RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP29.55■■■□□ 2.32
ACTB-211ENST00000480301 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP29.52■■■□□ 2.32
ACTB-211ENST00000480301 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP29.51■■■□□ 2.31
ACTB-211ENST00000480301 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP29.5■■■□□ 2.31
ACTB-211ENST00000480301 USP6P35125 1406 aa29.49■■■□□ 2.31
ACTB-211ENST00000480301 SLC24A1O60721 1099 aa29.49■■■□□ 2.31
ACTB-211ENST00000480301 USP21Q9UK80 565 aa29.49■■■□□ 2.31
ACTB-211ENST00000480301 NUTM2GQ5VZR2 741 aa29.48■■■□□ 2.31
ACTB-211ENST00000480301 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP29.48■■■□□ 2.31
ACTB-211ENST00000480301 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP29.48■■■□□ 2.31
ACTB-211ENST00000480301 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP29.48■■■□□ 2.31
ACTB-211ENST00000480301 SOCS7O14512 581 aa29.47■■■□□ 2.31
ACTB-211ENST00000480301 ABCA3Q99758 1704 aa29.47■■■□□ 2.31
ACTB-211ENST00000480301 SSH2Q76I76 1423 aa29.46■■■□□ 2.31
ACTB-211ENST00000480301 ABTB2Q8N961 1025 aa29.46■■■□□ 2.31
ACTB-211ENST00000480301 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP29.45■■■□□ 2.31
ACTB-211ENST00000480301 BCL9LQ86UU0 1499 aa29.44■■■□□ 2.3
ACTB-211ENST00000480301 RXRBP28702 533 aa29.44■■■□□ 2.3
ACTB-211ENST00000480301 TMC1Q8TDI8 760 aa29.43■■■□□ 2.3
ACTB-211ENST00000480301 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa29.43■■■□□ 2.3
ACTB-211ENST00000480301 SLIT2O94813 1529 aa29.43■■■□□ 2.3
ACTB-211ENST00000480301 FAM83GA6ND36 823 aa29.42■■■□□ 2.3
ACTB-211ENST00000480301 TMF1P82094 1093 aa29.41■■■□□ 2.3
ACTB-211ENST00000480301 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP29.41■■■□□ 2.3
ACTB-211ENST00000480301 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa29.41■■■□□ 2.3
ACTB-211ENST00000480301 CD163L1Q9NR16 1453 aa29.4■■■□□ 2.3
ACTB-211ENST00000480301 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa29.4■■■□□ 2.3
ACTB-211ENST00000480301 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP29.39■■■□□ 2.3
ACTB-211ENST00000480301 NLRP13Q86W25 1043 aa29.39■■■□□ 2.3
ACTB-211ENST00000480301 UNC5CLQ8IV45 518 aa29.39■■■□□ 2.3
ACTB-211ENST00000480301 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP29.39■■■□□ 2.29
ACTB-211ENST00000480301 ATRNO75882 1429 aa29.38■■■□□ 2.29
ACTB-211ENST00000480301 AKAP12Q02952 1782 aa29.38■■■□□ 2.29
ACTB-211ENST00000480301 USP19O94966 1318 aa29.38■■■□□ 2.29
ACTB-211ENST00000480301 NLRP6P59044 892 aa29.35■■■□□ 2.29
ACTB-211ENST00000480301 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP29.34■■■□□ 2.29
ACTB-211ENST00000480301 TTC21AQ8NDW8 1320 aa29.34■■■□□ 2.29
ACTB-211ENST00000480301 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP29.33■■■□□ 2.29
ACTB-211ENST00000480301 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP29.33■■■□□ 2.29
ACTB-211ENST00000480301 NINLQ9Y2I6 1382 aa29.33■■■□□ 2.29
ACTB-211ENST00000480301 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP29.33■■■□□ 2.29
ACTB-211ENST00000480301 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP29.32■■■□□ 2.28
ACTB-211ENST00000480301 KIAA0232Q92628 1395 aa29.32■■■□□ 2.28
ACTB-211ENST00000480301 GCP02774 474 aa29.32■■■□□ 2.28
ACTB-211ENST00000480301 PRDM11Q9NQV5 511 aa29.32■■■□□ 2.28
ACTB-211ENST00000480301 TERF2IPQ9NYB0 399 aa29.32■■■□□ 2.28
ACTB-211ENST00000480301 A0A1W2PP64 1363 aa29.31■■■□□ 2.28
ACTB-211ENST00000480301 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP29.31■■■□□ 2.28
ACTB-211ENST00000480301 NRKQ7Z2Y5 1582 aa29.3■■■□□ 2.28
ACTB-211ENST00000480301 CDCA8Q53HL2 280 aa29.3■■■□□ 2.28
ACTB-211ENST00000480301 BTG4Q9NY30 223 aa29.3■■■□□ 2.28
ACTB-211ENST00000480301 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP29.3■■■□□ 2.28
ACTB-211ENST00000480301 PIK3C2AO00443 1686 aa29.3■■■□□ 2.28
ACTB-211ENST00000480301 MON2Q7Z3U7 1717 aa29.29■■■□□ 2.28
ACTB-211ENST00000480301 PLCH1Q4KWH8 1693 aa29.29■■■□□ 2.28
ACTB-211ENST00000480301 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP29.29■■■□□ 2.28
ACTB-211ENST00000480301 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP29.28■■■□□ 2.28
ACTB-211ENST00000480301 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP29.28■■■□□ 2.28
ACTB-211ENST00000480301 NWD2Q9ULI1 1742 aa29.28■■■□□ 2.28
ACTB-211ENST00000480301 CHRNA2Q15822 529 aa29.27■■■□□ 2.28
ACTB-211ENST00000480301 VPS72Q15906 364 aa29.27■■■□□ 2.28
ACTB-211ENST00000480301 RGS12O14924 1447 aa29.26■■■□□ 2.27
ACTB-211ENST00000480301 CPDO75976 1380 aa29.26■■■□□ 2.27
ACTB-211ENST00000480301 SLIT3O75094 1523 aa29.25■■■□□ 2.27
ACTB-211ENST00000480301 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP29.25■■■□□ 2.27
ACTB-211ENST00000480301 ZRANB1Q9UGI0 708 aa29.24■■■□□ 2.27
ACTB-211ENST00000480301 NME9Q86XW9 330 aa29.23■■■□□ 2.27
ACTB-211ENST00000480301 USP31Q70CQ4 1352 aa29.23■■■□□ 2.27
ACTB-211ENST00000480301 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa29.22■■■□□ 2.27
ACTB-211ENST00000480301 NRAPQ86VF7 1730 aa29.21■■■□□ 2.27
ACTB-211ENST00000480301 GLI3P10071 1580 aa29.2■■■□□ 2.26
ACTB-211ENST00000480301 KCNH5Q8NCM2 988 aa29.19■■■□□ 2.26
ACTB-211ENST00000480301 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP29.18■■■□□ 2.26
ACTB-211ENST00000480301 SOX12O15370 315 aa29.15■■■□□ 2.26
ACTB-211ENST00000480301 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa29.15■■■□□ 2.26
ACTB-211ENST00000480301 ZBTB7CA1YPR0 619 aa29.14■■■□□ 2.26
ACTB-211ENST00000480301 ARHGEF25Q86VW2 580 aa29.14■■■□□ 2.26
ACTB-211ENST00000480301 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa29.14■■■□□ 2.25
ACTB-211ENST00000480301 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa29.14■■■□□ 2.25
ACTB-211ENST00000480301 AATKQ6ZMQ8 1374 aa29.13■■■□□ 2.25
ACTB-211ENST00000480301 LMO7Q8WWI1 1683 aa29.13■■■□□ 2.25
ACTB-211ENST00000480301 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP29.13■■■□□ 2.25
ACTB-211ENST00000480301 STRN4Q9NRL3 753 aa29.13■■■□□ 2.25
ACTB-211ENST00000480301 USP54Q70EL1 1684 aa29.12■■■□□ 2.25
ACTB-211ENST00000480301 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa29.11■■■□□ 2.25
ACTB-211ENST00000480301 OVOS2Q6IE36 1432 aa29.11■■■□□ 2.25
ACTB-211ENST00000480301 NFAT5O94916 1531 aa29.11■■■□□ 2.25
ACTB-211ENST00000480301 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP29.11■■■□□ 2.25
ACTB-211ENST00000480301 MYOM1P52179 1685 aa29.11■■■□□ 2.25
ACTB-211ENST00000480301 EVA1CP58658 441 aa29.1■■■□□ 2.25
ACTB-211ENST00000480301 POLR3GLQ9BT43 218 aa29.1■■■□□ 2.25
ACTB-211ENST00000480301 CARD14Q9BXL6 1004 aa29.1■■■□□ 2.25
ACTB-211ENST00000480301 SEPT12Q8IYM1 358 aa29.09■■■□□ 2.25
ACTB-211ENST00000480301 AXIN2Q9Y2T1 843 aa29.08■■■□□ 2.25
ACTB-211ENST00000480301 FYB1O15117 783 aa29.07■■■□□ 2.24
ACTB-211ENST00000480301 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
ACTB-211ENST00000480301 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa29.07■■■□□ 2.24
ACTB-211ENST00000480301 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
ACTB-211ENST00000480301 COL18A1P39060 1754 aa29.06■■■□□ 2.24
ACTB-211ENST00000480301 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
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