RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476612.1

UBE2Q1-204, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2Q1, Length 301 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1-204ENST00000476612 RGS12O14924 1447 aa5.68□□□□□ -1.5
UBE2Q1-204ENST00000476612 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa5.68□□□□□ -1.5
UBE2Q1-204ENST00000476612 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa5.68□□□□□ -1.5
UBE2Q1-204ENST00000476612 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
UBE2Q1-204ENST00000476612 CHRNA2Q15822 529 aa5.68□□□□□ -1.5
UBE2Q1-204ENST00000476612 VPS72Q15906 364 aa5.68□□□□□ -1.5
UBE2Q1-204ENST00000476612 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa5.68□□□□□ -1.5
UBE2Q1-204ENST00000476612 ZRANB1Q9UGI0 708 aa5.68□□□□□ -1.5
UBE2Q1-204ENST00000476612 KIF1AQ12756 1690 aa5.68□□□□□ -1.5
UBE2Q1-204ENST00000476612 USP19O94966 1318 aa5.68□□□□□ -1.5
UBE2Q1-204ENST00000476612 EVC2Q86UK5 1308 aa5.68□□□□□ -1.5
UBE2Q1-204ENST00000476612 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
UBE2Q1-204ENST00000476612 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
UBE2Q1-204ENST00000476612 RALGAPBQ86X10 1494 aa5.67□□□□□ -1.5
UBE2Q1-204ENST00000476612 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
UBE2Q1-204ENST00000476612 GCP02774 474 aa5.67□□□□□ -1.5
UBE2Q1-204ENST00000476612 ABTB2Q8N961 1025 aa5.67□□□□□ -1.5
UBE2Q1-204ENST00000476612 BTG4Q9NY30 223 aa5.67□□□□□ -1.5
UBE2Q1-204ENST00000476612 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa5.67□□□□□ -1.5
UBE2Q1-204ENST00000476612 KIAA0232Q92628 1395 aa5.67□□□□□ -1.5
UBE2Q1-204ENST00000476612 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
UBE2Q1-204ENST00000476612 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
UBE2Q1-204ENST00000476612 SEPT12Q8IYM1 358 aa5.66□□□□□ -1.5
UBE2Q1-204ENST00000476612 AXIN2Q9Y2T1 843 aa5.66□□□□□ -1.5
UBE2Q1-204ENST00000476612 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa5.66□□□□□ -1.5
UBE2Q1-204ENST00000476612 ALS2Q96Q42 1657 aa5.66□□□□□ -1.5
UBE2Q1-204ENST00000476612 USP6P35125 1406 aa5.65□□□□□ -1.5
UBE2Q1-204ENST00000476612 CD163L1Q9NR16 1453 aa5.65□□□□□ -1.5
UBE2Q1-204ENST00000476612 GLI3P10071 1580 aa5.65□□□□□ -1.5
UBE2Q1-204ENST00000476612 NLRP6P59044 892 aa5.65□□□□□ -1.5
UBE2Q1-204ENST00000476612 NLRP13Q86W25 1043 aa5.65□□□□□ -1.5
UBE2Q1-204ENST00000476612 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
UBE2Q1-204ENST00000476612 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
UBE2Q1-204ENST00000476612 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa5.65□□□□□ -1.51
UBE2Q1-204ENST00000476612 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa5.65□□□□□ -1.51
UBE2Q1-204ENST00000476612 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa5.65□□□□□ -1.51
UBE2Q1-204ENST00000476612 FBLN1P23142 703 aa5.64□□□□□ -1.51
UBE2Q1-204ENST00000476612 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
UBE2Q1-204ENST00000476612 FAM182BQ5T319 152 aa5.64□□□□□ -1.51
UBE2Q1-204ENST00000476612 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
UBE2Q1-204ENST00000476612 ARHGEF25Q86VW2 580 aa5.64□□□□□ -1.51
UBE2Q1-204ENST00000476612 NME9Q86XW9 330 aa5.64□□□□□ -1.51
UBE2Q1-204ENST00000476612 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP5.64□□□□□ -1.51
UBE2Q1-204ENST00000476612 PRDM11Q9NQV5 511 aa5.64□□□□□ -1.51
UBE2Q1-204ENST00000476612 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa5.64□□□□□ -1.51
UBE2Q1-204ENST00000476612 CLSPNQ9HAW4 1339 aa5.64□□□□□ -1.51
UBE2Q1-204ENST00000476612 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
UBE2Q1-204ENST00000476612 QRICH2Q9H0J4 1663 aa5.63□□□□□ -1.51
UBE2Q1-204ENST00000476612 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa5.63□□□□□ -1.51
UBE2Q1-204ENST00000476612 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
UBE2Q1-204ENST00000476612 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
UBE2Q1-204ENST00000476612 TMC1Q8TDI8 760 aa5.63□□□□□ -1.51
UBE2Q1-204ENST00000476612 STRN4Q9NRL3 753 aa5.63□□□□□ -1.51
UBE2Q1-204ENST00000476612 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
UBE2Q1-204ENST00000476612 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa5.63□□□□□ -1.51
UBE2Q1-204ENST00000476612 CPDO75976 1380 aa5.63□□□□□ -1.51
UBE2Q1-204ENST00000476612 ATAD2Q6PL18 1390 aa5.63□□□□□ -1.51
UBE2Q1-204ENST00000476612 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
UBE2Q1-204ENST00000476612 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa5.62□□□□□ -1.51
UBE2Q1-204ENST00000476612 CARD14Q9BXL6 1004 aa5.62□□□□□ -1.51
UBE2Q1-204ENST00000476612 USP31Q70CQ4 1352 aa5.62□□□□□ -1.51
UBE2Q1-204ENST00000476612 USP47Q96K76 1375 aa5.62□□□□□ -1.51
UBE2Q1-204ENST00000476612 ABCA3Q99758 1704 aa5.62□□□□□ -1.51
UBE2Q1-204ENST00000476612 EP400Q96L91 3159 aa5.61□□□□□ -1.51
UBE2Q1-204ENST00000476612 A0A1W2PP64 1363 aa5.61□□□□□ -1.51
UBE2Q1-204ENST00000476612 FYB1O15117 783 aa5.61□□□□□ -1.51
UBE2Q1-204ENST00000476612 SOX12O15370 315 aa5.61□□□□□ -1.51
UBE2Q1-204ENST00000476612 AATKQ6ZMQ8 1374 aa5.61□□□□□ -1.51
UBE2Q1-204ENST00000476612 BARGINQ6ZT62 677 aa5.61□□□□□ -1.51
UBE2Q1-204ENST00000476612 KRT27Q7Z3Y8 459 aa5.61□□□□□ -1.51
UBE2Q1-204ENST00000476612 TTC21AQ8NDW8 1320 aa5.61□□□□□ -1.51
UBE2Q1-204ENST00000476612 USP35Q9P2H5 1018 aa5.61□□□□□ -1.51
UBE2Q1-204ENST00000476612 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
UBE2Q1-204ENST00000476612 NRKQ7Z2Y5 1582 aa5.6□□□□□ -1.51
UBE2Q1-204ENST00000476612 SLIT3O75094 1523 aa5.6□□□□□ -1.51
UBE2Q1-204ENST00000476612 ZBTB7CA1YPR0 619 aa5.6□□□□□ -1.51
UBE2Q1-204ENST00000476612 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
UBE2Q1-204ENST00000476612 EVA1CP58658 441 aa5.6□□□□□ -1.51
UBE2Q1-204ENST00000476612 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
UBE2Q1-204ENST00000476612 DEFB132Q7Z7B7 95 aa5.6□□□□□ -1.51
UBE2Q1-204ENST00000476612 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
UBE2Q1-204ENST00000476612 ITSN1Q15811 1721 aa5.6□□□□□ -1.51
UBE2Q1-204ENST00000476612 NRAPQ86VF7 1730 aa5.6□□□□□ -1.51
UBE2Q1-204ENST00000476612 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
UBE2Q1-204ENST00000476612 PIK3C2AO00443 1686 aa5.59□□□□□ -1.51
UBE2Q1-204ENST00000476612 LMO7Q8WWI1 1683 aa5.59□□□□□ -1.51
UBE2Q1-204ENST00000476612 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
UBE2Q1-204ENST00000476612 TMF1P82094 1093 aa5.59□□□□□ -1.51
UBE2Q1-204ENST00000476612 PTF1AQ7RTS3 328 aa5.59□□□□□ -1.51
UBE2Q1-204ENST00000476612 TCP11L2Q8N4U5 519 aa5.59□□□□□ -1.51
UBE2Q1-204ENST00000476612 KCNH5Q8NCM2 988 aa5.59□□□□□ -1.51
UBE2Q1-204ENST00000476612 TERF2IPQ9NYB0 399 aa5.59□□□□□ -1.51
UBE2Q1-204ENST00000476612 PLCH1Q4KWH8 1693 aa5.59□□□□□ -1.52
UBE2Q1-204ENST00000476612 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.52
UBE2Q1-204ENST00000476612 NFAT5O94916 1531 aa5.58□□□□□ -1.52
UBE2Q1-204ENST00000476612 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa5.58□□□□□ -1.52
UBE2Q1-204ENST00000476612 OVOS2Q6IE36 1432 aa5.58□□□□□ -1.52
UBE2Q1-204ENST00000476612 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
UBE2Q1-204ENST00000476612 COL18A1P39060 1754 aa5.58□□□□□ -1.52
UBE2Q1-204ENST00000476612 NWD2Q9ULI1 1742 aa5.58□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 95.7 ms