RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477440.6

ARHGEF3-208, Transcript of Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

TSL 3

Gene ARHGEF3, Length 587 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3-208ENST00000477440 TESK2Q96S53 571 aa35.82■■■■□ 3.32
ARHGEF3-208ENST00000477440 AKAP12Q02952 1782 aa35.81■■■■□ 3.32
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ARHGEF3-208ENST00000477440 NGLY1Q96IV0 654 aa35.77■■■■□ 3.32
ARHGEF3-208ENST00000477440 USP6P35125 1406 aa35.75■■■■□ 3.31
ARHGEF3-208ENST00000477440 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP35.74■■■■□ 3.31
ARHGEF3-208ENST00000477440 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP35.74■■■■□ 3.31
ARHGEF3-208ENST00000477440 NRKQ7Z2Y5 1582 aa35.71■■■■□ 3.31
ARHGEF3-208ENST00000477440 MON2Q7Z3U7 1717 aa35.71■■■■□ 3.31
ARHGEF3-208ENST00000477440 PLCH1Q4KWH8 1693 aa35.69■■■■□ 3.3
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ARHGEF3-208ENST00000477440 SSH2Q76I76 1423 aa35.67■■■■□ 3.3
ARHGEF3-208ENST00000477440 NUTM2GQ5VZR2 741 aa35.67■■■■□ 3.3
ARHGEF3-208ENST00000477440 PIK3C2AO00443 1686 aa35.66■■■■□ 3.3
ARHGEF3-208ENST00000477440 CD163L1Q9NR16 1453 aa35.66■■■■□ 3.3
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ARHGEF3-208ENST00000477440 USP21Q9UK80 565 aa35.65■■■■□ 3.3
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ARHGEF3-208ENST00000477440 ABTB2Q8N961 1025 aa35.64■■■■□ 3.3
ARHGEF3-208ENST00000477440 SLIT2O94813 1529 aa35.63■■■■□ 3.29
ARHGEF3-208ENST00000477440 BCL9LQ86UU0 1499 aa35.63■■■■□ 3.29
ARHGEF3-208ENST00000477440 TMC1Q8TDI8 760 aa35.63■■■■□ 3.29
ARHGEF3-208ENST00000477440 NWD2Q9ULI1 1742 aa35.62■■■■□ 3.29
ARHGEF3-208ENST00000477440 TMF1P82094 1093 aa35.61■■■■□ 3.29
ARHGEF3-208ENST00000477440 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP35.61■■■■□ 3.29
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ARHGEF3-208ENST00000477440 USP19O94966 1318 aa35.57■■■■□ 3.29
ARHGEF3-208ENST00000477440 ATRNO75882 1429 aa35.57■■■■□ 3.28
ARHGEF3-208ENST00000477440 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa35.57■■■■□ 3.28
ARHGEF3-208ENST00000477440 NRAPQ86VF7 1730 aa35.55■■■■□ 3.28
ARHGEF3-208ENST00000477440 FAM83GA6ND36 823 aa35.55■■■■□ 3.28
ARHGEF3-208ENST00000477440 RXRBP28702 533 aa35.55■■■■□ 3.28
ARHGEF3-208ENST00000477440 A0A1W2PP64 1363 aa35.54■■■■□ 3.28
ARHGEF3-208ENST00000477440 SOCS7O14512 581 aa35.54■■■■□ 3.28
ARHGEF3-208ENST00000477440 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP35.54■■■■□ 3.28
ARHGEF3-208ENST00000477440 NINLQ9Y2I6 1382 aa35.53■■■■□ 3.28
ARHGEF3-208ENST00000477440 NLRP13Q86W25 1043 aa35.53■■■■□ 3.28
ARHGEF3-208ENST00000477440 MYOM1P52179 1685 aa35.52■■■■□ 3.28
ARHGEF3-208ENST00000477440 SLIT3O75094 1523 aa35.52■■■■□ 3.28
ARHGEF3-208ENST00000477440 KIAA0232Q92628 1395 aa35.51■■■■□ 3.28
ARHGEF3-208ENST00000477440 NLRP6P59044 892 aa35.51■■■■□ 3.28
ARHGEF3-208ENST00000477440 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP35.51■■■■□ 3.28
ARHGEF3-208ENST00000477440 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP35.51■■■■□ 3.28
ARHGEF3-208ENST00000477440 TTC21AQ8NDW8 1320 aa35.51■■■■□ 3.27
ARHGEF3-208ENST00000477440 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP35.5■■■■□ 3.27
ARHGEF3-208ENST00000477440 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP35.5■■■■□ 3.27
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ARHGEF3-208ENST00000477440 TERF2IPQ9NYB0 399 aa35.49■■■■□ 3.27
ARHGEF3-208ENST00000477440 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP35.48■■■■□ 3.27
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ARHGEF3-208ENST00000477440 PRDM11Q9NQV5 511 aa35.48■■■■□ 3.27
ARHGEF3-208ENST00000477440 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP35.47■■■■□ 3.27
ARHGEF3-208ENST00000477440 USP54Q70EL1 1684 aa35.46■■■■□ 3.27
ARHGEF3-208ENST00000477440 CDCA8Q53HL2 280 aa35.46■■■■□ 3.27
ARHGEF3-208ENST00000477440 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP35.45■■■■□ 3.27
ARHGEF3-208ENST00000477440 RGS12O14924 1447 aa35.45■■■■□ 3.27
ARHGEF3-208ENST00000477440 GLI3P10071 1580 aa35.45■■■■□ 3.27
ARHGEF3-208ENST00000477440 GCP02774 474 aa35.44■■■■□ 3.26
ARHGEF3-208ENST00000477440 BTG4Q9NY30 223 aa35.44■■■■□ 3.26
ARHGEF3-208ENST00000477440 CHRNA2Q15822 529 aa35.43■■■■□ 3.26
ARHGEF3-208ENST00000477440 CPDO75976 1380 aa35.42■■■■□ 3.26
ARHGEF3-208ENST00000477440 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa35.42■■■■□ 3.26
ARHGEF3-208ENST00000477440 LMO7Q8WWI1 1683 aa35.42■■■■□ 3.26
ARHGEF3-208ENST00000477440 NME9Q86XW9 330 aa35.4■■■■□ 3.26
ARHGEF3-208ENST00000477440 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP35.4■■■■□ 3.26
ARHGEF3-208ENST00000477440 ZRANB1Q9UGI0 708 aa35.39■■■■□ 3.26
ARHGEF3-208ENST00000477440 VPS72Q15906 364 aa35.37■■■■□ 3.25
ARHGEF3-208ENST00000477440 USP31Q70CQ4 1352 aa35.37■■■■□ 3.25
ARHGEF3-208ENST00000477440 NFAT5O94916 1531 aa35.36■■■■□ 3.25
ARHGEF3-208ENST00000477440 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa35.34■■■■□ 3.25
ARHGEF3-208ENST00000477440 COL18A1P39060 1754 aa35.33■■■■□ 3.25
ARHGEF3-208ENST00000477440 SOX12O15370 315 aa35.32■■■■□ 3.24
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ARHGEF3-208ENST00000477440 ZBTB7CA1YPR0 619 aa35.3■■■■□ 3.24
ARHGEF3-208ENST00000477440 POLR3GLQ9BT43 218 aa35.3■■■■□ 3.24
ARHGEF3-208ENST00000477440 KCNH5Q8NCM2 988 aa35.29■■■■□ 3.24
ARHGEF3-208ENST00000477440 KIF20BQ96Q89 1820 aa35.29■■■■□ 3.24
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ARHGEF3-208ENST00000477440 RGPD5Q99666 1765 aa35.28■■■■□ 3.24
ARHGEF3-208ENST00000477440 STRN4Q9NRL3 753 aa35.26■■■■□ 3.24
ARHGEF3-208ENST00000477440 BRWD3Q6RI45 1802 aa35.26■■■■□ 3.24
ARHGEF3-208ENST00000477440 AATKQ6ZMQ8 1374 aa35.25■■■■□ 3.23
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ARHGEF3-208ENST00000477440 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP35.24■■■■□ 3.23
ARHGEF3-208ENST00000477440 ARHGEF25Q86VW2 580 aa35.24■■■■□ 3.23
ARHGEF3-208ENST00000477440 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa35.23■■■■□ 3.23
ARHGEF3-208ENST00000477440 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa35.23■■■■□ 3.23
ARHGEF3-208ENST00000477440 NSD3Q9BZ95 1437 aa35.21■■■■□ 3.23
ARHGEF3-208ENST00000477440 CARD14Q9BXL6 1004 aa35.2■■■■□ 3.23
ARHGEF3-208ENST00000477440 EVA1CP58658 441 aa35.18■■■■□ 3.22
ARHGEF3-208ENST00000477440 ABCC6O95255 1503 aa35.17■■■■□ 3.22
ARHGEF3-208ENST00000477440 COG3Q96JB2 828 aa35.17■■■■□ 3.22
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