RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479976.5

CHTF18-209, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, human

TSL 2

Gene CHTF18, Length 1,110 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHTF18-209	ENST00000479976	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		40.89	■■■■■ 4.14
CHTF18-209	ENST00000479976	ACE	P12821	1306 aa		40.89	■■■■■ 4.14
CHTF18-209	ENST00000479976	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	40.88	■■■■■ 4.14
CHTF18-209	ENST00000479976	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		40.88	■■■■■ 4.13
CHTF18-209	ENST00000479976	EP400	Q96L91	3159 aa		40.86	■■■■■ 4.13
CHTF18-209	ENST00000479976	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		40.86	■■■■■ 4.13
CHTF18-209	ENST00000479976	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	40.86	■■■■■ 4.13
CHTF18-209	ENST00000479976	CCDC9	Q9Y3X0	531 aa	Known RBP	40.85	■■■■■ 4.13
CHTF18-209	ENST00000479976	BTG4	Q9NY30	223 aa		40.82	■■■■■ 4.13
CHTF18-209	ENST00000479976	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		40.82	■■■■■ 4.12
CHTF18-209	ENST00000479976	CABP2	Q9NPB3	220 aa		40.8	■■■■■ 4.12
CHTF18-209	ENST00000479976	CRYBG1	Q9Y4K1	1723 aa		40.8	■■■■■ 4.12
CHTF18-209	ENST00000479976	QRICH2	Q9H0J4	1663 aa		40.79	■■■■■ 4.12
CHTF18-209	ENST00000479976	ONECUT3	O60422	494 aa	Predicted RBP	40.79	■■■■■ 4.12
CHTF18-209	ENST00000479976	COL14A1	Q05707	1796 aa	Known RBP	40.79	■■■■■ 4.12
CHTF18-209	ENST00000479976	SEPT12	Q8IYM1	358 aa		40.78	■■■■■ 4.12
CHTF18-209	ENST00000479976	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	40.76	■■■■■ 4.12
CHTF18-209	ENST00000479976	PPIP5K1	Q6PFW1	1433 aa		40.76	■■■■■ 4.11
CHTF18-209	ENST00000479976	CCDC125	Q86Z20	511 aa		40.75	■■■■■ 4.11
CHTF18-209	ENST00000479976	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		40.75	■■■■■ 4.11
CHTF18-209	ENST00000479976	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		40.74	■■■■■ 4.11
CHTF18-209	ENST00000479976	NRAP	Q86VF7	1730 aa		40.73	■■■■■ 4.11
CHTF18-209	ENST00000479976	ABTB2	Q8N961	1025 aa		40.71	■■■■■ 4.11
CHTF18-209	ENST00000479976	BRWD3	Q6RI45	1802 aa		40.7	■■■■■ 4.11
CHTF18-209	ENST00000479976	EVC2	Q86UK5	1308 aa		40.68	■■■■■ 4.1
CHTF18-209	ENST00000479976	CABP1	Q9NZU7	370 aa		40.68	■■■■■ 4.1
CHTF18-209	ENST00000479976	KIAA0232	Q92628	1395 aa		40.68	■■■■■ 4.1
CHTF18-209	ENST00000479976	PHRF1	Q9P1Y6	1649 aa	Known RBP	40.66	■■■■■ 4.1
CHTF18-209	ENST00000479976	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	40.65	■■■■■ 4.1
CHTF18-209	ENST00000479976	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	40.64	■■■■■ 4.1
CHTF18-209	ENST00000479976	FAM98C	Q17RN3	349 aa	Known RBP	40.64	■■■■■ 4.1
CHTF18-209	ENST00000479976	CHRNA2	Q15822	529 aa		40.63	■■■■■ 4.09
CHTF18-209	ENST00000479976	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		40.63	■■■■■ 4.09
CHTF18-209	ENST00000479976	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	40.62	■■■■■ 4.09
CHTF18-209	ENST00000479976	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		40.62	■■■■■ 4.09
CHTF18-209	ENST00000479976	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		40.62	■■■■■ 4.09
CHTF18-209	ENST00000479976		A0A0G2JS52	829 aa		40.61	■■■■■ 4.09
CHTF18-209	ENST00000479976	MYT1	Q01538	1121 aa		40.61	■■■■■ 4.09
CHTF18-209	ENST00000479976	NLRP13	Q86W25	1043 aa		40.61	■■■■■ 4.09
CHTF18-209	ENST00000479976	USP19	O94966	1318 aa		40.58	■■■■■ 4.09
CHTF18-209	ENST00000479976	BLM	P54132	1417 aa	Predicted RBP	40.56	■■■■■ 4.08
CHTF18-209	ENST00000479976	TONSL	Q96HA7	1378 aa		40.55	■■■■■ 4.08
CHTF18-209	ENST00000479976	USP6	P35125	1406 aa		40.55	■■■■■ 4.08
CHTF18-209	ENST00000479976	GC	P02774	474 aa		40.53	■■■■■ 4.08
CHTF18-209	ENST00000479976	STRN4	Q9NRL3	753 aa		40.53	■■■■■ 4.08
CHTF18-209	ENST00000479976	NRK	Q7Z2Y5	1582 aa		40.52	■■■■■ 4.08
CHTF18-209	ENST00000479976	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		40.52	■■■■■ 4.08
CHTF18-209	ENST00000479976	CPD	O75976	1380 aa		40.51	■■■■■ 4.08
CHTF18-209	ENST00000479976	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		40.5	■■■■■ 4.07
CHTF18-209	ENST00000479976	EVA1C	P58658	441 aa		40.49	■■■■■ 4.07
CHTF18-209	ENST00000479976	NLRP6	P59044	892 aa		40.48	■■■■■ 4.07
CHTF18-209	ENST00000479976	ZNF692	Q9BU19	519 aa	Predicted RBP	40.48	■■■■■ 4.07
CHTF18-209	ENST00000479976	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	40.47	■■■■■ 4.07
CHTF18-209	ENST00000479976	SSH2	Q76I76	1423 aa		40.47	■■■■■ 4.07
CHTF18-209	ENST00000479976	ZRANB1	Q9UGI0	708 aa		40.44	■■■■■ 4.06
CHTF18-209	ENST00000479976	SBNO2	Q9Y2G9	1366 aa		40.44	■■■■■ 4.06
CHTF18-209	ENST00000479976	CAMTA1	Q9Y6Y1	1673 aa		40.43	■■■■■ 4.06
CHTF18-209	ENST00000479976	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		40.41	■■■■■ 4.06
CHTF18-209	ENST00000479976	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		40.4	■■■■■ 4.06
CHTF18-209	ENST00000479976	USP35	Q9P2H5	1018 aa		40.39	■■■■■ 4.06
CHTF18-209	ENST00000479976	LMO7	Q8WWI1	1683 aa		40.39	■■■■■ 4.06
CHTF18-209	ENST00000479976	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		40.38	■■■■■ 4.05
CHTF18-209	ENST00000479976	LARP1	Q6PKG0	1096 aa	Known RBP	40.37	■■■■■ 4.05
CHTF18-209	ENST00000479976	CPSF1	Q10570	1443 aa	Known RBP	40.36	■■■■■ 4.05
CHTF18-209	ENST00000479976	FAM182B	Q5T319	152 aa		40.36	■■■■■ 4.05
CHTF18-209	ENST00000479976	AKAP12	Q02952	1782 aa		40.35	■■■■■ 4.05
CHTF18-209	ENST00000479976	PIK3C2A	O00443	1686 aa		40.35	■■■■■ 4.05
CHTF18-209	ENST00000479976	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		40.35	■■■■■ 4.05
CHTF18-209	ENST00000479976	SLIT3	O75094	1523 aa		40.35	■■■■■ 4.05
CHTF18-209	ENST00000479976	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		40.33	■■■■■ 4.05
CHTF18-209	ENST00000479976	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		40.32	■■■■■ 4.04
CHTF18-209	ENST00000479976	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		40.31	■■■■■ 4.04
CHTF18-209	ENST00000479976	KTN1	Q86UP2	1357 aa	Known RBP	40.31	■■■■■ 4.04
CHTF18-209	ENST00000479976	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		40.3	■■■■■ 4.04
CHTF18-209	ENST00000479976	AATK	Q6ZMQ8	1374 aa		40.3	■■■■■ 4.04
CHTF18-209	ENST00000479976	COL5A2	P05997	1499 aa	Predicted RBP	40.28	■■■■■ 4.04
CHTF18-209	ENST00000479976	BAG6	P46379	1132 aa		40.27	■■■■■ 4.04
CHTF18-209	ENST00000479976	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	40.27	■■■■■ 4.04
CHTF18-209	ENST00000479976	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		40.26	■■■■■ 4.04
CHTF18-209	ENST00000479976	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		40.23	■■■■■ 4.03
CHTF18-209	ENST00000479976	TMC1	Q8TDI8	760 aa		40.23	■■■■■ 4.03
CHTF18-209	ENST00000479976	PDE3B	Q13370	1112 aa		40.22	■■■■■ 4.03
CHTF18-209	ENST00000479976	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		40.21	■■■■■ 4.03
CHTF18-209	ENST00000479976	PUS7	Q96PZ0	661 aa	Known RBP	40.21	■■■■■ 4.03
CHTF18-209	ENST00000479976	CRB1	P82279	1406 aa		40.2	■■■■■ 4.03
CHTF18-209	ENST00000479976	SLC12A5	Q9H2X9	1139 aa		40.2	■■■■■ 4.03
CHTF18-209	ENST00000479976	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		40.19	■■■■■ 4.02
CHTF18-209	ENST00000479976	MON2	Q7Z3U7	1717 aa		40.19	■■■■■ 4.02
CHTF18-209	ENST00000479976	AXIN2	Q9Y2T1	843 aa		40.19	■■■■■ 4.02
CHTF18-209	ENST00000479976	COL18A1	P39060	1754 aa		40.18	■■■■■ 4.02
CHTF18-209	ENST00000479976	SOX12	O15370	315 aa		40.18	■■■■■ 4.02
CHTF18-209	ENST00000479976	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	40.18	■■■■■ 4.02
CHTF18-209	ENST00000479976	CD163L1	Q9NR16	1453 aa		40.18	■■■■■ 4.02
CHTF18-209	ENST00000479976	ST20-MTHFS	A0A0A6YYL1	179 aa		40.17	■■■■■ 4.02
CHTF18-209	ENST00000479976	HDGFL2	Q7Z4V5	671 aa	Predicted RBP	40.17	■■■■■ 4.02
CHTF18-209	ENST00000479976	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	40.15	■■■■■ 4.02
CHTF18-209	ENST00000479976	TESK2	Q96S53	571 aa		40.15	■■■■■ 4.02
CHTF18-209	ENST00000479976	SLC24A1	O60721	1099 aa		40.13	■■■■■ 4.01
CHTF18-209	ENST00000479976	TRIM37	O94972	964 aa		40.13	■■■■■ 4.01
CHTF18-209	ENST00000479976	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		40.13	■■■■■ 4.01

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 113.7 ms