RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479554.5

ATG4B-218, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 4

Gene ATG4B, Length 556 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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ATG4B-218ENST00000479554 CCDC61Q9Y6R9 512 aa20.62■□□□□ 0.89
ATG4B-218ENST00000479554 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa20.62■□□□□ 0.89
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ATG4B-218ENST00000479554 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa20.48■□□□□ 0.87
ATG4B-218ENST00000479554 USP6P35125 1406 aa20.47■□□□□ 0.87
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ATG4B-218ENST00000479554 DEFB132Q7Z7B7 95 aa20.39■□□□□ 0.85
ATG4B-218ENST00000479554 USP35Q9P2H5 1018 aa20.37■□□□□ 0.85
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ATG4B-218ENST00000479554 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
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ATG4B-218ENST00000479554 FAM182BQ5T319 152 aa20.34■□□□□ 0.85
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ATG4B-218ENST00000479554 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
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ATG4B-218ENST00000479554 KCNH5Q8NCM2 988 aa20.29■□□□□ 0.84
ATG4B-218ENST00000479554 FAM196AQ6ZSG2 479 aa20.28■□□□□ 0.84
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ATG4B-218ENST00000479554 TRIM37O94972 964 aa20.24■□□□□ 0.83
ATG4B-218ENST00000479554 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
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ATG4B-218ENST00000479554 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP20.24■□□□□ 0.83
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