	1729 aa	Known RBP	29.33	■■■□□ 2.29
NELFE-208	ENST00000481121	NRK	Q7Z2Y5	1582 aa		29.32	■■■□□ 2.28
NELFE-208	ENST00000481121	USP6	P35125	1406 aa		29.32	■■■□□ 2.28
NELFE-208	ENST00000481121	NWD2	Q9ULI1	1742 aa		29.3	■■■□□ 2.28
NELFE-208	ENST00000481121	TESK2	Q96S53	571 aa		29.3	■■■□□ 2.28
NELFE-208	ENST00000481121	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	29.29	■■■□□ 2.28
NELFE-208	ENST00000481121	PIK3C2A	O00443	1686 aa		29.27	■■■□□ 2.28
NELFE-208	ENST00000481121	SLC24A1	O60721	1099 aa		29.26	■■■□□ 2.27
NELFE-208	ENST00000481121	USP21	Q9UK80	565 aa		29.26	■■■□□ 2.27
NELFE-208	ENST00000481121	COL14A1	Q05707	1796 aa	Known RBP	29.26	■■■□□ 2.27
NELFE-208	ENST00000481121	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	29.25	■■■□□ 2.27
NELFE-208	ENST00000481121	SLIT2	O94813	1529 aa		29.24	■■■□□ 2.27
NELFE-208	ENST00000481121	ABTB2	Q8N961	1025 aa		29.23	■■■□□ 2.27
NELFE-208	ENST00000481121	CPSF1	Q10570	1443 aa	Known RBP	29.23	■■■□□ 2.27
NELFE-208	ENST00000481121	SOCS7	O14512	581 aa		29.22	■■■□□ 2.27
NELFE-208	ENST00000481121	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		29.22	■■■□□ 2.27
NELFE-208	ENST00000481121	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		29.21	■■■□□ 2.27
NELFE-208	ENST00000481121	PUS7	Q96PZ0	661 aa	Known RBP	29.21	■■■□□ 2.27
NELFE-208	ENST00000481121	SSH2	Q76I76	1423 aa		29.21	■■■□□ 2.27
NELFE-208	ENST00000481121	NRAP	Q86VF7	1730 aa		29.21	■■■□□ 2.27
NELFE-208	ENST00000481121	ZNF692	Q9BU19	519 aa	Predicted RBP	29.2	■■■□□ 2.27
NELFE-208	ENST00000481121	CD163L1	Q9NR16	1453 aa		29.2	■■■□□ 2.26
NELFE-208	ENST00000481121	KTN1	Q86UP2	1357 aa	Known RBP	29.2	■■■□□ 2.26
NELFE-208	ENST00000481121	RXRB	P28702	533 aa		29.2	■■■□□ 2.26
NELFE-208	ENST00000481121	TMC1	Q8TDI8	760 aa		29.2	■■■□□ 2.26
NELFE-208	ENST00000481121	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	29.2	■■■□□ 2.26
NELFE-208	ENST00000481121	ATRN	O75882	1429 aa		29.19	■■■□□ 2.26
NELFE-208	ENST00000481121	TMF1	P82094	1093 aa		29.19	■■■□□ 2.26
NELFE-208	ENST00000481121	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	29.18	■■■□□ 2.26
NELFE-208	ENST00000481121	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	29.18	■■■□□ 2.26
NELFE-208	ENST00000481121	NINL	Q9Y2I6	1382 aa		29.17	■■■□□ 2.26
NELFE-208	ENST00000481121	USP19	O94966	1318 aa		29.16	■■■□□ 2.26
NELFE-208	ENST00000481121	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	29.15	■■■□□ 2.26
NELFE-208	ENST00000481121	NLRP13	Q86W25	1043 aa		29.15	■■■□□ 2.26
NELFE-208	ENST00000481121	SLIT3	O75094	1523 aa		29.14	■■■□□ 2.26
NELFE-208	ENST00000481121	MYOM1	P52179	1685 aa		29.13	■■■□□ 2.25
NELFE-208	ENST00000481121	USP54	Q70EL1	1684 aa		29.13	■■■□□ 2.25
NELFE-208	ENST00000481121	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		29.13	■■■□□ 2.25
NELFE-208	ENST00000481121	HDGFL2	Q7Z4V5	671 aa	Predicted RBP	29.13	■■■□□ 2.25
NELFE-208	ENST00000481121	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		29.13	■■■□□ 2.25
NELFE-208	ENST00000481121	SLC12A5	Q9H2X9	1139 aa		29.13	■■■□□ 2.25
NELFE-208	ENST00000481121		A0A1W2PP64	1363 aa		29.13	■■■□□ 2.25
NELFE-208	ENST00000481121	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		29.12	■■■□□ 2.25
NELFE-208	ENST00000481121	FAM83G	A6ND36	823 aa		29.11	■■■□□ 2.25
NELFE-208	ENST00000481121	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		29.11	■■■□□ 2.25
NELFE-208	ENST00000481121	KIAA0232	Q92628	1395 aa		29.11	■■■□□ 2.25
NELFE-208	ENST00000481121	RGS12	O14924	1447 aa		29.11	■■■□□ 2.25
NELFE-208	ENST00000481121	NLRP6	P59044	892 aa		29.1	■■■□□ 2.25
NELFE-208	ENST00000481121	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		29.1	■■■□□ 2.25
NELFE-208	ENST00000481121	GLI3	P10071	1580 aa		29.1	■■■□□ 2.25
NELFE-208	ENST00000481121	CDCA8	Q53HL2	280 aa		29.1	■■■□□ 2.25
NELFE-208	ENST00000481121	EDC4	Q6P2E9	1401 aa	Known RBP	29.09	■■■□□ 2.25
NELFE-208	ENST00000481121	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	29.08	■■■□□ 2.25
NELFE-208	ENST00000481121	LMO7	Q8WWI1	1683 aa		29.07	■■■□□ 2.24
NELFE-208	ENST00000481121	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	29.07	■■■□□ 2.24
NELFE-208	ENST00000481121	BTG4	Q9NY30	223 aa		29.06	■■■□□ 2.24
NELFE-208	ENST00000481121	CPD	O75976	1380 aa		29.05	■■■□□ 2.24
NELFE-208	ENST00000481121	GC	P02774	474 aa		29.04	■■■□□ 2.24
NELFE-208	ENST00000481121	GJD4	Q96KN9	370 aa	Predicted RBP	29.04	■■■□□ 2.24
NELFE-208	ENST00000481121	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	29.04	■■■□□ 2.24
NELFE-208	ENST00000481121	ANKRD36B	Q8N2N9	1353 aa		29.03	■■■□□ 2.24
NELFE-208	ENST00000481121	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	29.03	■■■□□ 2.24
NELFE-208	ENST00000481121	CHRNA2	Q15822	529 aa		29.03	■■■□□ 2.24
NELFE-208	ENST00000481121	VPS72	Q15906	364 aa		29.01	■■■□□ 2.23
NELFE-208	ENST00000481121	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		29.01	■■■□□ 2.23
NELFE-208	ENST00000481121	CCDC9	Q9Y3X0	531 aa	Known RBP	29	■■■□□ 2.23
NELFE-208	ENST00000481121	LTN1	O94822	1766 aa		29	■■■□□ 2.23
NELFE-208	ENST00000481121	NFAT5	O94916	1531 aa		28.99	■■■□□ 2.23
NELFE-208	ENST00000481121	USP31	Q70CQ4	1352 aa		28.99	■■■□□ 2.23
NELFE-208	ENST00000481121	CAMTA1	Q9Y6Y1	1673 aa		28.98	■■■□□ 2.23
NELFE-208	ENST00000481121	NME9	Q86XW9	330 aa		28.98	■■■□□ 2.23
NELFE-208	ENST00000481121	BRWD3	Q6RI45	1802 aa		28.98	■■■□□ 2.23
NELFE-208	ENST00000481121	COL18A1	P39060	1754 aa		28.98	■■■□□ 2.23
NELFE-208	ENST00000481121	RGPD5	Q99666	1765 aa		28.98	■■■□□ 2.23
NELFE-208	ENST00000481121	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		28.97	■■■□□ 2.23
NELFE-208	ENST00000481121	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		28.94	■■■□□ 2.22
NELFE-208	ENST00000481121	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		28.94	■■■□□ 2.22
NELFE-208	ENST00000481121	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		28.94	■■■□□ 2.22
NELFE-208	ENST00000481121	SOX12	O15370	315 aa		28.94	■■■□□ 2.22
NELFE-208	ENST00000481121	ZRANB1	Q9UGI0	708 aa		28.94	■■■□□ 2.22
NELFE-208	ENST00000481121	STRN4	Q9NRL3	753 aa		28.92	■■■□□ 2.22
NELFE-208	ENST00000481121	COL5A2	P05997	1499 aa	Predicted RBP	28.92	■■■□□ 2.22
NELFE-208	ENST00000481121	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		28.91	■■■□□ 2.22
NELFE-208	ENST00000481121	AATK	Q6ZMQ8	1374 aa		28.91	■■■□□ 2.22
NELFE-208	ENST00000481121	ABCC6	O95255	1503 aa		28.9	■■■□□ 2.22
NELFE-208	ENST00000481121	EP400	Q96L91	3159 aa		28.89	■■■□□ 2.22
NELFE-208	ENST00000481121	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		28.89	■■■□□ 2.22
NELFE-208	ENST00000481121	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		28.89	■■■□□ 2.22
NELFE-208	ENST00000481121	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		28.88	■■■□□ 2.21
NELFE-208	ENST00000481121	EVA1C	P58658	441 aa		28.88	■■■□□ 2.21
NELFE-208	ENST00000481121	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		28.86	■■■□□ 2.21
NELFE-208	ENST00000481121	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		28.85	■■■□□ 2.21
NELFE-208	ENST00000481121	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		28.84	■■■□□ 2.21

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